Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 239,378 (bp)   Positions: 621
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
Gramd1b
T
T
G
G
T
T
T
G
G
G
G
G
T
C
G
G
G
C
T
-
T
G
T
G
A
C
C
A
A
T
C
G
G
T
C
A
C
T
A
C
C
G
C
T
A
4
T
G
A
T
G
T
G
G
G
G
G
A
T
T
T
G
C
A
T
C
T
A
G
112
2
-
T
A
C
A
T
T
A
G
T
A
C
G
A
C
G
-
-
A
A
T
T
C
A
T
T
G
G
A
A
G
C
G
A
G
T
G
C
-
A
G
A
G
G
A
C
-
A
A
C
C
G
A
C
G
G
G
G
G
G
G
G
T
G
G
G
G
G
G
G
G
G
A
C
C
T
C
T
A
A
G
C
C
G
T
-
C
T
C
G
A
-
C
A
A
A
G
A
T
C
G
A
G
-
T
C
G
G
G
C
T
T
T
C
A
C
G
A
T
T
A
A
G
C
G
3
T
A
G
T
G
C
A
A
A
T
-
C
A
12
A
A
-
T
A
C
C
C
T
A
G
-
T
G
A
C
A
G
-
-
A
C
A
C
-
T
C
G
T
G
G
A
T
G
T
T
G
T
C
A
A
G
3
C
-
A
G
G
T
G
A
T
C
A
A
A
A
G
C
C
2
C
T
G
G
A
G
-
T
A
G
G
G
C
T
T
G
G
2
A
T
G
A
T
A
A
A
C
C
7
C
C
-
G
T
G
A
C
A
T
A
T
T
A
-
T
C
C
T
T
A
C
C
C
T
G
C
G
T
G
T
G
T
G
A
G
T
T
T
A
A
3
A
A
T
C
A
T
37
G
2
G
G
G
G
-
T
A
G
A
G
G
C
-
C
2
T
G
T
A
T
A
G
G
A
-
6
2
T
A
C
G
C
A
G
A
G
C
C
112
T
C
T
14
C
T
T
T
C
C
A
C
T
-
30
G
A
C
C
G
-
T
T
T
T
C
G
C
G
A
24
C
-
3
G
T
G
G
A
T
A
A
A
C
G
A
A
C
G
C
T
T
C
A
G
A
A
T
G
T
C
G
C
T
G
G
G
C
C
T
T
A
C
G
G
G
G
T
T
T
A
C
2
A
-
T
G
A
A
T
G
A
G
G
A
G
G
C
C
-
C
T
T
T
C
T
T
T
T
C
T
A
T
A
G
C
C
T
C
A
T
T
G
C
G
G
A
C
A
A
A
A
A
-
C
2
T
G
T
C
C
C
A
G
T
T
A
A
A
A
A
A
A
A
G
C
C
C
T
T
C
T
T
A
T
A
A
C
G
T
A
T
T
G
G
T
G
T
G
T
T
66
T
T
A
A
T
C
C
C
A
C
T
C
T
G
C
G
32
C
C
G
A
A
T
G
T
-
G
T
T
G
T
T
C
A
G
A
G
2
4
T
G
A
A
T
G
A
11
A
  40,657,306
  40,657,693
  40,659,517
  40,660,328
  40,661,074
  40,661,941
  40,662,415
  40,663,059
  40,663,648
  40,663,733
  40,664,411
  40,664,886
  40,664,966
  40,664,973
  40,665,663
  40,665,762
  40,665,883
  40,666,392
  40,666,678
  40,666,685
  40,666,919
  40,666,977
  40,667,170
  40,667,219
  40,667,516
  40,667,886
  40,667,921
  40,667,966
  40,668,395
  40,668,948
  40,669,500
  40,669,730
  40,669,955
  40,670,000
  40,670,292
  40,670,370
  40,671,164
  40,671,592
  40,671,688
  40,671,775
  40,672,256
  40,672,642
  40,672,677
  40,672,695
  40,672,846
  40,672,927
  40,673,446
  40,673,627
  40,673,838
  40,673,917
  40,674,268
  40,674,942
  40,674,961
  40,675,170
  40,675,498
  40,675,500
  40,675,502
  40,675,917
  40,676,041
  40,676,080
  40,676,158
  40,676,786
  40,677,514
  40,677,981
  40,678,099
  40,678,644
  40,679,041
  40,679,489
  40,679,721
  40,680,208
  40,680,438
  40,680,648
  40,680,674
  40,680,813
  40,681,253
  40,681,490
  40,681,611
  40,681,713
  40,682,008
  40,682,286
  40,682,369
  40,682,471
  40,683,281
  40,683,335
  40,683,416
  40,683,797
  40,684,197
  40,684,545
  40,685,353
  40,685,454
  40,686,205
  40,686,313
  40,686,666
  40,687,036
  40,687,326
  40,687,332
  40,687,419
  40,687,556
  40,687,572
  40,687,582
  40,688,087
