Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 233,776 (bp)   Positions: 516
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
SHR/OlalpcvMcwi (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
Arhgap18
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
-
C
C
T
-
T
A
C
T
A
A
G
G
T
G
G
T
A
G
G
G
T
5
C
G
7
T
C
2
-
A
C
-
A
T
2
C
A
G
T
G
A
G
G
T
T
A
T
-
A
G
C
-
C
G
T
T
C
C
G
12
C
4
T
G
A
A
G
C
T
T
A
G
G
C
A
12
C
2
-
G
T
4
-
G
A
C
-
A
A
T
T
A
T
G
G
A
C
T
T
G
-
A
A
C
C
C
A
T
T
-
T
A
A
G
T
A
G
C
A
A
A
A
32
G
4
G
C
-
C
C
C
G
G
A
C
-
T
T
G
G
T
-
-
A
G
12
A
G
T
T
A
A
A
A
G
-
C
A
-
A
-
C
G
T
A
G
A
C
C
-
C
A
C
A
C
G
A
3
G
A
A
A
G
C
C
A
C
T
T
T
C
T
C
T
T
C
A
C
A
G
T
T
T
G
C
-
T
A
T
T
T
-
-
T
C
A
G
C
C
G
G
T
T
G
A
A
C
A
C
T
-
C
T
T
G
A
T
A
C
T
A
A
T
C
T
C
G
T
4
T
G
A
A
-
-
G
T
T
T
C
T
A
T
7
T
A
G
-
G
A
T
T
-
G
5
T
A
C
T
G
C
C
-
A
A
-
G
G
G
3
2
G
A
T
T
A
A
C
-
A
G
G
T
C
T
C
G
G
C
-
A
T
G
G
7
T
T
A
A
9
C
T
A
G
A
A
C
A
T
-
T
-
C
T
G
-
-
T
A
C
A
A
A
A
C
G
C
T
-
-
G
T
A
G
A
C
T
T
G
-
G
-
T
G
C
G
G
G
T
C
G
C
A
G
C
G
C
T
C
12
A
A
A
C
A
T
A
T
G
C
A
6
-
A
C
G
T
A
C
A
G
3
3
G
2
C
C
G
-
-
C
C
A
A
A
C
G
T
C
T
C
G
G
G
T
T
G
G
A
G
C
G
T
C
A
C
C
A
C
C
T
G
C
T
C
C
G
G
11
A
-
A
C
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
C
C
-
-
C
G
G
A
3
A
G
18
6
A
G
C
-
C
T
A
C
C
G
C
A
G
5
G
A
C
C
7
2
A
G
T
T
G
T
G
-
G
T
G
T
G
A
A
A
C
  18,411,069
  18,440,246
  18,464,262
  18,509,686
  18,509,800
  18,510,032
  18,510,237
  18,510,285
  18,510,340
  18,510,345
  18,510,912
  18,511,025
  18,511,037
  18,511,508
  18,512,271
  18,512,689
  18,512,775
  18,513,007
  18,513,309
  18,513,314
  18,513,330
  18,513,332
  18,513,366
  18,513,950
  18,516,069
  18,517,805
  18,517,845
  18,518,147
  18,518,273
  18,518,338
  18,518,342
  18,518,704
  18,518,808
  18,519,092
  18,519,271
  18,519,373
  18,519,448
  18,519,696
  18,520,078
  18,520,089
  18,520,251
  18,520,560
  18,520,790
  18,520,975
  18,521,340
  18,521,740
  18,523,436
  18,524,280
  18,528,051
  18,529,227
  18,529,528
  18,529,913
  18,530,276
  18,534,232
  18,535,066
  18,535,630
  18,536,413
  18,536,428
  18,537,556
  18,540,787
  18,541,980
  18,544,089
  18,544,770
  18,548,340
  18,549,634
  18,549,782
  18,550,355
  18,551,209
  18,551,336
  18,551,439
  18,551,585
  18,551,684
  18,551,854
  18,551,893
  18,552,072
  18,552,516
  18,552,857
  18,553,046
  18,553,321
  18,553,413
  18,553,417
  18,553,656
  18,553,665
  18,553,716
  18,553,741
  18,553,871
  18,553,894
  18,553,928
  18,553,964
  18,553,971
  18,554,069
  18,554,176
  18,554,492
  18,554,739
  18,555,070
  18,556,123
  18,556,133
  18,556,165
  18,556,213
  18,556,290
  18,556,378
  18,556,379
  18,556,425
  18,556,473
  18,556,504
  18,556,577
  18,556,603
  18,556,630
  18,556,817
  18,556,833
  18,557,230
  18,557,298
  18,557,452
  18,557,665
  18,557,725
  18,557,726
  18,558,443
  18,558,459
  18,558,492
  18,558,656
  18,558,912
  18,558,914
  18,558,916
  18,558,918
  18,558,945
  18,559,235
  18,559,366
  18,559,670
  18,559,881
  18,561,062
  18,561,159
