Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 136,791 (bp)   Positions: 305
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF1A/Stm (2019) 
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
G
G
C
G
4
A
A
A
T
A
A
G
C
A
T
-
C
G
G
C
T
-
-
2
A
T
T
T
T
C
T
T
G
G
T
A
10
G
A
G
G
C
-
3
T
T
A
G
T
G
-
C
-
T
A
C
C
A
-
C
C
A
G
A
C
A
G
T
T
T
G
T
G
G
-
T
C
A
-
T
T
C
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
C
C
A
C
A
A
G
T
C
T
A
C
A
A
A
A
A
T
G
A
A
C
T
A
-
G
A
A
A
G
-
C
C
A
T
G
T
C
G
T
A
G
A
T
T
A
C
G
G
T
3
T
C
T
T
T
G
T
T
G
A
G
G
T
G
G
-
T
G
A
T
T
A
G
A
T
T
T
T
3
T
2
G
-
T
T
C
A
C
A
G
A
G
G
C
A
T
14
C
-
C
T
G
C
A
A
T
G
G
-
C
G
-
C
G
2
G
G
A
G
G
G
T
T
109
A
A
T
A
C
G
G
C
A
A
C
T
C
G
T
T
T
T
2
G
C
T
-
C
T
T
-
A
A
A
A
A
G
-
T
G
C
A
C
C
G
2
C
-
C
C
C
G
G
A
C
A
G
G
A
C
G
G
G
4
C
C
A
G
G
C
C
A
T
C
C
-
A
-
T
G
6
G
G
G
A
  174,349,091
  174,349,258
  174,349,936
  174,350,752
  174,351,175
  174,351,920
  174,352,346
  174,352,405
  174,352,409
  174,352,411
  174,352,873
  174,352,915
  174,354,075
  174,354,384
  174,354,790
  174,356,151
  174,356,302
  174,356,688
  174,356,692
  174,357,239
  174,357,473
  174,358,063
  174,358,307
  174,359,046
  174,359,824
  174,359,826
  174,360,002
  174,360,496
  174,360,587
  174,361,669
  174,361,742
  174,362,914
  174,363,188
  174,363,949
  174,364,033
  174,364,073
  174,364,542
  174,365,016
  174,365,412
  174,365,550
  174,366,376
  174,368,381
  174,368,545
  174,369,746
  174,370,336
  174,371,468
  174,371,787
  174,371,855
  174,373,651
  174,373,767
  174,374,053
  174,374,569
  174,374,581
  174,374,588
  174,374,615
  174,376,517
  174,380,414
  174,380,753
  174,380,764
  174,381,234
  174,381,333
  174,381,747
  174,381,818
  174,382,201
  174,382,439
  174,383,149
  174,384,214
  174,384,874
  174,384,971
  174,386,552
  174,387,121
  174,387,423
  174,388,229
  174,389,349
  174,389,378
  174,389,437
  174,389,485
  174,389,510
  174,389,512
  174,389,550
  174,389,906
  174,389,942
  174,390,739
  174,391,013
  174,391,037
  174,391,039
  174,391,041
  174,391,043
  174,391,045
  174,391,047
  174,391,049
  174,391,051
  174,391,053
  174,391,055
  174,391,057
  174,391,059
  174,391,061
  174,391,063
  174,391,065
  174,392,076
  174,393,926
  174,394,232
  174,394,382
  174,394,534
  174,395,065
  174,395,519
  174,395,744
  174,397,151
  174,397,402
  174,397,407
  174,397,494
  174,400,665
  174,400,914
  174,402,861
  174,404,430
  174,404,799
  174,404,906
  174,405,231
  174,407,040
  174,407,196
  174,407,562
  174,407,658
  174,407,895
  174,408,109
  174,408,666
  174,408,773
  174,408,982
  174,409,316
  174,409,650
  174,409,683
  174,410,549
  174,410,743
  174,412,482
  174,412,575
  174,412,882
  174,413,073
  174,413,621
  174,413,795
  174,414,222
  174,414,582
  174,414,733
  174,415,153
  174,416,323
  174,416,826
  174,417,214
  174,417,257
  174,417,381
