Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 156,634 (bp)   Positions: 304
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF11/Stm (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
Arnt2
G
A
C
C
G
A
T
T
T
A
C
T
T
C
G
2
2
C
T
G
T
C
G
C
A
C
A
A
T
T
C
3
C
2
T
C
T
C
-
T
C
G
G
T
C
T
C
T
C
T
C
A
G
-
C
C
C
G
-
-
G
G
A
T
T
C
T
A
G
G
A
T
G
T
A
A
C
A
A
G
-
C
C
T
C
A
G
T
A
G
A
C
C
T
A
G
G
A
T
-
G
T
A
G
G
G
T
A
A
C
T
C
G
G
T
A
-
G
A
C
G
A
T
2
G
C
G
T
T
T
G
T
T
C
C
C
C
A
C
A
G
G
G
G
C
G
C
T
A
C
G
T
C
G
C
C
G
C
T
A
G
G
T
A
A
C
5
T
A
C
T
A
C
-
T
C
G
T
T
G
A
-
C
C
C
T
G
G
T
T
C
T
G
T
T
-
A
A
C
G
A
T
C
A
A
C
G
C
A
G
G
A
A
6
C
C
A
G
A
A
A
T
11
C
A
T
T
T
4
G
G
T
T
T
C
A
T
G
A
C
C
C
C
G
G
2
A
-
C
C
G
A
8
A
C
A
G
G
T
G
T
A
A
C
C
A
A
A
G
G
G
T
C
A
A
C
T
C
-
2
G
A
A
-
A
G
T
C
-
4
-
A
T
C
T
C
T
G
T
T
-
T
-
A
  138,236,996
  138,237,164
  138,239,224
  138,240,531
  138,240,943
  138,241,196
  138,241,736
  138,241,909
  138,241,910
  138,241,960
  138,243,006
  138,243,150
  138,243,562
  138,243,596
  138,243,843
  138,244,037
  138,244,069
  138,244,340
  138,244,413
  138,244,641
  138,244,678
  138,245,080
  138,245,152
  138,245,506
  138,245,950
  138,246,148
  138,246,402
  138,246,689
  138,247,276
  138,247,305
  138,248,034
  138,248,111
  138,248,222
  138,248,637
  138,248,660
  138,248,977
  138,248,980
  138,248,997
  138,250,257
  138,250,507
  138,251,154
  138,252,104
  138,252,172
  138,253,070
  138,256,091
  138,256,869
  138,256,912
  138,257,019
  138,257,295
  138,257,745
  138,257,884
  138,258,942
  138,261,279
  138,261,601
  138,261,994
  138,263,367
  138,267,006
  138,268,458
  138,268,807
  138,268,808
  138,269,112
  138,269,592
  138,269,849
  138,270,085
  138,270,772
  138,270,835
  138,271,842
  138,272,470
  138,273,079
  138,273,365
  138,273,450
  138,274,128
  138,275,381
  138,276,707
  138,277,433
  138,277,889
  138,278,036
  138,279,259
  138,279,504
  138,279,720
  138,282,246
  138,284,104
  138,284,220
  138,285,408
  138,285,431
  138,287,850
  138,287,851
  138,289,080
  138,289,777
  138,289,831
  138,291,709
  138,292,261
  138,294,676
  138,294,803
  138,294,811
  138,295,130
  138,295,148
  138,295,284
  138,295,472
  138,295,504
  138,295,643
  138,295,708
  138,295,885
  138,296,328
  138,296,561
  138,296,563
  138,296,570
  138,296,672
  138,296,680
  138,296,816
  138,296,844
  138,296,860
  138,296,935
  138,297,087
  138,297,182
  138,297,380
  138,297,605
  138,297,934
  138,298,771
  138,299,413
  138,300,635
  138,300,701
  138,302,568
  138,303,109
  138,303,397
  138,305,036
  138,305,041
  138,305,440
  138,306,667
  138,308,030
  138,308,434
  138,308,680
  138,309,229
  138,309,853
  138,310,585
  138,311,613
  138,311,656
  138,312,881
  138,312,985
  138,313,282
  138,313,370
  138,315,216
  138,315,509
  138,315,779
  138,315,944
