Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 248,134 (bp)   Positions: 350
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
SHR/OlalpcvMcwi (2019) 
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
Cngb3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
G
C
C
A
T
G
T
C
C
G
-
C
A
C
T
G
G
-
A
C
G
C
C
A
A
A
A
C
G
T
A
A
C
T
A
G
C
G
A
G
A
A
A
T
G
A
T
G
G
A
G
C
A
4
G
5
G
G
2
T
G
G
T
C
G
C
C
G
C
G
G
G
C
A
G
C
T
A
A
C
G
A
G
C
C
C
C
T
C
G
A
C
C
C
C
G
T
G
G
A
A
T
G
A
G
2
T
G
T
G
A
A
T
C
C
T
T
T
T
G
A
A
A
C
T
A
G
T
C
5
16
-
A
G
A
A
A
G
T
G
A
T
G
C
A
G
C
A
A
G
-
T
G
A
G
2
18
G
2
A
-
T
G
C
T
A
A
T
A
C
C
T
A
A
A
-
A
C
T
T
A
G
C
A
2
-
T
C
-
G
T
G
T
G
A
T
G
C
C
G
C
3
-
G
-
T
T
A
G
A
C
C
C
G
-
A
C
C
G
C
T
A
C
C
G
A
G
T
C
T
A
G
C
G
C
G
A
A
C
G
7
C
C
T
C
-
C
C
A
T
G
T
G
T
A
G
C
G
A
C
G
3
2
C
A
G
C
C
G
A
C
T
-
-
-
3
T
C
G
A
T
G
G
-
A
C
2
-
T
A
G
G
G
G
G
C
G
-
T
G
G
-
C
A
C
C
T
G
G
G
C
A
T
G
A
T
T
G
G
G
G
C
G
C
C
C
A
C
T
G
G
-
-
A
G
G
C
T
A
-
G
A
C
-
A
T
A
-
  32,747,166
  32,747,193
  32,747,900
  32,748,503
  32,748,699
  32,748,761
  32,748,885
  32,749,173
  32,749,183
  32,749,250
  32,749,351
  32,749,426
  32,750,061
  32,750,399
  32,750,777
  32,750,842
  32,751,052
  32,751,074
  32,751,275
  32,751,490
  32,752,174
  32,752,413
  32,752,732
  32,753,184
  32,753,773
  32,754,098
  32,754,391
  32,755,112
  32,755,114
  32,755,467
  32,755,600
  32,756,054
  32,756,220
  32,756,261
  32,756,349
  32,756,350
  32,756,436
  32,756,445
  32,756,449
  32,756,453
  32,756,473
  32,757,935
  32,758,729
  32,759,576
  32,759,928
  32,760,400
  32,760,515
  32,761,183
  32,761,307
  32,761,422
  32,761,682
  32,761,700
  32,762,256
  32,762,720
  32,762,728
  32,769,118
  32,769,137
  32,769,167
  32,769,176
  32,769,181
  32,769,387
  32,769,388
  32,769,434
  32,769,702
  32,770,062
  32,770,514
  32,770,933
  32,771,143
  32,771,155
  32,773,834
  32,773,963
  32,773,965
  32,774,793
  32,774,891
  32,775,384
  32,775,385
  32,775,748
  32,776,198
  32,776,291
  32,776,318
  32,776,502
  32,776,782
  32,777,225
  32,777,346
  32,777,677
  32,778,295
  32,778,847
  32,779,332
  32,779,565
  32,779,596
  32,780,256
  32,780,325
  32,780,453
  32,781,503
  32,781,739
  32,782,626
  32,783,521
  32,784,482
  32,784,910
  32,785,070
  32,785,100
  32,785,424
  32,785,450
  32,787,010
  32,787,840
  32,788,036
  32,788,039
  32,788,042
  32,791,740
  32,792,026
  32,793,240
  32,793,631
  32,793,661
  32,793,667
  32,793,670
  32,793,837
  32,793,864
  32,794,151
  32,794,763
  32,794,879
  32,795,277
  32,795,797
  32,796,028
  32,799,763
  32,800,561
  32,800,708
  32,800,923
  32,801,252
  32,801,317
  32,802,905
  32,803,137
  32,803,896
  32,805,477
  32,808,192
  32,811,105
  32,811,150
  32,812,502
  32,812,897
  32,814,768
  32,815,522
  32,818,097
  32,818,527
  32,818,695
  32,858,777
  32,865,461
  32,865,596
  32,865,624
  32,865,632
  32,865,649
  32,865,687
  32,881,594
  32,891,989
  32,892,172
  32,892,445
  32,892,450
  32,892,510
  32,892,533
  32,892,556
  32,892,561
  32,892,681
  32,893,066
  32,893,100
  32,893,386
  32,893,820
  32,894,940
  32,895,003
  32,895,139
