Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 410,643 (bp)   Positions: 386
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
SS/JrHsdMcwi (2019) 
LOC108350428
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
Dcdc1-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
G
9
T
G
C
48
G
A
-
T
T
-
4
C
C
-
A
C
G
T
3
7
G
C
C
-
A
-
C
A
T
T
A
G
-
C
C
4
A
A
-
G
T
-
C
T
C
C
T
C
C
C
-
T
G
C
T
C
T
C
C
C
C
C
T
G
T
C
C
A
G
C
A
A
A
C
G
G
T
C
G
C
A
G
C
G
G
A
G
G
T
C
C
-
T
-
G
G
G
G
T
T
G
C
C
31
C
G
C
C
-
A
T
C
T
A
C
T
C
T
C
G
G
C
T
C
T
T
T
T
T
C
T
T
C
T
T
T
T
C
C
C
C
G
-
A
-
C
C
2
G
-
G
C
A
T
T
A
A
A
-
C
C
G
G
T
T
-
-
C
A
A
A
A
C
3
-
T
C
A
T
G
T
C
T
T
C
A
A
G
T
C
A
A
-
-
A
C
T
G
T
C
T
A
C
A
-
C
T
A
G
-
C
-
C
C
C
C
C
C
G
T
G
T
G
A
G
A
A
C
G
A
T
T
-
C
C
4
T
T
T
T
T
G
C
T
C
G
A
C
3
13
3
2
C
C
T
T
4
C
C
C
G
T
A
T
G
T
C
G
A
C
-
A
G
T
G
T
C
C
T
G
T
2
A
14
G
C
A
C
A
T
-
T
A
C
-
-
-
T
A
C
2
C
G
A
-
A
C
C
T
C
T
C
A
A
G
G
G
C
T
C
C
C
T
G
G
6
A
G
C
G
T
A
A
T
G
T
A
G
T
T
G
A
G
-
A
A
G
T
16
T
C
A
18
G
T
G
A
G
C
A
A
C
T
5
A
A
C
C
C
C
C
T
C
G
G
G
A
G
C
-
26
C
G
  92,488,813
  92,546,109
  92,546,136
  92,546,501
  92,546,619
  92,547,081
  92,547,171
  92,548,008
  92,548,845
  92,552,292
  92,553,063
  92,553,065
  92,553,117
  92,555,090
  92,555,787
  92,557,914
  92,558,032
  92,559,225
  92,562,096
  92,567,737
  92,567,868
  92,567,883
  92,567,888
  92,567,908
  92,567,909
  92,568,152
  92,568,611
  92,568,727
  92,569,149
  92,569,496
  92,569,858
  92,569,996
  92,570,010
  92,570,358
  92,570,382
  92,571,466
  92,574,356
  92,577,018
  92,577,924
  92,580,676
  92,580,849
  92,582,718
  92,583,931
  92,584,670
  92,585,342
  92,585,777
  92,586,350
  92,586,710
  92,586,931
  92,587,303
  92,587,362
  92,588,818
  92,589,930
  92,590,807
  92,591,751
  92,592,132
  92,592,357
  92,593,016
  92,594,694
  92,594,907
  92,596,338
  92,597,734
  92,599,266
  92,601,506
  92,601,566
  92,603,293
  92,603,875
  92,610,565
  92,610,685
  92,611,255
  92,611,309
  92,611,861
  92,612,016
  92,613,387
  92,613,394
  92,613,477
  92,614,411
  92,614,565
  92,615,169
  92,615,861
  92,616,231
  92,617,095
  92,617,106
  92,617,158
  92,618,993
  92,619,433
  92,619,449
  92,619,692
  92,620,757
  92,621,014
  92,621,159
  92,622,135
  92,622,358
  92,622,532
  92,622,671
  92,622,759
  92,622,801
  92,622,809
  92,622,854
  92,622,887
  92,622,906
  92,622,925
  92,622,964
  92,622,969
  92,623,212
  92,623,255
  92,623,269
  92,623,273
  92,623,289
  92,623,292
  92,623,294
  92,625,133
  92,625,278
  92,625,282
  92,625,331
  92,625,535
  92,625,543
  92,625,719
  92,628,118
  92,628,220
  92,628,567
  92,628,679
  92,628,986
  92,628,987
  92,629,101
  92,629,318
  92,629,355
  92,629,524
  92,629,918
  92,630,332
  92,630,400
  92,630,676
  92,630,880
  92,630,921
  92,630,941
  92,631,056
  92,631,071
  92,631,114
  92,631,794
  92,632,022
  92,632,191
  92,632,194
  92,632,197
  92,632,200
  92,632,636
  92,633,001
  92,634,311
  92,634,547
  92,634,552
  92,634,556
  92,634,567
  92,634,568
  92,634,582
  92,635,049
  92,635,312
  92,635,338
  92,635,392
  92,635,449
  92,635,456
  92,635,460
  92,635,468
  92,637,058
  92,637,633
  92,637,990
  92,638,685
  92,638,752
  92,639,162
  92,639,635
  92,639,689
  92,639,768
  92,639,908
  92,641,280
  92,642,055
  92,642,394
  92,642,562
  92,642,715
  92,642,896
  92,642,905
  92,643,673
  92,644,121
  92,645,295
  92,645,545
  92,645,565
  92,645,743
