Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 124,547 (bp)   Positions: 243
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF11/Stm (2020) 
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
Galnt7
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC120097422
LOC120097422
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
C
T
6
C
C
A
-
C
C
T
C
T
-
-
A
G
G
A
A
T
A
A
A
-
C
C
C
G
C
C
T
G
16
2
T
C
G
A
C
T
C
T
T
G
G
G
A
A
C
-
G
6
C
2
T
T
T
G
A
G
T
G
G
A
C
A
T
4
G
-
-
A
G
A
G
G
T
A
A
A
A
A
3
A
G
G
T
G
A
G
A
C
T
A
T
T
T
A
C
C
T
C
C
C
C
G
C
C
G
A
T
T
T
-
G
A
G
C
A
A
G
C
-
T
A
C
G
-
C
A
G
T
A
G
C
C
T
4
T
C
G
T
C
G
-
-
T
-
T
A
A
A
A
T
A
T
4
4
8
G
-
T
-
G
C
-
G
A
T
4
-
C
-
G
-
A
G
T
-
G
G
T
10
C
T
C
G
G
T
T
A
G
G
G
G
A
A
G
G
A
A
C
A
C
T
A
C
C
C
G
3
A
T
T
24
G
G
-
A
7
T
C
A
G
G
A
T
C
C
A
C
G
T
A
T
G
T
A
-
C
T
T
  32,579,064
  32,579,691
  32,580,061
  32,580,171
  32,581,505
  32,584,268
  32,594,107
  32,594,316
  32,596,026
  32,596,030
  32,601,758
  32,602,922
  32,604,561
  32,608,371
  32,608,654
  32,608,696
  32,609,153
  32,612,547
  32,612,566
  32,613,086
  32,613,159
  32,614,142
  32,614,531
  32,614,872
  32,615,543
  32,615,864
  32,616,209
  32,616,544
  32,616,571
  32,617,515
  32,620,568
  32,620,841
  32,620,852
  32,620,976
  32,622,432
  32,622,440
  32,622,585
  32,623,163
  32,623,336
  32,623,778
  32,623,779
  32,624,010
  32,624,135
  32,624,251
  32,624,591
  32,624,654
  32,624,826
  32,624,837
  32,625,075
  32,628,274
  32,628,390
  32,628,655
  32,628,866
  32,628,930
  32,629,582
  32,630,182
  32,630,339
  32,630,386
  32,631,638
  32,632,020
  32,632,107
  32,632,108
  32,632,204
  32,632,206
  32,632,210
  32,633,342
  32,634,053
  32,634,579
  32,634,581
  32,635,147
  32,635,460
  32,635,684
  32,635,739
  32,635,956
  32,636,485
  32,636,504
  32,636,600
  32,637,998
  32,638,157
  32,638,207
  32,638,379
  32,638,680
  32,639,444
  32,640,028
  32,640,039
  32,640,293
  32,640,345
  32,640,553
  32,640,667
  32,640,881
  32,641,700
  32,641,807
  32,642,237
  32,642,276
  32,642,436
  32,642,450
  32,642,604
  32,642,944
  32,642,992
  32,643,000
  32,643,894
  32,644,363
  32,645,200
  32,645,662
  32,645,935
  32,646,064
  32,647,323
  32,647,495
  32,647,717
  32,647,898
  32,648,016
  32,648,312
  32,648,378
  32,648,438
  32,648,455
  32,648,483
  32,649,038
  32,649,298
  32,649,314
  32,649,637
  32,649,719
  32,650,242
  32,650,253
  32,650,655
  32,650,994
  32,651,188
  32,651,200
  32,651,202
  32,651,914
  32,651,979
  32,652,455
  32,652,537
  32,653,751
  32,654,135
  32,654,501
  32,655,920
  32,656,858
  32,657,324
  32,658,538
  32,658,945
  32,658,980
  32,659,013
  32,659,567
  32,660,324
  32,661,018
  32,661,951
  32,663,269
  32,663,389
  32,665,517
  32,666,931
  32,669,543
  32,670,208
  32,671,685
  32,672,517
  32,672,827
  32,675,031
  32,675,905
  32,677,320
  32,680,015
  32,680,065
  32,680,072
  32,680,418
  32,680,556
  32,680,579
  32,680,668
  32,681,045
  32,681,125
  32,681,412
  32,681,456
  32,681,755
  32,682,695
  32,682,974
  32,683,468
  32,683,777
  32,684,290
  32,684,651
  32,684,751
  32,684,793
  32,684,991
  32,685,385
  32,685,509
  32,685,816
  32,686,276
  32,686,299
  32,686,303
  32,686,711
  32,687,096
  32,687,287
  32,687,354
  32,687,556
  32,687,591
  32,688,519
  32,688,788
  32,689,336
  32,689,461
  32,689,462
  32,690,146
  32,690,163
  32,690,292
  32,690,410
  32,690,465
  32,690,551
  32,690,584
  32,690,808
  32,691,260
  32,691,299
  32,691,313
  32,692,213
  32,692,217
  32,692,221
  32,692,320
  32,692,742
  32,692,888
  32,692,891
  32,693,009
  32,693,180
  32,693,328
  32,693,349
  32,693,478
  32,693,818
  32,693,875
  32,694,387
  32,694,601
  32,695,649
  32,695,950
  32,696,263
  32,696,692
  32,696,919
  32,698,722
  32,699,141
  32,699,578
  32,699,779
  32,700,015
  32,700,323
  32,700,991
  32,701,658
  32,701,763
  32,701,838
  32,701,848
  32,701,874
  32,702,181
  32,702,276
  32,702,590
C
T
G
-
T
T
C
C
-/T
T
G
-/T
C
T
10
G
A
A
G
G
A
G
G
G
31
G
T
T
T
A
T
C
A
-
-
C
T
T
G/-
A
A
A
-
C
T
C
-/T
G/-
C
T
4
C
-
T/-
-
A
G
C
A
-
A
G
C
T
G
G
G
-
-
A
A
3
G
A
G
A
A
C
G
G
G
G
G
-
G
A
C
C
A
-
A
C
A
G
G
C
C
A
G
T
T
C
T
T
T
T
A
T
T
T
G
A
C
G
6
A
T
A
T
G
T
A
G
13
G
G
T
T
C
-
C
A
C
G
-
T
T
-
-
C
T
A
C
T
A
84
A
C
G
C
G
T
C
-
C
G
C
-
-
-
-/A
A
C
8
C
T
GA/G
A
G
-/G
-
2
G
T
A
17
G
A
C
T
A
A
C
-
T/-
A
T
A
A
C
G
G
A
T
-
C
G
C
A
A
G
G
T
G
T
C
G
G/-
G
G
A
-
G
C
A
-
C
A
19
G
-
A
T
C
A
C
G
G
T
A
G
T
A
C
G
C
A
-
G
T
-
C
C