Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 237,514 (bp)   Positions: 562
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
LOC108351508
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
Col22a1
T
T
C
G
A
T
C
T
A
T
T
4
-
C
C
A
T
C
C
G
A
T
A
G
C
G
C
T
C
G
T
T
T
-
-
C
C
T
A
T
T
A
T
G
C
G
T
A
T
G
A
A
A
G
C
G
G
G
G
C
G
T
A
G
T
C
A
-
C
-
G
T
A
C
A
3
A
C
A
-
4
G
G
A
C
T
A
2
A
A
T
A
A
T
T
C
G
4
G
A
T
T
T
T
C
-
T
G
C
T
T
G
T
G
A
A
A
A
A
G
G
G
T
T
A
A
C
C
C
G
G
A
G
A
15
T
C
G
C
C
A
T
C
G
A
C
C
T
T
C
A
T
A
A
A
G
-
4
T
A
A
G
C
A
5
-
-
G
A
T
C
T
A
T
G
T
G
C
T
G
G
T
C
T
T
G
C
-
T
T
A
A
C
G
-
A
C
C
T
T
A
G
-
G
C
T
G
A
2
A
C
A
C
G
G
T
A
T
T
A
A
C
G
A
G
C
A
G
T
A
G
G
A
C
A
C
T
C
G
T
T
T
G
G
T
T
C
T
A
C
-
C
T
C
G
G
C
A
T
G
C
T
G
T
A
A
T
T
T
G
G
-
G
G
G
T
T
G
G
G
C
G
G
T
G
G
T
A
C
T
C
T
C
T
G
A
C
G
C
-
C
C
C
C
G
G
G
G
G
-
T
A
T
C
G
G
C
G
C
G
A
T
-
A
A
C
G
T
A
T
T
T
C
A
C
C
G
C
A
T
C
C
T
T
G
-
A
C
T
C
G
C
T
C
T
2
C
A
C
A
-
T
A
T
A
A
C
T
G
T
G
A
T
T
G
A
G
C
C
C
C
T
A
T
G
T
-
G
G
G
T
G
T
C
-
-
2
T
A
-
G
C
G
T
G
A
G
-
A
G
T
C
T
C
A
C
C
T
C
T
A
A
A
A
A
A
A
A
G
G
G
G
G
A
G
A
A
G
G
-
T
A
C
T
G
A
T
G
-
G
A
T
A
C
C
G
G
A
T
T
A
T
T
-
G
T
A
A
T
C
A
G
G
C
G
C
G
G
A
C
G
C
G
G
A
G
C
C
A
-
T
T
G
G
G
C
G
C
C
C
C
T
T
T
G
C
A
A
T
T
-
G
A
A
4
14
G
T
A
G
A
T
A
G
G
C
T
G
A
G
C
A
G
C
G
T
G
-
T
G
C
C
T
T
C
C
T
-
C
C
G
A
C
T
T
G
C
C
C
G
A
T
  103,731,179
  103,731,236
  103,732,109
  103,732,309
  103,732,318
  103,732,376
  103,733,356
  103,733,472
  103,733,886
  103,733,968
  103,734,477
  103,734,706
  103,735,589
  103,735,827
  103,736,000
  103,736,332
  103,736,516
  103,736,895
  103,736,930
  103,737,665
  103,738,305
  103,738,338
  103,738,400
  103,738,558
  103,738,620
  103,738,646
  103,739,213
  103,739,749
  103,739,941
  103,740,488
  103,740,600
  103,740,789
  103,740,900
  103,741,006
  103,741,019
  103,741,433
  103,741,435
  103,741,497
  103,742,012
  103,742,948
  103,743,651
  103,744,151
  103,744,350
  103,744,608
  103,744,757
  103,748,404
  103,749,869
  103,750,596
  103,750,968
  103,751,368
  103,753,824
  103,755,107
  103,756,207
  103,760,070
  103,760,631
  103,761,423
  103,761,921
  103,762,529
  103,763,082
  103,763,294
  103,763,386
  103,763,406
  103,763,505
  103,764,581
  103,766,212
  103,766,944
  103,767,599
  103,767,838
  103,767,840
  103,769,396
  103,769,817
  103,770,766
  103,771,170
  103,773,369
  103,775,517
  103,776,429
  103,777,068
  103,777,632
  103,777,918
  103,778,810
  103,778,972
  103,779,011
  103,779,195
  103,779,378
  103,779,679
  103,779,767
  103,779,905
  103,780,076
  103,780,142
  103,780,205
