Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 54,010 (bp)   Positions: 312
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
PVG/Seac (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
T
C
G
A
T
T
A
A
A
T
C
C
T
A
-
A
G
A
T
T
C
C
C
T
T
C
C
C
C
-
T
G
T
G
G
A
C
G
C
T
T
C
A
-
T
G
A
A
A
A
A
C
C
T
T
C
G
-
-
C
A
A
T
A
A
A
C
-
T
C
T
C
A
G
A
T
C
T
C
G
G
C
T
T
G
T
G
G
T
C
T
A
C
3
C
T
G
G
C
C
C
A
G
G
C
G
G
T
T
T
A
G
-
A
C
-
G
A
A
G
A
A
9
G
C
A
G
G
A
T
C
G
-
-
-
T
C
C
T
A
C
T
-
C
T
C
T
T
A
9
T
G
A
C
T
G
C
T
T
G
G
G
G
G
T
T
C
G
T
C
C
A
-
T
C
C
A
T
G
5
A
G
C
C
G
G
T
A
G
T
G
T
C
C
T
T
G
A
8
G
C
T
A
T
G
A
C
A
A
C
T
-
T
6
-
T
G
A
A
A
T
C
19
19
G
C
A
T
A
-
A
C
T
C
C
A
A
7
C
G
T
G
C
G
T
G
4
C
A
T
G
A
-
T
T
G
A
C
G
T
A
G
A
T
A
G
C
C
-
G
G
G
G
T
T
T
C
G
T
G
C
T
A
A
G
T
G
G
T
A
C
A
T
G
G
G
C
A
T
G
G
T
C
T
C
C
C
G
G
G
T
A
  12,729,004
  12,729,457
  12,730,406
  12,730,455
  12,730,739
  12,731,192
  12,731,383
  12,731,526
  12,731,708
  12,731,731
  12,732,332
  12,732,361
  12,733,998
  12,734,035
  12,734,143
  12,734,148
  12,734,561
  12,734,562
  12,734,707
  12,734,720
  12,734,728
  12,734,730
  12,734,763
  12,734,781
  12,734,795
  12,734,869
  12,735,002
  12,735,033
  12,735,113
  12,735,132
  12,735,148
  12,735,153
  12,735,154
  12,735,212
  12,735,397
  12,735,419
  12,735,420
  12,735,638
  12,735,654
  12,735,924
  12,735,998
  12,736,007
  12,736,066
  12,736,240
  12,736,317
  12,736,508
  12,736,698
  12,736,745
  12,736,802
  12,736,804
  12,736,904
  12,736,941
  12,736,991
  12,736,997
  12,737,150
  12,737,261
  12,737,275
  12,737,321
  12,737,345
  12,737,438
  12,737,529
  12,737,566
  12,737,567
  12,737,574
  12,737,762
  12,737,807
  12,737,834
  12,737,998
  12,738,027
  12,738,028
  12,738,055
  12,738,068
  12,738,101
  12,738,744
  12,738,784
  12,738,785
  12,738,795
  12,738,800
  12,738,825
  12,738,830
  12,738,831
  12,738,838
  12,738,874
  12,738,877
  12,738,923
  12,738,924
  12,738,943
  12,738,945
  12,738,976
  12,739,307
  12,739,366
  12,739,382
  12,739,387
  12,739,435
  12,739,479
  12,739,507
  12,739,593
  12,739,609
  12,739,621
  12,739,639
  12,739,640
  12,739,668
  12,739,757
  12,739,771
  12,739,930
  12,740,007
  12,740,030
  12,740,059
  12,740,077
  12,740,193
  12,740,205
  12,740,297
  12,740,462
  12,740,796
  12,740,809
  12,740,817
  12,740,832
  12,742,151
  12,746,292
  12,747,153
  12,747,195
  12,747,200
  12,747,689
  12,747,759
  12,747,864
  12,747,952
  12,748,302
  12,748,473
  12,748,608
  12,748,962
  12,749,245
  12,749,396
  12,749,413
  12,749,417
  12,749,419
  12,749,561
  12,749,572
  12,749,618
  12,749,625
  12,749,654
  12,749,777
  12,749,831
  12,750,294
  12,750,297
  12,750,298
  12,750,424
  12,750,698
  12,750,965
  12,751,333
