Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 125,592 (bp)   Positions: 190
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
BXH3/CubMcwi (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
Elavl2
T
C
A
A
C
C
A
T
T
A
-
C
T
T
A
C
T
T
C
-
T
C
G
4
G
T
C
A
A
C
G
-
A
T
A
C
G
T
G
G
A
A
C
A
G
C
-
A
T
A
T
G
T
A
A
-
T
T
C
G
T
A
T
G
G
T
T
-
C
C
T
G
T
A
-
T
A
4
3
G
-
T
G
A
T
C
-
G
G
T
A
A
T
G
T
C
C
G
C
G
A
A
G
T
T
C
A
-
-
-
G
G
T
G
C
A
-
T
A
G
G
T
T
C
T
G
C
A
A
C
G
G
G
-
T
C
A
3
T
G
C
A
6
A
C
A
T
G
A
C
G
A
G
T
T
T
C
G
G
T
A
T
T
-
-
A
C
T
C
G
G
G
-
-
-
A
A
G
C
-
G
C
-
A
G
-
T
A
G
-
  105,961,776
  105,962,128
  105,962,903
  105,962,914
  105,963,715
  105,964,616
  105,965,293
  105,966,380
  105,966,863
  105,967,175
  105,967,373
  105,967,555
  105,967,602
  105,968,051
  105,968,821
  105,970,932
  105,972,650
  105,973,126
  105,973,164
  105,974,543
  105,975,374
  105,978,254
  105,979,036
  105,979,182
  105,979,242
  105,979,560
  105,979,974
  105,980,364
  105,980,385
  105,980,519
  105,980,737
  105,980,776
  105,980,828
  105,981,435
  105,981,982
  105,982,029
  105,984,027
  105,984,821
  105,984,933
  105,987,679
  105,988,984
  105,993,122
  105,993,123
  105,993,145
  105,993,147
  105,994,201
  105,998,126
  106,000,811
  106,004,895
  106,005,215
  106,005,440
  106,006,439
  106,006,675
  106,007,170
  106,008,914
  106,010,856
  106,011,903
  106,013,091
  106,013,591
  106,015,620
  106,016,412
  106,016,531
  106,019,660
  106,025,157
  106,025,287
  106,025,382
  106,026,315
  106,028,824
  106,029,060
  106,029,083
  106,029,768
  106,030,268
  106,030,545
  106,030,836
  106,030,859
  106,030,883
  106,032,195
  106,036,656
  106,039,756
  106,039,879
  106,039,963
  106,040,613
  106,041,612
  106,042,124
  106,043,280
  106,043,296
  106,044,309
  106,044,483
  106,044,569
  106,044,784
  106,045,036
  106,047,097
  106,048,222
  106,048,475
  106,048,604
  106,048,919
  106,048,921
  106,049,334
  106,049,374
  106,049,755
  106,049,777
  106,050,247
  106,050,280
  106,050,623
  106,051,455
  106,051,558
  106,052,089
  106,052,630
  106,052,631
  106,052,753
  106,053,278
  106,054,649
  106,055,238
  106,055,482
  106,055,839
  106,056,013
  106,056,064
  106,056,564
  106,056,579
  106,057,247
  106,057,377
  106,057,835
  106,058,218
  106,058,785
  106,058,876
  106,059,034
  106,059,496
  106,059,585
  106,060,099
  106,061,102
  106,061,107
  106,061,267
  106,061,403
  106,061,723
  106,061,830
  106,061,994
  106,062,212
  106,062,377
  106,062,566
  106,062,743
  106,063,105
  106,063,265
  106,063,705
  106,063,752
  106,064,182
  106,064,223
  106,064,506
  106,064,696
  106,065,061
  106,065,763
  106,066,770
  106,066,773
  106,067,199
  106,068,388
  106,068,539
  106,068,972
  106,069,175
  106,069,343
  106,070,013
  106,071,395
  106,072,253
  106,073,333
  106,074,123
  106,075,092
  106,075,204
  106,075,536
  106,075,599
  106,076,100
  106,076,117
  106,076,626
  106,077,379
  106,077,506
  106,077,514
  106,077,597
  106,077,843
  106,078,078
  106,078,695
  106,079,196
  106,079,293
  106,079,820
  106,080,036
  106,080,326
  106,080,382
  106,081,097
  106,082,368
  106,082,853
  106,083,364
  106,084,090
  106,084,225
  106,084,590
-
A
-
G
T
T
G
C
C
T
2
T
C
A
C
A
C
C
T
6
C
T
T
-
C
A
A
C
T
T
T
A
T
C
C
T
T
G
A
A
-
G
T
C
A
T
A
G
C
C
C
C
A
G
G
G
C
C
A
T
C
G
-
C
A
C
C
4
A
T
C
A
C
T
3
G
G
-
-
C
9
C
A
G
C
-
3
-
A
G
-
G
-
A
C
T/-
C/T
C
T
T
G
G
A
C
C
G
-
2
5
C
T
A
A
T
T
G
A
C
G
A
A
C
A
T
G
A
A
G
-
T
A
C
A
A
C
A
G
-
C
C/A
T
G
-
G
G
G
C
A
G
T
A
T
A
C
G
G
A
A
T
C
G
C
C
2
G
G
T
C
G
C
A
A
6
A
T
G
G
C
G/-
2
A
T
A
C
-
T
C
G
T
G