Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 292,061 (bp)   Positions: 681
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Casp6-ps2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
Erc1
G
A
C
C
T
C
G
T
A
A
C
T
C
T
G
C
3
G
C
G
T
C
T
A
T
A
A
-
-
T
T
T
A
A
A
A
-
A
T
A
C
T
T
G
T
C
C
T
G
T
A
-
4
12
A
C
G
C
C
C
T
C
C
C
T
G
C
T
T
T
G
G
G
G
G
G
G
G
C
A
C
A
G
13
G
A
C
C
T
G
A
A
T
T
C
A
A
C
C
C
T
7
-
A
C
4
T
C
A
C
T
A
G
-
T
G
G
T
C
-
A
G
C
G
C
C
C
A
T
C
G
-
C
A
G
G
A
-
C
A
-
A
G
G
G
G
C
T
A
C
T
G
C
G
G
A
G
G
G
G
G
A
G
-
T
T
T
A
-
A
A
2
T
T
G
T
T
G
4
A
C
G
T
C
T
A
T
C
T
-
T
C
G
T
G
T
G
A
10
T
A
G
3
A
G
-
4
G
G
A
C
G
T
G
A
C
T
C
C
G
G
T
C
-
T
T
G
A
T
T
C
G
C
T
G
T
G
C
C
-
2
T
C
C
C
C
3
G
A
A
A
T
G
T
A
A
G
T
-
-
T
T
C
A
G
A
C
A
-
A
A
-
32
A
A
C
-
T
T
A
A
T
G
A
A
A
A
-
G
G
C
C
4
T
T
T
G
10
G
A
A
T
2
C
A
C
T
8
-
A
T
T
T
T
C
G
T
G
T
G
G
T
C
A
A
G
A
C
T
G
T
T
-
A
A
A
G
C
G
G
C
C
T
G
-
G
A
A
A
G
T
T
A
C
-
-
G
4
T
G
T
-
C
G
A
A
T
-
C
T
C
G
A
T
C
T
G
T
T
T
A
T
12
2
T
-
-
T
G
A
16
C
C
G
T
C
A
C
A
A
T
T
G
C
A
A
-
A
G
A
G
C
G
A
-
4
A
123
G
A
C
A
A
A
C
C
T
T
T
T
T
G
G
G
A
C
T
G
C
G
T
T
T
G
T
T
A
A
A
G
A
C
T
2
A
G
C
A
T
C
T
G
A
G
G
A
C
G
T
G
G
A
A
A
C
C
C
G
T
C
G
T
A
G
G
A
C
A
T
C
C
A
T
T
A
7
A
A
G
T
T
C
T
A
A
A
G
-
T
A
A
G
T
G
C
A
A
G
A
C
C
G
-
C
C
T
A
A
-
A
A
2
C
C
A
C
G
-
-
-
A
G
C
C
A
C
A
G
-
-
2
G
-
-
T
T
-
A
A
C
2
T
G
C
G
C
G
-
A
C
C
C
G
A
C
A
C
G
T
C
4
T
T
C
T
C
T
G
A
G
G
A
C
G
C
-
G
G
G
G
C
T
G
-
T
A
C
T
C
A
T
34
T
G
A
A
G
G
C
-
A
C
C
C
G
A
C
T
C
G
T
3
T
G
T
G
C
T
2
T
G
C
C
-
-
4
C
G
C
A
C
T
G
G
T
G
T
T
T
C
G
G
A
A
G
C
G
C
C
C
A
G
G
C
G
4
G
C
-
C
T
  152,765,684
  152,767,751
  152,770,528
  152,771,866
  152,772,311
  152,772,966
  152,773,231
  152,773,243
  152,774,133
  152,775,560
  152,776,459
  152,776,493
  152,776,571
  152,777,777
  152,778,453
  152,779,627
  152,780,315
  152,781,704
  152,781,925
  152,782,177
  152,783,359
  152,784,281
  152,784,598
  152,784,625
  152,784,652
  152,785,072
  152,785,130
  152,785,182
  152,785,262
  152,785,541
  152,785,646
  152,785,662
  152,785,665
  152,785,673
  152,786,456
  152,786,489
  152,786,498
  152,786,983
  152,787,102
  152,787,470
  152,787,554
  152,788,434
  152,788,549
  152,788,683
  152,788,960
  152,788,996
  152,789,153
  152,789,229
  152,789,439
  152,789,587
  152,789,905
  152,789,944
  152,789,979
  152,789,988
  152,789,996
  152,790,274
  152,790,326
  152,790,443
  152,790,549
  152,790,600
  152,790,997
  152,791,068
  152,791,311
  152,791,522
  152,791,586
  152,791,951
  152,792,096
  152,792,116
  152,792,254
  152,792,460
  152,792,723
  152,792,727
  152,792,731
  152,792,735
  152,792,739
  152,792,743
  152,792,747
  152,792,751
  152,792,820
  152,792,939
  152,793,292
  152,793,370
  152,793,619
  152,794,497
  152,794,509
  152,794,526
  152,794,743
  152,795,286
  152,795,330
  152,795,637
  152,795,923
  152,796,261
  152,796,328
  152,796,337
  152,796,779
  152,796,843
  152,796,857
  152,796,947
  152,797,403
  152,797,592
  152,797,926
  152,798,088
  152,799,274
  152,799,508
  152,799,727
  152,799,905
  152,799,914
  152,800,137
  152,800,289
  152,800,485
  152,800,525
  152,800,609