  174,417,601
  174,417,907
  174,418,081
  174,418,266
  174,418,271
  174,418,280
  174,418,309
  174,418,339
  174,418,410
  174,419,374
  174,419,407
  174,419,696
  174,419,975
  174,420,828
  174,421,087
  174,421,222
  174,421,604
  174,421,643
  174,423,276
  174,423,496
  174,425,017
  174,425,737
  174,425,888
  174,425,892
  174,426,276
  174,426,809
  174,426,887
  174,427,076
  174,427,266
  174,427,267
  174,427,287
  174,427,296
  174,427,559
  174,428,479
  174,428,524
  174,429,508
  174,429,897
  174,432,209
  174,432,331
  174,432,446
  174,432,582
  174,433,123
  174,433,757
  174,434,171
  174,434,172
  174,435,297
  174,435,462
  174,435,651
  174,437,211
  174,437,620
  174,437,673
  174,438,467
  174,438,486
  174,439,150
  174,439,500
  174,439,709
  174,439,710
  174,439,947
  174,440,140
  174,440,190
  174,440,405
  174,441,201
  174,442,586
  174,443,157
  174,444,010
  174,444,094
  174,444,357
  174,444,609
  174,444,801
  174,444,896
  174,445,271
  174,445,328
  174,445,403
  174,446,118
  174,446,516
  174,447,003
  174,447,225
  174,448,063
  174,448,174
  174,448,557
  174,448,736
  174,448,868
  174,448,908
  174,449,222
  174,449,307
  174,451,057
  174,452,104
  174,452,274
  174,453,253
  174,453,413
  174,453,473
  174,453,576
  174,453,785
  174,453,791
  174,454,172
  174,454,353
  174,454,766
  174,455,431
  174,455,819
  174,455,883
  174,455,914
  174,456,962
  174,456,963
  174,457,057
  174,457,164
  174,457,706
  174,457,872
  174,458,123
  174,458,529
  174,459,223
  174,459,288
  174,461,814
  174,462,188
  174,462,541
  174,462,773
  174,462,858
  174,463,387
  174,464,089
  174,464,534
  174,466,113
  174,466,390
  174,467,066
  174,467,068
  174,467,073
  174,467,651
  174,468,145
  174,468,263
  174,469,550
  174,469,627
  174,469,711
  174,470,051
  174,470,231
  174,470,347
  174,470,803
  174,471,370
  174,471,706
  174,472,207
  174,472,992
  174,473,170
  174,473,474
  174,475,191
  174,475,612
  174,475,753
  174,476,601
  174,476,983
  174,476,998
  174,477,228
  174,478,373
  174,478,387
  174,479,416
  174,479,533
  174,480,065
  174,480,115
  174,480,124
  174,481,149
  174,481,451
  174,481,970
  174,482,254
T
G
A
A
A
A
-
-/T
-/T
T/-
-
G
G
C
G
G
C
5
T
A
A
G
C
2
2
-
G
C
C
A
-
T
C
C
A
A
C
-
-
C
G
A
A
T
2
-
G
C
G
A
C
A
2
T
G
C
T
T
T
T
T
A
T
-
A
T
A
G
A
G
C
C
-
C
C
A
8
T/C
T/-
G
CA/C
C
A
C/G
-/C
C/-
C/-
-/C
C/-
C/-
-/C
-/C
C/-
-/C
C
C
C
C
G/C
T
T
G
T
T
G
A
A
G
-
G
T
G
G
C
C
G
A
A
C
G
T
A
G
2
A
T
T
G
A
5
T
G
G
A
A
-
G
C
G
G
C
G
C
G
-/T
T
A
A
-
-
C
-/T
-/C
C/-
C
T
C
C
A
T
A
C
A
A
C
4
C
A
G
-/A
A/-
G
A
G
A
C
C
G
-
A
-
A
2
-/G
-
A
T
T
T
A
G
T
A
T
G
C
14/-
T
4
-/G
-
A
T
G
T
C
T
A
5
A
A
G
T
T
-
A
A
G
A
A
T
G
A
-
G
-/T
-
G
T
A
A
T
G
T/-
-
A
T
A
C
-
C
A
-
A
T
C
36
A
-/A
A
A
G
G
G
-
G
A
A
C
A
T
G
T
T
A/-
-
A
G
A
A
A
A
A
G
T
-
A
A
G
A
A
T
A
-
A
T
-
A
-/A
T
T
G
-/C
T
T
G
T
A
-
C
6/-
A
A
-/A
-