Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 387,154 (bp)   Positions: 753
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
Fggy
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
LOC103692418
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
G
T
C
-
T
A
T
G
G
C
-
G
A
T
T
A
C
4
T
C
T
C
T
C
A
T
T
T
C
G
A
A
A
C
T
G
-
G
G
T
T
G
A
A
C
G
T
G
T
G
T
A
A
G
T
G
C
G
C
T
A
C
C
C
T
T
G
T
G
G
A
C
G
G
3
T
T
C
T
-
C
A
C
C
8
-
C
C
C
2
G
A
-
C
A
A
A
G
G
G
T
T
C
A
T
G
-
A
T
T
-
-
T
C
G
A
C
G
T
A
G
C
T
A
A
G
T
C
T
C
G
C
-
C
A
A
-
T
C
G
G
T
T
T
-
-
-
2
T
C
C
G
A
A
G
G
T
C
T
A
C
G
T
A
G
T
C
-
T
G
T
A
T
T
C
T
A
G
T
-
A
2
G
G
T
T
G
T
T
G
G
A
C
T
A
T
C
A
C
G
T
C
C
G
A
C
C
2
A
T
G
A
C
A
C
C
T
G
C
T
G
G
A
T
C
-
G
-
T
T
G
A
T
T
G
G
8
T
C
T
G
-
T
A
T
A
A
C
T
C
C
T
A
C
C
-
C
C
2
2
C
G
C
19
G
A
C
T
C
-
A
G
A
A
A
T
C
A
C
C
2
C
C
T
T
C
A
T
C
T
A
C
G
-
G
C
C
G
-
C
-
A
C
A
C
2
G
C
A
A
G
C
T
C
G
A
T
A
C
C
C
A
C
C
C
G
C
G
A
C
C
G
C
A
T
C
G
A
T
A
G
A
T
C
G
A
T
C
-
C
A
T
G
A
T
T
G
A
C
-
T
A
A
G
G
G
T
A
A
T
A
C
C
T
G
T
C
T
C
-
C
2
6
C
A
T
G
G
-
T
A
A
G
G
T
C
A
T
A
C
T
C
T
G
C
G
C
C
-
-
T
T
A
C
-
G
-
T
G
C
G
C
T
T
A
C
G
C
C
C
G
C
G
T
T
T
C
G
T
20
G
C
C
3
A
T
G
2
T
T
G
G
T
T
A
G
T
A
T
G
-
T
G
G
T
T
G
-
-
-
C
A
C
G
A
C
G
C
A
A
A
A
T
C
C
T
G
C
C
G
2
T
G
G
A
T
2
G
-
G
A
T
3
T
A
C
A
G
-
-
C
T
T
A
T
T
A
G
T
T
T
C
G
C
C
G
A
A
A
A
A
A
A
15
T
T
A
T
T
A
-
T
11
A
C
A
A
T
A
2
A
T
T
T
G
G
A
T
G
3
-
A
G
A
G
G
T
C
A
G
T
A
C
C
T
C
A
A
-
A
C
A
T
T
T
A
A
C
T
A
2
16
G
A
C
A
C
T
G
A
G
-
-
A
G
T
-
C
-
A
G
T
T
A
G
-
C
T
T
G
A
G
10
A
T
G
A
A
A
5
A
C
A
C
G
C
C
A
C
G
A
G
C
T
T
-
C
C
T
G
C
G
G
G
T
T
G
C
C
C
-
T
T
A
G
A
G
A
T
4
T
-
A
G
-
C
T
G
A
G
8
T
-
A
A
T
C
-
T
C
T
A
2
T
G
A
T
A
G
C
A
-
-
T
C
A
T
T
-
T
C
C
T
A
-
2
G
C
T
A
T
C
T
A
G
G
G
C
G
A
4
A
T
5
C
C
T
C
A
G
A
G
C
A
T
T
A
A
8
A
C
  110,400,271
  110,402,023
  110,402,035
  110,402,041
  110,402,043
  110,402,139
  110,402,177
  110,404,257
  110,404,608
  110,405,799
  110,407,306
  110,410,418
  110,412,068
  110,412,939
  110,419,333
  110,420,957
  110,421,736
  110,422,324
  110,422,381
  110,422,486
  110,422,700
  110,423,271
  110,423,314
  110,424,188
  110,424,708
  110,425,537
  110,425,768
  110,425,969
  110,426,271
  110,426,737
  110,427,062
  110,428,260
  110,428,513
  110,429,173
  110,431,515
  110,431,531
  110,431,784
  110,431,785
  110,432,515
  110,432,521
  110,432,588
  110,432,812
  110,432,908
  110,433,470
  110,433,550
  110,433,783
  110,433,815
  110,434,320
  110,434,458
  110,434,469
  110,434,482
  110,434,494
  110,434,505
  110,434,511
  110,434,521
  110,434,522
  110,434,601
  110,434,629
  110,434,669
  110,434,907
  110,434,909
  110,434,937
  110,434,989
  110,435,448
  110,435,564
  110,435,810
  110,435,824
  110,436,108
  110,436,146
  110,436,334
  110,436,843
  110,436,863
