Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 232,634 (bp)   Positions: 546
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF2B/Stm (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
Ccdc85a
G
C
G
C
C
C
A
A
T
G
G
A
A
A
G
C
G
G
G
G
T
A
T
T
-
G
G
A
A
-
A
C
-
-
-
2
T
T
-
G
A
T
T
-
-
T
C
C
C
A
A
A
T
T
A
C
G
A
A
-
A
G
A
A
C
-
A
G
A
T
T
C
C
C
C
G
C
C
-
-
T
A
A
3
C
C
G
A
A
T
C
G
G
A
A
-
G
T
A
-
A
-
-
G
G
A
-
C
A
G
C
T
T
A
A
-
A
C
C
T
T
G
G
A
A
-
G
-
G
A
A
A
A
G
A
C
C
G
A
G
C
G
C
A
A
6
T
A
C
A
C
A
C
A
A
A
A
A
C
C
G
T
T
T
A
G
-
A
C
C
A
G
G
A
T
C
T
A
C
G
A
G
A
A
A
T
T
G
C
-
-
A
G
T
T
G
T
G
G
A
C
G
G
-
T
A
A
C
-
C
T
C
A
G
C
C
T
G
A
G
T
-
T
C
T
A
A
T
A
A
G
G
A
T
T
T
A
G
C
T
C
T
A
C
A
T
C
A
T
T
C
C
A
C
-
T
A
A
-
-
-
A
A
G
C
G
-
G
C
G
C
A
G
T
A
C
C
-
G
C
-
G
A
-
A
G
T
-
T
C
A
T
T
A
A
C
T
G
T
C
T
A
T
G
2
2
C
C
-
T
A
T
G
-
C
T
C
A
C
C
C
C
T
C
T
T
T
G
-
G
G
G
A
G
T
C
C
G
G
C
A
A
C
T
G
-
C
T
C
A
A
A
T
G
-
15
C
C
A
G
T
-
G
A
A
T
G
T
T
T
C
G
A
T
G
T
T
G
T
-
-
A
A
T
C
A
T
C
T
T
G
-
A
G
T
-
G
G
T
C
T
-
C
A
C
C
A
A
G
T
G
T
A
-
-
T
T
C
G
-
C
A
G
T
2
G
G
G
G
T
T
-
A
A
T
A
A
A
A
C
G
G
T
C
A
T
A
C
A
A
9
C
C
G
A
-
A
T
A
5
C
A
T
A
C
T
C
T
C
T
T
A
A
T
G
T
G
G
-
C
C
A
A
-
C
C
C
C
G
T
G
G
A
C
-
A
T
G
A
T
G
A
A
A
A
A
T
C
T
3
T
T
G
C
C
G
A
T
C
C
T
C
T
C
G
A
G
A
A
A
T
C
C
A
G
C
C
C
C
G
G
C
G
G
G
C
  102,127,824
  102,128,108
  102,128,169
  102,128,494
  102,129,299
  102,129,390
  102,129,428
  102,129,613
  102,129,876
  102,130,466
  102,130,631
  102,130,777
  102,130,930
  102,131,181
  102,131,183
  102,131,239
  102,131,245
  102,131,975
  102,132,407
  102,132,547
  102,132,792
  102,134,385
  102,134,439
  102,134,728
  102,134,770
  102,134,812
  102,134,868
  102,134,925
  102,135,161
  102,135,228
  102,135,692
  102,135,698
  102,136,054
  102,136,169
  102,136,294
  102,137,310
  102,137,312
  102,137,315
  102,137,391
  102,137,633
  102,138,247
  102,138,457
  102,138,916
  102,139,214
  102,139,215
  102,139,248
  102,139,474
  102,140,509
  102,141,059
  102,141,084
  102,141,104
  102,141,379
  102,142,074
  102,142,142
  102,142,335
  102,142,337
  102,142,425
  102,142,810
  102,142,999
  102,143,861
  102,144,052
  102,144,537
  102,144,642
  102,144,712
  102,144,881
  102,145,156
  102,145,256
  102,145,463
  102,145,538
  102,146,136
  102,146,177
  102,146,198
  102,146,209
  102,146,211
  102,146,280
  102,147,636
  102,153,255
  102,154,313
  102,154,980
  102,155,125
  102,156,629
  102,156,915
  102,156,995
  102,157,201
  102,159,033
  102,161,451
  102,161,483
  102,162,751
  102,163,030
  102,163,231
  102,163,529
  102,163,559
  102,163,672
  102,164,689
  102,164,754
  102,165,043
  102,165,251
  102,165,587
  102,165,590
  102,167,049
  102,167,107
  102,167,353
  102,171,554
  102,172,604
  102,172,676
  102,173,105
  102,174,008
  102,175,152
  102,175,214
  102,175,522
  102,177,361
  102,177,379
  102,179,087
  102,180,435
  102,180,929
  102,181,351
  102,181,417
  102,181,619
  102,182,431
  102,182,644
  102,182,649
  102,182,681
  102,183,296
  102,183,591
  102,183,608
  102,183,669
  102,183,761
  102,184,169
  102,184,364
  102,185,307
  102,185,316
  102,185,560
  102,185,736
  102,185,957
  102,186,003
  102,186,522
  102,186,820
  102,188,301
  102,190,428
  102,191,194
  102,191,217
  102,192,803
  102,193,020
  102,193,574
  102,193,884
  102,194,114
  102,194,463
  102,194,528
