Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 463,287 (bp)   Positions: 542
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
ACI/EurMcwi (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
Grin2b
A
A
A
A
A
T
C
C
T
T
G
A
-
2
T
T
C
C
-
-
-
-
T
C
-
C
A
C
A
T
A
C
A
A
A
4
T
G
G
-
-
C
T
G
G
A
A
26
A
C
G
A
C
-
G
T
G
C
C
C
T
8
T
C
C
C
T
C
A
G
T
A
G
-
C
18
C
T
A
A
G
G
A
T
C
A
A
-
G
A
T
T
T
C
G
G
G
G
G
T
3
A
C
G
A
C
A
G
C
G
C
T
T
G
G
C
G
-
A
T
A
G
G
G
A
A
C
G
C
-
T
2
T
G
T
G
T
G
C
T
-
-
G
6
T
A
A
A
G
G
A
A
C
A
A
C
A
A
C
A
T
A
T
C
T
G
-
A
C
G
-
G
T
G
C
C
C
C
A
C
C
A
-
A
A
C
C
C
A
A
C
G
A
A
A
A
A
A
G
G
T
G
T
G
G
T
A
A
C
T
C
T
T
A
T
C
A
G
T
T
G
C
G
G
G
-
T
C
A
C
T
A
A
G
T
-
-
T
C
-
-
C
C
T
A
G
T
A
C
A
A
G
A
C
T
C
T
T
A
C
G
G
T
T
2
G
G
G
T
C
T
-
-
C
4
-
-
G
T
C
4
A
T
C
2
C
C
C
6
C
T
T
T
A
C
G
C
G
C
T
C
C
G
C
C
A
G
A
-
A
T
C
G
G
A
A
T
A
C
T
A
A
T
C
2
C
C
A
G
C
-
A
G
A
A
2
A
A
A
G
A
4
A
T
C
A
A
G
G
T
A
C
G
C
T
G
A
A
G
C
T
G
G
C
T
C
G
G
T
T
A
C
C
A
C
A
A
-
A
G
T
T
T
5
T
G
C
2
A
C
T
T
G
C
T
C
A
T
G
T
T
C
A
C
C
C
T
G
T
T
A
-
3
T
C
A
C
G
A
A
G
G
G
G
C
G
C
T
A
A
C
T
C
C
G
T
-
-
G
C
A
G
G
-
G
G
G
T
C
G
T
A
C
G
C
T
G
G
G
C
G
A
T
G
A
A
G
-
T
G
G
T
G
C
G
G
G
24
C
2
-
2
15
-
T
G
C
T
C
A
C
T
A
T
T
A
T
C
G
T
T
A
G
T
A
A
C
2
G
-
-
A
G
G
T
G
A
G
C
C
A
-
C
C
T
G
T
-
C
C
C
C
3
A
T
C
C
C
-
G
G
A
  168,603,718
  168,603,720
  168,603,722
  168,603,724
  168,603,726
  168,624,940
  168,624,956
  168,625,079
  168,719,735
  168,719,745
  168,723,185
  168,783,903
  168,791,602
  168,795,604
  168,802,799
  168,852,876
  168,858,073
  168,859,936
  168,860,787
  168,861,181
  168,862,179
  168,862,181
  168,863,207
  168,865,659
  168,867,644
  168,867,648
  168,867,649
  168,868,136
  168,870,514
  168,872,039
  168,872,142
  168,876,309
  168,878,002
  168,878,004
  168,878,006
  168,878,345
  168,879,087
  168,881,669
  168,881,787
  168,882,109
  168,882,230
  168,883,126
  168,883,229
  168,883,506
  168,884,134
  168,884,409
  168,884,494
  168,885,133
  168,885,579
  168,885,607
  168,885,937
  168,886,137
  168,886,298
  168,886,526
  168,886,626
  168,886,740
  168,887,109
  168,887,120
  168,887,174
  168,887,379
  168,887,570
  168,887,789
  168,888,294
  168,888,326
  168,888,352
  168,888,354
  168,888,512
  168,888,544
  168,888,638
  168,888,660
  168,888,862
  168,889,172
  168,889,435
  168,889,472
  168,889,711
  168,889,733
  168,889,767
  168,889,793
  168,889,985
  168,890,000
  168,890,224
  168,890,235
  168,890,280
  168,890,534
  168,890,558
  168,890,813
  168,890,817
  168,891,135
  168,891,192
  168,891,204
  168,891,212
  168,891,216
  168,891,295
  168,891,446
  168,891,451
  168,891,508
  168,891,617
  168,891,625
  168,891,779
  168,892,094
  168,892,163
  168,892,168
  168,892,181
  168,892,183
  168,892,302
  168,892,634
  168,892,685
  168,892,937
  168,892,950
  168,893,175
  168,893,333
  168,893,349
  168,893,358
  168,893,376
  168,893,432
  168,893,731
  168,893,893
  168,893,976
  168,894,276
  168,894,287
  168,894,581
  168,894,658
  168,894,898
  168,895,061
  168,895,236
  168,895,340
  168,896,083
  168,897,321
  168,897,907
  168,898,432
  168,900,275
  168,900,555
  168,901,033
  168,901,548
  168,901,680
  168,901,697
  168,901,702
  168,902,515
  168,902,650
  168,902,806
  168,902,826
  168,902,834
  168,902,852
  168,902,854
  168,902,859
  168,902,872
  168,902,924
