Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 25,490 (bp)   Positions: 173
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LE/Stm (2019) 
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
Aldh4a1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
-
C
A
T
C
G
2
-
T
C
C
C
C
C
A
A
-
T
G
A
T
C
T
T
A
A
C
T
C
C
A
-
T
-
C
G
-
T
-
A
-
A
C
C
G
A
C
G
T
C
A
A
A
T
A
9
A
T
A
C
A
15
T
C
G
T
T
C
G
G
G
G
G
T
A
G
G
T
-
T
G
G
A
A
G
C
G
T
G
A
T
T
T
G
T
A
G
G
C
C
C
C
G
A
C
C
A
G
G
T
G
A
C
T
G
C
A
G
-
C
G
G
T
T
A
G
T
T
C
C
G
2
C
T
-
-
T
G
G
A
T
A
T
G
T
T
A
C
G
C
T
G
G
C
T
C
C
G
C
G
T
T
-
C
C
A
T
T
T
C
C
A
  151,880,194
  151,880,324
  151,880,370
  151,880,495
  151,881,306
  151,881,612
  151,881,689
  151,881,734
  151,881,841
  151,881,857
  151,881,953
  151,881,986
  151,881,987
  151,882,246
  151,883,133
  151,883,178
  151,883,188
  151,883,269
  151,883,449
  151,883,967
  151,884,119
  151,884,262
  151,884,307
  151,884,344
  151,884,502
  151,884,917
  151,885,063
  151,885,115
  151,885,177
  151,885,326
  151,885,377
  151,885,448
  151,885,562
  151,885,655
  151,885,940
  151,886,036
  151,886,197
  151,886,199
  151,886,685
  151,886,694
  151,886,916
  151,887,058
  151,887,139
  151,887,247
  151,887,359
  151,887,923
  151,887,954
  151,888,041
  151,888,177
  151,888,191
  151,888,658
  151,888,812
  151,889,395
  151,889,397
  151,889,625
  151,890,313
  151,890,651
  151,890,761
  151,890,942
  151,891,370
  151,892,586
  151,892,907
  151,893,016
  151,893,041
  151,893,101
  151,893,123
  151,893,158
  151,893,165
  151,893,248
  151,893,310
  151,893,311
  151,893,721
  151,893,739
  151,893,747
  151,893,750
  151,893,753
  151,893,787
  151,893,873
  151,894,097
  151,894,103
  151,894,150
  151,894,191
  151,894,202
  151,894,412
  151,894,413
  151,894,444
  151,894,457
  151,894,465
  151,894,491
  151,894,531
  151,894,533
  151,894,637
  151,894,700
  151,894,801
  151,894,809
  151,894,823
  151,894,826
  151,894,835
  151,895,066
  151,895,081
  151,895,164
  151,895,198
  151,895,208
  151,895,306
  151,895,388
  151,895,446
  151,895,463
  151,895,487
  151,895,501
  151,895,504
  151,895,519
  151,895,521
  151,895,535
  151,895,640
  151,895,658
  151,895,667
  151,895,683
  151,895,684
  151,895,767
  151,895,834
  151,895,838
  151,895,935
  151,895,955
  151,895,957
  151,896,008
  151,896,253
  151,896,298
  151,896,316
  151,896,332
  151,896,355
  151,896,418
  151,896,505
  151,896,638
  151,896,650
  151,896,676
  151,896,689
  151,896,887
  151,897,005
  151,897,014
  151,897,020
  151,897,026
  151,897,028
  151,897,030
  151,897,071
  151,897,072
  151,897,080
  151,897,095
  151,897,203
  151,897,249
  151,897,373
  151,897,416
  151,897,523
  151,897,565
  151,897,604
  151,897,800
  151,897,870
  151,897,999
  151,899,390
  151,899,756
  151,900,064
  151,900,844
  151,901,925
  151,901,958
  151,902,248
  151,902,271
  151,902,273
  151,902,763
  151,902,949
  151,903,243
  151,903,304
  151,903,880
  151,903,890
  151,904,399
G
C
T
T
C
T
-
-
A
C
-
T
T
G
-
-/G
G/-
-/2
C
A
G
C
-
C
C
G
G
A
C
T
A
T
3
C
2
-
T
G
C
10
G
23
G
A
T
A
G
T
A
C
T
G
C/-
C
C
G
-
G
C
G
T
G
-
C
T
A
C
C
T
A
A
T
-
T
A
G
A
A
C
9
G
A
A
G
G
A
A
A
C
A
G
C
C
C
A
A
G
A
C
T
T
-
T
A
G
T
T/-
G
A
A
C
A
G
T
C
T
T
G
A
14
T
C
A
C
C
G
A
G
C
T
G
C
-
T
C
C
C
C
?
C/A
C/-
C/-
-/C
C
T
C
C
T
T
A
T
C
A
-
T
C
T
-/T
A
T
A
C
G
2
T
T
T
T/-
C
C
-/T
T
G