Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 58,424 (bp)   Positions: 253
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEW/Crl (2019) 
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
Dsg2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
-
-
C
-
-
G
-
C
G
C
G
A
A
T
4
-
A
A
A
A
5
C
G
G
C
A
A
7
T
C
C
T
C
A
-
T
C
G
T
T
C
-
C
C
G
G
G
G
T
G
A
A
G
-
16
4
G
T
A
C
C
T
A
T
T
T
A
-
G
-
-
C
G
C
A
A
T
T
G
T
G
G
T
C
G
A
A
4
59
A
A
T
G
G
C
A
A
T
C
G
-
5
A
T
2
G
C
T
T
-
G
G
C
C
A
C
C
C
T
A
G
G
A
T
-
T
A
A
-
G
C
T
C
A
C
G
T
T
C
A
T
A
G
T
T
C
A
2
-
G
A
2
T
-
T
-
C
T
-
-
C
T
A
G
G
A
A
A
G
C
C
A
T
G
T
A
A
A
G
G
C
G
T
G
C
A
G
A
T
C
A
C
G
A
-
2
A
A
G
T
T
C
A
C
A
-
C
-
T
T
C
51
68
G
T
G
C
A
G
T
C
G
C
A
-
G
G
T
A
G
C
A
T
A
A
C
T
G
C
T
G
A
A
T
G
C
A
T
-
G
A
A
  11,846,372
  11,847,475
  11,847,795
  11,847,897
  11,848,353
  11,848,420
  11,849,183
  11,849,260
  11,849,368
  11,849,374
  11,849,555
  11,849,602
  11,849,691
  11,850,240
  11,850,260
  11,850,777
  11,850,809
  11,850,813
  11,850,817
  11,850,821
  11,851,199
  11,851,314
  11,851,756
  11,851,892
  11,851,893
  11,852,031
  11,852,101
  11,852,646
  11,852,677
  11,852,735
  11,853,484
  11,853,732
  11,854,477
  11,854,478
  11,854,550
  11,854,611
  11,855,891
  11,856,367
  11,856,411
  11,856,560
  11,856,672
  11,856,789
  11,856,812
  11,856,862
  11,857,287
  11,862,118
  11,863,433
  11,863,876
  11,864,018
  11,864,259
  11,864,724
  11,864,814
  11,865,251
  11,865,284
  11,865,465
  11,866,189
  11,866,213
  11,866,492
  11,866,496
  11,866,867
  11,868,595
  11,869,096
  11,869,513
  11,869,660
  11,870,317
  11,870,450
  11,870,477
  11,870,509
  11,870,750
  11,870,845
  11,870,890
  11,870,892
  11,870,893
  11,870,938
  11,871,059
  11,871,216
  11,871,249
  11,871,366
  11,871,814
  11,872,096
  11,872,147
  11,872,434
  11,873,322
  11,873,446
  11,873,448
  11,873,656
  11,873,762
  11,873,990
  11,874,009
  11,874,014
  11,874,257
  11,874,277
  11,874,316
  11,874,569
  11,874,597
  11,874,697
  11,874,764
  11,875,004
  11,875,319
  11,875,326
  11,876,796
  11,877,676
  11,877,750
  11,878,213
  11,879,730
  11,880,944
  11,883,139
  11,885,386
  11,889,773
  11,889,791
  11,890,428
  11,891,118
  11,892,644
  11,892,738
  11,892,854
  11,892,863
  11,892,875
  11,892,894
  11,893,032
  11,893,048
  11,893,062
  11,893,063
  11,893,087
  11,893,090
  11,893,132
  11,893,143
  11,893,168
  11,893,213
  11,893,231
  11,893,249
  11,893,286
  11,893,468
  11,893,543
  11,893,548
  11,893,554
  11,893,555
  11,893,591
  11,893,601
  11,893,618
  11,893,633
  11,893,662
  11,893,728
  11,893,738
  11,893,743
  11,893,759
  11,893,765
  11,893,792
  11,893,796
  11,893,798
  11,893,817
  11,893,866
  11,894,081
  11,894,094
  11,894,270
  11,894,284
  11,894,313
  11,894,363
  11,894,437
  11,894,530
  11,894,598
  11,894,603
  11,895,478
  11,895,572
  11,895,597
  11,895,604
  11,895,625
  11,895,681
  11,895,693
  11,895,753
  11,895,760
  11,895,956
  11,895,971
  11,895,974
  11,895,997
  11,895,998
  11,896,032
  11,896,051
  11,896,052
  11,896,096
  11,896,143
  11,896,174
  11,896,235
  11,896,266
  11,896,270
  11,896,288
  11,896,294
  11,896,298
  11,896,302
  11,896,303
  11,896,328
  11,896,369
  11,896,418
  11,896,485
  11,896,585
  11,896,600
  11,896,633
  11,896,634
  11,896,652
  11,896,654
  11,896,655
  11,896,705
  11,896,858
  11,896,908
  11,897,131
  11,897,133
  11,897,137
  11,897,142
  11,897,207
  11,897,232
  11,897,396
  11,897,402
  11,897,476
  11,897,618
  11,897,672
  11,897,915
  11,897,927
  11,897,970
  11,898,270
  11,898,273
  11,898,278
  11,898,288
  11,898,301
  11,898,342
  11,898,437
  11,898,447
  11,898,483
  11,898,618
  11,899,096
  11,899,422
  11,899,428
  11,899,653
  11,899,683
  11,899,758
  11,899,800
  11,899,910
  11,899,914
  11,899,999
  11,900,018
  11,900,117
  11,900,386
  11,900,626
  11,900,807
  11,900,881
  11,900,895
  11,901,487
  11,901,662
  11,902,338
  11,902,903
  11,903,273
  11,904,084
  11,904,284
  11,904,285
  11,904,380
T
7
34
-
24
4
A
32
A
A
T
A
G
T
C
-
T
T
T
T
G
-
T
-
T
A
G
G
-
A
G
A
G
T
G
4
C
T
A
G
A
T
59
T
T
-
C
A
T
C
A
G
G
T
5
-
-
A
-
T
T
G
C
G
G
C
C
G
C
A
2
5
A
A
T
C
G
A
C
A
C
A
T
C
T
A
G
G
-
-
G
G
-
A
A
T
G
C
C
T
A
5
-
G
C
-
A
T
A
C
T
A
T
T
G
G
T
T
A
A
C
A
A
T
C
T
G
G
C
T
A
T
C
G
G
T
A
G
C
G
G
C
G
A
C
C
T
C
-
2
T
G
-
C
2
A
G
G
C
T
A
G
G
G
A
-
G
G
T
C
T
G
C
C
T
C
G
C
G
A
A/C
A
A
C
A
T
T
A
T
C
A
G
T
A
G
2
-
G
G
A
C
C
G
G
A
T
3
T
3
C
G
A
-
-
T
C
A
A
G
A
A
A
A
G
G
2
A
A
C
G
A
T
G
C
T
T
T
C
A
T
C
A
T
-
-
A
T
G
C
2
A
T
G