  32,895,653
  32,896,002
  32,896,631
  32,896,651
  32,897,225
  32,897,870
  32,897,961
  32,898,255
  32,899,823
  32,900,323
  32,900,714
  32,900,897
  32,901,258
  32,901,284
  32,901,675
  32,901,720
  32,901,880
  32,901,885
  32,902,948
  32,904,581
  32,905,050
  32,905,284
  32,905,300
  32,905,624
  32,906,007
  32,906,439
  32,906,853
  32,906,933
  32,907,294
  32,907,301
  32,907,320
  32,907,321
  32,907,685
  32,907,687
  32,908,207
  32,908,701
  32,908,912
  32,908,955
  32,909,246
  32,909,261
  32,909,296
  32,909,297
  32,909,453
  32,910,184
  32,910,481
  32,910,532
  32,910,752
  32,910,818
  32,911,021
  32,911,101
  32,911,605
  32,911,639
  32,912,046
  32,912,358
  32,912,685
  32,912,875
  32,912,958
  32,913,089
  32,913,382
  32,913,615
  32,913,624
  32,913,915
  32,914,082
  32,914,290
  32,915,332
  32,915,346
  32,915,720
  32,916,865
  32,917,042
  32,917,304
  32,917,431
  32,917,819
  32,917,871
  32,917,970
  32,918,013
  32,918,110
  32,918,299
  32,918,317
  32,918,728
  32,918,777
  32,919,552
  32,919,626
  32,920,267
  32,920,329
  32,920,649
  32,920,652
  32,920,751
  32,920,883
  32,921,132
  32,921,574
  32,921,985
  32,922,084
  32,922,347
  32,922,416
  32,922,432
  32,922,583
  32,923,024
  32,923,084
  32,923,187
  32,923,191
  32,923,514
  32,923,774
  32,923,873
  32,924,125
  32,924,256
  32,925,139
  32,927,340
  32,931,143
  32,931,155
  32,931,325
  32,932,278
  32,932,280
  32,933,255
  32,933,509
  32,935,644
  32,935,905
  32,936,131
  32,937,831
  32,939,443
  32,939,448
  32,939,563
  32,939,978
  32,939,981
  32,939,983
  32,941,350
  32,941,496
  32,941,498
  32,941,500
  32,941,502
  32,941,504
  32,942,344
  32,943,171
  32,944,096
  32,945,818
  32,946,020
  32,946,523
  32,947,173
  32,947,208
  32,947,909
  32,949,258
  32,950,221
  32,951,895
  32,952,199
  32,952,798
  32,954,252
  32,956,028
  32,957,996
  32,958,013
  32,958,138
  32,959,189
  32,959,786
  32,959,813
  32,960,163
  32,964,173
  32,965,807
  32,967,087
  32,967,897
  32,968,038
  32,968,786
  32,968,788
  32,968,790
  32,976,515
  32,977,085
  32,978,316
  32,978,698
  32,980,422
  32,981,840
  32,982,410
  32,984,070
  32,985,213
  32,985,216
  32,985,217
  32,985,236
  32,985,237
  32,985,241
  32,985,416
  32,985,949
  32,986,405
  32,988,095
  32,988,911
  32,989,801
  32,991,964
  32,993,258
G
G
T
A
T
C
C
C
G
T
T
C
2
-
G
A
C
A
C
T
G
T
A
A
A
G
T
G/-
-/G
T
A
C
G
G
T
A
T
C
T
T
G
A
T
G
T
C
A
G
-
T
A
G
A
A
G
4/-
A
-
T
T
-
A/-
C
A
C
A
C
A
T
C
T
T
A
T
A
G
A
A
G
T
C/T
-
A
G
A
G
T
T
T
-
A/G
T
T
T
T
T
T
A
C
A
T
T
G
C
A
-
C
-
C
C
A
A
G
G
C
T
G
C
C
C
C
A
G
-
-
A
C
T
A
C
T
-
16/-
3
C
A
C
G
G
T
G
-
C
-
G/A
C/T
A/T
G/T
C/T
A/-
-
A
2
-
A
-
A
-
-
A
-
G
T
C
A
T
C
T
G
C
C
T
T
A
G
G
T
T
G
A
C
C
-
A
A
-
-
A
C
T
T
C
-
T
-
G/A
A/G
G
T
T
G
C
A/T
-
T
T
T
-
G
G
A
G
A
T
-
A
5
T
G
G
A
A/T
C
C
T
T
T
C
C
C
T
A
C
C
-
C/A
T
A
C
T
A
-
-
T
T
A
T
T
T/-
A
G
A
A
C
A
A
G
T
G
A
T
T
A
-
-
T
G
A
T
A
A
G
G
C
A
A
4
-
G/-
G
-
T
C
A
T
G
G
-
-
2
A
G
-/C
-/C
C/-
-/C
-/C
T
A
C
G
A
A
3
T
G
T
T
C
A
T
A
T
G
A
C
T
C
A
T
T
A
A
A
C
-/T
-/T
-/T
G
-
A
T
A
18
A
T
T
T
T
-
C
A
A
T
T
T
T
C
T
A