  40,688,673
  40,690,494
  40,691,695
  40,691,955
  40,692,604
  40,692,812
  40,694,786
  40,695,143
  40,696,164
  40,696,321
  40,696,438
  40,696,587
  40,698,405
  40,700,360
  40,702,830
  40,702,837
  40,702,859
  40,703,601
  40,704,816
  40,705,692
  40,705,693
  40,708,908
  40,711,859
  40,712,071
  40,713,137
  40,713,139
  40,713,141
  40,713,143
  40,713,145
  40,713,147
  40,713,149
  40,713,151
  40,713,154
  40,713,155
  40,713,157
  40,713,159
  40,713,161
  40,713,163
  40,713,165
  40,713,167
  40,713,169
  40,713,171
  40,713,553
  40,714,245
  40,715,480
  40,715,987
  40,716,839
  40,717,233
  40,717,477
  40,717,784
  40,718,257
  40,718,479
  40,718,542
  40,718,735
  40,718,900
  40,718,961
  40,720,184
  40,722,454
  40,723,568
  40,726,406
  40,726,459
  40,726,520
  40,727,129
  40,727,156
  40,727,202
  40,727,790
  40,728,046
  40,728,932
  40,729,102
  40,729,122
  40,729,355
  40,729,466
  40,729,474
  40,729,524
  40,729,598
  40,729,626
  40,730,415
  40,730,427
  40,730,429
  40,730,496
  40,730,512
  40,731,135
  40,731,191
  40,731,271
  40,731,526
  40,731,879
  40,732,033
  40,732,478
  40,732,664
  40,732,875
  40,733,859
  40,734,871
  40,735,302
  40,735,975
  40,736,492
  40,737,836
  40,738,086
  40,738,914
  40,738,951
  40,738,988
  40,740,175
  40,740,231
  40,740,234
  40,740,269
  40,740,312
  40,740,997
  40,741,337
  40,741,360
  40,741,532
  40,742,785
  40,745,002
  40,745,394
  40,746,120
  40,746,148
  40,746,179
  40,746,519
  40,746,780
  40,746,955
  40,746,968
  40,747,028
  40,747,775
  40,747,979
  40,749,961
  40,750,243
  40,751,410
  40,751,742
  40,751,774
  40,751,849
  40,751,867
  40,751,953
  40,752,006
  40,752,228
  40,753,350
  40,753,812
  40,754,507
  40,755,436
  40,755,612
  40,755,632
  40,755,663
  40,756,131
  40,756,566
  40,756,805
  40,756,976
  40,757,527
  40,758,640
  40,758,716
  40,760,812
  40,761,300
  40,761,361
  40,761,566
  40,762,225
  40,763,355
  40,763,399
  40,763,400
  40,763,405
  40,763,673
  40,764,645
  40,764,652
  40,764,752
  40,764,801
  40,765,152
  40,765,784
  40,765,903
  40,766,111
  40,766,427
  40,766,962
  40,767,195
  40,767,385
  40,767,436
  40,767,470
  40,767,950
  40,769,407
  40,769,595
  40,769,942
  40,770,002
  40,770,078
  40,770,714
  40,770,926
  40,771,174
  40,771,585
  40,771,768
  40,772,280
  40,772,535
  40,772,665
  40,774,265
  40,774,268
  40,774,788
  40,774,902
  40,774,993
  40,775,013
  40,775,036
  40,775,055
  40,775,118
  40,775,147
  40,775,412
  40,775,421
  40,775,440
  40,775,529
  40,775,689
  40,776,087
  40,776,107
  40,776,169
  40,776,194
  40,776,977
  40,777,025
  40,777,081
  40,778,234
  40,778,328
  40,778,340
  40,778,435
