Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 351,037 (bp)   Positions: 421
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
A
G
T
G
-
-
C
C
C
-
T
A
T
T
C
-
G
A
A
A
A
T
T
A
A
G
G
A
G
T
T
A
G
A
G
A
T
A
G
A
-
T
C
C
C
T
A
A
T
G
-
A
T
G
A
A
A
T
-
-
C
A
G
A
T
A
G
C
-
A
A
C
G
A
C
C
T
T
A
A
T
C
A
G
C
G
C
T
T
C
G
-
T
C
G
C
T
C
T
T
A
G
A
A
-
G
C
15
T
C
T
G
G
T
-
T
G
C
-
C
12
-
T
A
-
C
-
G
C
T
G
-
G
T
C
-
A
T
-
-
C
-
-
C
G
C
T
G
G
-
A
T
C
A
A
G
C
T
G
-
T
T
T
T
A
C
C
C
C
C
-
T
G
C
A
-
-
A
T
G
T
A
A
C
A
C
T
G
C
A
C
C
T
C
T
T
C
A
C
C
G
A
C
C
C
G
C
T
C
2
G
C
T
A
-
T
T
G
C
C
T
A
A
C
-
T
G
3
T
A
T
C
A
T
C
T
A
A
C
C
T
C
A
A
T
T
A
C
G
G
-
C
C
G
G
T
A
G
3
C
-
A
A
A
G
A
T
G
C
G
G
T
A
C
-
A
G
T
A
-
T
G
C
A
G
G
T
2
-
-
C
-
A
T
C
C
2
2
T
A
A
A
G
T
G
C
T
G
T
C
T
C
-
C
C
A
T
T
T
C
C
G
A
A
C
T
T
A
A
A
-
C
T
-
G
T
G
C
G
-
A
A
T
A
T
T
4
T
-
T
G
C
C
C
-
G
9
A
27
G
-
A
A
G
C
C
A
G
C
T
C
A
A
C
T
C
A
A
T
G
A
T
G
G
G
G
C
A
C
T
T
G
C
G
T
G
T
T
G
T
T
T
C
C
A
T
3
C
T
A
G
A
G
A
A
G
T
G
T
-
G
  104,796,967
  104,811,127
  104,811,553
  104,811,903
  104,812,459
  104,812,581
  104,812,849
  104,812,897
  104,813,181
  104,813,200
  104,813,270
  104,813,343
  104,813,389
  104,813,543
  104,814,106
  104,814,144
  104,814,255
  104,814,381
  104,815,274
  104,815,619
  104,815,635
  104,815,748
  104,815,999
  104,816,074
  104,816,087
  104,816,387
  104,816,394
  104,816,448
  104,816,462
  104,816,464
  104,816,538
  104,817,157
  104,817,270
  104,817,369
  104,817,378
  104,817,983
  104,818,492
  104,818,933
  104,819,302
  104,819,551
  104,819,793
  104,819,847
  104,821,443
  104,821,469
  104,821,471
  104,822,008
  104,822,013
  104,822,162
  104,822,630
  104,823,072
  104,823,285
  104,823,456
  104,823,457
  104,823,521
  104,823,824
  104,824,134
  104,824,794
  104,826,449
  104,827,088
  104,827,836
  104,828,277
  104,829,739
  104,830,738
  104,831,207
  104,831,293
  104,831,309
  104,831,805
  104,831,856
  104,831,923
  104,832,937
  104,833,634
  104,833,679
  104,834,029
  104,834,121
  104,834,328
  104,834,732
  104,835,331
  104,835,491
  104,835,508
  104,835,862
  104,837,318
  104,837,427
  104,837,429
  104,837,925
  104,838,028
  104,839,007
  104,840,329
  104,840,604
  104,841,896
  104,842,170
  104,842,492
  104,844,291
  104,845,813
  104,845,899
  104,847,932
  104,848,747
  104,848,916
  104,849,586
  104,851,070
  104,851,738
  104,851,780
  104,853,120
  104,853,815
  104,854,332
  104,855,171
  104,855,274
  104,855,865
  104,856,177
  104,857,267
  104,857,899
  104,858,172
  104,858,369
  104,858,389
  104,859,198
