Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 128,286 (bp)   Positions: 441
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
FHH/EurMcwi (2019) 
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
Adarb1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
-
T
-
G
-
2
T
A
T
G
C
G
A
-
G
3
-
A
C
A
C
T
G
C
A
C
A
A
C
T
A
A
T
T
-
G
A
T
-
T
C
A
C
G
C
A
4
C
-
T
T
A
A
A
C
T
12
-
A
G
T
G
-
G
G
T
A
T
C
C
G
T
A
5
A
G
T
-
T
C
C
A
C
T
A
G
A
C
G
T
A
T
G
A
C
T
G
T
T
G
G
C
-
8
2
C
A
T
A
T
T
G
T
G
T
G
T
A
C
G
C
G
3
G
G
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
A
C
A
A
G
A
T
T
A
A
C
G
A
C
C
C
A
56
G
G
-
G
A
C
G
G
T
A
G
C
G
C
T
A
G
A
C
A
C
C
G
T
G
C
G
-
C
A
G
G
C
G
C
T
5
T
C
C
C
T
G
G
A
T
T
T
A
A
C
G
G
G
G
T
T
T
T
-
G
C
G
C
T
A
T
T
G
C
A
C
G
A
C
T
A
G
G
A
G
G
C
A
A
-
G
A
A
T
A
G
C
G
T
A
T
G
G
C
C
C
A
-
C
T
A
T
T
A
T
A
C
C
G
G
T
T
A
G
T
A
A
C
-
A
A
C
C
G
G
A
C
C
A
T
A
G
G
G
A
-
T
C
C
A
T
G
C
G
G
T
G
A
T
G
G
-
A
C
3
C
C
C
C
C
A
A
T
G
-
C
C
G
G
-
-
-
C
A
A
C
T
A
T
G
T
C
A
A
A
T
A
A
T
-
G
A
C
C
C
G
G
C
C
G
A
G
G
C
G
A
G
A
T
G
C
-
T
G
A
A
18
A
-
-
T
C
A
T
G
T
C
3
A
A
T
G
T
G
G
G
G
A
G
T
A
T
T
G
G
T
A
G
T
A
-
G
G
A
A
C
-
-
2
T
5
A
A
G
T
C
A
C
T
C
T
G
A
T
G
T
A
A
  11,223,066
  11,223,742
  11,223,794
  11,224,283
  11,224,442
  11,224,446
  11,224,619
  11,224,801
  11,224,806
  11,224,946
  11,225,319
  11,225,523
  11,225,649
  11,225,908
  11,226,051
  11,226,311
  11,226,440
  11,226,661
  11,226,756
  11,226,989
  11,227,584
  11,228,586
  11,228,672
  11,229,674
  11,229,796
  11,229,839
  11,230,319
  11,230,371
  11,231,037
  11,231,189
  11,231,392
  11,231,597
  11,231,700
  11,231,743
  11,231,801
  11,232,955
  11,233,219
  11,233,318
  11,234,380
  11,234,418
  11,234,592
  11,234,835
  11,235,031
  11,235,317
  11,235,329
  11,235,581
  11,236,507
  11,237,837
  11,238,032
  11,238,048
  11,239,010
  11,239,233
  11,239,391
  11,239,745
  11,239,990
  11,240,302
  11,240,698
  11,240,949
  11,242,216
  11,243,137
  11,244,237
  11,244,274
  11,246,719
  11,246,975
  11,248,150
  11,248,344
  11,248,443
  11,248,785
  11,250,479
  11,251,235
  11,251,644
  11,251,778
  11,252,277
  11,252,410
  11,252,765
  11,252,783
  11,254,435
  11,255,803
  11,256,398
  11,256,454
  11,256,742
  11,256,893
  11,256,917
  11,257,250
  11,257,338
  11,257,340
  11,257,518
  11,257,795
  11,257,837
  11,257,999
  11,258,044
  11,258,104
  11,258,115
  11,258,164
  11,258,508
  11,258,554
  11,258,584
  11,258,736
  11,258,757
  11,258,772
  11,258,918
  11,258,928
  11,258,983
  11,258,993
  11,259,326
  11,259,603
  11,259,959
  11,259,998
  11,259,999
  11,260,227
  11,260,608
