Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 80,333 (bp)   Positions: 200
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
WAG/RijCrl (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
Arfip1
A
C
C
C
G
G
C
A
C
-
A
-
4
G
G
T
T
G
A
T
C
A
T
A
T
-
A
A
C
C
A
G
T
G
G
A
G
A
T
C
-
T
T
A
C
G
G
T
-
C
C
C
G
A
G
T
A
4
A
C
T
A
A
A
G
G
G
G
-
G
A
T
T
T
-
A
G
T
A
C
A
A
-
A
16
G
A
G
-
C
T
C
C
G
C
G
T
C
C
T
C
A
T
T
C
A
C
7
A
A
T
T
A
T
T
G
2
G
G
A
T
T
G
A
C
C
A
T
C
C
T
T
T
A
-
T
A
T
G
C
A
T
A
T
A
T
A
C
C
C
C
G
T
T
A
G
C
C
A
T
-
A
T
A
A
C
C
G
G
G
G
G
G
G
T
-
G
-
C
T
A
C
G
3
A
T
G
C
C
C
A
T
A
A
C
T
T
A
G
G
  169,845,236
  169,845,983
  169,846,037
  169,846,449
  169,846,645
  169,847,044
  169,847,506
  169,848,208
  169,848,209
  169,848,683
  169,849,370
  169,849,572
  169,849,664
  169,849,720
  169,849,762
  169,850,015
  169,850,127
  169,851,543
  169,852,367
  169,853,550
  169,854,263
  169,854,939
  169,855,483
  169,855,991
  169,856,301
  169,856,518
  169,856,520
  169,856,693
  169,857,352
  169,857,553
  169,857,695
  169,858,083
  169,858,197
  169,858,810
  169,859,641
  169,859,782
  169,859,800
  169,860,309
  169,861,009
  169,861,376
  169,861,487
  169,861,490
  169,862,168
  169,862,207
  169,862,361
  169,862,490
  169,863,087
  169,863,889
  169,865,943
  169,866,621
  169,867,368
  169,867,406
  169,867,468
  169,867,927
  169,868,047
  169,868,392
  169,868,622
  169,869,361
  169,870,205
  169,870,431
  169,870,601
  169,870,676
  169,870,945
  169,871,520
  169,871,603
  169,871,607
  169,871,611
  169,871,615
  169,871,846
  169,872,805
  169,873,157
  169,873,325
  169,873,494
  169,874,160
  169,874,394
  169,874,662
  169,874,850
  169,875,414
  169,875,954
  169,876,762
  169,876,915
  169,878,066
  169,879,177
  169,880,203
  169,880,342
  169,880,392
  169,880,677
  169,881,038
  169,881,276
  169,881,388
  169,881,440
  169,882,108
  169,882,166
  169,882,215
  169,883,296
  169,883,379
  169,883,593
  169,883,863
  169,883,898
  169,883,956
  169,883,961
  169,884,814
  169,884,914
  169,885,010
  169,885,200
  169,885,689
  169,886,001
  169,886,003
  169,886,126
  169,886,255
  169,886,314
  169,886,716
  169,886,726
  169,887,282
  169,887,665
  169,887,871
  169,887,920
  169,887,973
  169,887,981
  169,888,328
  169,889,447
  169,890,025
  169,890,743
  169,890,802
  169,891,778
  169,892,209
  169,892,731
  169,893,262
  169,893,956
  169,894,022
  169,894,296
  169,895,892
  169,895,983
  169,896,583
  169,897,161
  169,897,770
  169,898,487
  169,898,808
  169,900,007
  169,900,172
  169,900,298
  169,900,304
  169,901,337
  169,901,391
  169,901,478
  169,901,740
  169,901,947
  169,902,288
  169,902,593
  169,902,887
  169,903,112
  169,903,286
  169,904,561
  169,904,563
  169,905,724
  169,906,062
  169,906,471
  169,906,711
  169,907,170
  169,907,448
  169,907,663
  169,907,991
  169,908,139
  169,909,103
  169,909,114
  169,909,358
  169,909,465
  169,909,970
  169,910,554
  169,910,565
  169,910,567
  169,910,569
  169,910,570
  169,910,572
  169,910,797
  169,910,995
  169,911,432
  169,911,686
  169,912,035
  169,912,268
  169,913,327
  169,913,596
  169,914,250
  169,914,341
  169,915,139
  169,915,932
  169,916,001
  169,917,276
  169,917,280
  169,917,282
  169,917,468
  169,917,991
  169,918,032
  169,918,149
  169,918,150
  169,918,600
  169,918,665
  169,918,774
  169,922,749
  169,922,766
G
T
T
T
A
A
-
G
A
A
T
8
-
A
A
C
C
C
T
C
A
C
C
G
C
9
T
G
T
G
G
C
C
A
A
T
C
C
C
T
C
A
-
G
T
A
A
C
C
A
A
T
A
T
A
C
G
-
T
T
A
T
G
G
C/-
C
C
C/-
7
T
G
C
G
C
C
T
A
C
G
T
C
G
7
G
-
-
G
A
4
T
C
T
T
A
T
C
C
T
T
C
A
C
C
C
T
G
T
-
G
G
C
C
G
A
A
A
-
C
C
G
C
C
A
G
A
-
G
G
T
-
C
A
C
T
4
G
G
C
A
T
T
C
G
C
G
C
-
T
T
T
T
C
-
-
G
-
T
T
G
C
A
T
-
T
G
T
T
T
G/A
-/A
-/A
-/A
A/-
-/A
C
T
T
-/9
G
A
-
T
A
-
G
G
C
T
T
T
T
C
-
T
A
C
C
G
T
A