Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 69,429 (bp)   Positions: 216
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LE/Stm (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
A
A
T
C
A
T
G
C
A
A
T
T
G
G
4
T
A
A
C
A
G
A
C
A
G
A
A
-
C
A
C
G
T
C
T
T
-
C
T
C
G
G
-
C
C
A
A
T
C
G
T
T
G
T
28
A
G
-
G
A
C
-
T
-
T
T
G
G
T
G
C
G
G
C
C
A
T
T
T
T
A
G
A
T
A
3
C
A
G
T
T
4
A
C
G
A
A
T
4
15
G
T
A
7
A
C
C
G
-
A
G
C
C
A
A
C
C
C
A
G
T
A
G
C
T
C
A
G
C
C
T
C
-
T
C
C
G
C
A
G
T
C
T
A
A
C
G
A
T
C
C
C
C
T
C
A
A
A
T
-
T
T
-
C
T
C
3
A
A
A
T
C
A
G
G
T
-
T
C
C
C
A
A
T
T
T
23
T
T
T
C
A
C
T
C
-
C
G
C
T
A
G
A
A
T
C
C
C
A
T
C
G
A
G
A
T
  151,671,628
  151,672,715
  151,672,756
  151,674,455
  151,674,456
  151,674,582
  151,674,769
  151,675,061
  151,675,137
  151,675,174
  151,675,175
  151,675,186
  151,677,123
  151,677,697
  151,678,100
  151,680,208
  151,687,023
  151,688,714
  151,689,674
  151,692,575
  151,693,170
  151,693,957
  151,694,632
  151,695,189
  151,695,447
  151,695,573
  151,695,763
  151,695,776
  151,695,898
  151,695,903
  151,695,912
  151,695,930
  151,695,932
  151,695,984
  151,696,006
  151,696,105
  151,696,121
  151,696,128
  151,696,131
  151,696,150
  151,696,153
  151,696,164
  151,696,171
  151,696,199
  151,696,342
  151,696,383
  151,696,393
  151,696,409
  151,696,468
  151,696,511
  151,696,520
  151,696,557
  151,696,578
  151,696,612
  151,696,624
  151,696,672
  151,696,687
  151,696,702
  151,696,710
  151,696,742
  151,696,767
  151,696,769
  151,696,793
  151,696,801
  151,696,809
  151,696,812
  151,696,813
  151,696,816
  151,696,827
  151,696,874
  151,696,880
  151,696,942
  151,696,943
  151,696,994
  151,697,042
  151,697,043
  151,697,136
  151,697,146
  151,697,163
  151,697,164
  151,697,259
  151,697,315
  151,697,413
  151,697,414
  151,697,415
  151,697,427
  151,697,441
  151,697,442
  151,697,446
  151,697,451
  151,697,452
  151,697,669
  151,697,741
  151,697,765
  151,697,830
  151,697,873
  151,698,099
  151,698,112
  151,698,173
  151,698,178
  151,698,209
  151,698,261
  151,698,270
  151,698,286
  151,698,454
  151,698,936
  151,698,944
  151,699,122
  151,699,517
  151,699,770
  151,699,815
  151,699,900
  151,700,076
  151,700,077
  151,700,294
  151,700,378
  151,700,440
  151,700,978
  151,701,254
  151,701,334
  151,701,427
  151,701,686
  151,701,856
  151,702,313
  151,702,325
  151,702,395
  151,702,474
  151,702,505
  151,702,517
  151,702,753
  151,702,961
  151,703,049
  151,703,240
  151,703,355
  151,703,382
  151,703,643
  151,703,698
  151,703,835
  151,704,930
  151,707,413
  151,707,867
  151,708,258
  151,710,553
  151,713,528
  151,715,147
  151,715,290
  151,715,497
  151,715,889
  151,716,026
  151,716,046
  151,718,204
  151,718,959
  151,718,973
  151,719,065
  151,719,936
  151,720,192
  151,720,248
  151,720,314
  151,720,410
  151,720,575
  151,720,616
  151,720,642
  151,720,797
  151,720,893
  151,721,526
  151,721,555
  151,721,627
  151,721,814
  151,721,943
  151,722,030
  151,722,166
  151,722,215
  151,722,270
  151,722,273
  151,722,317
  151,722,325
  151,722,356
  151,722,554
  151,723,347
  151,724,534
  151,724,641
  151,725,687
  151,725,822
  151,726,770
  151,726,772
  151,726,794
  151,726,796
  151,726,816
  151,726,818
  151,726,820
  151,727,389
  151,727,556
  151,728,262
  151,730,372
  151,730,950
  151,731,221
  151,731,431
  151,731,573
  151,731,660
  151,731,751
  151,731,883
  151,733,324
  151,733,477
  151,733,483
  151,733,728
  151,733,795
  151,733,924
  151,733,986
  151,734,342
  151,734,466
  151,734,674
  151,735,071
  151,736,163
  151,736,547
  151,738,706
  151,739,466
G
G
C
T
G
C
A
T
C
G
A
G
A
A
-
C
G
G
T
G
C
G
T
G
A
G
T
G
T
-
-
A
C
T
C
C
2
G
C
T
A
A
A
T
T
C
T
C
-
A
C
C
A
C
-
G
A
3
A
G
A
4
G
C
C
C
C
A
C
T
T
T
A
A
T
G
A
G
A
C
G
C
C
A
G
-
T
G
T
G
A
-
G
T
A
G
G
C
-
-
A
A
G
-
G
T/-
-/G
A
4
G
T
T
A
C
G
T
T
T
G
A
C
G
A
T
C
T
G
A
T
T
C
T
3
C
A
T
A
T
T
A
A
T
G
-
-
T
C
G
C
T
T
T
T
C
T
-
C
G
C
C
C
C
A
T
A
T
-
G
C
G
C
T
G
T
A
C
A
G
T
T
T
G
G
A/-
A/-
-
-
-/C
-/C
T/C
-/T
-
T
C
T
A
G
A
T/-
-/C
G
A
G/-
-/G
C
T
T
-
G
A
T
A
G
A
-/G
A