Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 105,238 (bp)   Positions: 227
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LL/MavRrrcAek (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
Fgfr2
G
T
C
A
A
T
T
2
T
C
G
T
-
4
A
A
3
T
C
C
T
G
G
C
G
T
T
C
T
A
T
T
C
T
T
C
T
C
C
C
T
-
A
G
T
A
T
T
A
C
T
T
T
C
C
A
T
A
-
C
A
G
C
A
C
A
A
C
G
C
C
C
C
G
A
T
G
C
A
G
C
T
A
A
A
A
G
A
G
G
A
A
C
G
G
C
8
T
6
T
T
G
C
2
G
-
T
-
G
C
-
A
T
C
G
A
G
T
G
C
A
-
G
G
C
G
2
G
G
A
A
T
C
C
G
C
A
C
A
G
A
C
G
A
G
T
G
2
C
T
A
T
G
T
A
T
C
A
T
G
A
G
T
A
G
18
G
T
C
T
G
A
G
G
C
C
A
G
C
G
4
3
C
C
6
A
T
A
A
T
C
C
A
T
A
G
T
C
A
A
-
A
C
T
A
C
A
G
A
-
2
T
A
C
T
A
A
C
G
T
A
T
G
T
C
4
G
  184,745,628
  184,745,637
  184,745,655
  184,746,029
  184,746,683
  184,746,834
  184,748,164
  184,748,346
  184,748,393
  184,749,166
  184,749,340
  184,749,358
  184,749,604
  184,749,625
  184,749,683
  184,749,719
  184,749,806
  184,750,176
  184,750,274
  184,750,297
  184,750,567
  184,750,652
  184,750,718
  184,751,364
  184,751,702
  184,752,088
  184,752,247
  184,752,318
  184,752,488
  184,753,330
  184,755,004
  184,755,016
  184,755,210
  184,756,182
  184,756,392
  184,756,595
  184,756,639
  184,757,216
  184,757,259
  184,757,512
  184,757,662
  184,757,963
  184,758,163
  184,758,827
  184,759,983
  184,760,057
  184,760,359
  184,760,389
  184,760,565
  184,760,675
  184,760,692
  184,760,790
  184,760,883
  184,760,885
  184,761,107
  184,761,455
  184,761,902
  184,761,956
  184,763,011
  184,763,057
  184,763,468
  184,764,340
  184,764,426
  184,764,837
  184,765,172
  184,767,605
  184,767,662
  184,767,831
  184,768,441
  184,768,523
  184,768,530
  184,768,545
  184,769,231
  184,769,472
  184,769,491
  184,769,574
  184,771,665
  184,771,788
  184,772,745
  184,773,388
  184,774,834
  184,775,253
  184,775,359
  184,775,550
  184,775,638
  184,775,692
  184,776,152
  184,776,317
  184,776,413
  184,776,439
  184,776,506
  184,776,645
  184,778,062
  184,778,992
  184,779,072
  184,779,705
  184,780,402
  184,780,403
  184,780,692
  184,780,743
  184,780,869
  184,782,936
  184,783,072
  184,783,340
  184,783,721
  184,784,018
  184,784,064
  184,784,093
  184,785,036
  184,786,199
  184,786,862
  184,786,939
  184,787,680
  184,787,696
  184,788,251
  184,788,292
  184,788,440
  184,789,123
  184,789,200
  184,789,201
  184,789,621
  184,789,773
  184,790,207
  184,790,635
  184,791,244
  184,791,465
  184,791,753
  184,792,052
  184,793,016
  184,793,715
  184,793,787
  184,794,175
  184,794,253
  184,794,401
  184,794,605
  184,794,920
  184,795,020
  184,795,262
  184,795,333
  184,795,909
  184,796,170
  184,796,549
  184,797,118
  184,797,932
  184,798,107
  184,798,626
  184,798,656
  184,798,740
  184,798,743
  184,799,138
  184,799,570
  184,799,715
  184,800,164
  184,800,867
  184,801,034
  184,801,630
  184,802,157
  184,802,249
  184,802,427
  184,802,780
  184,803,473
  184,803,706
  184,803,778
  184,803,842
  184,805,129
  184,805,624
  184,806,167
  184,806,834
  184,809,423
  184,809,624
  184,809,774
  184,810,158
  184,810,288
  184,810,630
  184,811,299
  184,811,851
  184,812,143
  184,812,864
  184,813,140
  184,813,297
  184,814,263
  184,814,366
  184,814,886
  184,815,062
  184,816,961
  184,817,798
  184,818,206
  184,818,297
  184,818,339
  184,818,425
  184,818,483
  184,818,574
  184,818,664
  184,818,781
  184,820,097
  184,820,889
  184,821,364
  184,821,578
  184,821,984
  184,822,748
  184,824,241
  184,825,081
  184,827,635
  184,828,436
  184,828,443
  184,829,389
  184,829,504
  184,830,213
  184,830,464
  184,832,513
  184,833,170
  184,833,213
  184,833,475
  184,833,928
  184,834,714
  184,837,313
  184,840,244
  184,841,143
  184,841,874
  184,842,042
  184,842,046
  184,842,904
  184,843,557
  184,844,820
  184,846,735
  184,847,786
  184,847,979
A
C
T
G
G
C
C
-
C/-
T
T
C
T
-
G
C
-
C
T
A
C
A
T
T
A
A
A
T
C
G
C
C
T
C
C
T
C
T
T
T
C
32
G
A
C
G
G
C
G
A
A
A
G
G
T
G
C
G
2
T
G
A
T
G
T
G
G
T/-
A
A
T
T
A
A
G
C
A
G
G
A
T
C
G
G
T
G
A
G
A
A
G
G
T
C
A
T
-
C/-
-
G
A
A
T
-
A
A
C
-/10
A
T
A
G
G
G
C
G/-
A
C
A
T
C
37
T
A
G
T
-
A
C
G
G
C
T
T
A
T
G
T
G
T
G
T
A
G
A
C
A
-
T
C
C
C
A
C
C
C
A
G
C
C
G
T
A
G
A
-
T
A
A
C
A
G
T
A
A
T
-
C
T
A
-
-
-
T
-
G
C
-
C
C
A
T
T
G
G
A
C
T
G
T
A
G
A
C/-
-
G
G
A
T
5
-
G
C
T
C
G
T/-
T
A
C
G
A
T
C
A/-
-
A