Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 98,496 (bp)   Positions: 544
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
BXH3/CubMcwi (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
C
T
T
A
T
A
G
G
A
C
G
T
G
G
C
A
T
T
C
G
T
G
T
T
C
T
A
T
T
C
C
A
T
T
T
A
T
T
A
C
T
25
53
23
T
A
C
G
C
T
G
A
G
G
G
T
A
-
G
G
A
A
-
T
T
C
C
T
G
T
A
T
A
T
C
A
A
C
A
T
C
A
T
G
G
3
T
A
A
C
T
C
A
A
A
G
-
T
T
A
12
-
A
A
-
T
G
G
A
-
T
-
C
G
C
A
C
C
T
-
G
C
C
C
A
T
T
G
-
G
10
G
C
G
G
C
G
G
C
A
G
T
C
G
G
A
G
G
-
T
G
-
2
T
G
2
-
T
A
A
A
-
A
-
A
C
G
T
A
G
C
G
T
2
22
-
A
-
C
-
A
C
G
-
-
A
-
A
A
G
A
T
-
-
C
C
A
-
12
10
C
-
A
2
C
C
G
T
C
A
G
A
C
-
A
-
A
G
G
-
3
-
-
A
-
G
C
-
C
A
-
-
G
-
C
A
A
G
C
C
A
C
C
-
C
-
-
A
-
-
-
A
T
T
T
A
A
-
-
-
G
-
C
T
G
A
-
C
-
-
G
C
C
C
G
A
-
2
A
C
C
A
T
C
C
C
T
C
T
A
C
T
C
T
-
A
A
C
A
-
T
G
C
A
T
A
C
C
T
C
C
G
T
A
G
-
C
-
G
-
G
C
C
C
-
-
A
T
C
-
-
G
2
C
A
G
C
C
A
G
T
-
C
-
G
2
C
C
-
C
C
-
-
C
T
G
G
A
G
T
T
T
T
T
C
G
C
G
G
G
A
2
T
A
T
T
T
T
T
G
A
T
T
G
T
C
A
2
T
2
C
4
2
C
A
A
A
C
-
A
-
C
A
G
-
T
T
A
C
C
4
G
G
T
G
A
A
G
A
C
A
T
C
T
G
4
C
-
T
G
C
G
G
A
C
C
G
A
A
T
T
T
12
3
5
T
T
A
-
-
T
-
T
C
T
C
2
G
T
-
A
A
C
T
-
T
A
-
-
T
C
A
T
-
A
C
T
-
A
G
T
A
-
A
C
-
-
T
-
A
T
C
-
T
G
C
C
G
A
-
G
A
-
A
G
A
2
C
-
-
-
C
T
-
G
C
-
-
-
A
-
T
C
G
C
C
G
C
A
C
A
2
-
T
2
-
T
A
G
-
C
-
-
-
  170,389,551
  170,389,795
  170,390,226
  170,391,943
  170,392,348
  170,392,350
  170,392,354
  170,392,438
  170,392,473
  170,394,027
  170,394,186
  170,394,432
  170,394,789
  170,394,886
  170,395,081
  170,395,252
  170,395,313
  170,395,421
  170,395,437
  170,395,466
  170,395,899
  170,395,900
  170,396,666
  170,396,672
  170,396,694
  170,396,719
  170,396,863
  170,396,883
  170,396,896
  170,397,066
  170,397,148
  170,397,295
  170,397,296
  170,397,346
  170,397,438
  170,397,528
  170,397,537
  170,397,617
  170,397,629
  170,397,637
  170,397,638
  170,397,669
  170,397,698
  170,397,754
  170,398,000
  170,398,237
  170,398,250
  170,398,255
  170,398,312
  170,398,313
  170,398,390
  170,398,393
  170,398,432
  170,398,639
  170,398,754
  170,398,763
  170,398,766
  170,398,936
  170,399,024
  170,399,342
  170,399,514
  170,399,576
  170,399,642
  170,399,670
  170,399,671
  170,399,979
  170,400,086
  170,400,088
  170,400,204
  170,400,330
  170,400,504
  170,400,525
  170,400,563
  170,400,680
  170,400,731
  170,401,048
  170,401,127
  170,401,585
  170,401,680
  170,401,691
  170,401,760
  170,402,081
  170,402,234
  170,402,803
  170,402,908
  170,402,910
  170,403,154
  170,403,245
  170,403,247
  170,403,297
  170,403,698
  170,403,807
  170,403,947
  170,404,437
  170,404,451
  170,405,716
  170,405,806
  170,405,842
  170,406,144
  170,406,311
  170,406,330
  170,410,671
  170,411,001
  170,411,034
  170,411,290
  170,411,421
  170,411,527
  170,411,576
  170,411,903
  170,413,460
  170,414,835
  170,415,075
  170,416,174
  170,416,271
  170,418,020
  170,418,132
  170,418,600
  170,420,145
  170,420,816
  170,421,695
  170,423,248
  170,423,503
  170,423,744
  170,423,885
  170,423,965
  170,424,309
  170,424,343
  170,424,434
  170,424,496
  170,425,476
  170,426,475
  170,426,846
  170,427,005
  170,427,413
  170,427,613
  170,428,018
  170,428,021
  170,428,164
  170,428,281
  170,428,801
  170,429,004
  170,429,206
  170,429,208
  170,429,323
  170,429,525
  170,429,538
  170,429,830