  102,194,538
  102,194,705
  102,195,360
  102,195,515
  102,196,736
  102,196,880
  102,197,464
  102,197,569
  102,198,252
  102,198,310
  102,198,584
  102,199,203
  102,199,866
  102,200,179
  102,200,719
  102,201,131
  102,202,619
  102,202,681
  102,202,700
  102,202,733
  102,203,010
  102,203,291
  102,204,762
  102,205,026
  102,205,855
  102,207,609
  102,207,986
  102,209,695
  102,209,913
  102,209,977
  102,210,145
  102,210,407
  102,210,819
  102,210,977
  102,211,172
  102,211,697
  102,211,721
  102,211,772
  102,212,407
  102,212,408
  102,212,455
  102,212,459
  102,212,504
  102,212,744
  102,213,595
  102,213,616
  102,213,622
  102,213,625
  102,213,626
  102,213,641
  102,213,708
  102,213,721
  102,213,730
  102,213,733
  102,213,846
  102,214,007
  102,214,760
  102,216,625
  102,216,806
  102,216,923
  102,217,406
  102,217,869
  102,217,923
  102,217,980
  102,218,292
  102,218,309
  102,218,441
  102,218,671
  102,219,040
  102,219,380
  102,220,702
  102,221,206
  102,221,481
  102,221,515
  102,222,256
  102,222,873
  102,223,038
  102,223,291
  102,223,956
  102,224,185
  102,224,321
  102,224,968
  102,230,351
  102,231,064
  102,231,364
  102,232,188
  102,238,975
  102,240,358
  102,240,788
  102,242,504
  102,242,662
  102,242,720
  102,242,784
  102,242,884
  102,243,673
  102,243,684
  102,244,328
  102,244,849
  102,245,489
  102,247,230
  102,248,337
  102,248,738
  102,249,526
  102,249,963
  102,254,632
  102,255,225
  102,255,734
  102,257,342
  102,257,799
  102,259,857
  102,259,860
  102,260,731
  102,260,914
  102,261,297
  102,261,557
  102,262,740
  102,265,485
  102,266,453
  102,269,132
  102,270,598
  102,271,583
  102,271,951
  102,272,421
  102,276,128
  102,276,864
  102,277,139
  102,277,230
  102,277,679
  102,277,751
  102,278,650
  102,278,990
  102,279,333
  102,279,438
  102,279,760
  102,281,005
  102,281,044
  102,281,257
  102,284,306
  102,285,249
  102,285,676
  102,285,997
  102,286,157
  102,287,033
  102,287,383
  102,287,432
  102,288,686
  102,291,657
  102,291,726
  102,291,768
  102,292,197
  102,292,222
  102,292,346
  102,292,696
  102,293,197
  102,294,797
  102,295,068
  102,295,214
  102,295,327
  102,295,356
  102,295,368
  102,295,373
  102,295,383
  102,295,385
  102,295,592
  102,296,492
  102,296,556
  102,297,178
  102,297,364
  102,297,395
  102,297,407
  102,298,549
  102,299,045
  102,299,468
  102,299,472
  102,300,225
  102,300,280
  102,300,369
  102,300,479
  102,300,612
  102,300,647
  102,300,818
  102,300,858
  102,301,202
  102,301,219
  102,301,328
  102,301,463
  102,301,547
  102,301,691
  102,302,083
  102,302,093
  102,302,140
  102,302,180
  102,302,219
  102,302,360
  102,302,381
  102,302,529
  102,302,882
  102,303,074
  102,303,194
  102,303,205
  102,303,664
  102,303,963
  102,304,009
  102,305,036
  102,305,048
  102,305,092
  102,305,105
  102,305,252
  102,305,553
  102,305,603
  102,305,639
  102,306,223
  102,306,342
  102,307,612
  102,308,506
  102,308,673
  102,309,302
  102,309,539
  102,314,807
  102,315,055
  102,315,457
  102,315,915
  102,316,854
  102,317,117
  102,318,578
  102,319,967
  102,320,425
  102,320,651
  102,320,725
  102,320,902
  102,321,040
  102,321,070
  102,321,432
  102,321,706
  102,321,773
  102,321,956
  102,322,420
  102,322,772
  102,322,892
  102,322,913
