Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 98,496 (bp)   Positions: 378
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
BUF/N (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
Eps8
A
A
T
T
-
T
T
G
A
G
C
T
G
T
G
G
A
T
G
T
A
T
G
G
C
G
T
T
C
T
A
T
T
C
A
T
T
T
A
T
T
-
T
T
T
A
C
T
25
53
23
G
T
A
C
G
G
G
A
G
C
C
20
T
G
G
G
T
A
-
G
G
A
A
-
T
C
T
G
T
A
T
A
C
A
A
C
C
A
T
C
A
T
C
G
G
3
T
A
A
C
T
C
A
A
A
A
T
C
A
A
T
T
-
T
C
C
7
G
G
G
T
A
G
A
42
24
9
A
A
-
-
2
T
G
G
A
T
T
T
C
C
G
C
T
G
C
C
A
A
C
C
T
G
G
A
-
T
-
C
C
T
-
-
A
C
-
-
A
-
-
C
C
A
-
-
G
G
-
-
-
A
-
G
C
-
-
-
G
-
C
A
A
G
C
C
A
C
C
-
-
-
A
-
-
-
A
T
T
T
A
A
-
-
-
G
-
C
-
C
-
-
G
C
A
-
C
A
C
C
C
C
C
-
C
T
C
T
C
C
A
G
-
G
C
C
-
-
A
C
-
-
G
2
A
G
C
C
A
-
-
C
A
3
C
3
A
C
C
A
A
A
A
-
A
T
C
2
C
-
C
C
-
-
C
C
T
T
T
T
-
T
C
C
2
G
T
-
A
A
C
T
-
T
A
-
-
T
C
A
T
-
A
C
T
-
A
G
T
A
-
A
C
-
-
T
-
T
C
-
T
G
C
C
G
A
-
G
A
-
A
G
A
C
-
-
-
C
T
-
G
C
-
-
-
A
-
C
G
C
C
G
C
A
C
A
2
-
T
2
T
A
G
-
C
-
-
-
  170,392,350
  170,392,660
  170,392,678
  170,393,041
  170,393,517
  170,393,559
  170,393,675
  170,393,774
  170,394,044
  170,394,072
  170,394,128
  170,394,151
  170,394,153
  170,394,432
  170,394,789
  170,394,886
  170,395,252
  170,395,421
  170,395,466
  170,395,694
  170,395,702
  170,395,899
  170,395,900
  170,395,942
  170,396,035
  170,396,333
  170,396,666
  170,396,672
  170,396,694
  170,396,719
  170,396,863
  170,396,883
  170,396,896
  170,397,148
  170,397,295
  170,397,296
  170,397,346
  170,397,438
  170,397,528
  170,397,537
  170,397,589
  170,397,592
  170,397,593
  170,397,597
  170,397,617
  170,397,629
  170,397,637
  170,397,638
  170,397,669
  170,397,698
  170,397,754
  170,397,835
  170,398,000
  170,398,237
  170,398,250
  170,398,255
  170,398,330
  170,398,390
  170,398,393
  170,398,432
  170,398,495
  170,398,518
  170,398,566
  170,398,589
  170,398,639
  170,398,754
  170,398,755
  170,398,763
  170,398,766
  170,398,993
  170,399,024
  170,399,342
  170,399,514
  170,399,576
  170,399,642
  170,399,670
  170,399,979
  170,400,088
  170,400,204
  170,400,330
  170,400,504
  170,400,525
  170,400,563
  170,400,731
  170,401,048
  170,401,127
  170,401,405
  170,401,585
  170,401,680
  170,401,691
  170,401,760
  170,402,081
  170,402,234
  170,402,393
  170,402,803
  170,402,908
  170,402,910
  170,403,154
  170,403,245
  170,403,247
  170,403,297
  170,403,698
  170,403,946
  170,403,947
  170,404,018
  170,404,063
  170,404,242
  170,404,400
  170,404,409
  170,404,437
  170,404,451
  170,404,591
  170,404,678
  170,404,835
  170,404,994
  170,405,073
  170,405,112
  170,405,123
  170,405,404
  170,405,408
  170,405,497
  170,405,551
  170,405,735
  170,405,994
  170,406,311
  170,410,545
  170,410,614
  170,410,656
  170,411,001
  170,411,034
  170,411,088
  170,411,290
  170,411,348
  170,411,421
  170,411,527
  170,411,576
  170,411,903
  170,412,924
  170,414,835
  170,415,076
  170,415,253
  170,416,174
  170,416,271
  170,416,389
  170,417,841
  170,417,993
  170,418,004
  170,418,020
  170,418,132
  170,418,170
  170,419,751
  170,420,304
  170,420,816
  170,420,960
  170,420,978
  170,421,115
  170,421,695
  170,421,755
  170,437,865
  170,438,178
  170,438,633
  170,438,878
  170,439,166
  170,440,172
  170,440,255
  170,440,470
  170,440,648
  170,440,905
  170,440,986
  170,441,936
  170,441,986
  170,441,999
  170,442,087
  170,442,214
  170,444,104
  170,444,268
  170,444,278
  170,444,399
  170,444,563
  170,444,639
  170,444,686
  170,444,699
  170,444,708
  170,444,742
  170,444,754