  18,561,709
  18,561,713
  18,562,005
  18,562,030
  18,562,614
  18,563,017
  18,563,032
  18,563,167
  18,563,952
  18,564,122
  18,564,420
  18,564,498
  18,564,985
  18,565,087
  18,565,088
  18,565,094
  18,565,147
  18,565,628
  18,565,646
  18,565,786
  18,565,797
  18,565,805
  18,565,886
  18,566,000
  18,566,007
  18,566,046
  18,566,522
  18,567,008
  18,569,890
  18,569,907
  18,570,307
  18,570,436
  18,570,503
  18,570,738
  18,571,085
  18,571,261
  18,571,273
  18,571,629
  18,571,710
  18,572,572
  18,572,994
  18,573,459
  18,574,000
  18,574,455
  18,574,880
  18,575,224
  18,575,353
  18,575,407
  18,575,453
  18,575,634
  18,575,947
  18,576,117
  18,576,402
  18,576,566
  18,576,637
  18,576,692
  18,576,716
  18,577,269
  18,577,349
  18,577,545
  18,577,661
  18,577,667
  18,578,320
  18,578,392
  18,578,397
  18,578,489
  18,578,950
  18,579,012
  18,579,120
  18,579,131
  18,579,190
  18,579,414
  18,580,232
  18,580,501
  18,580,830
  18,580,843
  18,580,985
  18,581,563
  18,581,583
  18,581,585
  18,581,696
  18,582,413
  18,582,642
  18,582,643
  18,583,330
  18,583,368
  18,583,871
  18,583,872
  18,583,920
  18,584,053
  18,584,083
  18,584,314
  18,584,396
  18,584,410
  18,585,643
  18,585,657
  18,585,744
  18,585,897
  18,585,975
  18,586,071
  18,586,328
  18,586,707
  18,586,718
  18,586,722
  18,586,830
  18,587,740
  18,587,744
  18,587,870
  18,588,176
  18,588,303
  18,588,627
  18,588,628
  18,588,759
  18,588,840
  18,588,970
  18,589,121
  18,589,356
  18,589,627
  18,589,631
  18,589,765
  18,589,831
  18,590,151
  18,590,472
  18,590,760
  18,590,865
  18,590,936
  18,591,104
  18,591,241
  18,591,458
  18,591,727
  18,591,846
  18,592,637
  18,593,412
  18,593,764
  18,594,030
  18,594,277
  18,594,367
  18,594,381
  18,594,403
  18,594,620
  18,594,626
  18,594,695
  18,594,719
  18,594,734
  18,594,919
  18,595,054
  18,595,152
  18,595,219
  18,595,225
  18,595,575
  18,595,610
  18,595,642
  18,595,661
  18,595,666
  18,595,687
  18,595,691
  18,595,704
  18,595,808
  18,595,832
  18,595,892
  18,595,938
  18,595,963
  18,595,973
  18,596,029
  18,596,111
  18,596,124
  18,596,187
  18,596,238
  18,596,253
  18,596,294
  18,596,299
  18,596,459
  18,596,473
  18,596,545
  18,596,546
  18,596,556
  18,596,559
  18,596,655
  18,596,759
  18,596,767
  18,596,786
  18,596,924
  18,596,972
  18,597,023
  18,597,065
  18,597,071
  18,597,085
  18,597,087
  18,597,094
  18,597,101
  18,597,129
  18,597,152
  18,597,160
  18,597,189
  18,597,218
  18,597,275
  18,597,286
  18,597,298
  18,597,354
  18,597,357
  18,597,368
  18,597,408
  18,597,502
  18,597,538
  18,597,561
  18,597,604
  18,597,614
  18,597,620
  18,597,670
  18,597,689
  18,597,736
  18,597,903
  18,597,963
  18,597,992
  18,598,195
  18,598,216
  18,598,234
  18,598,260
  18,598,280
  18,598,294
  18,598,300
  18,598,310
  18,598,461
  18,598,580
  18,598,723
  18,598,762
  18,598,853
  18,599,386
  18,599,392
  18,599,609
  18,599,618
  18,599,851
  18,599,893
  18,600,028
  18,600,038