  11,260,662
  11,260,695
  11,260,835
  11,260,883
  11,261,231
  11,261,606
  11,261,660
  11,261,762
  11,262,330
  11,262,598
  11,262,654
  11,262,990
  11,263,367
  11,263,564
  11,263,633
  11,263,639
  11,263,986
  11,264,008
  11,264,010
  11,264,012
  11,264,014
  11,264,016
  11,264,018
  11,264,020
  11,264,022
  11,264,024
  11,264,026
  11,264,135
  11,264,323
  11,264,355
  11,264,737
  11,264,738
  11,264,822
  11,265,080
  11,265,354
  11,265,484
  11,266,174
  11,268,282
  11,268,653
  11,269,467
  11,269,657
  11,270,609
  11,271,922
  11,274,214
  11,276,479
  11,276,543
  11,276,618
  11,276,717
  11,276,796
  11,276,924
  11,276,972
  11,277,439
  11,277,630
  11,277,632
  11,277,761
  11,277,795
  11,278,138
  11,278,168
  11,278,190
  11,278,199
  11,278,348
  11,279,153
  11,279,272
  11,279,288
  11,279,655
  11,280,214
  11,280,937
  11,281,033
  11,281,190
  11,281,969
  11,283,824
  11,285,403
  11,285,405
  11,285,407
  11,285,408
  11,286,536
  11,286,818
  11,287,102
  11,287,847
  11,288,519
  11,288,884
  11,289,175
  11,289,333
  11,289,788
  11,289,803
  11,289,810
  11,289,817
  11,289,840
  11,289,977
  11,289,978
  11,290,383
  11,290,385
  11,290,387
  11,290,548
  11,290,630
  11,290,842
  11,290,916
  11,291,014
  11,291,056
  11,291,128
  11,291,223
  11,291,224
  11,291,237
  11,291,246
  11,291,371
  11,291,410
  11,291,447
  11,292,094
  11,292,951
  11,293,369
  11,293,430
  11,293,460
  11,293,480
  11,293,527
  11,294,292
  11,294,522
  11,294,570
  11,294,700
  11,294,710
  11,295,465
  11,295,489
  11,296,042
  11,296,461
  11,296,584
  11,296,722
  11,296,759
  11,297,003
  11,297,021
  11,297,062
  11,297,646
  11,297,670
  11,297,677
  11,297,896
  11,297,969
  11,298,051
  11,298,349
  11,298,377
  11,298,421
  11,298,910
  11,298,938
  11,299,242
  11,299,273
  11,299,390
  11,299,433
  11,299,678
  11,299,757
  11,299,785
  11,299,791
  11,299,853
  11,300,043
  11,300,875
  11,300,876
  11,300,911
  11,301,204
  11,301,479
  11,301,691
  11,301,768
  11,301,851
  11,301,887
  11,301,969
  11,301,989
  11,302,128
  11,302,185
  11,302,186
  11,302,435
  11,302,441
  11,302,802
  11,302,844
  11,302,906
  11,302,934
  11,303,321
  11,303,485
  11,303,564
  11,303,748
  11,303,800
  11,304,011
  11,304,015
  11,304,031
  11,304,035
  11,304,159
  11,304,221
  11,304,303
  11,304,306
  11,304,503
  11,304,573
  11,304,630
  11,304,631
  11,304,706
  11,304,899
  11,304,905
  11,305,115
  11,305,140
  11,305,180
  11,305,185
  11,305,190
  11,305,226
  11,305,352
  11,305,376
  11,305,600
  11,305,607
  11,305,612
  11,305,629
