Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 115,312 (bp)   Positions: 270
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
PVG/Seac (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
Fnbp1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
-
G
A
A
-
G
A
4
-
-
-
G
T
T
T
A
-
-
T
A
C
-
G
C
T
A
C
C
C
-
A
C
G
A
T
G
C
T
A
C
T
T
A
A
C
T
C
C
C
G
T
G
C
-
T
T
10
G
G
T
G
A
C
T
C
G
T
G
-
-
G
G
-
G
A
11
A
A
A
T
G
G
C
T
A
A
-
G
T
A
-
G
T
G
G
C
A
A
A
-
G
T
G
C
A
T
G
T
C
6
T
G
C
G
G
C
T
A
-
C
-
T
C
C
A
C
-
C
T
A
G
T
A
G
G
C
G
T
C
C
G
C
A
C
C
2
A
T
C
4
G
A
A
G
-
C
G
T
C
G
C
A
T
T
T
A
4
C
-
2
-
C
G
A
T
C
T
T
A
T
G
C
A
T
C
A
G
G
-
T
G
T
-
2
G
A
-
T
T
T
G
C
G
6
G
A
G
A
A
A
A
-
A
T
-
-
G
C
C
-
T
T
C
T
G
A
-
C
G
T
G
G
T
C
A
C
C
2
C
2
5
T
-
T
C
A
G
T
A
C
G
A
A
-
T
G
A
-
23
G
A
-
G
A
G
A
A
A
A
  14,311,486
  14,313,032
  14,313,796
  14,314,256
  14,314,296
  14,315,208
  14,315,509
  14,316,261
  14,316,609
  14,316,614
  14,317,907
  14,317,994
  14,318,168
  14,320,171
  14,320,172
  14,320,173
  14,320,489
  14,321,423
  14,321,424
  14,321,448
  14,321,733
  14,322,274
  14,322,560
  14,322,761
  14,323,313
  14,323,656
  14,323,926
  14,324,899
  14,325,357
  14,325,525
  14,325,903
  14,326,685
  14,326,731
  14,326,774
  14,328,649
  14,329,097
  14,329,098
  14,330,398
  14,330,949
  14,331,257
  14,331,702
  14,331,866
  14,331,948
  14,331,953
  14,332,417
  14,334,466
  14,334,523
  14,335,795
  14,335,829
  14,335,956
  14,336,984
  14,338,323
  14,339,046
  14,341,442
  14,342,363
  14,342,785
  14,342,787
  14,344,526
  14,344,533
  14,344,535
  14,345,860
  14,347,711
  14,348,211
  14,348,675
  14,349,723
  14,349,884
  14,354,519
  14,354,697
  14,355,604
  14,356,657
  14,357,805
  14,360,377
  14,366,432
  14,367,237
  14,367,511
  14,367,729
  14,368,342
  14,368,344
  14,368,348
  14,368,352
  14,368,363
  14,369,675
  14,369,779
  14,370,033
  14,370,095
  14,370,206
  14,370,212
  14,370,348
  14,371,349
  14,372,357
  14,373,523
  14,373,572
  14,373,581
  14,374,182
  14,376,919
  14,377,499
  14,378,705
  14,379,464
  14,380,819
  14,380,908
  14,382,432
  14,382,665
  14,382,680
  14,382,936
  14,383,140
  14,383,567
  14,383,569
  14,383,797
  14,383,917
  14,384,437
  14,384,492
  14,384,497
  14,384,722
  14,384,724
  14,384,725
  14,384,736
  14,384,790
  14,384,805
  14,384,841
  14,384,912
  14,385,317
  14,385,360
  14,385,396
  14,385,418
  14,385,424
  14,385,466
  14,385,478
  14,385,641
  14,385,772
  14,386,130
  14,386,717
  14,387,423
  14,387,626
  14,387,922
  14,388,392
  14,388,565
  14,388,581
  14,388,599
  14,388,983
  14,389,723
  14,389,880
  14,389,949
  14,390,086
  14,390,191
  14,390,608
  14,391,017
  14,391,212
  14,391,218
  14,391,364
  14,392,133
  14,392,258
  14,392,263
  14,392,366
  14,392,402
  14,392,437
  14,392,528
  14,392,533
  14,392,689
  14,392,940
  14,393,025
  14,393,072
  14,393,093
  14,393,127
  14,393,175
  14,393,406
  14,393,747
  14,394,334
  14,394,631
  14,395,360
  14,395,489
  14,395,531
  14,395,595
  14,396,390
  14,396,468
  14,396,502
  14,396,862
  14,396,958
  14,397,204
  14,397,690
  14,397,791
  14,397,875
  14,397,889
  14,397,890
  14,397,904
  14,397,919
  14,398,109
  14,398,157
  14,398,861
  14,398,862
  14,398,896
  14,398,918
  14,399,001
  14,399,084
  14,399,211
  14,399,253
  14,399,387
  14,399,434
  14,399,829
  14,399,854
  14,399,855
  14,399,856
  14,401,148
  14,401,192
  14,401,677
  14,401,810
  14,401,840
  14,401,857
  14,402,761
  14,402,894
  14,402,898
  14,402,903
  14,402,904
  14,402,917
  14,402,926
  14,403,199
  14,403,590
  14,404,019
  14,404,608
  14,404,784
  14,404,859
  14,405,196
  14,405,217
  14,406,084
  14,406,556
  14,406,755
  14,406,763
  14,406,986
  14,407,159
  14,407,433
  14,407,702
  14,408,544
  14,408,673
  14,408,929
  14,409,555
  14,409,579
  14,410,049
  14,410,058
  14,410,062
  14,410,078
  14,410,079
  14,410,151
  14,410,283
  14,410,952
  14,411,084
  14,412,124
  14,413,006
  14,414,620
  14,415,178
  14,415,191
  14,415,251
  14,415,441
  14,415,735
  14,416,605
  14,416,806
  14,417,471
  14,417,666
  14,417,710
  14,417,959
  14,417,963
  14,417,986
  14,418,097
  14,418,220
  14,418,576
  14,418,602
  14,418,778
  14,419,184
  14,419,361
  14,419,795
  14,421,591
  14,423,910
A
T
A
G
G
T
A
G
-
4
20
4
T
-/C
-/C
-/C
T
7
5
C
G
T
3
-
A
C
C
T
T
T
8
C
T
A
T
G
T
-
C
G
T
G
C
C
G
A
A
T
T
T
A
C
A
A
26
C/-
-/C
-
?
C/-
C
A
G
T
-
T
A
-/G
A
8
4
C
A
5
A
G
-
-/T
-/T
T/-
A
-/A
T
T
A
G
G
A
A
C
G
T
-/T
C
A
A
T
-/G
T/-
G
G
A
C
A
T
G
C
A
C
A
-
A/-
T
T
T
A
T
C
C
7
A
A
G
G
G
G
A
A
T
C
G
A
-
G
A
A
T
C
C
G
T
A
T
G
T
T
-
-
C
G/T
-
T
G
-
A
21
T
C
A
T
A
G
G
C
G
C
G
-
T
12
-
2
T
A
G
C
T
C
C
G
C
A
T
T
C
G
G
A
A
A
C
A
G
9
-
A
G
44
A
C
G
A
T
A
?
A
G
A
-/G
-/G
-/T
G/-
2
G
C
3
3
A
T
T
G
C
C
T
C
A
G
8
A
A
C
A
A
C
T
C
A/-
A/-
-
A/-
-
-
C
22
G/-
T
G
A
C
G/-
T
C
C
G
3
C
T
C
C
-
T/A
G
18
A
G
A
G
G
G
G