  104,860,597
  104,861,068
  104,861,113
  104,862,565
  104,868,361
  104,875,360
  104,875,770
  104,886,311
  104,887,133
  104,887,699
  104,892,635
  104,905,101
  104,908,213
  104,920,124
  104,920,170
  104,942,131
  104,942,925
  104,943,723
  104,944,976
  104,945,354
  104,946,328
  104,946,385
  104,947,653
  104,947,979
  104,948,122
  104,948,139
  104,948,480
  104,948,825
  104,950,206
  104,951,684
  104,951,689
  104,951,694
  104,951,695
  104,951,699
  104,951,719
  104,951,725
  104,951,735
  104,951,737
  104,951,740
  104,951,746
  104,951,754
  104,951,755
  104,951,866
  104,954,825
  104,955,789
  104,956,073
  104,956,131
  104,956,554
  104,957,634
  104,957,933
  104,957,979
  104,959,713
  104,959,715
  104,959,717
  104,959,719
  104,959,721
  104,959,774
  104,960,068
  104,960,212
  104,960,631
  104,961,178
  104,961,680
  104,962,453
  104,962,488
  104,963,083
  104,963,095
  104,963,141
  104,963,725
  104,964,424
  104,964,538
  104,965,175
  104,966,374
  104,967,798
  104,968,155
  104,968,734
  104,975,602
  104,975,669
  104,975,948
  104,976,129
  104,976,660
  104,977,213
  104,977,634
  104,977,884
  104,978,385
  104,978,549
  104,978,747
  104,979,183
  104,980,073
  104,980,573
  104,981,465
  104,982,446
  104,982,454
  104,982,874
  104,983,618
  104,983,995
  104,984,341
  104,984,511
  104,984,684
  104,984,894
  104,985,356
  104,985,760
  104,986,255
  104,986,471
  104,987,249
  104,987,306
  104,987,319
  104,988,259
  104,988,594
  104,988,778
  104,991,328
  104,995,153
  104,995,202
  104,995,332
  104,995,633
  104,995,990
  104,996,668
  104,996,825
  104,996,970
  104,997,098
  104,997,171
  104,997,207
  104,997,449
  104,998,256
  105,000,427
  105,006,675
  105,006,833
  105,007,082
  105,007,882
  105,008,585
  105,011,303
  105,011,545
  105,011,555
  105,012,482
  105,012,756
  105,012,903
  105,012,911
  105,012,944
  105,013,797
  105,013,895
  105,014,412
  105,014,788
  105,015,971
  105,017,214
  105,018,270
  105,020,059
  105,020,740
  105,020,800
  105,021,284
  105,021,818
  105,024,977
  105,024,997
  105,025,478
  105,026,537
  105,027,006
  105,027,220
  105,028,388
  105,028,786
  105,030,050
  105,030,170
  105,030,253
  105,030,344
  105,030,956
  105,032,651
  105,033,723
  105,034,409
  105,034,650
  105,035,557
  105,035,754
  105,035,910
  105,037,420
  105,037,687
  105,038,434
  105,039,300
  105,039,497
  105,039,503
  105,039,525
  105,040,886
  105,041,004
  105,041,351
  105,041,639
  105,045,209
  105,045,210
  105,047,440
  105,047,711
  105,049,294
