Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 76,943 (bp)   Positions: 366
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
SR/JrHsd (2020) 
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
Gabra4
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
C
G
T
T
C
G
T
-
-
G
G
C
T
C
G
G
G
-
T
T
T
2
C
G
G
T
A
C
G
12
17
T
-
T
T
G
G
T
A
T
G
T
G
-
G
C
C
-
C
T
A
C
G
T
-
A
C
-
C
G
T
T
T
-
T
T
G
C
C
G
C
A
A
T
C
T
G
G
C
10
T
A
G
A
G
C
A
G
G
G
A
C
-
T
C
C
T
A
C
G
T
C
A
A
G
T
C
T
-
G
G
G
A
A
A
G
C
4
C
G
A
-
T
A
G
A
G
G
A
G
C
C
T
C
T
T
A
A
C
T
C
T
G
C
C
T
-
T
G
T
A
A
G
G
G
A
T
G
A
C
G
T
T
A
C
C
A
G
A
-
C
T
C
T
C
C
T
A
G
A
-
A
C
A
-
T
C
G
A
A
G
G
G
A
C
G
T
C
A
C
A
C
T
T
G
G
T
C
T
C
G
-
G
T
G
A
G
G
C
G
T
C
C
A
A
A
C
A
C
4
A
A
T
A
A
G
T
A
G
G
A
G
T
G
A
C
T
C
A
A
A
A
A
C
A
T
C
G
A
G
T
G
A
A
C
G
T
A
C
C
A
G
C
C
G
A
C
T
2
T
-
G
G
C
A
T
G
T
T
G
A
T
C
C
A
A
-
T
T
A
3
3
T
C
G
C
C
G
T
A
A
T
C
C
G
A
T
T
C
A
T
G
C
C
T
G
T
G
C
T
G
T
A
T
C
T
C
T
C
T
T
C
T
C
G
G
T
G
G
C
G
10
C
A
T
A
A
G
A
G
A
T
C
G
  36,591,075
  36,591,280
  36,592,060
  36,592,433
  36,593,466
  36,593,529
  36,594,285
  36,594,399
  36,594,663
  36,595,364
  36,595,365
  36,595,761
  36,595,860
  36,595,970
  36,596,270
  36,596,367
  36,596,438
  36,596,689
  36,596,711
  36,597,017
  36,597,110
  36,597,143
  36,597,184
  36,597,412
  36,597,413
  36,597,451
  36,597,477
  36,597,551
  36,597,820
  36,598,331
  36,598,672
  36,599,083
  36,599,099
  36,599,212
  36,599,434
  36,599,917
  36,600,135
  36,600,601
  36,601,517
  36,601,717
  36,601,767
  36,602,261
  36,602,693
  36,602,822
  36,602,851
  36,602,997
  36,603,060
  36,603,127
  36,603,394
  36,603,430
  36,603,435
  36,603,563
  36,603,594
  36,603,804
  36,604,667
  36,604,724
  36,604,757
  36,604,865
  36,605,115
  36,605,887
  36,606,580
  36,606,917
  36,607,000
  36,607,026
  36,607,772
  36,608,814
  36,608,830
  36,608,865
  36,609,855
  36,610,073
  36,610,247
  36,610,910
  36,611,340
  36,611,372
  36,611,433
  36,611,663
  36,611,724
  36,612,390
  36,612,685
  36,612,694
  36,613,096
  36,613,695
  36,614,440
  36,614,506
  36,614,630
  36,614,698
  36,614,768
  36,614,782
  36,615,191
  36,615,573
  36,615,755
  36,616,978
  36,616,992
  36,617,537
  36,617,586
  36,617,826
  36,617,980
  36,620,291
  36,620,379
  36,621,099
  36,621,509
  36,621,632
  36,621,659
  36,622,403
  36,622,573
  36,623,474
  36,623,842
  36,624,033
  36,624,094
  36,624,138
  36,624,215
  36,624,277
  36,624,361
  36,624,547
  36,624,630
  36,624,818
  36,624,843
  36,625,172
  36,625,463
  36,625,477
  36,625,688
  36,626,292
  36,626,574
  36,626,582
  36,627,454
  36,628,252
  36,630,270
  36,630,453
  36,630,722
  36,630,975
  36,631,124
  36,632,861
  36,633,468
  36,633,591
  36,633,847
  36,633,855
  36,634,007
  36,634,046
  36,634,187
  36,634,565
  36,634,581
  36,634,623
  36,634,627
  36,634,696
  36,634,823
  36,634,831
  36,634,854
  36,634,894
  36,634,992
  36,635,040
  36,635,056
  36,635,098
  36,635,118
  36,635,245
  36,635,378
  36,635,457
  36,635,458
  36,635,823
  36,635,891
  36,636,084
  36,636,106
  36,636,214
  36,636,251
  36,636,292
  36,636,337
  36,636,383
  36,636,617
  36,636,756
  36,636,828
  36,636,928
  36,636,956
  36,637,231
  36,637,249
