Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 157,658 (bp)   Positions: 288
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
BUF/N (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
Gnao1
-
C
A
C
-
C
G
G
A
C
G
A
T
C
A
A
A
T
T
C
G
A
-
A
A
A
T
C
T
A
G
G
A
C
2
-
C
C
C
C
G
C
A
C
G
-
-
T
-
T
C
C
T
G
T
T
G
-
T
T
T
A
C
G
C
T
C
G
C
C
A
T
2
C
G
A
-
T
A
C
G
A
A
G
A
-
6
C
T
A
G
C
T
G
A
A
C
3
2
4
G
C
T
G
G
G
C
T
T
T
A
C
T
7
A
C
A
G
-
-
A
T
A
A
A
C
G
2
A
G
C
T
G
A
-
-
G
A
T
C
-
T
G
A
A
A
A
A
G
G
2
-
2
38
C
A
A
C
G
T
G
T
G
8
C
A
-
T
C
G
C
G
-
T
T
T
G
T
G
G
T
G
T
G
C
T
G
G
T
2
-
G
2
C
C
T
T
3
T
T
C
T
2
A
-
-
T
-
C
C
G
27
T
G
T
A
A
A
C
5
G
2
T
T
T
T
T
T
A
G
T
A
T
G
G
-
-
C
T
A
T
T
T
3
C
G
T
C
A
T
G
-
T
G
G
26
A
A
T
G
T
T
G
-
A
G
C
-
2
-
G
G
G
5
-
C
C
A
G
C
G
T
T
-
G
-
A
A
  11,035,239
  11,036,315
  11,038,004
  11,038,013
  11,038,064
  11,038,417
  11,038,504
  11,038,739
  11,038,823
  11,038,969
  11,039,809
  11,040,193
  11,040,295
  11,040,298
  11,040,362
  11,040,839
  11,041,104
  11,041,901
  11,043,940
  11,044,819
  11,045,133
  11,046,614
  11,047,660
  11,047,935
  11,050,809
  11,051,701
  11,052,414
  11,052,693
  11,052,730
  11,052,737
  11,053,137
  11,053,339
  11,053,859
  11,054,135
  11,054,151
  11,054,175
  11,054,238
  11,054,242
  11,054,246
  11,054,250
  11,054,332
  11,054,543
  11,054,642
  11,055,281
  11,055,282
  11,055,517
  11,055,839
  11,057,175
  11,058,041
  11,058,608
  11,059,061
  11,059,184
  11,059,725
  11,059,780
  11,060,076
  11,060,355
  11,060,871
  11,061,441
  11,061,453
  11,061,615
  11,061,663
  11,062,793
  11,062,921
  11,064,209
  11,064,915
  11,065,333
  11,065,438
  11,065,625
  11,066,585
  11,066,886
  11,067,109
  11,067,235
  11,067,434
  11,067,559
  11,068,007
  11,068,200
  11,068,610
  11,068,854
  11,068,971
  11,069,330
  11,069,502
  11,069,619
  11,069,645
  11,070,174
  11,070,475
  11,071,153
  11,071,179
  11,071,342
  11,071,460
  11,073,003
  11,073,164
  11,073,863
  11,074,029
  11,074,055
  11,074,236
  11,074,403
  11,074,465
  11,076,840
  11,076,845
  11,078,533
  11,078,535
  11,078,611
  11,078,744
  11,078,771
  11,079,205
  11,079,537
  11,079,552
  11,081,453
  11,082,425
  11,082,731
  11,084,405
  11,084,904
  11,085,242
  11,085,711
  11,085,883
  11,085,952
  11,086,463
  11,086,579
  11,086,751
  11,086,883
  11,087,328
  11,087,771
  11,087,868
  11,088,188
  11,088,395
  11,088,598
  11,088,769
  11,088,773
  11,088,804
  11,088,860
  11,089,052
  11,089,565
  11,090,276
  11,090,459
  11,091,051
  11,091,448
  11,092,264
  11,092,304