  105,049,453
  105,051,202
  105,051,770
  105,051,827
  105,051,871
  105,052,022
  105,052,443
  105,052,817
  105,054,055
  105,054,458
  105,055,013
  105,055,026
  105,055,669
  105,056,238
  105,057,184
  105,057,634
  105,058,094
  105,058,102
  105,058,596
  105,058,628
  105,059,112
  105,059,405
  105,059,669
  105,059,791
  105,060,153
  105,060,235
  105,060,581
  105,060,681
  105,060,691
  105,061,104
  105,061,353
  105,061,506
  105,061,521
  105,061,675
  105,063,481
  105,063,820
  105,063,960
  105,064,366
  105,064,869
  105,064,978
  105,065,091
  105,065,955
  105,066,312
  105,066,316
  105,066,337
  105,066,653
  105,066,938
  105,068,174
  105,068,419
  105,068,505
  105,069,283
  105,069,973
  105,070,491
  105,070,506
  105,071,020
  105,071,030
  105,071,230
  105,071,348
  105,071,395
  105,071,596
  105,071,796
  105,072,077
  105,072,159
  105,072,500
  105,073,479
  105,073,708
  105,074,202
  105,074,815
  105,074,829
  105,075,147
  105,076,108
  105,076,553
  105,076,806
  105,076,957
  105,077,039
  105,077,147
  105,078,345
  105,079,862
  105,080,105
  105,080,151
  105,081,364
  105,081,376
  105,081,524
  105,081,712
  105,082,074
  105,082,305
  105,082,999
  105,083,022
  105,084,196
  105,084,996
  105,085,501
  105,085,762
  105,085,972
  105,086,038
  105,086,208
  105,086,271
  105,092,590
  105,092,624
  105,092,633
  105,093,240
  105,093,286
  105,093,291
  105,093,613
  105,093,924
  105,093,991
  105,094,265
  105,096,588
  105,099,101
  105,100,403
  105,102,261
  105,107,914
  105,108,662
  105,109,015
  105,109,129
  105,109,940
  105,110,710
  105,112,329
  105,113,512
  105,113,821
  105,114,392
  105,114,786
  105,116,898
A/G
C
G
C
T
T
T
T
T
C
C
G
G
C
T
T
A
C
G
T
G
A
C
G
G
A
A
G
T
A
C
T
A
-
C
G
C
G
T
C
12
A
A
T
T
C
G
-
-
C
4
T
C
A
T
G
G
C
A
T
T
G
A
C
C
T
A
T
A
T
G
T
A
G
A
T
C
G
T
G
G
A
G
A
T
A
T
G
G
T
C
T
C
T
-
T
C
T
C
G
C
A
G
T
G
A
G
-
C
T
A
A
A
C
-/12
C
A
T
2
A
-
A
A
-
8
T
-/4
G/A
C/T
C
A
T
A
A
T
A
G
C
A
A
G
9
A
T
C
T
G
A
A
T/G
C
C
T
C
T
T
T
G
A
4
C
G
C
G
C
-/G
G/-
-/G
G/-
G
2
C
A
A/-
G
A
G
G
A
C
G
G
T
T
G
A
A
A
A
T
G
G
C
T
C
G
T
G
T
T
A
G
G
T
T
A
G
C
T
-
A
A
A
-
T
-
C
A
G
T
C
G
G
T
A
A
T
-
C
T
C
T
G
C
T
C
G
G
T
T
C
A
-
A/C
C
C
-
T
A
A
4
T
A
T
A
-
G
A
-
T
T
G
T
G
A
G
C
A
T
A
A
C
C
T
2
G
A
G
G
14
G
-
T
G
A
C
G
-
4
2
T
T
C
G
T
T
-
-
C
G
G
T
A
G
A
T
A
A
A
T
C
T
10
-
T
G
A
A
G
T
T
A
G
C
T
A
C
G
G
G
5
T
C
A
T
A
T
T
T
C
G
G
A
G
C
G
-
C
2
C
A
T
T
A
A
A
-
G
-
A
2
G
C
A
T
T
G
A
T
-
T
T
T
T
C
A
T
G
G
A
G
A
A
A
A
T
A
G
T
C
C
T
G
A
-
G/A
T/C
T/C
-
C
G
C
T
T
G
C
-
T
G
G
T
C
C
C
T
A
C
T
C
2
A