Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 69,429 (bp)   Positions: 293
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
BXH3/CubMcwi (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
Ankrd26
3
C
A
T
A
G
G
A
A
C
C
G
G
T
A
T
A
G
C
G
C
C
T
T
C
G
G
C
-
A
T
-
C
C
A
G
C
T
G
C
C
C
T
-
A
C
-
T
T
G
-
C
T
C
T
A
C
T
T
T
64
-
A
A
T
C
G
C
C
T
T
A
A
T
G
T
T
C
C
C
G
C
A
T
T
C
T
A
G
G
A
T
A
C
T
C
A
C
C
A
T
T
G
C
A
T
C
A
G
G
A
T
-
C
A
-
A
G
T
-
G
A
T
C
A
A
C
A
T
C
C
C
G
A
C
T
C
C
A
C
G
G
A
A
A
A
T
C
G
G
A
C
G
C
T
C
T
C
A
A
G
C
T
T
C
C
A
C
-
T
G
A
-
G
C
A
G
C
T
A
A
C
T
A
C
G
A
A
C
C
A
T
C
C
G
T
G
G
A
C
C
G
G
G
C
-
G
C
G
-
-
2
T
T
G
C
A
-
C
G
113
C
G
C
C
A
A
C
C
G
G
C
G
A
-
G
G
G
A
T
A
T
G
T
-
C
T
G
T
A
3
C
T
C
C
T
C
T
T
A
G
G
A
A
T
C
G
T
A
T
C
T
C
T
C
A
C
A
G
C
G
C
C
A
C
A
G
A
G
A
2
C
T
  151,670,682
  151,672,443
  151,672,715
  151,672,756
  151,673,168
  151,674,485
  151,674,769
  151,674,781
  151,674,803
  151,675,061
  151,677,826
  151,677,939
  151,678,459
  151,680,208
  151,681,158
  151,681,208
  151,681,346
  151,681,470
  151,681,492
  151,681,556
  151,681,747
  151,681,804
  151,681,932
  151,682,023
  151,682,059
  151,682,069
  151,682,123
  151,682,326
  151,682,461
  151,682,507
  151,682,546
  151,682,562
  151,682,735
  151,682,752
  151,682,764
  151,682,767
  151,682,918
  151,682,928
  151,682,970
  151,683,029
  151,683,061
  151,683,077
  151,683,273
  151,683,523
  151,683,591
  151,683,621
  151,683,624
  151,683,649
  151,683,792
  151,683,798
  151,683,900
  151,683,947
  151,684,070
  151,684,073
  151,684,195
  151,684,288
  151,684,312
  151,684,440
  151,684,484
  151,684,491
  151,684,766
  151,684,920
  151,685,032
  151,685,210
  151,685,334
  151,685,335
  151,686,193
  151,686,575
  151,686,619
  151,686,737
  151,686,901
  151,687,012
  151,687,023
  151,687,297
  151,687,329
  151,687,456
  151,687,527
  151,687,589
  151,687,701
  151,687,805
  151,687,857
  151,687,886
  151,688,206
  151,688,559
  151,688,661
  151,688,939
  151,689,247
  151,689,658
  151,689,886
  151,690,254
  151,690,373
  151,690,536
  151,690,804
  151,691,260
  151,691,606
  151,692,085
  151,692,105
  151,692,250
  151,692,529
  151,692,575
  151,692,846
  151,693,065
  151,693,170
  151,693,253
  151,693,294
  151,693,657
  151,693,684
  151,693,779
  151,693,847
  151,693,927
  151,693,957
  151,694,094
  151,694,360
  151,694,384
  151,695,803
  151,698,332
  151,698,859
  151,698,860
  151,698,862
  151,699,517
  151,699,815
  151,700,294
  151,701,427
  151,702,335
  151,704,041
  151,704,078
  151,704,488
  151,704,684
  151,704,870
  151,705,099
  151,705,958
  151,706,142
  151,706,191
  151,706,502
  151,706,726
  151,706,727
  151,706,778
  151,706,993
  151,707,076
  151,707,226