  110,436,968
  110,437,671
  110,437,712
  110,437,848
  110,438,166
  110,438,341
  110,438,786
  110,439,059
  110,439,620
  110,440,559
  110,440,626
  110,441,417
  110,441,745
  110,441,850
  110,442,027
  110,442,050
  110,442,140
  110,442,220
  110,442,284
  110,442,322
  110,442,343
  110,442,438
  110,442,882
  110,442,921
  110,443,276
  110,443,290
  110,443,362
  110,443,366
  110,443,563
  110,443,902
  110,443,945
  110,443,948
  110,444,007
  110,444,117
  110,444,633
  110,444,813
  110,445,488
  110,445,503
  110,445,875
  110,445,922
  110,446,577
  110,446,611
  110,446,797
  110,446,918
  110,447,117
  110,447,118
  110,447,593
  110,447,811
  110,447,933
  110,448,108
  110,448,197
  110,448,202
  110,448,318
  110,448,378
  110,448,426
  110,448,472
  110,448,916
  110,448,917
  110,448,929
  110,448,930
  110,449,164
  110,449,466
  110,449,575
  110,449,967
  110,450,042
  110,450,048
  110,450,302
  110,450,303
  110,450,972
  110,451,752
  110,452,444
  110,452,603
  110,453,355
  110,453,746
  110,455,551
  110,455,825
  110,455,953
  110,456,137
  110,456,325
  110,456,327
  110,456,385
  110,456,394
  110,456,414
  110,456,456
  110,456,615
  110,456,801
  110,456,809
  110,456,965
  110,456,975
  110,457,332
  110,457,483
  110,457,996
  110,458,147
  110,458,222
  110,458,345
  110,458,518
  110,458,520
  110,459,053
  110,459,108
  110,459,402
  110,459,457
  110,459,595
  110,459,756
  110,459,770
  110,460,311
  110,460,953
  110,461,291
  110,461,418
  110,461,432
  110,461,529
  110,461,772
  110,461,798
  110,461,868
  110,461,934
  110,462,090
  110,462,091
  110,463,247
  110,463,283
  110,463,334
  110,463,381
  110,463,439
  110,463,606
  110,464,008
  110,464,089
  110,464,205
  110,464,560
  110,464,646
  110,464,682
  110,464,974
  110,465,654
  110,465,750
  110,466,161
  110,466,180
  110,466,346
  110,466,472
  110,466,510
  110,468,140
  110,468,263
  110,468,272
  110,468,512
  110,468,685
  110,469,677
  110,471,812
  110,472,359
  110,472,423
  110,473,192
  110,473,364
  110,473,483
  110,473,609
  110,474,088
  110,474,625
  110,475,092
  110,475,271
  110,475,553
  110,475,699
  110,475,798
  110,477,688
  110,478,359
  110,478,692
  110,478,988
  110,479,252
  110,479,443
  110,479,704
  110,479,794
  110,479,911
  110,480,048
  110,480,452
  110,480,907
  110,480,908
  110,482,329
  110,482,344
  110,484,591
  110,486,892
  110,487,129
  110,489,530
  110,490,060
  110,491,951
  110,492,268
  110,492,913
  110,492,996
  110,493,776
  110,494,524
  110,496,571
  110,496,673
  110,497,071
  110,497,087
  110,497,204
  110,497,227
  110,497,931
  110,498,747
  110,500,328
  110,500,631
  110,500,632
  110,500,731
  110,501,151
  110,501,787
  110,502,547
  110,502,623