  152,800,622
  152,801,203
  152,801,375
  152,801,582
  152,802,650
  152,802,738
  152,802,821
  152,803,082
  152,803,220
  152,803,310
  152,803,311
  152,803,691
  152,804,181
  152,805,324
  152,805,769
  152,806,262
  152,806,499
  152,807,769
  152,808,781
  152,809,595
  152,810,245
  152,810,349
  152,810,574
  152,810,605
  152,810,974
  152,811,152
  152,811,522
  152,811,529
  152,811,819
  152,812,642
  152,812,707
  152,812,740
  152,812,749
  152,813,861
  152,814,225
  152,815,686
  152,816,563
  152,818,442
  152,819,188
  152,819,662
  152,820,997
  152,821,293
  152,821,433
  152,821,459
  152,821,465
  152,821,471
  152,821,474
  152,821,480
  152,821,486
  152,821,568
  152,822,097
  152,823,584
  152,824,034
  152,824,730
  152,824,945
  152,826,123
  152,826,397
  152,826,553
  152,826,560
  152,826,838
  152,827,045
  152,828,174
  152,828,285
  152,828,868
  152,828,932
  152,829,247
  152,829,576
  152,830,049
  152,830,266
  152,830,750
  152,830,896
  152,830,975
  152,831,085
  152,831,205
  152,831,522
  152,831,778
  152,831,781
  152,831,974
  152,832,022
  152,832,393
  152,833,019
  152,833,887
  152,834,132
  152,834,680
  152,834,702
  152,834,779
  152,834,799
  152,835,929
  152,836,042
  152,837,305
  152,837,427
  152,837,434
  152,837,443
  152,837,579
  152,837,581
  152,837,602
  152,837,638
  152,837,670
  152,837,723
  152,837,732
  152,837,740
  152,837,755
  152,837,760
  152,837,765
  152,837,778
  152,837,799
  152,837,801
  152,837,810
  152,837,812
  152,838,790
  152,838,976
  152,839,109
  152,839,150
  152,839,511
  152,839,810
  152,840,097
  152,840,194
  152,840,248
  152,840,249
  152,840,510
  152,840,718
  152,840,934
  152,840,971
  152,840,981
  152,841,328
  152,841,855
  152,842,208
  152,842,734
  152,842,737
  152,847,081
  152,847,873
  152,847,992
  152,848,221
  152,848,451
  152,848,482
  152,848,756
  152,850,609
  152,851,139
  152,853,045
  152,853,100
  152,854,324
  152,854,415
  152,855,237
  152,857,147
  152,857,587
  152,857,607
  152,857,701
  152,857,737
  152,859,503
  152,860,568
  152,860,654
  152,862,450
  152,862,479
  152,862,570
  152,864,520
  152,865,014
  152,865,101
  152,866,568
  152,868,020
  152,868,793
  152,871,188
  152,871,964
  152,874,086
  152,874,822
  152,878,245
  152,880,476
  152,880,628
  152,882,040
  152,883,216
  152,883,446
  152,884,054
  152,885,263
  152,885,264
  152,885,267
  152,885,275
  152,885,491
  152,889,303
  152,890,012
  152,890,080
  152,890,542
  152,890,551
  152,890,855
  152,892,400
  152,893,095
  152,893,663
  152,894,483
  152,894,950
  152,895,653
  152,895,873
  152,896,568
  152,897,524
  152,897,917
  152,898,905
  152,900,707
  152,900,914
  152,904,737
  152,906,795
  152,908,336
  152,910,979
  152,911,180
  152,911,388
  152,912,026
  152,912,076
  152,912,516
  152,912,668
  152,912,851
  152,912,955
  152,914,066
  152,914,309
  152,915,611
  152,915,657
  152,915,746
  152,916,123
  152,916,737
  152,917,016
  152,917,268
  152,917,385
  152,917,647
  152,918,662
  152,918,816
  152,918,939
  152,919,015
  152,919,126
  152,919,795