  11,305,872
  11,306,061
  11,306,093
  11,306,389
  11,306,688
  11,306,700
  11,306,706
  11,306,708
  11,306,710
  11,306,712
  11,307,323
  11,307,468
  11,308,132
  11,308,368
  11,308,589
  11,308,722
  11,308,747
  11,308,792
  11,308,849
  11,308,878
  11,308,992
  11,309,143
  11,309,464
  11,309,841
  11,309,907
  11,310,035
  11,310,195
  11,310,967
  11,311,015
  11,311,508
  11,311,780
  11,312,466
  11,312,649
  11,312,846
  11,313,381
  11,314,036
  11,314,050
  11,314,279
  11,314,464
  11,314,501
  11,314,507
  11,314,601
  11,314,929
  11,315,290
  11,315,305
  11,315,320
  11,315,470
  11,315,542
  11,315,563
  11,315,974
  11,316,033
  11,316,708
  11,316,850
  11,316,929
  11,317,063
  11,317,879
  11,318,048
  11,318,573
  11,319,123
  11,319,231
  11,319,541
  11,319,622
  11,319,667
  11,319,774
  11,319,910
  11,320,079
  11,320,086
  11,320,089
  11,320,109
  11,320,616
  11,320,800
  11,321,633
  11,322,509
  11,322,806
  11,322,909
  11,322,958
  11,322,979
  11,323,106
  11,323,268
  11,324,397
  11,325,397
  11,325,647
  11,327,074
  11,327,220
  11,327,869
  11,328,032
  11,328,428
  11,329,346
  11,329,717
  11,330,202
  11,330,840
  11,331,217
  11,331,468
  11,331,592
  11,331,710
  11,332,181
  11,332,963
  11,333,394
  11,333,728
  11,334,987
  11,335,822
  11,337,842
  11,338,113
  11,338,153
  11,338,252
  11,338,418
  11,338,672
  11,339,113
  11,339,139
  11,341,729
  11,342,681
  11,343,274
  11,343,895
  11,344,048
  11,345,052
  11,345,637
  11,345,694
  11,345,905
  11,347,536
  11,347,838
  11,347,941
  11,347,960
  11,348,158
  11,349,273
  11,349,870
  11,350,070
  11,350,403
  11,350,763
C
G
5
G
T
T/-
7
-
C
C
C
A
T
A
-
G
A
-
23
G
T
T
T
C
A
T
G
T
G
G
T
C
G
C
C
C
7
A
G
C
C
C
T
G
T
T
G
T
-
T
8
C
C
G
G
G
T
C
-
2
G
A
G
A
A
A
A
A
G
C
T
-/T
A
C
G
-
G
A
C
T
C
T
A
G
T
G
G
C
C
G
A
C
-
G
T
C
A
-
-
G
C
A
A/-
-/A
4
-
2/-
C/G
A/C
G
G
C
C
T
C
T
C
A
C
G
T
A
T
A
-
A
A
G/-
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
T
G
T
G
G
A
G
A
C
G/T
G
T
A
G
A
T
T
G
-
A
A
10
A
G
T
C
T
C
G
C
A
A
T
C
G
-
G
T
T
T
T
C
C
A
T
A
A
A/AA
G
T
C
T
A
A
G
-
C
T
T
T
C
C
C
-
G
G
A
G
G
T
A
A
A
A
C
-
C
C
2
A
T
A
G/T
C
G
C
G
A
T
G
T
A
G
T
C
G
A/-
A
G
A
A
T
G
G
3
A
G
G
-
G
A
T
A
G
G
C
T
A
T
T
T
T
3
T
A
G
C
C
G
C
G
T
T
A
A
C
G
G
T
C
G
G
A
8
C
G
T
T
A
A
G
T
A
G
G
G
A
A
A
C
2
C
G
T
T
C
A
T
A
-
C
A
G
C
A
A
T
G
T
-
G/-
-/G
G/-
-/G
-/G
G
G
C
T
4
G
T
T
C
T
2
2
T
G
T
T
C
G
C
A
C
A
G
G
G
C
G
G
C
T
A
G
T
T
T
C
A
T
T
A
G
A
T
T
A
G
A
G
C
A
A
A
C
A
G
G
-
G/-
2
19
-
T
C
C
A
C
T
-
G
-/T
-
A
C
C
C
A
T
G
T/-
C
G
C
C
A
T
C
G
A
T/G
-
4
A
A
G
T
T
2
4
-
C
-
C
G
A
A
G
G
A
C
T
A
A
G
G
A
C
G
T