  18,600,041
  18,600,053
  18,600,055
  18,600,147
  18,600,149
  18,600,179
  18,600,520
  18,600,591
  18,600,612
  18,600,640
  18,600,678
  18,600,806
  18,600,807
  18,600,891
  18,600,917
  18,601,228
  18,601,239
  18,601,311
  18,601,439
  18,601,460
  18,601,862
  18,601,924
  18,602,945
  18,603,071
  18,603,204
  18,603,756
  18,603,780
  18,603,878
  18,604,519
  18,604,566
  18,604,870
  18,604,960
  18,605,238
  18,605,512
  18,605,616
  18,606,831
  18,606,889
  18,607,286
  18,607,292
  18,607,537
  18,608,865
  18,609,035
  18,609,039
  18,609,145
  18,609,277
  18,609,299
  18,609,469
  18,609,669
  18,609,830
  18,610,027
  18,610,128
  18,610,458
  18,610,839
  18,611,430
  18,611,682
  18,612,161
  18,612,190
  18,612,218
  18,612,674
  18,612,699
  18,613,007
  18,613,094
  18,613,119
  18,613,282
  18,613,338
  18,614,222
  18,614,793
  18,614,899
  18,615,249
  18,615,265
  18,616,452
  18,616,530
  18,616,640
  18,616,641
  18,616,721
  18,616,841
  18,616,849
  18,617,981
  18,617,990
  18,618,377
  18,618,432
  18,618,533
  18,618,947
  18,618,954
  18,619,056
  18,619,079
  18,619,753
  18,620,077
  18,620,413
  18,620,622
  18,620,624
  18,620,646
  18,620,648
  18,620,650
  18,620,652
  18,620,654
  18,620,656
  18,620,658
  18,620,660
  18,621,138
  18,621,646
  18,621,919
  18,622,972
  18,623,075
  18,623,122
  18,623,207
  18,623,215
  18,623,218
  18,623,220
  18,623,222
  18,623,246
  18,623,291
  18,623,349
  18,623,593
  18,623,716
  18,624,034
  18,624,246
  18,624,431
  18,624,462
  18,624,616
  18,624,648
  18,624,661
  18,624,729
  18,624,758
  18,625,479
  18,625,881
  18,625,895
  18,625,934
  18,626,316
  18,626,339
  18,626,517
  18,626,643
  18,627,608
  18,627,709
  18,627,740
  18,627,822
  18,627,891
  18,627,918
  18,627,968
  18,628,176
  18,629,899
  18,629,909
  18,631,738
  18,632,630
  18,632,728
  18,634,907
  18,636,184
  18,636,564
  18,636,751
  18,636,807
T
4
T/-
T
C
A
C
T
T
-
G
G
C
A
C
A
A
C
C/-
-/A
A/-
-/A
A
-
T
A
-
C
T
-
G
G/-
T
2
G
C
-
T
C
A
C
A
G
C
T
C
C
G
C
T
G
A
C/A
G
T
C
A
A
T
T
A
12/-
T
-
-
A
G
G
T
T
C
-
G
T
-
T
T
-
T
-
4
A
-
-
9
A
G
-
9
G
G
C
C
T
A
A
A
G
T
G
C
T
7
G
-/T
T
T
T
G
C
C
G
G
G
-
T
G
-
A
T
-/T
-/T
T/-
A/T
32/-
T
-
A
A
30
T
T
T
A
A
G
T
T
C
G
A
T
C
40
4
G
A
-
G
A
C
C
G
G
-
T
A
C
A
G
A
G
3
T
A
G
G
A
G
T
-
2
A
G
T
G
T
A
G
-
-
G
G
G
A
T
T
-
G
C
C
G
T
A
A
G
C
T
C
T
T
T
C
G
C
A
T
A
G
T
A
C
-
A
T
C
T
T
C
T
T
C
G/C
T/A
T/G
A
G
G
T
C
T
C
G
T
C
G
A
T
C
T/-
G
G
T
G
C
T
C
T
A
C
-
C
A
C
T
5
T
T
C
C
A
T
C
G
C
-
-
G
A
3
A
G
C
C
C
A
-
C
C
T
C
A
T
G
G
C
G
2
A
A
T
-
-
A
G
C
C
G
G
T
A
C
T
A
A
T
C
G
A
A
G
G
G
G
A
A
-
G
A
G
G
-
T
A
G
A
G
G
T
G
C
2
C
4
T
C
A
6
9
C
G
T
G
C
G
G
A
A
T
C
G
T
A
C
G
T
G
T
-
-
A
A
T
T
C
A
T
C
A
A
C
T
A
A
G
C
T
C
A
C
G
-
-/G
G
G
T
G
C
G
C
T
G
-
-
A
C
A
C
C
C
T
T
A
-
-
A
-
T/-
T
T
8
A
T
T
C
C
T
T
T
C
G
C
A
A
A
C
C
A
T
C
G
A
T
C
A
T
G
G
T
T
A
T
A
T
G
C
G
T
-
C
-
T
A
G
T
T/A
A/-
A/-
-/A
-/A
A
A
A
A
A
C
G
T
T
A
T
T
T
-/G
-
-/G
-/A
-
-
G
T
T
G
A
C
G
G
T
A
A
G
T
-
T
G
G
T
-
-
G
A
C
-
A
G/-
A
A
A
C
A
A
-
G
-
G
-