  40,778,734
  40,779,134
  40,779,313
  40,780,067
  40,780,107
  40,780,337
  40,780,365
  40,780,569
  40,780,608
  40,781,015
  40,781,090
  40,781,512
  40,781,585
  40,781,632
  40,781,775
  40,781,830
  40,781,834
  40,781,913
  40,782,271
  40,782,284
  40,782,295
  40,782,571
  40,782,889
  40,783,055
  40,783,265
  40,783,373
  40,783,576
  40,783,637
  40,783,933
  40,783,936
  40,784,400
  40,784,405
  40,784,406
  40,784,419
  40,785,584
  40,785,611
  40,786,005
  40,786,149
  40,786,571
  40,786,744
  40,786,791
  40,787,992
  40,788,240
  40,789,634
  40,789,930
  40,790,338
  40,790,439
  40,790,511
  40,790,671
  40,791,237
  40,791,487
  40,791,521
  40,791,555
  40,791,636
  40,791,906
  40,791,999
  40,792,079
  40,792,914
  40,793,016
  40,793,896
  40,794,016
  40,794,310
  40,794,619
  40,794,796
  40,794,898
  40,794,970
  40,795,094
  40,795,200
  40,795,574
  40,796,545
  40,797,249
  40,797,256
  40,797,898
  40,798,133
  40,798,867
  40,798,921
  40,799,286
  40,799,426
  40,799,544
  40,799,680
  40,799,822
  40,800,365
  40,800,524
  40,800,720
  40,801,172
  40,801,230
  40,801,258
  40,801,264
  40,801,302
  40,801,304
  40,801,392
  40,801,626
  40,801,702
  40,801,746
  40,801,861
  40,801,933
  40,802,093
  40,802,255
  40,804,251
  40,804,309
  40,804,642
  40,804,711
  40,804,713
  40,804,715
  40,804,719
  40,804,969
  40,805,060
  40,805,239
  40,805,785
  40,805,917
  40,806,319
  40,806,332
  40,807,282
  40,808,569
  40,808,635
  40,809,388
  40,809,448
  40,809,636
  40,810,012
  40,810,235
  40,810,443
  40,810,690
  40,811,112
  40,811,246
  40,811,408
  40,812,056
  40,812,072
  40,812,481
  40,812,623
  40,812,759
  40,813,503
  40,813,620
  40,813,805
  40,814,017
  40,814,026
  40,814,869
  40,814,870
  40,815,861
  40,815,874
  40,815,958
  40,816,328
  40,816,543
  40,816,623
  40,816,908
  40,817,045
  40,817,361
  40,818,259
  40,819,082
  40,819,086
  40,819,427
  40,820,236
  40,820,839
  40,821,966
  40,824,580
  40,824,582
  40,824,584
  40,824,586
  40,828,811
  40,830,295
  40,833,361
  40,836,866
  40,837,232
  40,837,666
  40,838,709
  40,838,974
  40,839,910
  40,839,958
  40,840,154
  40,840,777
  40,841,668
  40,841,750
  40,841,757
  40,842,123
  40,842,600
  40,842,807
  40,843,067
  40,843,335
  40,843,346
  40,843,743
  40,843,805
  40,844,224
  40,845,219
  40,845,222
  40,845,225
  40,845,238
  40,845,261
  40,845,264
  40,845,267
  40,845,270
  40,845,330
  40,845,442
  40,846,792
  40,847,541
  40,848,107
  40,849,181
  40,849,384
  40,849,392
  40,849,409
  40,849,445
  40,849,456
  40,849,499
  40,849,860
  40,850,094
  40,850,268
  40,850,547
  40,850,973
  40,851,000
  40,851,241
  40,851,393