  151,707,292
  151,707,301
  151,707,308
  151,707,310
  151,707,325
  151,707,336
  151,707,353
  151,707,363
  151,707,385
  151,707,399
  151,707,438
  151,707,475
  151,707,531
  151,707,621
  151,707,714
  151,707,788
  151,707,867
  151,708,393
  151,708,396
  151,708,408
  151,708,438
  151,708,555
  151,708,624
  151,708,802
  151,709,125
  151,709,899
  151,709,934
  151,710,458
  151,710,548
  151,710,561
  151,711,429
  151,711,434
  151,711,437
  151,711,477
  151,712,136
  151,712,394
  151,712,460
  151,712,578
  151,712,947
  151,712,957
  151,713,528
  151,713,888
  151,713,921
  151,713,981
  151,714,042
  151,714,253
  151,714,494
  151,714,842
  151,714,862
  151,715,093
  151,715,147
  151,716,082
  151,716,459
  151,716,500
  151,716,942
  151,718,386
  151,718,703
  151,719,751
  151,720,248
  151,721,823
  151,722,215
  151,722,273
  151,722,308
  151,722,317
  151,722,330
  151,722,356
  151,722,380
  151,722,541
  151,722,948
  151,722,950
  151,722,953
  151,722,967
  151,723,875
  151,724,846
  151,725,350
  151,725,632
  151,725,822
  151,726,570
  151,727,055
  151,727,158
  151,727,322
  151,727,389
  151,727,477
  151,727,571
  151,727,650
  151,727,816
  151,727,885
  151,728,041
  151,728,096
  151,728,115
  151,728,158
  151,728,191
  151,728,313
  151,728,877
  151,728,990
  151,729,094
  151,729,322
  151,729,604
  151,729,979
  151,730,372
  151,730,486
  151,730,779
  151,731,083
  151,731,151
  151,731,221
  151,731,431
  151,731,484
  151,731,500
  151,731,516
  151,731,580
  151,731,631
  151,731,639
  151,731,697
  151,731,702
  151,731,708
  151,731,731
  151,731,734
  151,731,751
  151,731,785
  151,731,883
  151,732,469
  151,733,324
  151,733,477
  151,733,483
  151,733,728
  151,733,795
  151,734,037
  151,734,266
  151,734,342
  151,734,696
  151,734,978
  151,734,996
  151,735,037
  151,735,121
  151,735,148
  151,735,542
  151,735,589
  151,735,653
  151,735,656
  151,735,723
  151,735,929
  151,735,985
  151,735,987
  151,736,163
  151,736,228
  151,736,286
  151,736,287
  151,736,513
  151,738,127
  151,738,244
  151,738,410
  151,739,013
  151,739,466
-
T
G
C
T
T
A
C
G
T
A
A
A
C
G
C
G
A
T
A
T
T
C
A
G
A
A
G
A
C
C
2
T
T
T
A
T
C
T
T
A
T
C
G
G
T
G
C
C
A
T
T
C
G
C
G
T
C
C
A
-
3
G
T
A
T
A
T
T
-/C
C
G
G
C
A
C
C
T
T
T
A
G
G
C
C
T
C
-
A
A
G
C
C
T
C
T
G
T
A
G
C
A
C
T
-
C
A
G
T
A
G
C
2
T
G
T
-/G
C/-
C/-
4
T
G
C
T
G
G
T
G
C
T
A
T
A
G
A
C
T
T
G
T
A
A
G
T
G
T
A
T
C
A
T
T
A
T
C
G
A
T
T
G
-
T
C
C
T
T
G
A
T
-
C
-
A
T
T
C
A
G
C
G
-
T
G
G
T
A
G
C
G
T
-
-
T
T
A
C
A
A
C
T
T
T
A
A
T
A
A
G
A
C
A
-
C
C
A
A
G
A
T
T
-
-/T
C
T/-
T
C
T
T
T
A
C
T
C
T
A
A
A
-/A
C
C
G
C
T
G
A
G
G
A
A
G
-
T/-
C/-
-/T
T/-
-/C
T/-
C/-
-/C
G
-
A
G/-
-/G
C
T
A
A
G
C
T
C
A
G
T
G
-
G
A
G
A
G
G
G
G
C
A
G
A
G
-
T
A