Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 81,925 (bp)   Positions: 241
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
F344/DuCrl (2019) 
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
Cdk17
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
3
A
C
C
C
T
G
-
C
C
4
T
T
A
A
T
A
G
A
T
T
C
A
A
C
8
C
-
-
A
T
G
T
8
C
-
A
A
T
T
T
A
C
A
A
T
C
-
T
T
-
T
T
C
T
C
C
C
T
C
-
A
G
G
A
-
T
T
T
T
T
C
T
T
C
G
T
C
C
A
A
A
A
T
A
T
A
A
-
G
G
G
A
C
A
-
G
-
T
G
C
C
A
C
G
T
T
-
T
G
A
C
T
G
-
A
G
G
15
4
C
A
C
T
G
A
C
G
G
G
C
T
A
C
A
A
C
-
T
C
C
T
G
G
C
T
A
C
A
T
G
T
A
C
T
T
G
T
G
T
T
T
-
C
C
G
C
A
C
C
T
T
A
A
C
T
C
G
A
-
A
G
A
T
-
T
A
G
T
T
C
A
G
8
A
T
T
4
A
C
T
C
A
A
A
A
T
C
A
T
G
T
C
C
C
A
T
C
T
G
-
-
2
C
G
G
G
A
-
C
G
T
C
T
C
G
-
A
T
-
  27,684,271
  27,685,445
  27,685,816
  27,686,038
  27,686,061
  27,686,412
  27,687,302
  27,688,540
  27,688,544
  27,688,877
  27,689,361
  27,690,186
  27,690,508
  27,691,446
  27,691,545
  27,692,173
  27,692,582
  27,693,416
  27,693,480
  27,693,887
  27,694,251
  27,694,988
  27,695,048
  27,695,302
  27,695,487
  27,696,354
  27,696,402
  27,696,795
  27,697,130
  27,697,266
  27,697,701
  27,697,892
  27,698,187
  27,698,235
  27,698,527
  27,698,751
  27,698,789
  27,699,563
  27,699,654
  27,700,277
  27,700,559
  27,700,638
  27,700,680
  27,701,631
  27,701,705
  27,701,879
  27,703,111
  27,703,785
  27,704,175
  27,704,735
  27,705,536
  27,705,797
  27,706,223
  27,706,244
  27,706,525
  27,706,543
  27,706,552
  27,706,555
  27,706,587
  27,706,905
  27,707,185
  27,707,358
  27,707,723
  27,707,741
  27,707,768
  27,708,103
  27,708,106
  27,708,768
  27,708,770
  27,708,779
  27,708,780
  27,708,920
  27,709,093
  27,710,177
  27,710,219
  27,711,065
  27,711,097
  27,711,107
  27,711,507
  27,711,566
  27,711,747
  27,711,748
  27,711,917
  27,712,096
  27,712,227
  27,712,378
  27,712,693
  27,713,031
  27,713,332
  27,713,389
  27,713,474
  27,713,902
  27,714,000
  27,714,104
  27,714,282
  27,714,875
  27,714,897
  27,715,043
  27,715,229
  27,715,355
  27,715,488
  27,715,567
  27,715,739
  27,715,740
  27,715,761
  27,715,832
  27,716,295
  27,716,468
  27,716,621
  27,717,600
  27,718,737
  27,718,742
  27,718,744
  27,718,771
  27,718,828
  27,719,218
  27,719,288
  27,719,670
  27,719,804
  27,720,187
  27,720,282
  27,720,570
  27,720,948
  27,721,550
  27,721,557
  27,721,677
  27,722,116
  27,722,392
  27,722,512
  27,722,703
  27,722,832
  27,722,876
  27,722,901
  27,722,912
  27,723,172
  27,723,259
  27,723,398
  27,723,406
  27,723,417
  27,723,587
  27,723,657
  27,724,346
  27,724,427
  27,724,443
  27,724,613
  27,725,055
  27,725,250
  27,725,336
  27,725,377
  27,725,441
  27,725,501
  27,725,626
  27,725,681
  27,725,693
  27,725,695
  27,725,866
  27,726,435
  27,726,495
  27,726,640
  27,727,282
  27,727,294
  27,727,434
  27,727,979
  27,728,004
  27,728,388
  27,728,566
  27,728,946
  27,729,220
  27,729,281
  27,729,446
  27,729,510
  27,729,673
  27,730,386
  27,730,563
  27,731,574
  27,731,580
  27,733,221
  27,735,162
  27,735,784
  27,736,412
  27,737,861
  27,741,484
  27,741,807
  27,742,336
  27,742,814
  27,743,795
  27,743,991
  27,744,899
  27,747,995
  27,748,666
  27,750,497
  27,750,966
  27,751,194
  27,752,185
  27,752,187
  27,752,991
  27,753,062
  27,753,083
  27,753,367
  27,753,370
  27,753,403
  27,753,418
  27,753,588
  27,753,623
  27,753,737
  27,753,833
  27,754,120
  27,754,357
  27,754,434
  27,754,436
  27,754,492
  27,754,493
  27,754,626
  27,754,707
  27,755,063
  27,755,129
  27,755,177
  27,755,232
  27,755,337
  27,755,356
  27,755,368
  27,755,662
  27,755,664
  27,755,705
  27,756,084
  27,756,435
  27,756,641
  27,756,911
  27,756,915
  27,756,934
  27,757,315
  27,757,361
  27,757,759
  27,757,986
  27,758,503
  27,758,646
  27,760,085
  27,760,751
  27,762,606
  27,763,946
  27,765,638
A
-
G
T
T
A
A
A
G
T
T
-
-
C
G
T
G/-
C
A
G
A
-/C
A
G
-
T
8/-
T
T
7
G
C
A
-
-
T
4
G
G
C
C
G
T
T
G
G
C
T
T
C
G
2
A
C
T
G
T
G
T
-
A
23
G
A
T
C
G
C/-
G/-
C/-
C/-
C
T
C
C
-
T
C
T
T
-
T
C
G
G
C
G
G
G
5
T
A
A
T
A
G
4
A
T
C
A
G
T
G
G
A
-
C
A
C
C
G
T
C
A
6
C
T
A
-
-
T
G
G
C
C
C
T
A
A
A
T
C
G
T
T
G
-
G
C
G
T
C
A
C
A
C
G
T
T
G
A
C
G
T
C
C
T
C
A
G
-/G
C
2
T
G
A
A
-
G
T
C
C
G
T
T
C
T
T
C
A
G
A/-
C
C
16
-
G
A
G
C
A
G
-
-
C
C
-
-
-/C
G
C
T
G
G
G
G
G
T
C
C
A
A
A
T
T
G
C
G
A
A
24
80
-
T
A
T
A
G
28
T
C
A
T
A
G
C/A
A
G
C
8