Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 31,483 (bp)   Positions: 198
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
HXB10/IpcvMcwi (2019) 
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
F8
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
G
A
G
C
G
G
T
A
A
30
T
T
A
T
G
-
G
G
T
T
-
C
T
G
G
G
A
G
T
A
A
C
T
T
A
-
T
T
A
T
T
T
44
22
A
C
T
G
2
C
G
C
-
4
T
G
A
C
G
T
-
T
C
T
G
-
T
T
T
A
C
-
T
C
A
A
A
G
G
C
C
G
T
-
T
G
T
C
A
C
C
T
G
T
A
G
A
C
T
T
A
T
-
C
C
G
6
T
2
T
C
G
C
A
C
C
T
G
A
A
T
-
T
G
4
T
C
T
T
T
A
T
G
-
C
T
2
C
C
G
T
A
C
6
25
A
C
22
-
-
G
G
C
A
T
C
C
G
T
G
G
C
A
17
G
T
C
T
T
-
T
G
A
T
C
T
G
A
T
G
-
T
T
-
C
T
6
2
A
A
T
A
T
A
T
-
  140,925
  140,934
  141,001
  141,130
  141,205
  141,292
  141,328
  141,361
  141,462
  141,641
  141,840
  141,854
  142,237
  142,544
  142,840
  142,911
  143,027
  143,286
  143,561
  143,563
  143,635
  143,823
  143,850
  143,930
  143,946
  144,141
  144,170
  144,750
  144,885
  145,176
  145,423
  145,505
  145,506
  146,080
  146,164
  146,277
  146,439
  146,478
  146,686
  147,102
  147,147
  147,273
  147,407
  147,646
  147,909
  147,965
  148,029
  148,459
  148,600
  148,676
  148,680
  148,725
  148,766
  148,876
  149,273
  149,354
  149,358
  149,571
  149,825
  149,835
  149,873
  150,006
  150,062
  150,107
  150,167
  150,209
  150,214
  150,615
  150,837
  150,981
  151,117
  151,283
  151,303
  152,008
  152,067
  153,564
  153,565
  153,681
  153,948
  153,982
  154,516
  154,706
  154,709
  154,733
  155,088
  155,117
  155,360
  155,630
  155,993
  156,082
  156,195
  156,339
  156,523
  156,961
  157,129
  157,240
  157,394
  157,609
  157,918
  158,019
  158,201
  158,259
  158,348
  158,410
  158,460
  158,734
  158,928
  158,978
  159,042
  159,234
  159,425
  159,626
  159,634
  160,131
  160,325
  160,421
  160,430
  160,473
  160,680
  160,684
  161,105
  161,193
  161,215
  161,447
  161,659
  161,725
  161,823
  161,904
  162,183
  162,236
  162,273
  162,437
  162,637
  162,663
  163,086
  163,459
  163,688
  163,905
  164,069
  164,602
  164,640
  164,647
  164,808
  164,840
  164,891
  164,893
  165,074
  165,136
  165,155
  165,172
  165,320
  165,335
  165,377
  165,450
  165,639
  165,769
  166,057
  166,165
  166,255
  166,405
  166,853
  167,128
  167,131
  167,187
  167,445
  167,597
  168,077
  168,286
  168,476
  168,600
  168,890
  169,044
  169,164
  169,171
  169,196
  169,330
  169,505
  169,541
  169,543
  169,747
  170,187
  170,192
  170,215
  170,370
  170,636
  170,639
  171,074
  171,371
  171,466
  171,520
  171,800
  171,802
  171,819
  171,834
  171,994
  171,995
  172,182
  172,272
A
T
C
C
A
T
A/-
A
C
G
G
-
C
C
G
C
C
2
T
C
C
C
4
T
C
A
C
A
G
A
A
T
C
T
C
C
-
57
C
C
G
G
G
A
-
-
G
T
C
A
-
T
T
T
2
-
C
A
G
T
A
C
2
C
T
A
T
29
G
A
C
C
T
5
C
T
G
G
T
A
T
G
T
A
A
T
C
A
C
T
C
G
T
C
A
C
G
C
G
T
C
C
G
C
57
T
T
T
-
C
-
G
G
T
T
C
A
T
C
A
G
G
C
C
A
C
-
C
A
C
C
C
G
C
-
T
T
C
-
T
A
T
C
G
T
-
-
G
T
-
6
2
A
A
A
G
C
T
A
A
A
A
C
T
T
-
A
G
T
C
C
33
C
A
T
C
A
C
T
C
C
C
5
C
C
2
T
C
-
-
-/G
G
C
G
A
C
C
A