Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 69,429 (bp)   Positions: 311
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
SR/JrHsd (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
A
T
C
T
A
A
C
C
G
G
G
A
T
T
T
G
C
C
C
A
G
T
C
4
C
A
-
A
G
C
A
T
T
T
C
A
T
G
T
C
T
G
T
G
A
G
C
G
T
G
A
T
C
C
T
-
T
G
G
A
A
A
A
C
A
-
A
C
A
C
G
T
C
T
T
A
-
C
T
C
G
G
-
C
C
C
A
A
T
C
G
T
G
T
T
G
T
28
A
G
-
G
A
C
-
T
-
T
T
G
G
T
G
G
G
C
C
A
T
T
T
T
A
G
A
A
G
3
C
A
G
T
T
C
-
4
A
C
G
A
A
T
4
15
A
7
A
A
T
A
C
C
G
-
G
A
-
G
C
A
T
G
A
-
A
A
C
A
T
C
C
C
G
G
A
C
T
G
C
C
A
C
G
G
A
A
A
A
T
C
G
G
A
C
G
C
T
C
T
G
C
A
A
G
C
G
T
T
C
C
-
T
C
A
A
A
A
G
-
A
-
A
A
C
T
C
A
C
G
A
C
A
G
3
C
T
C
G
T
-
G
A
A
-
T
G
T
A
G
C
G
-
C
G
A
C
A
C
C
C
T
C
A
113
C
G
C
C
A
A
8
5
7
C
T
C
A
G
A
T
A
T
C
G
T
G
T
C
T
G
G
A
A
G
A
G
A
T
C
C
A
T
C
G
-
A
G
-
A
A
T
  151,670,696
  151,671,064
  151,671,391
  151,671,393
  151,671,503
  151,671,805
  151,672,329
  151,672,466
  151,672,536
  151,672,596
  151,672,608
  151,672,715
  151,672,756
  151,672,788
  151,672,834
  151,672,835
  151,672,972
  151,672,973
  151,673,016
  151,673,637
  151,673,703
  151,673,928
  151,674,125
  151,674,360
  151,674,455
  151,674,456
  151,674,582
  151,674,622
  151,674,675
  151,675,061
  151,675,174
  151,675,175
  151,675,186
  151,675,285
  151,675,310
  151,675,311
  151,675,492
  151,675,608
  151,675,639
  151,675,647
  151,675,704
  151,675,763
  151,676,068
  151,676,493
  151,676,606
  151,676,621
  151,676,783
  151,677,027
  151,677,265
  151,677,302
  151,678,117
  151,678,529
  151,678,700
  151,679,172
  151,679,577
  151,680,181
  151,680,208
  151,688,534
  151,689,037
  151,692,575
  151,693,957
  151,695,189
  151,695,573
  151,695,638
  151,695,763
  151,695,776
  151,695,838
  151,695,898
  151,695,903
  151,695,912
  151,695,930
  151,695,932
  151,695,984
  151,696,006
  151,696,105
  151,696,111
  151,696,121
  151,696,128
  151,696,131
  151,696,150
  151,696,153
  151,696,164
  151,696,171
  151,696,199
  151,696,230
  151,696,342
  151,696,383
  151,696,393
  151,696,409
  151,696,468
  151,696,511
  151,696,520
  151,696,523
  151,696,557
  151,696,574
  151,696,578
  151,696,612
  151,696,624
  151,696,672
  151,696,687
  151,696,702
  151,696,710
  151,696,742
  151,696,767
  151,696,769
  151,696,793
  151,696,801
  151,696,809
  151,696,812
  151,696,813
  151,696,816
  151,696,827
  151,696,874
  151,696,942
  151,696,943
  151,696,994
  151,697,042
  151,697,043
  151,697,136
  151,697,146
  151,697,163
  151,697,164
  151,697,259
  151,697,315
  151,697,413
  151,697,415
  151,697,416
  151,697,427
  151,697,441
  151,697,442
  151,697,446
  151,697,451
  151,697,452
  151,697,473
  151,697,533
  151,697,669
  151,697,741
  151,697,765
  151,697,830
  151,697,873
  151,698,099
  151,698,112
  151,698,173
  151,698,178
  151,698,270
  151,698,286
  151,698,454
  151,698,521
  151,698,694