  110,503,676
  110,504,132
  110,504,723
  110,504,841
  110,505,038
  110,505,287
  110,506,938
  110,507,386
  110,508,359
  110,508,421
  110,508,527
  110,508,746
  110,510,029
  110,511,582
  110,512,386
  110,513,210
  110,513,295
  110,514,058
  110,514,736
  110,515,502
  110,516,312
  110,516,509
  110,518,631
  110,519,277
  110,519,778
  110,519,895
  110,520,785
  110,520,800
  110,520,804
  110,521,015
  110,521,071
  110,521,113
  110,521,394
  110,521,766
  110,521,967
  110,522,571
  110,523,033
  110,523,383
  110,523,458
  110,523,522
  110,523,696
  110,523,891
  110,524,638
  110,526,694
  110,527,202
  110,528,462
  110,529,038
  110,529,306
  110,531,903
  110,532,022
  110,532,412
  110,532,414
  110,533,529
  110,534,657
  110,537,137
  110,537,138
  110,537,633
  110,538,047
  110,539,380
  110,542,182
  110,542,234
  110,542,316
  110,543,090
  110,544,085
  110,544,620
  110,545,163
  110,545,444
  110,545,497
  110,546,202
  110,546,365
  110,546,377
  110,553,705
  110,553,988
  110,554,285
  110,554,479
  110,554,513
  110,555,675
  110,555,816
  110,556,687
  110,556,983
  110,557,505
  110,557,558
  110,558,160
  110,558,680
  110,559,235
  110,559,665
  110,560,611
  110,561,956
  110,562,879
  110,564,749
  110,564,863
  110,566,084
  110,566,723
  110,567,201
  110,567,597
  110,567,704
  110,567,738
  110,567,739
  110,567,864
  110,568,861
  110,569,187
  110,569,189
  110,569,722
  110,570,170
  110,570,854
  110,571,716
  110,572,013
  110,572,332
  110,572,554
  110,573,062
  110,573,782
  110,573,814
  110,575,813
  110,576,835
  110,576,869
  110,577,021
  110,579,475
  110,580,942
  110,581,859
  110,582,065
  110,582,438
  110,585,795
  110,586,993
  110,587,322
  110,587,538
  110,588,567
  110,590,781
  110,592,618
  110,592,976
  110,596,547
  110,596,923
  110,600,599
  110,601,762
  110,605,124
  110,609,088
  110,609,739
  110,610,340
  110,611,273
  110,613,520
  110,613,891
  110,615,241
  110,615,338
  110,615,382
  110,620,444
  110,621,174
  110,621,592
  110,621,808
  110,625,360
  110,626,111
  110,626,119
  110,626,552
  110,626,850
  110,627,055
  110,627,190
  110,627,353
  110,627,909
  110,627,990
  110,628,032
  110,628,777
  110,629,798
  110,630,070
  110,630,145
  110,630,379
  110,630,712
  110,631,032
  110,631,071
  110,631,192
  110,631,272
  110,631,419
  110,631,473
  110,631,563
  110,631,571
  110,631,697
  110,632,528
  110,633,203
  110,633,317
  110,634,344
  110,635,448
  110,637,965
  110,638,012
  110,638,013
  110,638,030
  110,638,069
  110,638,318
  110,638,361
  110,638,681
  110,638,742
  110,638,747
  110,638,749
  110,638,848
  110,638,875
  110,639,067
  110,639,106
  110,639,108
  110,639,620
  110,639,657
  110,639,676
  110,639,891