  152,920,380
  152,921,148
  152,921,159
  152,921,568
  152,922,359
  152,922,614
  152,923,558
  152,924,917
  152,925,122
  152,925,954
  152,926,875
  152,927,851
  152,927,909
  152,929,164
  152,929,743
  152,930,454
  152,930,989
  152,932,610
  152,932,781
  152,932,804
  152,933,119
  152,933,122
  152,933,132
  152,933,135
  152,933,161
  152,933,809
  152,934,156
  152,934,749
  152,936,131
  152,937,310
  152,938,864
  152,938,967
  152,939,021
  152,940,631
  152,941,680
  152,942,222
  152,942,528
  152,942,625
  152,944,386
  152,944,648
  152,945,917
  152,946,705
  152,947,142
  152,947,294
  152,948,155
  152,948,410
  152,953,078
  152,954,303
  152,954,309
  152,954,338
  152,954,377
  152,954,399
  152,954,771
  152,954,864
  152,955,217
  152,955,581
  152,955,771
  152,956,284
  152,956,328
  152,956,586
  152,956,604
  152,956,953
  152,956,972
  152,957,031
  152,957,473
  152,957,730
  152,958,463
  152,958,480
  152,958,524
  152,959,442
  152,959,582
  152,960,212
  152,960,832
  152,961,651
  152,962,022
  152,962,028
  152,962,029
  152,962,063
  152,962,357
  152,962,391
  152,962,725
  152,963,044
  152,963,364
  152,963,538
  152,963,690
  152,965,552
  152,965,941
  152,966,244
  152,966,461
  152,966,587
  152,966,591
  152,966,622
  152,966,683
  152,966,951
  152,967,104
  152,967,330
  152,967,376
  152,967,893
  152,967,991
  152,968,248
  152,968,495
  152,968,530
  152,968,815
  152,969,376
  152,969,382
  152,969,607
  152,970,586
  152,970,718
  152,970,840
  152,970,845
  152,970,962
  152,971,200
  152,971,691
  152,972,086
  152,972,602
  152,972,793
  152,973,537
  152,974,245
  152,974,272
  152,974,473
  152,974,711
  152,975,941
  152,976,306
  152,976,520
  152,976,866
  152,976,910
  152,976,943
  152,977,252
  152,977,502
  152,978,498
  152,979,232
  152,979,235
  152,979,697
  152,979,710
  152,979,776
  152,980,048
  152,980,132
  152,980,344
  152,981,335
  152,982,124
  152,982,377
  152,982,389
  152,982,420
  152,982,871
  152,983,108
  152,983,337
  152,984,280
  152,984,869
  152,985,218
  152,985,493
  152,986,026
  152,986,095
  152,986,344
  152,986,485
  152,986,490
  152,986,608
  152,986,628
  152,986,708
  152,986,837
  152,986,941
  152,987,426
  152,988,055
  152,988,650
  152,989,108
  152,989,193
  152,989,230
  152,989,314
  152,989,724
  152,989,874
  152,990,398
  152,990,664
  152,991,240
  152,991,688
  152,991,881
  152,991,887
  152,992,234
  152,993,047
  152,993,072
  152,993,922
  152,994,328
  152,994,347
  152,994,896
  152,995,183
  152,995,537
  152,995,686
  152,995,705
  152,995,713
  152,996,031
  152,996,054
  152,996,186
  152,996,407
  152,996,608
  152,997,967
  152,998,295
  152,998,365
  152,998,493
  152,998,494
  152,998,498
  152,998,522
  152,999,077
  152,999,747
  152,999,880
  152,999,915
  152,999,917
  152,999,935
  153,000,466
  153,000,800
  153,000,964
  153,001,207
  153,002,376
  153,002,624
  153,002,701
  153,002,943
  153,003,166
  153,003,444
  153,003,495
  153,003,507
  153,003,508
  153,003,531
  153,003,921
  153,004,073
  153,004,172
  153,004,503
  153,004,911
