Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 99,810 (bp)   Positions: 240
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
FXLE16/Stm (2020) 
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
Capzb
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
C
T
A
G
6
2
T
T
A
C
2
G
G
A
T
-
G
C
A
G
T
T
T
G
T
G
T
T
A
T
A
A
T
G
T
A
A
T
G
A
A
14
T
2
10
19
G
-
G
T
T
A
T
G
A
G
A
G
T
T
C
A
C
A
T
C
T
C
G
A
A
T
A
G
C
T
T
A
C
T
T
T
T
T
C
2
G
G
G
T
T
C
T
G
T
C
T
2
T
A
C
G
C
C
A
T
A
T
A
-
C
G
-
T
A
2
23
8
C
A
C
T
A
A
-
A
A
G
G
A
A
A
T
G
C
G
T
C
A
A
G
A
C
A
-
T
C
A
2
A
G
A
T
A
G
A
A
A
C
A
G
-
G
T
C
C
T
A
C
C
A
G
C
G
T
T
T
A
T
G
T
12
-
C
A
A
C
G
A
T
G
A
-
T
C
A
48
-
T
T
G
T
T
A
A
A
G
T
A
G
2
G
A
A
A
A
A
G
A
A
G
G
C
2
C
A
C
G
13
A
T
G
A
A
A
C
A
-
  151,439,600
  151,443,909
  151,446,687
  151,447,634
  151,449,384
  151,450,807
  151,451,654
  151,454,265
  151,457,786
  151,458,712
  151,461,377
  151,461,821
  151,461,922
  151,462,374
  151,462,561
  151,463,440
  151,463,449
  151,464,131
  151,464,441
  151,464,954
  151,465,539
  151,465,733
  151,466,162
  151,466,208
  151,466,225
  151,466,655
  151,466,952
  151,467,139
  151,467,253
  151,467,255
  151,467,622
  151,467,827
  151,467,834
  151,467,899
  151,467,920
  151,467,990
  151,468,082
  151,468,463
  151,468,668
  151,469,072
  151,469,203
  151,469,569
  151,469,607
  151,469,686
  151,469,732
  151,470,575
  151,470,578
  151,470,606
  151,471,233
  151,471,942
  151,471,972
  151,471,978
  151,472,238
  151,472,675
  151,472,856
  151,473,024
  151,473,301
  151,473,391
  151,473,583
  151,473,789
  151,473,816
  151,474,211
  151,474,587
  151,474,805
  151,474,990
  151,475,011
  151,475,173
  151,475,504
  151,475,582
  151,475,720
  151,475,829
  151,476,073
  151,476,190
  151,477,577
  151,477,857
  151,477,899
  151,478,380
  151,478,440
  151,478,597
  151,478,657
  151,479,354
  151,479,852
  151,480,123
  151,481,866
  151,484,823
  151,485,272
  151,485,698
  151,485,878
  151,485,932
  151,486,745
  151,487,549
  151,488,237
  151,488,249
  151,489,281
  151,489,903
  151,490,464
  151,491,116
  151,491,554
  151,492,344
  151,492,969
  151,493,283
  151,493,351
  151,493,480
  151,493,538
  151,494,565
  151,494,833
  151,495,554
  151,496,485
  151,496,503
  151,496,593
  151,496,707
  151,497,150
  151,497,590
  151,497,618
  151,497,646
  151,497,780
  151,498,274
  151,498,348
  151,498,369
  151,498,457
  151,498,746
  151,498,770
  151,498,873
  151,499,209
  151,499,391
  151,499,554
  151,499,605
  151,499,963
  151,500,019
  151,500,896
  151,500,947
  151,501,444
  151,503,989
  151,504,032
  151,504,043
  151,504,344
  151,505,483
  151,506,492
  151,507,440
  151,508,242
  151,509,040
  151,509,277
  151,509,356
  151,509,473
  151,509,558
  151,509,639
  151,509,840
  151,509,971
  151,510,955
  151,511,077
  151,511,165
  151,511,484
  151,512,260
  151,512,735
  151,512,850
  151,513,510
  151,514,495
  151,514,536
  151,515,398
  151,515,538
  151,515,754
  151,516,085
  151,516,190
  151,516,226
  151,516,228
  151,516,806
  151,517,122
  151,517,456
  151,517,464
  151,517,559
  151,517,933
  151,517,996
  151,518,409
  151,518,663
  151,518,913
  151,518,929
  151,518,941
  151,518,952
  151,519,198
  151,519,954
  151,520,275
  151,521,163
  151,521,378
  151,521,498
  151,521,879
  151,521,886
  151,521,896
  151,521,914
  151,522,239
  151,522,728
  151,523,275
  151,523,373
  151,523,495
  151,523,611
  151,523,975
  151,524,297
  151,524,449
  151,524,816
  151,524,820
  151,525,104
  151,525,163
  151,525,188
  151,525,321
  151,525,354
  151,525,656
  151,525,702
  151,526,060
  151,527,268
  151,527,456
  151,527,501
  151,527,616
  151,528,222
  151,528,877
  151,528,878
  151,528,883
  151,528,885
  151,528,887
  151,528,889
  151,528,891
  151,529,211
  151,529,258
  151,529,259
  151,529,432
  151,529,451
  151,529,764
  151,529,787
  151,530,390
  151,530,419
  151,530,574
  151,531,214
  151,532,940
  151,532,963
  151,533,476
  151,533,613
  151,533,630
  151,534,091
  151,534,256
  151,534,418
  151,534,557
  151,535,377
C/-
G
T
A
G
A
-
-
C
C
G
A
-
A
A
G
C
28
C
T
T
-
C
C
C
A
-
A
-/A
A
G
C
G
G
C
A
C
G
G
C
A
G
G
-
C
-
-
-
A
3
A
G
A
G
C
A
G
T
G
T
C
C
T
G
T
C
C
A
A
T
A
G
G
G
G
A
T
C
C
T
A
C
A
C
C
C
T
-
A
A
T
C
C
A
C
A
C
T
C
-
-
T
A
A
T
T
G
G
G
-
C
4
T
A
G
A
G
-
-
-
T
G
A
C
T
G
T
G
G
A
A
T
T
G
C
C
A
T
C
A
G
G
A
G
T
G
10
C
G
G
-
G
A
C
C
G
T
G
G
G
A
G
T
2
T
C
T
T
C
G
T
T
G
A
T
A
C
C
C
G
A
A
-
-
6
T
T
G
A
C
G
C
C
G
G
C
T
G
-
7
C
C
A
C
C
C
G
C
A
C
G
A
-
-/C
T/-
-/T
T/-
-/T
T
A
C
T
A
A
T
-
T
G
T
A
-
T
C
A
G
C
C
T
G
A