Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 54,010 (bp)   Positions: 259
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
F344/DuCrl (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
Anxa3
G
T
C
A
G
A
A
T
T
A
A
A
T
-
A
A
T
G
-
T
G
C
C
G
T
A
G
-
A
G
G
A
C
C
3
A
-
C
T
T
C
C
G
A
C
-
G
A
T
A
G
A
A
A
G
C
A
G
G
A
T
C
G
-
-
-
T
C
C
T
A
C
T
-
C
T
-
T
G
T
G
-
C
A
A
T
G
G
G
G
G
G
G
G
T
A
C
G
T
C
C
C
C
T
C
T
G
A
T
3
C
T
-
C
G
G
G
A
T
C
C
C
C
G
C
T
G
T
T
T
T
A
G
A
8
G
C
T
C
A
A
T
G
A
A
A
C
-
T
T
C
2
4
6
-
C
T
A
A
A
T
C
19
19
G
A
A
T
A
T
-
C
-
A
T
A
T
C
T
C
30
C
C
A
C
G
T
G
C
G
T
G
4
C
A
T
G
A
A
-
T
T
G
A
C
G
T
A
G
A
T
A
G
C
-
G
G
G
T
T
T
C
G
T
G
T
C
T
A
A
G
T
G
G
T
A
C
A
3
A
T
G
G
G
A
T
G
G
T
C
T
C
C
C
G
G
G
T
G
  12,728,112
  12,729,004
  12,729,359
  12,729,419
  12,729,876
  12,730,350
  12,730,455
  12,731,178
  12,731,192
  12,731,383
  12,731,526
  12,731,708
  12,731,731
  12,732,375
  12,732,426
  12,732,455
  12,732,469
  12,732,495
  12,732,615
  12,732,637
  12,732,799
  12,733,694
  12,733,885
  12,733,997
  12,733,998
  12,734,035
  12,734,061
  12,734,143
  12,734,148
  12,734,604
  12,734,940
  12,735,164
  12,735,420
  12,735,589
  12,735,616
  12,736,066
  12,736,243
  12,736,264
  12,736,317
  12,737,150
  12,739,646
  12,740,271
  12,740,340
  12,740,796
  12,740,809
  12,740,817
  12,740,832
  12,742,151
  12,746,195
  12,746,292
  12,747,153
  12,747,195
  12,747,200
  12,747,442
  12,747,759
  12,747,864
  12,747,952
  12,748,302
  12,748,473
  12,748,608
  12,748,962
  12,749,245
  12,749,396
  12,749,413
  12,749,417
  12,749,419
  12,749,561
  12,749,572
  12,749,618
  12,749,625
  12,749,654
  12,749,777
  12,749,831
  12,750,294
  12,750,297
  12,750,298
  12,750,440
  12,750,965
  12,751,300
  12,751,588
  12,751,589
  12,751,886
  12,751,942
  12,752,101
  12,752,353
  12,752,365
  12,753,487
  12,753,489
  12,753,491
  12,753,493
  12,753,495
  12,753,497
  12,753,499
  12,753,501
  12,753,542
  12,753,772
  12,754,043
  12,754,051
  12,754,104
  12,754,194
  12,754,196
  12,754,198
  12,754,276
  12,754,289
  12,754,325
  12,754,413
  12,754,709
  12,755,197
  12,756,744
  12,756,971
  12,757,292
  12,757,767
  12,758,028
  12,758,162
  12,758,741
  12,758,950
  12,759,224
  12,760,354
  12,760,482
  12,760,681
  12,760,793
  12,761,156
  12,762,098
  12,762,114
  12,762,190
  12,762,234
  12,763,095
  12,763,176
  12,763,265
  12,763,339
  12,764,648
  12,766,408
  12,766,582
  12,766,680
  12,766,798
  12,767,009
  12,767,059
  12,767,353
  12,767,372
  12,767,373
  12,767,440
  12,767,489
  12,767,953
  12,768,247
  12,768,959
  12,769,855
  12,770,122
  12,770,897
  12,771,136
  12,771,204
  12,771,214
  12,771,221
  12,771,224
  12,771,366
  12,771,401
  12,771,754
  12,771,821
  12,772,134
  12,772,216
  12,772,280
  12,772,646
  12,772,697
  12,773,465
  12,773,534
  12,773,937
  12,774,118
  12,774,120
  12,774,459
  12,774,538
  12,774,665
  12,774,706
  12,774,708
  12,774,924
  12,774,957
  12,775,600
  12,775,697
  12,775,723
  12,775,726
  12,775,799
  12,775,844
  12,775,850
  12,775,879
  12,775,916
  12,775,956
  12,776,140
  12,776,149
  12,776,193
  12,776,745
  12,776,791
  12,777,041
  12,777,056
  12,777,066
  12,777,224
  12,777,413
  12,777,601
  12,777,612
  12,777,618
  12,777,635
  12,777,637
  12,777,662
  12,777,675
  12,777,698
  12,777,699
  12,777,714
  12,777,723
  12,777,773
  12,777,788
  12,777,802
  12,777,808
  12,777,810
  12,777,823
  12,777,865
  12,777,871
  12,777,956
  12,778,048
  12,778,105
  12,778,267
  12,778,642
  12,778,666
  12,778,698
  12,778,716
  12,778,739
  12,778,826
  12,778,895
  12,778,908
  12,779,202
  12,779,323
  12,779,409
  12,779,412
  12,779,463
  12,779,560
  12,779,589
  12,779,629
  12,779,710
  12,779,712
  12,779,729
  12,779,967
  12,780,151
  12,780,260
  12,780,355
  12,780,484
  12,780,502
  12,780,547
  12,780,566
  12,780,661
  12,780,663
  12,780,754
  12,780,786
  12,780,788
  12,780,821
  12,780,823
  12,780,881
  12,780,923
  12,781,142
  12,781,174
  12,781,488
  12,781,507
  12,781,551
  12,781,559
A
G
T
G
A
-
G
C
C
G
C
G
C
T
G
G
G
A
C
G
C
T
T
A
C
C
A
T
-
T
A
G
G
T
-
G
A
T
G
C
T
T
T
G
T
G
A
T
-
G
A
G
G
-/G
A
A
G
C
A
G
C
T
A
5
C
60
A
A
A
C
G
T
C
T
T
A
2
C
T
C
A
A
T
G
G
A
C/-
C/-
-/C
-/C
-/C
-/C
C/-
?
A
T
T
A
C
G
T
T
A
-
T
C
A
C
C
-
T
-
2
T
A
A
A
G
C
T
T
T
T
A
T
C
A
A
C
C
C
T
T
C
-
A
T
C
T
G
G
C
A
G
G
G
T
C
C
C/-
T
-
-
-
2
G
C
G
C
G
C
T
-
-
T
-/T
A/T
C
G
C
-/2
-/A
T
G
A
-/C
A/-
T/-
-/C
?
-
T/-
T
G
T
-
C
T
T
A
C
A
-
T
G
C
A
C
C
A
-
C
A
G
T
A
A
G
A
G
C
G
C
T
T
A
A
A
C
C
C
T
A
C
C
G
T
C
G
T
A
C
A
A
C
C
T
-
-
-
C
C
T
A
-
C
T
A
C
-
A
T
-
A
A
A
C
C
A