  170,429,837
  170,430,174
  170,430,434
  170,431,055
  170,432,315
  170,433,229
  170,433,246
  170,433,248
  170,433,535
  170,434,086
  170,436,494
  170,436,527
  170,437,411
  170,437,487
  170,437,684
  170,437,758
  170,437,865
  170,437,880
  170,438,178
  170,438,226
  170,438,380
  170,438,491
  170,438,628
  170,438,633
  170,438,841
  170,438,878
  170,439,219
  170,439,512
  170,439,592
  170,439,609
  170,439,710
  170,439,793
  170,440,172
  170,440,255
  170,440,470
  170,440,474
  170,440,648
  170,440,675
  170,440,694
  170,440,905
  170,440,986
  170,441,061
  170,441,598
  170,441,676
  170,441,747
  170,441,936
  170,441,986
  170,441,999
  170,442,087
  170,442,214
  170,442,477
  170,442,538
  170,442,655
  170,442,711
  170,443,023
  170,443,050
  170,443,057
  170,443,058
  170,443,060
  170,443,401
  170,443,408
  170,443,473
  170,443,578
  170,443,754
  170,443,806
  170,443,886
  170,444,104
  170,444,232
  170,444,268
  170,444,269
  170,444,278
  170,444,399
  170,444,563
  170,444,608
  170,444,639
  170,444,686
  170,444,699
  170,444,708
  170,444,742
  170,444,754
  170,444,780
  170,445,183
  170,445,551
  170,445,896
  170,446,118
  170,446,187
  170,446,490
  170,446,533
  170,446,568
  170,446,624
  170,446,714
  170,446,760
  170,446,793
  170,447,138
  170,447,157
  170,447,163
  170,447,347
  170,447,409
  170,447,412
  170,447,418
  170,447,544
  170,447,550
  170,447,645
  170,447,715
  170,447,794
  170,447,798
  170,447,828
  170,447,842
  170,447,863
  170,447,875
  170,447,886
  170,447,972
  170,448,011
  170,448,175
  170,448,180
  170,448,205
  170,448,258
  170,448,307
  170,448,313
  170,448,351
  170,448,396
  170,448,423
  170,448,470
  170,448,491
  170,448,520
  170,448,639
  170,448,643
  170,448,665
  170,448,708
  170,448,759
  170,448,778
  170,448,819
  170,448,827
  170,448,912
  170,449,179
  170,449,191
  170,449,221
  170,449,238
  170,449,253
  170,449,258
  170,449,264
  170,449,268
  170,449,287
  170,449,316
  170,449,385
  170,449,388
  170,449,417
  170,449,422
  170,449,442
  170,449,448
  170,449,449
  170,449,475
  170,449,510
  170,449,537
  170,449,550
  170,449,748
  170,449,925
  170,449,958
  170,450,004
  170,450,051
  170,450,080
  170,450,134
  170,450,181
  170,450,193
  170,450,202
  170,450,215
  170,450,221
  170,450,356
  170,450,382
  170,450,471
  170,450,564
  170,450,695
  170,450,776
  170,450,824
  170,450,852
  170,451,096
  170,451,449
  170,451,495
  170,451,557
  170,451,586
  170,451,707
  170,451,722
  170,451,752
  170,451,782
  170,451,796
  170,451,860
  170,451,884
  170,451,913
  170,451,928
  170,451,938
  170,451,941
  170,451,983
  170,452,023
  170,452,077
  170,452,085
  170,452,153
  170,452,299
  170,452,319
  170,452,325
  170,452,328
  170,452,370
  170,452,377
  170,452,403
  170,452,480
  170,452,523
  170,452,527
  170,452,536
  170,452,639
  170,452,820
  170,452,838
  170,452,897
  170,453,053
  170,453,218
  170,453,220
  170,453,344
  170,453,722
  170,453,767
  170,454,202
  170,455,605
  170,456,051
  170,456,235
  170,457,733
  170,458,995
  170,459,131
  170,459,330
  170,459,455
  170,459,478
  170,459,583
  170,459,592
  170,459,603
  170,461,261
  170,465,632
  170,467,484
  170,468,630
  170,469,832
  170,469,871
  170,471,006
  170,471,013
  170,471,033