  110,640,230
  110,640,546
  110,640,576
  110,640,899
  110,641,421
  110,641,447
  110,641,890
  110,642,664
  110,643,594
  110,645,024
  110,646,457
  110,647,440
  110,647,516
  110,647,848
  110,649,477
  110,649,995
  110,650,094
  110,650,446
  110,650,873
  110,650,994
  110,651,044
  110,651,165
  110,651,451
  110,651,745
  110,651,750
  110,651,891
  110,651,967
  110,652,650
  110,653,019
  110,653,028
  110,653,046
  110,653,060
  110,653,183
  110,653,509
  110,654,185
  110,654,391
  110,654,401
  110,654,504
  110,654,683
  110,654,796
  110,654,966
  110,654,981
  110,655,516
  110,655,859
  110,655,954
  110,656,600
  110,656,601
  110,656,650
  110,657,286
  110,658,970
  110,659,895
  110,659,950
  110,659,961
  110,661,102
  110,661,394
  110,666,153
  110,666,193
  110,673,541
  110,675,234
  110,675,529
  110,676,417
  110,678,562
  110,678,564
  110,678,566
  110,678,568
  110,678,570
  110,678,572
  110,678,862
  110,680,490
  110,680,765
  110,680,883
  110,681,707
  110,681,717
  110,683,190
  110,683,700
  110,686,434
  110,688,139
  110,691,505
  110,691,985
  110,692,076
  110,692,300
  110,692,490
  110,692,491
  110,692,745
  110,694,358
  110,695,081
  110,695,822
  110,695,887
  110,696,653
  110,696,725
  110,697,544
  110,699,260
  110,700,720
  110,702,372
  110,705,828
  110,708,793
  110,709,294
  110,710,666
  110,710,727
  110,711,292
  110,711,384
  110,712,103
  110,712,221
  110,712,259
  110,713,374
  110,716,659
  110,717,222
  110,717,548
  110,717,549
  110,718,067
  110,718,687
  110,718,689
  110,720,684
  110,722,896
  110,723,079
  110,723,761
  110,724,284
  110,724,404
  110,724,770
  110,725,823
  110,726,117
  110,726,412
  110,727,164
  110,727,225
  110,727,230
  110,727,370
  110,727,442
  110,727,502
  110,727,551
  110,727,602
  110,727,949
  110,727,953
  110,728,178
  110,728,254
  110,728,256
  110,728,450
  110,728,676
  110,728,686
  110,728,697
  110,728,726
  110,728,738
  110,728,789
  110,728,811
  110,729,075
  110,729,210
  110,729,334
  110,729,394
  110,729,509
  110,729,533
  110,729,876
  110,730,137
  110,730,548
  110,730,931
  110,731,283
  110,731,476
  110,731,801
  110,731,836
  110,731,943
  110,732,060
  110,732,103
  110,732,375
  110,732,448
  110,732,905
  110,733,629
  110,734,044
  110,734,155
  110,734,238
  110,734,745
  110,735,163
  110,736,917
  110,736,941
  110,736,946
  110,736,957
  110,736,968
  110,736,979
  110,737,943
  110,738,282
  110,739,203
  110,739,385
  110,739,621
  110,739,962
  110,739,964
  110,740,350
  110,740,631
  110,740,851
  110,740,937
  110,740,985
  110,741,343
  110,741,422
  110,741,621
  110,741,701
  110,741,865
  110,741,984
  110,743,303
  110,743,658
  110,743,909
  110,744,303
  110,744,307