  103,781,071
  103,781,295
  103,782,023
  103,782,596
  103,782,770
  103,783,015
  103,783,061
  103,783,063
  103,783,118
  103,783,335
  103,783,815
  103,784,115
  103,784,343
  103,785,202
  103,785,223
  103,785,663
  103,786,655
  103,787,050
  103,787,438
  103,787,657
  103,787,779
  103,788,786
  103,789,071
  103,789,073
  103,789,405
  103,789,814
  103,789,988
  103,790,157
  103,790,183
  103,790,556
  103,790,963
  103,794,200
  103,794,355
  103,795,507
  103,796,311
  103,799,273
  103,800,445
  103,800,818
  103,800,976
  103,802,356
  103,803,498
  103,805,136
  103,805,194
  103,805,494
  103,805,798
  103,806,060
  103,806,292
  103,806,356
  103,806,644
  103,806,656
  103,806,723
  103,806,861
  103,807,028
  103,807,288
  103,807,297
  103,807,363
  103,807,405
  103,807,430
  103,808,354
  103,808,448
  103,808,738
  103,809,075
  103,809,079
  103,809,677
  103,809,755
  103,809,796
  103,809,843
  103,809,851
  103,809,856
  103,809,861
  103,809,870
  103,809,872
  103,809,928
  103,809,929
  103,809,961
  103,809,967
  103,814,812
  103,815,101
  103,815,482
  103,816,730
  103,816,737
  103,816,738
  103,816,858
  103,817,133
  103,817,237
  103,817,238
  103,817,341
  103,817,547
  103,817,609
  103,817,850
  103,818,246
  103,818,730
  103,818,800
  103,819,346
  103,822,148
  103,822,263
  103,822,332
  103,822,454
  103,822,670
  103,824,383
  103,824,481
  103,825,638
  103,826,215
  103,826,599
  103,826,914
  103,827,173
  103,827,574
  103,827,792
  103,827,808
  103,830,531
  103,830,770
  103,831,093
  103,831,808
  103,832,128
  103,834,021
  103,834,086
  103,834,091
  103,834,704
  103,834,963
  103,835,286
  103,835,611
  103,836,285
  103,836,386
  103,836,430
  103,836,523
  103,836,550
  103,836,615
  103,836,911
  103,837,196
  103,837,406
  103,837,453
  103,837,473
  103,837,489
  103,837,532
  103,837,597
  103,837,671
  103,838,096
  103,838,154
  103,838,204
  103,838,268
  103,838,283
  103,838,286
  103,838,288
  103,841,636
  103,841,663
  103,841,667
  103,841,675
  103,841,676
  103,841,779
  103,842,213
  103,842,492
  103,842,538
  103,842,609
  103,842,648
  103,843,598
  103,843,682
  103,843,846
  103,843,985
  103,844,087
  103,844,417
  103,844,592
  103,845,298
  103,845,380
  103,846,408
  103,846,447
  103,846,665
  103,846,667
  103,846,940
  103,847,306
  103,847,330
  103,847,391
  103,847,418
  103,847,692
  103,849,278
  103,849,865
  103,850,983
  103,852,217
  103,852,572
  103,854,119
  103,854,149
  103,854,157
  103,854,214
  103,854,367
  103,855,457
  103,855,522
  103,856,472