  138,316,248
  138,316,312
  138,316,761
  138,317,004
  138,317,008
  138,317,018
  138,317,057
  138,317,902
  138,318,341
  138,318,864
  138,318,932
  138,318,960
  138,318,972
  138,319,048
  138,319,308
  138,319,394
  138,319,584
  138,319,765
  138,320,409
  138,320,514
  138,320,527
  138,321,062
  138,321,696
  138,321,779
  138,321,893
  138,322,334
  138,322,351
  138,322,463
  138,322,500
  138,322,502
  138,322,616
  138,322,867
  138,322,968
  138,323,196
  138,323,550
  138,323,700
  138,324,083
  138,324,217
  138,324,573
  138,324,741
  138,324,794
  138,324,883
  138,326,595
  138,326,637
  138,327,701
  138,328,399
  138,328,465
  138,328,480
  138,328,737
  138,328,975
  138,329,267
  138,329,510
  138,330,129
  138,331,436
  138,331,440
  138,332,043
  138,332,134
  138,332,792
  138,333,323
  138,334,109
  138,334,228
  138,334,307
  138,334,398
  138,334,408
  138,334,919
  138,334,923
  138,335,071
  138,335,751
  138,336,006
  138,336,231
  138,336,496
  138,337,700
  138,338,296
  138,338,334
  138,338,589
  138,338,791
  138,338,883
  138,338,895
  138,338,928
  138,338,939
  138,339,044
  138,339,302
  138,339,368
  138,339,903
  138,340,814
  138,341,127
  138,341,311
  138,342,450
  138,342,663
  138,342,957
  138,342,958
  138,343,524
  138,343,698
  138,344,002
  138,344,048
  138,344,316
  138,345,064
  138,345,106
  138,345,182
  138,345,460
  138,345,791
  138,345,931
  138,346,152
  138,346,469
  138,346,877
  138,347,343
  138,348,326
  138,348,827
  138,348,865
  138,348,933
  138,349,247
  138,350,895
  138,351,927
  138,352,473
  138,352,687
  138,352,797
  138,352,806
  138,353,003
  138,353,520
  138,353,696
  138,355,701
  138,355,725
  138,356,351
  138,357,652
  138,357,684
  138,357,940
  138,358,205
  138,358,461
  138,358,633
  138,359,958
  138,361,065
  138,362,176
  138,364,243
  138,364,865
  138,371,788
  138,371,831
  138,372,812
  138,376,197
  138,377,014
  138,378,168
  138,380,271
  138,380,558
  138,381,332
  138,381,494
  138,381,597
  138,383,035
  138,385,070
  138,386,426
  138,388,138
  138,388,291
  138,388,376
  138,388,456
  138,389,266
  138,389,836
  138,390,074
  138,390,786
  138,391,460
  138,392,182
  138,392,620
C
G
T
T
A
G
A
C
C
G
T
C
C
T
A
-
-
G
C
A
C
T
A
A
G
T
G
G
-
C
T
-
A
-
C
T
A
A
4
C
T
C
A
C
T
C
T
C
A
C
T
G
T
15
T
T
G
A
3
17
A
C
G
C
C
A
-
G
A
A
G
C
A
A
C
G
T
T
T
A
C
T
T
G
T
T
A
C
G
A
G
T
T
C
G
A
C
C
G
A
A
C
G
A
-/C
C/-
A/-
G
G
T
C
T
A
A
C
G
A
A
G
T
-
G
C
-
C
G
A
G
C
G
A
C
C
T
T
T
T
G
T
T
A
A
A
A
G
A
T
G
G
T
T
G
T
A
T
A
C
A
C
C
C
A
C
G
G
T
-
C
G
T
G
G
T
8
G
T
A
C
-
A
G
15
T
-
G
C
A
T
C
C
T
C
A
C
C
T
G
G
T
A
G
C
T
G
G
A
C
A
G
A
A
G
G
-
T
T
T
A
C
G
-/G
C
-
G
G
C
C
C
-
A
A
G
C
C
T
G
C/-
A
T
G
-
T
T
A
T
-
C
13
T
A
A
C
-
G
T
G
A
A
C
A
C
C
G
T
T
-
G
G
A
A
-/A
-
A
G
G
T
C
G
T
2/-
A
-
G
3
G
A
C
T
8
-
4
-
C
T
G
T
C
A
C
C
A
C
T
G