  102,323,024
  102,323,467
  102,323,660
  102,323,688
  102,323,832
  102,324,113
  102,324,149
  102,324,334
  102,324,356
  102,324,524
  102,325,515
  102,326,261
  102,326,291
  102,326,666
  102,328,627
  102,330,261
  102,330,432
  102,330,569
  102,330,993
  102,331,094
  102,331,104
  102,331,467
  102,332,546
  102,332,612
  102,333,188
  102,333,449
  102,333,505
  102,333,822
  102,333,985
  102,334,508
  102,334,817
  102,335,151
  102,335,429
  102,335,977
  102,336,026
  102,336,609
  102,336,924
  102,337,871
  102,338,562
  102,339,211
  102,339,280
  102,339,337
  102,340,136
  102,340,599
  102,340,667
  102,340,832
  102,340,946
  102,341,202
  102,341,207
  102,341,396
  102,341,450
  102,341,779
  102,341,881
  102,341,954
  102,342,194
  102,342,239
  102,342,255
  102,342,457
  102,342,494
  102,342,507
  102,342,544
  102,342,670
  102,342,752
  102,342,780
  102,342,922
  102,343,420
  102,343,421
  102,343,425
  102,343,469
  102,343,704
  102,344,008
  102,344,013
  102,344,017
  102,344,180
  102,344,185
  102,344,215
  102,344,224
  102,344,342
  102,344,411
  102,344,441
  102,344,481
  102,344,546
  102,344,607
  102,344,613
  102,344,636
  102,344,645
  102,344,646
  102,344,677
  102,344,871
  102,344,922
  102,345,436
  102,345,549
  102,345,652
  102,345,702
  102,345,706
  102,345,882
  102,345,964
  102,346,153
  102,346,282
  102,346,321
  102,346,440
  102,346,542
  102,346,588
  102,346,693
  102,346,990
  102,347,056
  102,347,352
  102,347,718
  102,348,296
  102,348,334
  102,348,357
  102,348,474
  102,348,483
  102,348,490
  102,348,504
  102,348,574
  102,348,753
  102,348,950
  102,349,246
  102,349,784
  102,350,094
  102,350,223
  102,350,248
  102,350,306
  102,350,331
  102,350,524
  102,350,557
  102,350,628
  102,350,796
  102,350,878
  102,351,015
  102,351,152
  102,351,209
  102,351,213
  102,351,470
  102,351,776
  102,351,938
  102,351,983
  102,353,213
  102,353,621
  102,353,623
  102,353,651
  102,353,829
  102,353,992
  102,354,847
  102,355,325
  102,355,917
  102,355,989
  102,355,991
  102,356,001
  102,356,019
  102,356,025
  102,356,027
  102,356,204
  102,356,244
  102,357,461
  102,357,834
  102,358,393
A
A
A
A
G
A
G
C
C
T
A
G
G
G
A
A
A
A
A
A
C
G
C
G
7
T
A
T
C
A
T
A
T
2
T
-
G
A/A
A
-
G
G
A
T
8
C
T
T
A
-
G
-
G
C
T
T
A
G
G
A
T
A
G
G
T
A
G
A
G
G
C/-
T/-
T/-
T/-
A
C
T
T
A
A
A
G
T
-
G
T
A
C
G
C
T
A
A
T
G
A
A
-
-
A
-
A
T
A
A
C
A
A
T
T
A
G
C
T
C/G
4
G/-
T
T
G
G
A
A
-
G
C
A
A
A
-
G
G
G
A
T
T
G
C
C
A
T
A
G
-
T
-
A
-
T
T
T
C
A
-
G
G
C
G
A
T
A
G
C
G
G
A
A
G
A
A
-
A
T
C
C
G
C
G
T
T
G
T
G
G
T
A
A
A
C/A
-/30
C
G
G/T
C/-
-/C
-/A
C/-
A/-
A
T
T
A
A
A
G
G
T
A
A
T
A
A
C
A
T
T
-
T
T
T
C
T
G
T
C
G
G
C
C
G
A
C
T
G
C
C
G
A
G
A
A
C
G
T
-
G
A
C
C
A
T
T
G
A
2
A
C
-
T
A
G
-
C
A
T
A
5
T
T
A
T
G
A
A
G
-
A
18
A
T
A
A
C
A
T
A
-
T
C
T
-
G
-
C
G
A
C
A
C
T
C
G
C
A
-
-
A/-
-
T
C/G
G
G
A
16
A
C
T
G
T
T
T
A
C
T
C
C
G
A
C
T
A
A
T
A
C
T
T
A
T
A
C
T
T
A
A
10
T
-
A
G
G
G
C
A
C
-
T
A
G
C
G
A
A
C
C
A
T
C
-
G
T
A
-
C
A
A
C
A
C
T
A
G
T
G
T
G
C
T
C
G
T
A
C
A
C
A
A
A
G
A
G
A
T
C
T
G
G
C
A
C
T
G
G
A
T
C
C
A
A
35
A
C
A/-
C
-
A
A
A/-
C
C
C
T
C
G
A
-
T
C
-
A
C
A
C
T
T
A
T
T
G
G
-
T
T
A
T
T
G
C
-
-
T/-
G
G
T
G
C
T
A
T
C
G
C
C
C
A
G
A
A
T
T
G
G
T
7
T
A
T
G
A
A
A
A
G
A
A
G
C
A
-
-
T
G
G
T
-/G
G
C
T
C
-
C
C
A
T
T
A
T
G
T
T
C
T
A
T
A
G
T
G/-
G/-
G
C
T
A
C
C
G/-
-/G
G/-
-/G
-/C
-/C
T
A
A
A
T