  110,744,400
  110,745,191
  110,746,224
  110,746,304
  110,747,148
  110,747,240
  110,747,262
  110,747,352
  110,747,500
  110,748,313
  110,748,332
  110,748,410
  110,748,545
  110,748,572
  110,748,598
  110,748,654
  110,748,832
  110,748,919
  110,749,024
  110,749,134
  110,749,464
  110,749,537
  110,749,607
  110,749,668
  110,749,806
  110,749,895
  110,750,506
  110,751,966
  110,752,057
  110,753,703
  110,753,779
  110,754,753
  110,755,215
  110,755,343
  110,755,648
  110,755,669
  110,755,702
  110,755,959
  110,755,960
  110,756,776
  110,757,018
  110,757,491
  110,757,686
  110,758,200
  110,758,288
  110,758,644
  110,758,785
  110,759,163
  110,759,618
  110,759,797
  110,759,865
  110,760,561
  110,760,801
  110,761,184
  110,762,000
  110,762,121
  110,764,215
  110,765,030
  110,767,177
  110,767,194
  110,767,760
  110,768,915
  110,769,640
  110,769,711
  110,771,419
  110,772,631
  110,773,484
  110,773,738
  110,773,851
  110,774,083
  110,774,708
  110,775,343
  110,775,985
  110,776,056
  110,776,168
  110,776,623
  110,777,353
  110,777,874
  110,779,095
  110,779,360
  110,779,398
  110,779,422
  110,782,302
  110,782,442
  110,782,967
  110,785,435
  110,785,775
G
T/A
G/-
T/C
C/A
T
T/-
G
C
A
A
T
G
A
C
-
C
G
T
-
C
T
C
T
A
T
G
C
C
C
T
A
G
G
T
T
C
A
T
T
T
C
C
A
G
T
T
T
G
T
-
A
C
G
C
T
C
A
T
A
A
G
T
T
T
T
C
G
C
A
A
A
T
G
T
A
-
C
A
T
C
T
T
G
T
A
-
2
T
T
T
-
T
G
T
T
C
-
G
A
A
A
-
C
A/T
T
C
A
A
G
A
C
T
25
-
T
C
C
T
A
C
G
T
T
A
-
-
A
C
T
C
T
A
T
A
G
C
C
G
G
G
-
A
C
G
C
2
A
A
-
C
G
G
T
T
T
C
C
A
T
C
G
T
A
C
G
T
A
-/A
T
C
A
C
T
C
C
A
A
G
A
C
A
G
-
A
A
C
C
C
-
C
A
A
G
T
C
G
-
T
G
T
A
C
T
T
A
G
G
T
-
G
C
A
G
A
G
T
T
A
A
T
C
A
C
T
G
T
2
A
A
C
C
A
G
C
C
A
C
-
A
A
C
T
G
G
G
C
G
-
T
C
T
T
A
T
T
A
T
G
T
-
-
G
A
T
-
A
G
A
-
T
G
G
A
G
G
G
C
T
G
-/T
T
-
T
T
A
C
T
G
C
A
C
T
T
C
3
A
T
-/T
A
T
A
3
G
G
G
G
-
C
T
C
G
A
A
C
T
A
T
C
G
A
T
T
G
T
T
G
A
T
A
G
G
T
A
T
G
C
G
A
G
C
G
A
C
C
T
C
G
C
T
T
T
C
A
A
G
C
C
A
C
T
4
C
T
G
A
A
A
C
G
T
A
G
T
-/G
C
A
C
T
C
T
T
A
-
-
T
-
C
A
A
10
C
G
T
A
A
A
A
G
C
C
-
C
T/-
C
A
T
A
A
A
T
2
C
C
G
T
T
A
A
A
A
T
A
T
C
C
G
A
A
T
A
G
A
T
T
-
G
G
A
C
C
-
A
A
-
-
G
A
A
-
-/A
C
A
C
A
G
G
A
G
T
-
A
A
A
A/C
A
C
A
A
6
57
-/41
T
T
T
A
G
A
A
T
T
G
G
C
C
A
T
G
A
T
A
A
-
G
A
A
T
G
-
-/A
2
C
T
C
-
A
G
A
T
A
T
A
T
C
C
G
C
C
G
A
A
C
-
T
A
G
T
A
C
T
T
T
T
T
T
-
C
C
G
-/A
-/A
G
3
C
-
G
T
T
G
C
G
-
G
C
G
C
A
A
G
C
A
-
C
C
A
G
A
A
G
T
G
A
C
G
T
T
C
T
-/G
A/G
12
G
T
T
C
C
C
T
G
T
C
T
-
-
C
G
T
G
G
C
A
G
T
4
T
G
A
C
10
T
T
T
A
C
C
G
T
5
T
A
A
A
G
A
-
C
C
A
T
G
G
-
-
T
G
T
A
T
T
G
A
A
G
A
T
C
G
2
G
G
C
A
-/A
A
A
A
C
C
A
T
T
T
G
C
C
C
A
T
A
G
C
-
G
50
T
A
3
T
C
C
G
T
-
C
G
T
T
C
T
T
A
-
G
G
-
-
A
G
A
G
T
T
G
C
7
C
G
G
G
G
C
C
T
T
C
G
A
-
A
G
C
-/T
C
T
C
-
C
A
C
G
C
G
-
T
A
-
T
T
A
T
G
T
G
T
T
G
G
C
T
G
-
G
T