  170,444,780
  170,445,896
  170,446,118
  170,446,187
  170,446,490
  170,446,533
  170,446,568
  170,446,624
  170,446,714
  170,446,760
  170,446,793
  170,447,138
  170,447,157
  170,447,163
  170,447,347
  170,447,412
  170,447,418
  170,447,544
  170,447,550
  170,447,645
  170,447,715
  170,447,794
  170,447,798
  170,447,828
  170,447,842
  170,447,863
  170,447,875
  170,447,886
  170,447,972
  170,448,011
  170,448,175
  170,448,180
  170,448,205
  170,448,351
  170,448,396
  170,448,423
  170,448,470
  170,448,491
  170,448,520
  170,448,708
  170,448,759
  170,448,912
  170,449,179
  170,449,221
  170,449,253
  170,449,264
  170,449,316
  170,449,449
  170,449,510
  170,449,748
  170,449,958
  170,450,080
  170,450,134
  170,450,181
  170,450,193
  170,450,221
  170,450,356
  170,450,776
  170,450,824
  170,450,852
  170,451,449
  170,451,495
  170,451,557
  170,451,586
  170,451,722
  170,451,752
  170,451,782
  170,451,796
  170,451,860
  170,451,913
  170,451,928
  170,451,938
  170,451,941
  170,451,983
  170,452,085
  170,452,088
  170,452,153
  170,452,182
  170,452,188
  170,452,196
  170,452,201
  170,452,214
  170,452,217
  170,452,222
  170,452,230
  170,452,232
  170,452,233
  170,452,234
  170,452,242
  170,452,250
  170,452,263
  170,452,268
  170,452,325
  170,452,370
  170,452,377
  170,452,403
  170,452,480
  170,452,523
  170,452,527
  170,452,536
  170,475,200
  170,479,619
  170,479,621
  170,479,623
  170,481,697
  170,481,704
  170,481,717
  170,481,719
  170,481,934
  170,481,948
  170,481,991
  170,482,007
  170,482,018
  170,482,020
  170,482,030
  170,482,053
  170,482,062
  170,482,141
  170,482,176
  170,482,179
  170,482,188
  170,482,203
  170,482,217
  170,482,266
  170,482,332
  170,482,336
  170,482,353
  170,482,384
  170,482,385
  170,482,399
  170,482,502
  170,482,525
  170,482,526
  170,482,569
  170,482,611
  170,482,760
  170,482,807
  170,482,840
  170,482,889
  170,482,898
  170,482,962
  170,482,978
  170,483,024
  170,483,054
  170,483,059
  170,483,074
  170,483,078
  170,483,088
  170,483,119
  170,483,135
  170,483,165
  170,483,182
  170,483,199
  170,483,205
  170,483,212
  170,483,466
  170,483,557
  170,483,571
  170,483,734
  170,483,767
  170,483,841
  170,483,866
  170,483,931
  170,483,945
  170,484,010
  170,484,071
  170,484,072
  170,484,094
  170,484,105
  170,484,143
  170,484,151
  170,484,332
  170,484,388
  170,484,409
  170,484,419
  170,484,450
  170,484,451
  170,484,458
  170,484,459
  170,484,469
  170,484,487
  170,484,495
  170,484,506
  170,484,517
  170,484,995
  170,485,639
  170,485,713
  170,485,764
  170,485,834
  170,485,955
  170,486,135
  170,486,232
  170,486,238
C
C
C
C
T
C
C
C
G
A
T
A
A
C
C
A
G
C
A
C
-
C
T
A
T
A
A
A
T
C
-
C
C
T
G
G
C
G
G
C
C
6
C
C
-/C
G
A
A
-
-
-
C
G
T
T
A
T
C
G
T
A
T
-
-/G
T/-
A/T
C
C
G
A
A
A
G
G
T
-
T
C
C
C
T
C
G
G
G
G
T
T
C
C
A
G
C
T
-
-
-
G
G
G
A
C
A
G
G
G
G
C
A
G
G
C
G
G
C
T
-
-
A
C
T
C
G
A
G
-
-
-
-
G
G
2
-
C
C
C
G
C
C
G
T
T
T
T
C
C
T
G
G
C
T
T
C
C
A
G
64
C
G
-
-
-
A
A
-
-
C
T
-
C
T
-
-
-
C
C
-
-
T
C
A
-
T
-
-
A
T
A
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
A
G
G
A
C
A
C
C
-
-
-
-
-
-
C
C
C
-
G
-
C
-
G
G
-
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-/G
T
-
-
-
-
-
-
C
T
A
T
-
-
G
A
-
-
A
A
-
-
-
-
-
A
-
C
C
T
T
-
-
-
T
-
-
T
T
C
C
2
-
-
T
-
-
C
A
-
C
A
T/-
G
C/-
-/C
-/C
C
A
A
G
-
-
-
A
A
T
-
-
-
A
G
-
T
C
-
-
-
-
T
C
A
A
G
G
C
-
C
A
-
-
T
A
A
C
-
-
A
-
-
-
-
-
-
C
-
C
C
-
-
-
-
A
G
G
-
-
T
-
A
G
G
A
-
A
-
-
-
G
C
A
C
-
-
-
A
-
-
-
-
-
T
-
T
A
T