Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 106,960 (bp)   Positions: 258
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF11/Stm (2020) 
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
Clip1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC120095846
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
A
G
G
-
T
A
A
G
2
G
C
G
T
-
T
G
G
-
A
T
T
A
G
T
G
A
T
T
A
G
A
C
A
-
C
2
G
G
G
3
A
C
C
C
C
T
A
A
-
T
C
-
C
C
G
C
C
G
T
2
A
C
A
A
G
C
A
A
C
A
T
G
T
T
C
T
T
G
C
G
T
C
A
T
C
A
C
G
-
C
C
C
A
C
C
A
A
T
G
2
T
G
-
T
T
G
G
A
G
A
A
A
A
T
6
-
C
C
A
A
C
A
C
C
C
G
T
A
T
18
T
C
4
G
G
G
A
A
C
C
T
34
C
3
G
G
A
T
C
C
T
A
T
C
-
T
A
T
C
2
T
T
A
G
G
A
A
G
A
T
-
T
A
G
C
G
G
G
G
G
G
G
T
A
G
C
A
T
G
C
A
C
C
C
T
C
G
A
A
A
A
-
A
T
T
C
T
T
C
T
-
A
C
T
A
A
T
A
T
G
T
8
2
T
G
-
6
A
G
G
-
T
A
G
-
G
G
G
G
G
2
T
-
T
2
A
A
T
G
-
T
T
T
C
G
C
A
  32,911,166
  32,911,235
  32,911,253
  32,911,632
  32,912,926
  32,913,012
  32,913,421
  32,914,180
  32,914,630
  32,915,267
  32,915,427
  32,916,218
  32,918,572
  32,919,429
  32,919,743
  32,919,978
  32,920,435
  32,920,708
  32,920,905
  32,921,240
  32,922,176
  32,922,180
  32,922,530
  32,922,743
  32,922,748
  32,922,750
  32,922,858
  32,924,706
  32,926,368
  32,926,696
  32,928,273
  32,928,844
  32,929,904
  32,930,549
  32,931,007
  32,931,511
  32,931,879
  32,931,882
  32,931,891
  32,931,899
  32,931,907
  32,931,921
  32,933,633
  32,933,635
  32,933,659
  32,933,661
  32,934,143
  32,934,452
  32,934,713
  32,934,999
  32,938,379
  32,938,584
  32,939,768
  32,939,858
  32,939,907
  32,940,012
  32,940,433
  32,941,229
  32,941,234
  32,941,473
  32,941,802
  32,942,047
  32,942,231
  32,942,777
  32,943,639
  32,946,258
  32,946,829
  32,946,932
  32,947,377
  32,947,383
  32,947,501
  32,948,515
  32,948,595
  32,948,961
  32,949,570
  32,950,160
  32,950,684
  32,950,970
  32,951,363
  32,951,485
  32,951,539
  32,952,011
  32,952,691
  32,953,315
  32,953,392
  32,953,394
  32,953,431
  32,953,441
  32,953,458
  32,953,537
  32,953,605
  32,953,673
  32,953,719
  32,953,838
  32,953,855
  32,953,880
  32,954,208
  32,954,357
  32,954,370
  32,954,535
  32,954,537
  32,954,627
  32,955,010
  32,955,365
  32,955,402
  32,955,902
  32,956,288
  32,956,544
  32,956,734
  32,956,756
  32,957,027
  32,957,198
  32,957,439
  32,957,584
  32,957,960
  32,958,782
  32,958,850
  32,959,068
  32,959,238
  32,959,402
  32,959,414
  32,959,578
  32,959,672
  32,959,920
  32,960,027
  32,960,668
  32,961,309
  32,961,395
  32,962,121
  32,962,312
  32,962,487
  32,962,500
  32,962,524
  32,962,634
  32,962,668
  32,962,670
  32,962,672
  32,962,683
  32,962,802
  32,963,262
  32,963,273
  32,964,054
  32,964,426
  32,966,275
  32,968,648
  32,969,197
  32,969,271
  32,969,725
  32,970,588
  32,971,238
  32,971,846
  32,972,270
  32,972,455
  32,973,085
  32,974,579
  32,974,685
  32,975,262
  32,976,507
  32,977,364
  32,979,226
  32,982,288
  32,982,617
  32,983,278
  32,983,597
  32,983,764
  32,983,794
  32,983,884
  32,983,918
  32,984,006
  32,984,194
  32,984,313
  32,985,624
  32,986,213
  32,986,316
  32,986,648
  32,987,003
  32,987,082
  32,987,247
  32,987,441
  32,987,443
  32,987,445
  32,987,447
  32,987,449
  32,987,542
  32,987,602
  32,987,680
  32,987,749
  32,988,234
  32,988,583
  32,988,721
  32,989,193
  32,989,308
  32,990,020
  32,990,338
  32,991,229
  32,991,303
  32,991,471
  32,991,486
  32,992,540
  32,992,700
  32,993,725
  32,994,165
  32,994,206
  32,995,402
  32,995,700
  32,995,708
  32,995,799
  32,997,340
  32,997,582
  32,997,828
  33,000,872
  33,002,613
  33,002,842
  33,004,047
  33,004,698
  33,004,699
  33,005,298
  33,006,549
  33,006,593
  33,007,368
  33,007,644
  33,007,645
  33,008,217
  33,008,255
  33,008,258
  33,008,374
  33,009,525
  33,009,566
  33,010,853
  33,011,229
  33,011,495
  33,011,643
  33,012,973
  33,013,270
  33,013,297
  33,013,358
  33,013,371
  33,013,379
  33,013,383
  33,013,398
  33,013,485
  33,013,532
  33,013,533
  33,013,538
  33,013,542
  33,013,562
  33,013,657
  33,013,865
  33,013,951
  33,014,160
  33,014,680
  33,015,406
  33,015,738
  33,015,978
  33,016,192
  33,016,865
  33,017,441
  33,017,691
G
C
C
A
T
-
-
C/G
C
-
A
T
A
C
G
C
A
A
A
T
-/C
-/C
C
C
C
T
T
-/C
C
C
A
-
T
T
T
T
-
-/A
A
A
-
G
-/G
-/G
G
G
C
G
C
T
-
A/T
64
G
T
C
A
-
T
C
-
-/G
T
G
G
C
T
G/-
G
T
G
A
A
C
C
G
C
G
-
T
-
C
T
G
C
G
G
A
T
4
T
T
A
G
T
T
G
G
G
G/T
?
C
A
2
C
C
C
A
G
C
G
T
T
G
C
-
T
T
T
G
C
G
G
G
T
T
A
C
C
C
-
-/C
T
-
-/C
C
C
-
T
T
T
C
-
A
-
A
T
G
A
-
T/-
C
G
C
T
T
C
G
C
G
-
C
C
G
A
A
G
G
A
C
G
A
C
G
C
T
C
A
-/C
-/C
-/C
C/-
-/C
C
G
C
T
G
G
T
T
G
A
G/T
T
C
T
A
-
?
-
G
2
T
G
G
T
C
G
A
C
2
G
-/T
C
G
C
C
G
A
T
C
-
-
G
A
4
-
G
A
-
2
C
C
T
G
-
T
T
G/A
A
-
G/-
2
C
-
G
C
A
C
4
C
G
C
T
T/-
T
G