  151,698,859
  151,698,936
  151,698,944
  151,699,122
  151,699,517
  151,699,815
  151,700,294
  151,700,766
  151,700,777
  151,701,115
  151,701,254
  151,701,427
  151,701,476
  151,701,992
  151,703,240
  151,704,041
  151,704,078
  151,704,488
  151,704,684
  151,704,870
  151,705,099
  151,705,958
  151,706,142
  151,706,191
  151,706,455
  151,706,502
  151,706,726
  151,706,727
  151,706,759
  151,706,778
  151,706,993
  151,707,076
  151,707,226
  151,707,292
  151,707,301
  151,707,308
  151,707,310
  151,707,325
  151,707,336
  151,707,353
  151,707,363
  151,707,385
  151,707,399
  151,707,438
  151,707,475
  151,707,531
  151,707,621
  151,707,714
  151,707,788
  151,707,867
  151,708,353
  151,708,393
  151,708,396
  151,708,408
  151,708,438
  151,708,555
  151,708,613
  151,708,624
  151,708,802
  151,708,933
  151,709,125
  151,710,548
  151,710,561
  151,711,442
  151,711,443
  151,711,553
  151,711,578
  151,711,628
  151,711,654
  151,711,704
  151,712,062
  151,712,172
  151,712,394
  151,713,528
  151,713,888
  151,713,921
  151,714,042
  151,714,494
  151,715,290
  151,715,497
  151,715,889
  151,716,046
  151,720,248
  151,721,598
  151,721,627
  151,721,995
  151,722,188
  151,722,215
  151,722,317
  151,722,324
  151,722,356
  151,722,621
  151,723,524
  151,723,836
  151,723,845
  151,723,875
  151,724,503
  151,724,846
  151,724,886
  151,724,954
  151,725,278
  151,725,460
  151,725,488
  151,725,632
  151,725,806
  151,725,822
  151,725,928
  151,725,947
  151,726,186
  151,726,500
  151,726,631
  151,726,818
  151,727,055
  151,727,116
  151,727,322
  151,727,389
  151,727,566
  151,727,624
  151,727,650
  151,727,816
  151,727,885
  151,728,014
  151,728,056
  151,728,161
  151,728,191
  151,728,754
  151,728,755
  151,728,877
  151,729,604
  151,729,979
  151,730,372
  151,730,486
  151,730,776
  151,730,967
  151,731,083
  151,731,151
  151,731,277
  151,731,313
  151,731,431
  151,731,484
  151,731,500
  151,731,519
  151,731,580
  151,731,883
  151,732,080
  151,732,305
  151,733,324
  151,733,483
  151,733,728
  151,733,795
  151,733,986
  151,734,342
  151,734,466
  151,734,674
  151,735,071
  151,735,595
  151,736,163
  151,736,547
  151,738,254
  151,738,706
  151,738,707
  151,739,466
C
G
T
C
G
C
T
T
T
T
A
G
C
G
C
T
A
T
T
T
A
C
T
-
T
G
C
T
A
T
G
A
G
C
T
G
C
A
C
T
G
A
C
A
G
A
T
T
C
A
G
C
G
T
A
A
C
A
A
G
G
G
G
A
T
G
G
T
-
-
A
C
T
C
C
G
2
G
C
T
A
A
A
T
T
T
C
T
C
-
A
C
A
C
G
A
C
-
G
A
3
A
G
A
4
G
C
C
C
C
A
C
T
T
A
A
T
G
A
G
A
C
G
C
C
G
C
-
T
G
T
G
A
T
T
-
G
T
A
G
G
C
-
-
G
-
G
G
C/-
-/G
T/-
G/-
A
4
T
G
A
-
-
G
C
C
-
3
G
G
T
G
C
T
A
T
A
A
G
A
C
A
T
T
G
T
A
A
G
T
G
T
A
T
C
A
T
T
A
T
C
G
A
A
T
T
G
-
T
A
C
C
T
T
T
-
C/T
A/G
-/G
G/-
-/G
C/-
25
G
2
C
-
T
G
T
G
T
C
G
T
C
A
-
T
C
T
A
-
A
C
C
G
A
C
A
C
-
A
T
A
G
A
A
G
A
C
T
G
T
C/-
T
-/G
-
-/T
A
T
T
C
T
-
-
-
T
A
T
T
A/-
C
C
G
A
T
T
G
A
-
G
G
A
A
G
G
A
T
A
-/G
C
T
-
G
A
T
A
-/2
G
A
4
G/-
G/-
A