  36,637,300
  36,637,333
  36,637,413
  36,637,485
  36,637,791
  36,637,839
  36,637,908
  36,637,996
  36,638,030
  36,638,056
  36,638,095
  36,638,212
  36,638,213
  36,638,249
  36,638,268
  36,638,446
  36,638,598
  36,638,626
  36,638,646
  36,638,720
  36,638,827
  36,638,890
  36,638,919
  36,638,959
  36,639,100
  36,639,351
  36,639,382
  36,639,410
  36,639,420
  36,639,448
  36,639,452
  36,639,455
  36,639,538
  36,639,650
  36,639,707
  36,639,833
  36,639,927
  36,639,953
  36,639,971
  36,640,050
  36,640,225
  36,640,230
  36,640,301
  36,640,647
  36,640,736
  36,640,890
  36,640,893
  36,640,921
  36,641,074
  36,641,115
  36,641,181
  36,641,244
  36,641,248
  36,641,339
  36,641,425
  36,641,463
  36,641,478
  36,641,479
  36,641,502
  36,641,523
  36,641,577
  36,641,612
  36,641,646
  36,641,654
  36,641,685
  36,641,810
  36,642,220
  36,642,253
  36,642,267
  36,642,317
  36,642,586
  36,643,019
  36,643,170
  36,643,358
  36,644,398
  36,644,652
  36,645,090
  36,646,067
  36,646,075
  36,646,077
  36,646,083
  36,646,097
  36,646,188
  36,647,399
  36,647,444
  36,648,086
  36,648,930
  36,649,163
  36,649,242
  36,649,392
  36,649,843
  36,650,259
  36,650,448
  36,652,407
  36,652,410
  36,652,420
  36,652,476
  36,652,533
  36,652,594
  36,652,720
  36,652,802
  36,652,861
  36,652,922
  36,653,021
  36,653,152
  36,653,364
  36,653,390
  36,653,464
  36,653,484
  36,653,513
  36,653,523
  36,653,526
  36,653,654
  36,653,691
  36,653,700
  36,653,705
  36,653,757
  36,653,816
  36,653,833
  36,653,859
  36,653,901
  36,654,026
  36,654,185
  36,654,232
  36,654,247
  36,654,264
  36,654,302
  36,654,560
  36,654,644
  36,654,835
  36,654,839
  36,654,942
  36,655,116
  36,655,141
  36,655,165
  36,655,170
  36,655,225
  36,655,497
  36,655,540
  36,655,697
  36,655,928
  36,656,063
  36,656,323
  36,656,749
  36,656,790
  36,656,791
  36,657,198
  36,657,247
  36,657,306
  36,657,450
  36,657,597
  36,657,872
  36,658,084
  36,658,486
  36,658,563
  36,658,773
  36,658,852
  36,659,020
  36,659,197
  36,659,256
  36,659,317
  36,659,349
  36,659,701
  36,659,763
  36,660,023
  36,660,052
  36,660,171
  36,660,330
  36,660,608
  36,661,004
  36,661,013
  36,661,305
  36,661,478
  36,661,940
  36,662,069
  36,662,370
  36,662,740
  36,663,130
  36,663,263
  36,663,414
  36,663,550
  36,664,171
  36,664,246
  36,664,257
  36,664,343
  36,664,344
  36,664,781
  36,666,002
  36,666,166
  36,666,354
  36,667,072
  36,667,378
  36,667,414
C
C
G
A
C
-
T
T
C
T
3
A
A
T
C
T
A
A
C
G
G
A
C
-
-/T
T/-
C
-
G
T
A
-
-
-
T
C
C
T
A
C
-
G
A
C
T
6
A
T
T
10
T
C
G
T
A
C
T
G
T
T
T
C
C
C
-
A
G
C
A
G
A
C
T
G
G
C
T
C
T
T
A
-
G
G
A
G
C
T
G
T
A
A
G
T
G
G
G
A
G
G
T
A
C
A
G
G
A
C
T
C
T
A
T
T
T
C
G
A
T
-
T
-
T
G
G
T
A
G
A
T
G
C
T
T
C
T
C
C
T
G
T
C
A
C
A
T
T
A
6
G
A
C
G
G
A
C
T
G
A
T
G
G
T
C
C
G
T
T
G
A
T
T
T
-
G
C
T
T
G
G
A
T
A
G
T
C
C
A
T
T
G
C
C
A
C
G
G
A
A
A
-
T
G
-
C
-
C
A
C
T
C
T
A
C
A
C
-/A
G
A
T
T
A
C
G
T
C
G
G
T
G
A
-
G
G
C
C
G
T
C
G
C
A
G
A
G
C
G
T
G
A
G/-
G/-
G/-
G
G
T
C
G
G
A
C
T
C
T
G
G
T
A
G
C
T
-
T
A
G
A
A
G
T
A
-
C
C
-
A
-
T
G
A
G
-
T
G
G
T
T
G
G
2
C
C
G
-
-
C
T
T
A
A
A
C
G
G
C
T
-
A
T
C
C
T
G
C
T
T
T
A
A
C
A
T
C
A
G
G
C
G
C
T
C
T
G
C
T
C
T
A
A
A
A
A
T
A
-
A
G
C
G
G
A
G
A
G
G
T
A