  12,751,388
  12,751,588
  12,751,765
  12,752,353
  12,752,357
  12,752,365
  12,752,657
  12,753,067
  12,753,248
  12,753,303
  12,753,487
  12,753,489
  12,753,491
  12,753,493
  12,753,495
  12,756,744
  12,756,942
  12,758,162
  12,758,950
  12,759,400
  12,759,910
  12,760,210
  12,760,354
  12,760,501
  12,761,012
  12,761,050
  12,761,124
  12,761,188
  12,761,298
  12,761,311
  12,761,388
  12,761,392
  12,761,440
  12,761,571
  12,762,098
  12,762,114
  12,762,128
  12,762,234
  12,762,669
  12,763,095
  12,763,176
  12,763,212
  12,763,265
  12,763,554
  12,763,738
  12,764,088
  12,764,288
  12,766,582
  12,766,680
  12,766,798
  12,767,009
  12,767,059
  12,767,353
  12,767,440
  12,767,489
  12,767,953
  12,768,247
  12,768,788
  12,768,959
  12,769,855
  12,770,122
  12,770,627
  12,770,897
  12,771,136
  12,771,366
  12,771,401
  12,771,821
  12,772,103
  12,772,134
  12,772,216
  12,772,280
  12,772,646
  12,772,697
  12,773,465
  12,773,534
  12,773,937
  12,773,946
  12,774,118
  12,774,459
  12,774,538
  12,774,924
  12,774,957
  12,775,169
  12,775,600
  12,775,629
  12,775,916
  12,775,956
  12,775,965
  12,775,968
  12,776,140
  12,776,149
  12,776,193
  12,776,745
  12,776,791
  12,777,041
  12,777,056
  12,777,066
  12,777,224
  12,777,413
  12,777,601
  12,777,612
  12,777,618
  12,777,635
  12,777,662
  12,777,675
  12,777,698
  12,777,699
  12,777,714
  12,777,723
  12,777,773
  12,777,788
  12,777,802
  12,777,808
  12,777,810
  12,777,823
  12,777,865
  12,777,871
  12,777,898
  12,777,956
  12,778,048
  12,778,105
  12,778,201
  12,778,267
  12,778,642
  12,778,666
  12,778,698
  12,778,716
  12,778,739
  12,778,826
  12,778,895
  12,778,908
  12,779,323
  12,779,409
  12,779,412
  12,779,463
  12,779,560
  12,779,589
  12,779,629
  12,779,710
  12,779,712
  12,779,729
  12,779,967
  12,780,355
  12,780,484
  12,780,502
  12,780,547
  12,780,566
  12,780,652
  12,780,661
  12,780,663
  12,780,754
  12,780,786
  12,780,788
  12,780,821
  12,780,823
  12,780,881
  12,780,923
  12,781,142
  12,781,174
  12,781,488
  12,781,507
  12,781,551
  12,781,685
G
T
A
G
A
C
G
C
G
C
T
T
C
C
T
-
T
G
A
C
T
T
T
C
A
T
A
T
T
2
C
T
C
C
A
G
G
C
A
A
C
T
G
T
G
A
G
C
T
G
-
T
G
A
C
T
A
A
2
T
G
G
C
G
C
C
G
A
A
T
A
T
G
A
G
A
A
C
A
A
A
A
C
C
A
C
A
T
C
T
C
G
T
-
T
C
A
-
T
T
T
G
A
C
T
C
A
C
C
A
T
A
A
G
T
G
A
T
G
A
G
G
9/-
A
A
G
C
A
G
C
T
A
5
C
60
A
A
A
C
G
T
C
T
T
A
T
C
C
G
-
C
A
G
T
A
A
T
A
C
-/C
C/-
C/-
C/-
C/-
C
C
T
A
C
T
T
G
3
C
G
T
G
C
A
-
-/G
A
T
T
A
A
C
G
A
A
A
C
A
T
G
-
T
C
-
A
T
C
G
C
A
G
T
G
G
T
C
C
C
-
2
C
A
G
C
G
C
T
-
-
T
T
T/-
C
G
T
G
A
A
T
T
G
G
-
T
-
C
T
T
A
C
A
-
T
G
C
A
C
A
-
C
A
G
T
A
A
G
A
G
C
G
C
T
T
T
A
A
A
A
C
C
C
T
A
C
C
T
C
G
T
A
C
A
A
C
C
T
-
C
C
T
A
T
-
C
T
A
C
-
A
T
-
A
A
A
C
C
G