  92,647,416
  92,648,437
  92,648,571
  92,649,468
  92,650,190
  92,650,861
  92,653,243
  92,653,295
  92,653,457
  92,653,458
  92,653,487
  92,653,964
  92,654,364
  92,654,853
  92,656,216
  92,657,074
  92,657,699
  92,658,016
  92,658,332
  92,658,634
  92,658,639
  92,658,931
  92,659,379
  92,659,802
  92,661,818
  92,662,075
  92,662,401
  92,662,782
  92,663,328
  92,663,584
  92,663,597
  92,663,614
  92,663,616
  92,663,620
  92,664,908
  92,664,955
  92,664,974
  92,665,710
  92,667,106
  92,667,295
  92,668,367
  92,669,032
  92,669,089
  92,669,151
  92,669,253
  92,669,261
  92,669,467
  92,669,838
  92,671,648
  92,672,411
  92,672,413
  92,674,163
  92,674,272
  92,674,565
  92,675,164
  92,676,091
  92,677,388
  92,677,817
  92,678,046
  92,678,381
  92,679,048
  92,679,160
  92,679,265
  92,679,301
  92,679,627
  92,679,824
  92,680,126
  92,680,292
  92,680,301
  92,680,354
  92,680,360
  92,680,370
  92,680,378
  92,680,403
  92,680,407
  92,680,432
  92,680,535
  92,682,978
  92,683,078
  92,683,499
  92,684,422
  92,684,803
  92,684,924
  92,685,066
  92,685,856
  92,686,838
  92,687,878
  92,694,537
  92,694,604
  92,696,691
  92,698,343
  92,701,269
  92,702,017
  92,702,532
  92,702,787
  92,702,868
  92,703,111
  92,703,148
  92,704,866
  92,706,667
  92,707,126
  92,709,282
  92,711,344
  92,711,625
  92,712,362
  92,713,667
  92,714,140
  92,714,497
  92,716,329
  92,716,510
  92,719,159
  92,719,199
  92,723,108
  92,723,467
  92,729,253
  92,731,653
  92,732,554
  92,733,429
  92,733,438
  92,733,558
  92,739,126
  92,739,238
  92,739,850
  92,739,886
  92,740,003
  92,740,415
  92,740,502
  92,740,962
  92,741,203
  92,742,220
  92,742,534
  92,743,205
  92,743,626
  92,743,723
  92,743,854
  92,744,598
  92,745,205
  92,745,579
  92,745,587
  92,745,881
  92,746,090
  92,746,569
  92,746,840
  92,746,952
  92,747,051
  92,747,093
  92,747,152
  92,747,309
  92,747,346
  92,747,820
  92,748,170
  92,748,437
  92,749,188
  92,749,344
  92,749,348
  92,750,854
  92,750,936
  92,751,704
  92,751,794
  92,751,851
  92,753,589
  92,753,978
  92,754,815
  92,756,501
  92,758,413
  92,759,774
  92,759,975
  92,761,545
  92,761,768
  92,761,887
  92,762,729
  92,762,838
  92,763,689
  92,764,324
  92,764,453
  92,765,966
  92,766,953
  92,768,362
  92,777,394
  92,777,900
  92,779,841
  92,780,695
  92,781,942
  92,787,086
  92,795,970
  92,797,748
  92,798,358
  92,798,624
  92,798,934
  92,798,968
  92,799,189
  92,799,216
  92,799,229
  92,799,234
  92,799,702
  92,799,822
  92,799,841
  92,799,847
  92,800,413
  92,800,537
  92,800,749
  92,802,701
3
-
-
C
C
T
-
A
T
6
A
A
6
-
A
T
T
G
G
A
C
-
-
A
T
T
G
C
A
G
T
C
C
G
T
T
T
T
-
G
G
A
A
C
T
G
C
A
T
C
T
T
A
3
G
A
T
-
T
C
T
A
T
T
T
G
C
C
T
T
G
T
G
G
G
G
T
A
C
C
T
T
T
C
C
T
A
T
G
A
C
C
T
T
A
C
17
T
A
A
A
C
C
T
A
T
-
T/-
A/-
-/T
-/T
62
A/C
T/C
T
G
C
T
C
T
C
A
T
C
T
C
T
C
C
C
C
C
T
-
G
T
C
C
C
C
-/A
A/-
-/A
-/A
A
T
G
-/12
C/G
C/G
2/-
-/C
-/G
-
A
-
G/-
?
-/T
T/-
T/-
T
T
T
T
A
C
C
C
G
T
G
T
G
C
T
-
3
A
G
G
A
A
G
T
A
C
G
C
G
A
G
A
G
C
A
8
G
G
A
A
A
T
A
G
T
C
2
-
C
C
C
T
T
2
G/-
-/G
-/G
T
A
A
A
C
A
-/C
A
G
A
-
G
T
A
C
C
C
2
G
T
-
G
C
C
C
C
A
A
-
T
A
C
T
-
-
-
-
-
-/T
-/C
-/C
-
T
T
A
A
A
G
-
A
-
T
A
C
T
A
T
A
C
A
C
T
T
C
A
C
-
G
-
C
T
T
T
G
-
T
C
-
T
T
2
G
G
C
T
-
C/G
A
G
3
G
T
T
C
T
G
T
G
G
A
A
A
T
C
G
G
G
C
A
A
-
G
A
-
A/-
C
-
G
A
G/C
T/C
G
-
C
A
T
G
C
G
T
G
A
C
-
C
A
-
-
C
C
A
G
C
T
G
G
A
C
-
G
-
T
T
G
T
A
A
A
T
T
A
G
A
T
4
-
T
A