  11,092,522
  11,092,655
  11,092,705
  11,092,744
  11,092,745
  11,092,785
  11,092,924
  11,093,398
  11,093,407
  11,093,413
  11,093,414
  11,093,443
  11,093,471
  11,093,475
  11,093,583
  11,093,587
  11,093,589
  11,093,593
  11,093,594
  11,093,608
  11,093,622
  11,093,624
  11,093,647
  11,093,918
  11,094,084
  11,094,095
  11,094,278
  11,094,762
  11,098,491
  11,099,503
  11,100,209
  11,100,386
  11,100,850
  11,101,423
  11,101,690
  11,101,947
  11,101,957
  11,101,961
  11,102,191
  11,102,448
  11,102,848
  11,103,109
  11,104,039
  11,104,437
  11,104,826
  11,104,835
  11,104,946
  11,105,806
  11,105,916
  11,106,239
  11,106,489
  11,106,741
  11,106,869
  11,106,889
  11,107,049
  11,108,980
  11,110,714
  11,112,863
  11,113,133
  11,113,851
  11,116,758
  11,117,705
  11,118,160
  11,119,582
  11,119,708
  11,120,687
  11,120,696
  11,120,715
  11,120,829
  11,121,251
  11,121,267
  11,122,909
  11,122,998
  11,123,007
  11,123,873
  11,124,375
  11,124,676
  11,127,471
  11,128,110
  11,128,476
  11,128,757
  11,132,396
  11,133,296
  11,135,618
  11,135,627
  11,135,630
  11,135,639
  11,135,648
  11,135,657
  11,135,713
  11,137,038
  11,137,042
  11,138,350
  11,138,731
  11,139,417
  11,142,842
  11,142,853
  11,142,966
  11,148,025
  11,149,150
  11,150,797
  11,151,310
  11,155,312
  11,155,479
  11,156,772
  11,156,962
  11,157,095
  11,157,637
  11,159,841
  11,160,360
  11,160,704
  11,161,470
  11,161,553
  11,161,574
  11,161,619
  11,161,699
  11,162,054
  11,162,359
  11,162,418
  11,164,583
  11,165,571
  11,165,830
  11,165,979
  11,166,906
  11,168,550
  11,169,143
  11,170,016
  11,170,188
  11,171,216
  11,173,189
  11,173,278
  11,173,295
  11,174,570
  11,175,025
  11,176,008
  11,176,264
  11,176,654
  11,178,273
  11,179,871
  11,180,872
  11,183,490
  11,183,611
  11,183,745
  11,186,560
  11,187,315
  11,188,947
  11,189,392
  11,189,557
  11,189,568
  11,191,110
T
T
G
T
20
T
A
-
C
T
T
C
-
-
G
T
G
C
C
T
A
G
9
G
C
G
G
G
C
G
A
T
T
T
-
5
-/A
A
A
A
T
G
G
T
T
4
4
C
A
C
T
G
C
A
C
C
A
A
C
C
G
G
T/G
C
T
C
A
T
T
T
G
C
-
T
T
G
2
-/C
G
T
T
T
G
A
G
C
-
G
C
-
-
T
C
A
T
G
T
-
-
-
-/C
T
C
A
A
A
T
C
C
C
G
T
C
-
G
G
G
T
3
12
T
G
T
G
C
T
A
-
G
-
T
G
A
G
10
A
A
G
C
T
20
C
A
G
T/-
A/G
A/G
A/C
G/C
A/-
-
2
-
-
A/-
C/-
-/C
-/T
-/A
A/-
A
C
A
-
T
G
50
C
T
C
T
A
A
-/C
-/C
-/C
C
G
T
A
C
A
G
A
-
A
A
C
C
-
2
C
-
G
T
G
C
3/-
C
C
T
C
-
G
4
2
A
TT/C
G
-/A
A
-
C
A
C
C
G
G
T
-
A
?
C/-
C/-
C
C
C
C
-
A
C
C
C
A
A
-/12
A
T
C
G
C
C
A
-
T
A
C
T
G
A
A
3
C
A
A
-
-
G
C
T
C
A
A
G
G
A
T
2
-
2
A
C
A
-
G
T
G
G
A
T
C
C
C
A
C
7
G
G