  170,471,034
  170,471,104
  170,471,179
  170,471,190
  170,471,616
  170,471,670
  170,471,690
  170,471,733
  170,471,779
  170,471,780
  170,471,970
  170,471,984
  170,472,033
  170,472,050
  170,472,063
  170,472,146
  170,472,175
  170,472,257
  170,472,287
  170,472,298
  170,472,316
  170,472,322
  170,472,442
  170,472,544
  170,472,609
  170,472,755
  170,472,757
  170,472,789
  170,472,838
  170,472,848
  170,472,864
  170,472,866
  170,472,940
  170,473,010
  170,473,347
  170,473,542
  170,473,950
  170,474,228
  170,474,522
  170,475,138
  170,475,200
  170,476,332
  170,476,335
  170,476,858
  170,476,979
  170,477,098
  170,477,569
  170,477,808
  170,478,313
  170,478,336
  170,478,408
  170,478,531
  170,478,542
  170,478,728
  170,478,955
  170,479,038
  170,479,233
  170,479,326
  170,479,330
  170,479,619
  170,479,621
  170,479,945
  170,480,004
  170,480,566
  170,481,697
  170,481,704
  170,481,717
  170,481,719
  170,481,757
  170,481,934
  170,481,948
  170,481,991
  170,482,007
  170,482,018
  170,482,020
  170,482,030
  170,482,053
  170,482,062
  170,482,141
  170,482,176
  170,482,179
  170,482,188
  170,482,203
  170,482,217
  170,482,266
  170,482,332
  170,482,336
  170,482,353
  170,482,384
  170,482,385
  170,482,399
  170,482,502
  170,482,525
  170,482,526
  170,482,569
  170,482,611
  170,482,760
  170,482,807
  170,482,840
  170,482,889
  170,482,898
  170,482,962
  170,482,978
  170,482,989
  170,483,024
  170,483,054
  170,483,059
  170,483,074
  170,483,078
  170,483,088
  170,483,119
  170,483,135
  170,483,165
  170,483,182
  170,483,199
  170,483,205
  170,483,212
  170,483,466
  170,483,557
  170,483,571
  170,483,692
  170,483,734
  170,483,767
  170,483,841
  170,483,866
  170,483,931
  170,483,945
  170,484,010
  170,484,071
  170,484,072
  170,484,094
  170,484,105
  170,484,143
  170,484,151
  170,484,332
  170,484,346
  170,484,388
  170,484,409
  170,484,419
  170,484,450
  170,484,451
  170,484,458
  170,484,459
  170,484,469
  170,484,487
  170,484,495
  170,484,506
  170,484,517
  170,484,995
  170,485,103
  170,485,639
  170,485,713
  170,485,764
  170,485,834
  170,485,955
  170,486,135
  170,486,232
  170,486,238
T
-
G
C
-/G
C
A
T
T
T
A
C
C
A
T
G
C
C
T
A
C
T
A
A
T
C
-
C
C
T
T
G
G
C
G
G
C
C/-
G
A
A
-
-
-
G
T
T
A
-
G
C
G
T
T/-
T/A
C
G
C
A
A
G
G
T
T/-
-/G
T
T
C
C
C
T
C
G
C
G
G
G
T
C
C
A
G
C
-
-
-
G
G
G
A
C
T
G
G
G
A
8
C
A
G
-
9
-
G
2
C
C
C
G
A
C
T
T
T
G
G
T
T
C
64
A
T
T
T
G
C
C
A
39
C
-
A
T
A
A
T
A
A
A
G
T
C
T
A
A
T
A
A
A
C
A
8
-
G
C
-
2
G
G
G
G
G
G
G
C
-
A
C
G
T
-
T
-
-
-
2
-/G
2
T
A
-
-
A
C
A
G
T
-
T
C
T
C
C
T
-
-
-
2
-
-
T
8
T
-
T/-
T
A
C
T
G
C
G
T
C
G
C
G
-
-
T
-
C
A
-
T
-
-
A
T
G
T
A
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
A
G
A
G
A
C
A
C
C
-
-
-
-
-
-
C
C
C
-
G
-
C
A
C
C
-
G
G
-
-
T
A
A
-
A
-
G
G
-
-
C
-
T
-
A
-
C
G
-
C
G
A
4
C
-
G/-
G
T
G
T
-
T
-
T
A
-
-
-
-
C
C
C
T
A
T
3
A
A
T
-
T
-
G
A
-
C
-
A
A
-
-
T
-
-
-
A
-
A
C
C
T
2
C
-
T
-
C
A
-
C
A
-/T
C
A
A
-
T
C
C
C
C
C
A
A
G
A
A
T
G
-
C
G
C
C
G
A
C
A
C
C
C
A
G
G
G
-
A
-
T
-
-
G
G
C
G
T
9
G
C
G
G
A
2
G
G
C
G
A
-
T
T
C
T
G
G
C
T
T
C
G
T
C
A
-
G
A
G
A
T
-
A
G
A
T
A
-
G
C
C
G
-
-
-
-/C
C/-
G
T
A
C
A
A
G
C
-
-
-
A
A
T
-
-
-
A
G
-
T
C
-
-
-
-
T
C
A
A
G
G
C
-
C
A
-
-
T
A
A
C
T
-
-
A
-
-
-
-
-
-
C
-
C
C
-
-
-
-
-
A
G
G
-
-
T
-
A
G
G
A
-
A
C
-
-
-
G
C
A
C
-
-
-
A
-
-
2
-
-
-
T
-
T
A
T