  168,902,980
  168,903,160
  168,903,318
  168,906,388
  168,907,811
  168,907,885
  168,908,017
  168,908,079
  168,908,243
  168,908,519
  168,908,570
  168,908,655
  168,908,657
  168,908,947
  168,908,953
  168,909,594
  168,911,148
  168,911,507
  168,911,955
  168,914,204
  168,915,777
  168,915,940
  168,916,817
  168,916,822
  168,917,070
  168,917,713
  168,917,719
  168,917,935
  168,918,473
  168,919,529
  168,920,829
  168,921,152
  168,921,187
  168,921,518
  168,921,684
  168,922,301
  168,922,537
  168,923,050
  168,923,151
  168,923,214
  168,923,321
  168,923,344
  168,923,345
  168,923,397
  168,923,503
  168,923,715
  168,923,908
  168,923,910
  168,923,912
  168,923,914
  168,923,916
  168,924,053
  168,924,122
  168,924,388
  168,924,425
  168,924,445
  168,924,989
  168,925,218
  168,925,423
  168,925,447
  168,925,522
  168,925,724
  168,925,745
  168,925,839
  168,926,009
  168,926,062
  168,926,115
  168,926,422
  168,926,452
  168,926,470
  168,926,487
  168,926,489
  168,926,529
  168,926,801
  168,926,835
  168,927,289
  168,927,419
  168,927,731
  168,927,864
  168,929,001
  168,929,526
  168,930,017
  168,930,321
  168,930,345
  168,930,592
  168,931,150
  168,931,260
  168,931,286
  168,933,912
  168,933,915
  168,934,050
  168,934,179
  168,934,413
  168,935,312
  168,935,498
  168,935,522
  168,935,764
  168,937,568
  168,937,758
  168,939,169
  168,939,354
  168,939,531
  168,939,574
  168,939,600
  168,939,798
  168,939,829
  168,940,183
  168,940,368
  168,940,427
  168,940,563
  168,940,771
  168,940,814
  168,941,044
  168,941,091
  168,941,120
  168,941,260
  168,941,390
  168,941,836
  168,941,883
  168,942,451
  168,943,506
  168,945,348
  168,947,397
  168,949,313
  168,949,387
  168,949,400
  168,949,788
  168,950,098
  168,950,106
  168,950,109
  168,951,126
  168,951,521
  168,952,339
  168,952,563
  168,952,773
  168,953,555
  168,954,375
  168,954,390
  168,954,391
  168,954,429
  168,954,431
  168,954,440
  168,954,445
  168,955,385
  168,956,206
  168,956,288
  168,956,300
  168,956,463
  168,956,868
  168,956,870
  168,956,878
  168,957,915
  168,957,916
  168,958,008
  168,958,039
  168,958,047
  168,958,088
  168,958,154
  168,958,196
  168,960,113
  168,960,131
  168,960,520
  168,960,651
  168,960,691
  168,960,714
  168,960,716
  168,963,498
  168,963,704
  168,963,757
  168,963,781
  168,963,866
  168,963,873
  168,964,347
  168,964,645
  168,964,675
  168,964,820
  168,964,889
  168,965,038
  168,965,039
  168,965,043
  168,965,624
  168,965,651
  168,965,994
  168,966,159
  168,966,655
  168,966,659
  168,966,779
  168,966,789
  168,966,850
  168,966,915
  168,967,018
  168,967,167
  168,967,620
  168,967,890
  168,968,124
  168,968,127
  168,968,179
  168,968,194
  168,968,203
  168,968,469
  168,969,163
  168,970,129
  168,970,338
  168,970,862
  168,971,627
  168,972,475
  168,972,994
  168,974,174
  168,974,742
  168,974,874
  168,975,359
  168,975,477
  168,975,779
  168,975,791
  168,976,429
  168,976,548
  168,976,873
  168,977,150
  168,978,084
  168,978,211
  168,978,378
  168,978,914
  168,979,496
  168,979,934
  168,980,005
  168,980,064
  168,980,948
  168,981,687
  168,982,189
  168,982,289
  168,982,346
  168,982,749
  168,983,201
  168,984,375
  168,985,035
  168,985,044
  168,985,352
  168,985,773
  168,985,855