  153,004,920
  153,005,628
  153,006,027
  153,006,328
  153,006,517
  153,006,726
  153,007,117
  153,007,198
  153,007,205
  153,007,302
  153,007,338
  153,008,026
  153,008,188
  153,008,589
  153,008,618
  153,008,833
  153,008,867
  153,008,923
  153,009,480
  153,009,608
  153,009,638
  153,009,642
  153,009,924
  153,010,238
  153,010,303
  153,010,504
  153,010,580
  153,010,662
  153,011,065
  153,011,112
  153,011,416
  153,011,504
  153,011,517
  153,011,990
  153,011,997
  153,012,713
  153,012,936
  153,012,937
  153,013,008
  153,013,180
  153,013,321
  153,013,765
  153,015,911
  153,015,942
  153,016,505
  153,016,668
  153,016,701
  153,016,897
  153,017,366
  153,017,494
  153,017,547
  153,018,456
  153,019,715
  153,019,798
  153,019,814
  153,020,013
  153,020,166
  153,021,599
  153,021,761
  153,021,831
  153,021,876
  153,022,951
  153,023,202
  153,023,370
  153,023,401
  153,024,143
  153,024,709
  153,025,292
  153,025,300
  153,025,700
  153,026,495
  153,027,122
  153,027,138
  153,027,145
  153,027,152
  153,027,167
  153,027,776
  153,027,780
  153,028,023
  153,028,025
  153,028,376
  153,029,457
  153,029,480
  153,031,686
  153,031,693
  153,032,353
  153,033,208
  153,033,426
  153,034,360
  153,034,368
  153,034,582
  153,034,846
  153,034,890
  153,035,697
  153,036,318
  153,037,028
  153,037,059
  153,037,150
  153,037,399
  153,037,698
  153,039,830
  153,040,130
  153,040,270
  153,041,148
  153,041,605
  153,041,917
  153,042,025
  153,042,447
  153,042,448
  153,042,694
  153,045,896
  153,046,228
  153,046,774
  153,047,271
  153,050,085
  153,050,364
  153,050,387
  153,051,034
  153,054,134
  153,054,303
  153,055,692
A
G
T
T
C
A
A
C
G
G
-/T
-/C
-/T
C
A
T
-
A
T
A
G
T
C
T
C
T
-
4
9
C
A
A/-
-/T
T
G
G
5
G
C
G
T
C
C
T
C
A
T
C
C
C
T
-/2
-
-
-/G
T
A
T
T
T
C
T
T
G
C
A
T
G
C
A
A/-
-/A
A/-
-/A
A/-
-/A
-/A
-/A
A
G
T
G
A
-
-/T
G
T
T
C
T
G
-/C
C
C
G
C
G
G
G
T
A
-
A
-
-
-
C
T
G
T
C
G
A
G
C
A
-
A
T
-/5
A/G
T
T
A
T
T
T
G
C
T
A
A
T
C
A
T
G
2
T
T
T
G
A
A
A
A
T
-
-/C
A
C
A
T
T
A/-
?
T
?
-/A
A
A
G/-
C
A
C
C
A
G
T
G
C
-
A
-
A
A
C
A
-
-
G
A
C
T
C
C
A
A
A
2
C
T
A
C
A
C
A
-
-
G
-
A
-
C
A
4
-
A
A
G
A
A
C
A
G
A
C
A
T
A
A
G
T
3
C
C
A
G
C
G
T
A
A
C
A
G
T
G
T
2
-
C
T
-
-
T
-
C
G
T
G
A
C
C
G
T
A
A
A
G
C
G
A
G
A
-
A
G
2
T
G
T
-
C
-
T
17
C
A
-
G
G
-/T
G/-
G/-
-/G
-/G
T
A
A
T
T
-
C
C
C
A
-
A
T
G
C
-
T
G
T
C
8/-
9
C
C
C
G
C
A
A
C
C
C
T
A
C
C/T
T
C
A
G
T
C
A
C
C
3
T
G
G
T/-
T
C
A
T
A
A
T
C
A
G
G
T
A
C
C
G
T
2
6
C
-
G
T
-/G
T
T
A
-
C
C
2
G
C
A
A
G
C
G
C
A
C
C
C
C/-
C
-
-
C
A
C
C
C
G
-
T
T
A
C
A
G
T
G
-
C
C
A
G
G
T
13
T
A
T
G/A
C/G
G/A
G/-
A
-
C
123/-
A
G
T
G
C
G
T
G
A
A
C
A
C
A
A
-
G
-
C
A
T
A
C
-
C
C
C
C
G
G
G
C
G
T
C
-
C
T
T
G
C
T
-
T
T
A
A
G
G
C
C
A
A
G
G
T
G
T
T
A
G
T
A
C
-
A
A
G
T
G
C
T
T
G
C
C
C
-
G
G
T
C
C
A
A
C
G
G
A
5
C
G
G
A
A
T
G
-/T
G
T
G
T
T
A
A
T
T
C
G
G
4
G
G
-
A/-
A
G
T
A
2
2
9
G
A
T
A
G
T
-
-
A
TC/C
-
-
3
77
C
C
3
G
G
T
-
G
A
A
T
A
A
C
C
T
T
C/A
A
C
T
G
T
A
C
A
-
A
C
T
G
G
C
C
C
A
A
T
G
A
A
-/A
A
A
A
C
A
A
C
G
C
G
T
-
A
C
C
-
C
A
G
G
A
A
T
2
C
T
T
G
C
C
A
C
T
A
A
-
G
T
A
A
T
C
-
C
A
T
G
G
2
-
T
A
A
G
T
-
A
A
-
A
C
C
G
T
A
A
-
C
T
T
A
T
T
G
T
A
T
T
A
-
T
T
4
A
C