  103,857,999
  103,858,223
  103,858,414
  103,858,477
  103,858,681
  103,858,871
  103,859,885
  103,862,727
  103,865,464
  103,866,503
  103,866,532
  103,866,777
  103,867,056
  103,867,394
  103,867,412
  103,867,438
  103,867,512
  103,867,885
  103,867,973
  103,868,235
  103,868,767
  103,868,892
  103,868,903
  103,869,061
  103,869,828
  103,870,105
  103,870,509
  103,870,819
  103,870,867
  103,870,869
  103,870,871
  103,870,873
  103,870,889
  103,871,199
  103,871,678
  103,871,732
  103,871,760
  103,871,827
  103,871,846
  103,871,983
  103,872,122
  103,872,197
  103,872,524
  103,872,628
  103,872,641
  103,873,001
  103,873,069
  103,873,239
  103,873,319
  103,873,328
  103,873,374
  103,873,447
  103,873,479
  103,873,501
  103,873,715
  103,873,778
  103,873,968
  103,873,976
  103,874,033
  103,874,048
  103,874,104
  103,874,297
  103,874,353
  103,874,643
  103,874,727
  103,874,747
  103,874,751
  103,874,778
  103,874,842
  103,874,958
  103,874,982
  103,874,988
  103,875,031
  103,875,378
  103,875,602
  103,875,626
  103,875,696
  103,875,903
  103,875,937
  103,875,965
  103,876,047
  103,876,109
  103,876,158
  103,876,169
  103,876,207
  103,876,219
  103,876,239
  103,876,244
  103,876,258
  103,876,588
  103,876,626
  103,876,812
  103,876,821
  103,876,880
  103,877,213
  103,877,908
  103,878,088
  103,878,108
  103,878,779
  103,878,796
  103,878,851
  103,878,871
  103,878,904
  103,878,932
  103,878,934
  103,878,982
  103,878,991
  103,879,010
  103,879,143
  103,879,148
  103,879,223
  103,879,224
  103,879,225
  103,879,279
  103,879,582
  103,880,020
  103,880,106
  103,880,114
  103,880,209
  103,880,462
  103,880,473
  103,880,518
  103,880,725
  103,880,728
  103,880,739
  103,881,017
  103,881,154
  103,881,188
  103,881,244
  103,881,248
  103,881,258
  103,881,290
  103,881,312
  103,881,327
  103,881,466
  103,881,624
  103,881,681
  103,881,805
  103,882,632
  103,882,881
  103,883,243
  103,884,062
  103,885,168
  103,885,904
  103,888,689
  103,888,693
  103,888,697
  103,888,701
  103,888,705
  103,888,709
  103,888,713
  103,892,225
  103,892,301
  103,892,303
  103,892,305
  103,892,307
  103,897,148
  103,897,156
  103,898,843
  103,899,572
  103,900,212
  103,900,372
  103,902,231
  103,902,278
  103,903,689
  103,904,475
  103,908,322
  103,909,368
  103,913,019
  103,917,380
  103,917,985
  103,918,961
  103,919,421
  103,919,906
  103,920,277
  103,920,300
  103,920,921
  103,921,377
  103,921,381
  103,921,422
  103,921,774
  103,921,998
  103,922,750
  103,922,759
  103,922,827
  103,923,043