  168,986,299
  168,986,399
  168,988,264
  168,988,573
  168,989,355
  168,989,427
  168,989,474
  168,989,531
  168,990,150
  168,990,439
  168,990,592
  168,990,987
  168,991,211
  168,991,739
  168,991,756
  168,992,221
  168,992,317
  168,992,353
  168,992,474
  168,992,743
  168,992,892
  168,993,221
  168,993,286
  168,993,547
  168,993,885
  168,993,984
  168,993,985
  168,994,488
  168,994,558
  168,994,577
  168,994,864
  168,994,877
  168,994,899
  168,995,442
  168,995,640
  168,995,659
  168,995,841
  168,995,945
  168,995,961
  168,995,991
  168,996,131
  168,996,451
  168,996,469
  168,996,535
  168,996,605
  168,996,780
  168,997,263
  168,997,459
  168,997,846
  168,997,865
  168,997,890
  168,997,979
  168,998,177
  168,998,217
  168,998,246
  168,998,247
  168,998,276
  168,998,504
  168,998,526
  168,998,551
  168,998,738
  168,998,750
  168,998,914
  168,999,039
  168,999,104
  168,999,137
  168,999,349
  168,999,480
  168,999,633
  168,999,637
  169,000,042
  169,002,592
  169,004,361
  169,006,157
  169,006,192
  169,006,220
  169,006,525
  169,007,239
  169,007,333
  169,007,649
  169,007,946
  169,008,012
  169,008,424
  169,009,653
  169,009,662
  169,009,675
  169,009,676
  169,009,764
  169,010,085
  169,011,075
  169,011,700
  169,012,140
  169,012,541
  169,012,748
  169,012,794
  169,012,818
  169,012,911
  169,013,348
  169,014,005
  169,014,253
  169,014,337
  169,014,674
  169,015,557
  169,015,700
  169,015,744
  169,016,404
  169,021,219
  169,021,326
  169,021,427
  169,021,429
  169,021,488
  169,021,603
  169,021,929
  169,022,306
  169,022,404
  169,022,442
  169,022,681
  169,022,857
  169,023,287
  169,023,442
  169,023,629
  169,023,692
  169,023,714
  169,024,241
  169,024,790
  169,025,913
  169,026,160
  169,026,491
  169,028,281
  169,028,919
  169,029,874
  169,030,223
  169,030,545
  169,030,582
  169,030,917
  169,031,248
  169,031,695
  169,032,010
  169,032,610
  169,033,994
  169,034,188
  169,035,661
  169,035,748
  169,036,143
  169,036,339
  169,037,397
  169,037,806
  169,038,428
  169,039,802
  169,040,021
  169,040,441
  169,041,332
  169,042,312
  169,042,496
  169,042,880
  169,043,248
-/T
-/T
T/-
-/T
T/-
-/C
-/T
-/T
-/C
C/-
-/C
G
G
2/-
T/-
C
T
T
A
T
-/T
-/T
C
T
T
T
G
T
C
C
G
T
-/T
-/T
T/-
-
G
A
A
4
2
T
C
A
A
T
G
26/-
G
T
A
G
T
4
A
C
A
T
T
G
-
-
C
A
T
T
C
-
G
C
G
G
C
T
T
-
T
C
-
T
A
A
T
C
T
-
G
9
C
G
C
G
A
T
C
A
A
A
C
G
-
C
A/-
-/A
G
T
G
A
T
A
T
C
C
A
A
G
A
T
C
C
G
T
A
A
C
G/-
G
A
T
C
-
-
G
C
A
A
C
A
-
G
G
A
-
-
-/A
T
G
G
A
A
G
T
G
G
T
T
G
G
G
G
C
T
G
T
C
A
2
G
A
A
T
A
C
A
A
T
T
A
G
T
G
G
6
G
T
T
T
G
-/T
-/T
T
C
G
T/-
-/T
-/T
T/-
A/T
A
A
C/-
-/A
C
A
A
C
G
G
A
C
G
C
C
G
C
T
C
A
C
C
A
T
A
T
A
T
C
T
G
A
C
G
G
A
C
-/4
-/2
C
T
G
T
T
T
C
G
A
C
C
A
G
G
A
G
A
C
G
C
C
G
G
A
T
C
G
-
A
C
A
C
T
G
A
2
T
-
5
9
A
C
T
-
G
A
T
-
-/T
T/-
-/T
6/-
?
G
C
C
G
G
A
T
C
A
C
A
A
A
A
T
G
A
G
A
G
A
T
A
A
T
G
-
G
T
C
T
G
G
T
2/-
-/T
T
C
C
T
T
-
A
G
G
-
G
G
G
A
G
-
G/-
C
T
G
G
A
C
C
G
G
A
T
C
T
G
-
A
T
A
A
A
T
C
A
A
C
C
C
G
T
T
G
T
C
C
17
G
A
A
C
G
-
G
A
A
-
G
T
G
C
A
T
C
A
T
C
A
C
C
G
G
A
G
A
C
A
C
C
G
-/2
3/-
G
T
G
G
A
G
G
A
T
A
A
A
T
T
A
C
G
G
C
A
A
C
A
2
A/A
A
T
T
A
C
T
A
A
A
C
A
A
C
G
G
A
T
C
A
A
T
A
A
G
A
A
T
T
A
A
C
C
A
C
A
T
A
T
A
-
T
-
2
-
-
A
C
A
T
C
T
G
T
G
C
A/G
A
G
C
A
C
C
C
G
A
C
T
G
A
-
A
8
T
G
A
A
C
A
T
A
A
G
G
G
T
T
C
A
C
C
T
A
A
T
-
G
A
T
T
T
T
A
A
-