  40,851,395
  40,851,397
  40,851,399
  40,851,401
  40,852,671
  40,852,732
  40,853,731
  40,854,522
  40,855,163
  40,855,465
  40,857,947
  40,858,185
  40,858,191
  40,859,151
  40,859,449
  40,859,610
  40,860,181
  40,860,336
  40,861,071
  40,861,073
  40,861,075
  40,861,077
  40,861,316
  40,863,902
  40,863,915
  40,864,003
  40,865,217
  40,865,571
  40,865,850
  40,866,467
  40,867,149
  40,869,319
  40,870,962
  40,870,964
  40,871,363
  40,871,874
  40,872,089
  40,872,190
  40,872,255
  40,873,495
  40,874,652
  40,874,717
  40,874,728
  40,875,437
  40,875,572
  40,875,641
  40,875,643
  40,875,649
  40,875,651
  40,875,657
  40,875,659
  40,876,254
  40,876,574
  40,877,064
  40,877,125
  40,877,236
  40,877,471
  40,877,481
  40,877,580
  40,877,689
  40,877,699
  40,878,885
  40,879,393
  40,879,530
  40,879,817
  40,880,220
  40,880,507
  40,880,572
  40,880,690
  40,881,404
  40,881,435
  40,881,825
  40,883,039
  40,883,235
  40,883,580
  40,883,842
  40,883,956
  40,884,066
  40,884,212
  40,884,355
  40,884,713
  40,885,037
  40,885,071
  40,885,107
  40,885,469
  40,885,513
  40,886,411
  40,886,584
  40,887,078
  40,887,111
  40,887,388
  40,887,391
  40,887,569
  40,888,714
  40,889,151
  40,889,205
  40,889,666
  40,890,220
  40,891,347
  40,892,260
  40,892,676
C
C
C
A
C
-
C
A
A
A
A
A
C
T
A
A
C
G
C
8
C
A
-
A
G
T
A
G
C
G
T
-/A
A
C
T
G
T
A
G
T
T
A
T
C
G
-
G
A
C
C
A
C
A
A
C/-
-/C
-/C
G
-
C
A
A
A
C
C
T
C
G
A
-
-
G
C
G
T
G
C
A
C
A
C
G
T
A
G
T
T
8
T
G
G
C
C
T
T
C
C
A
A
G
-/C
A
C/G
A
G
A
C
-
T
T
G
A
C
A
A
G
T
16
C
-
-/A
C/A
A
G
T
C/-
C/-
-/C
-/C
C/-
C/-
-/C
C/-
C/-
C/-
-/C
-/C
C
C
C
C
C
C
G
G
T
C
T
G
G
G
A
A
T
A
C
12
T
C
T
T
C/-
4
T
T/-
-/C
G
A
G
C
A
A
G
A
2
C
A
A/-
G/A
G/A
T
C
-
C
A
G
T
A
G
C
C
G
G
A
A
A
-
C
A/-
C
C
A
T
G
G
C
A
C
G
-
-
G
T
8
C
G
T
A
T
A
G
T
A
C
A
T
T
C
A
5
C
G
T
C
-
9
C
A
A
G
A
A
G
C
T
-/C
C/-
A
C
T
G
G
A
-
T/-
8
G
T
A
C
A
G
G
T
G
G
G
C
A
-/A
-/A
-
A
C
A
T
G
A
3
C
T
T
C
A
T
C
C
C
A
-
G
C
A
T/G
C
G
G
T
T
T
-
T
T
8
A/-
C
A
G
G
G
G
T
C
C
G
2
C
T/G
T
C
C
G
T
G
-
A
A/T
T
A
A
A
A
A
C
A
C
T
G
C
G
G
-
-
T/-
-
G
T
G
C
-
A
-
A
C
T
A
T
C
T
A
-
A
A
T
7
T
-
C
A
A
T
G
G
A
A
G
-/60
-
2/-
C
G
T
A
T
C
T
G
-
T
T
-
C
A
C
-
T
C
A
A
T/-
T/-
G
T
A
2
-
A
G
T
A
A
A
T/A
A
A
A
T
A
T
A
G
-
-/T
A
-
A
A
A
A
G
A
T
G
G
T
A
-
G
A
C
T
A
G
G
-/G
-/A
C
C
C
T
G
T
A
T
G
A
T
-
-/T
T/-
C
G
G
T
-/C
C/-
-/C
C/-
C
A
C
T
T
-
G
A
T/A
A
G
G
C
A
T
A
A
G
C/T
A
G
T
2
T
C/-
C/-
-/C
-/T
-/C
-/C
-/C
-/C
T
-
C
C
G
A
A
T
C
A
C
C
C
-
T
A
A
G
A
-/G
G/-
-/G
-/G
G
C
T
-
C
A
C
T
G
A
G
C
C
G
G
-/G
G/-
G/-
G/-
T
G
G
A
G
T
T
C
C/A
C/G
C
C
C
A
C
C
T
A
C
C
G
C
A
C
G/-
C/-
-/G
-/C
-/G
A
-
A/-
C
T
C
A
T
T
G
C
T
C
T
G
A
-
C
-
T/-
T
A
G
G
C
A
C
13
T
C
A
A
C
C
A
G
A
G
C
-
-
-
A
G
G
-
A
G
-
G