  103,923,048
  103,923,179
  103,923,583
  103,923,737
  103,923,835
  103,924,149
  103,924,201
  103,924,297
  103,924,348
  103,924,892
  103,925,496
  103,926,773
  103,926,990
  103,927,003
  103,927,137
  103,927,345
  103,927,689
  103,928,425
  103,929,334
  103,929,737
  103,930,168
  103,930,246
  103,930,615
  103,931,504
  103,931,706
  103,932,312
  103,933,278
  103,933,393
  103,936,033
  103,936,728
  103,937,256
  103,937,355
  103,938,066
  103,941,154
  103,941,694
  103,943,650
  103,943,652
  103,943,654
  103,943,656
  103,943,700
  103,943,702
  103,945,192
  103,948,616
  103,949,119
  103,949,240
  103,949,804
  103,950,285
  103,951,506
  103,951,555
  103,953,246
  103,953,303
  103,953,306
  103,953,315
  103,953,331
  103,954,438
  103,954,775
  103,956,418
  103,957,347
  103,958,103
  103,959,580
  103,961,043
  103,961,457
  103,962,615
  103,963,424
  103,963,904
  103,964,207
  103,964,446
  103,964,507
  103,964,515
  103,964,532
  103,964,551
  103,964,785
  103,964,834
  103,964,896
  103,964,991
  103,965,064
  103,965,131
  103,965,187
  103,965,195
  103,965,382
  103,965,398
  103,965,530
  103,965,606
  103,965,792
  103,965,973
  103,966,088
  103,966,349
  103,966,468
  103,966,685
  103,966,726
  103,966,896
  103,966,940
  103,967,228
  103,967,243
  103,967,291
  103,967,503
  103,967,519
  103,967,698
  103,967,779
  103,967,801
C
C
T
C
G
C
T
A/G
G
A
A
-
T
T
A
G
G
G
G
C
-
C
G
A
T
C
T
C
T
C
G/-
C
A
A
A
-/T
C/T
A
C
C
C
C
C
A
T
A
C
C
A
T
G
G
G
A
T
T
T
A
A
T
A
C
C
C
C
T
G
4
T
T
A
C
G
A
G
-
T
-
G
23
-
-/C
-
G
T
C
G
-
G
G
C
G
-
C
C
T
A
-
C
G
A
C
-
A
T
2
C
T
T
C
C
A
A
A
G
C
C
G
T
A
A
T
C
C
G
G
T
T
G
A
A
G
A
-
-
A
A
A
-/T
-/T
G
G
A
A
G
T
T
-
G
G
G
C
G
G
G
T
2
-
A
G
C
A
T
G
-
A
4
A
G
C
A
C
G
C
A
C
C/-
T
C
A
C
C
T
C
-
A
T
T
C
G
G
G
T
A
6
-
T
T
G
C
T
A
2
A
T/-
C
T
G
-
C
A
C
T
A
A
C
G
C
C
G
C
T
A
G
A
T
C
C
-
G
T
T
C
A
G
T
G/A
A
A
A
A
C
T
C
C
G
A
G
G
T
A
G
C
-
T
A
T
C
C
A
T
A
C
C
G
G
C
C
C
A
A
C
A
A
C
C
G
A
A
A
T
A
C
C
A
A
C
G
T
C
A
G
T
G
T
G
G
A
T
5
T
T
T
G
C/-
-/C
-/C
C
A/-
4
C
G
C
G
A
T
T
A
T
A
T
C
T
C
G
T
T
G
G
G
C
C
A
G
-/A
A
A
T
G
G
T
T
C
C
T
T
G
G
C
A
T
T
-
T
C
-
-/A
C
T
G
2
C
T
C
T
C
T
C
A
C
A
C
-
C
A
G
A
T
G
T
T
G
T
G
T
G
2
T
T
A
A
C
C
T
A
5
-
C
G
C
A
T
A
C
A
G
A
A
T
A
A
A
C
T
G
T
T
C
T
C
-/T
-/T
-/T
-/T
-/T
-/T
T/-
-
-/C
-/C
C/-
-/C
T
T
A
G
G
A
T
9
C
G
T
C
A
C
C
A
4
A
G
A
-
-/T
T/-
-/A
A
C
C
C
G
A
G
A
A
A
C
G
C
T
G
A
T
G
A
T
A
A
G
A
T
T
C
C
G/C
A
T
T
G
4
C
C
A
A
A
T
A
-/G
G/-
-/G
-/G
T/C
C
C
A
T
G
G
A
C
A
A
-
-/G
-
-
A
C
G
T
G
G
G
-
T
T
C
A
G
A
T
C
C
T
A
C
T
C/C
G
A
T
T
G
G/-
T
T
C
4
A
T
A
G
T
C
C
A
T
T
G
C
G
C