Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 132,046 (bp)   Positions: 424
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LH/MavRrrcAek (2020) 
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
Adamts16
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
T
T
A
A
G
T
C
A
T
A
-
-
C
A
128
G
G
C
C
G
G
T
T
G
C
T
6
C
T
C
G
A
A
T
A
G
C
A
A
G
A
G
T
T
G
A
G
A
A
T
T
A
A
T
C
A
C
T
A
T
G
T
-
C
A
T
C
G
C
C
A
T
C
C
C
G
-
T
T
C
T
A
A
G
A
T
T
T
T
T
T
51
T
A
G
G
C
C
G
G
G
T
G
T
T
A
A
G
T
G
G
A
A
T
A
C
T
G
T
T
T
G
G
A
T
C
G
A
A
A
-
A
T
T
G
G
T
G
C
T
G
C
A
T
3
60
T
C
C
4
A
T
A
-
-
A
G
T
-
G
A
C
4
T
-
T
C
A
T
G
A
-
A
T
G
A
G
-
4
A
G
C
G
T
T
T
A
T
C
G
T
T
G
A
G
T
C
C
C
C
C
C
T
2
2
C
C
-
A
T
T
A
A
A
G
C
C
A
11
A
T
A
C
C
T
G
-
C
C
C
C
T
G
T
G
G
G
T
G
C
G
A
-
-
C
T
G
A
G
G
C
G
G
G
T
C
2
C
G
C
C
T
G
T
T
C
A
A
G
T
-
T
8
A
T
G
G
T
C
A
T
C
A
G
T
G
A
-
T
A
T
A
G
C
T
C
A
C
4
10
A
A
G
A
A
T
A
T
A
G
T
C
T
G
C
4
-
C
T
G
G
4
G
T
A
T
4
G
C
T
A
G
-
T
A
A
T
-
C
T
18
A
G
C
G
T
G
A
C
C
T
A
G
T
T
C
-
G
T
G
A
A
C
-
A
C
A
G
T
C
G
-
T
T
-
T
A
T
-
G
A
A
T
T
G
C
A
G
-
G
-
T
G
G
G
G
T
C
T
A
A
G
9
C
G
T
A
T
C
A
T
C
C
C
G
T
C
T
A
A
A
T
  32,430,978
  32,431,630
  32,432,261
  32,432,877
  32,433,387
  32,433,872
  32,434,146
  32,434,330
  32,434,494
  32,434,717
  32,435,606
  32,435,918
  32,436,199
  32,436,291
  32,437,864
  32,438,302
  32,438,731
  32,439,860
  32,440,236
  32,440,432
  32,442,293
  32,442,739
  32,444,158
  32,444,221
  32,444,402
  32,444,490
  32,444,605
  32,444,767
  32,444,771
  32,444,803
  32,444,812
  32,445,268
  32,445,622
  32,445,643
  32,445,645
  32,445,650
  32,445,840
  32,445,898
  32,446,175
  32,446,366
  32,446,382
  32,446,544
  32,446,889
  32,447,285
  32,447,382
  32,447,945
  32,449,065
  32,449,285
  32,449,525
  32,449,954
  32,450,453
  32,450,961
  32,452,327
  32,454,574
  32,455,005
  32,455,037
  32,455,574
  32,457,384
  32,458,995
  32,460,824
  32,460,943
  32,460,947
  32,460,961
  32,461,388
  32,461,595
  32,461,766
  32,462,112
  32,463,236
  32,463,377
  32,463,433
  32,463,991
  32,464,580
  32,465,166
  32,465,205
  32,465,541
  32,465,805
  32,465,830
  32,465,866
  32,465,950
  32,465,960
  32,465,995
  32,466,086
  32,466,106
  32,466,234
  32,466,242
  32,466,273
  32,466,356
  32,466,951
  32,466,952
  32,466,990
  32,467,106
  32,467,367
  32,467,368
  32,467,438
  32,467,562
  32,467,698
  32,467,974
  32,468,663
  32,468,842
  32,469,301
  32,469,318
  32,469,652
  32,470,446
  32,470,503
  32,470,714
  32,470,736
  32,470,894
  32,471,242
  32,471,647
  32,471,678
  32,472,154
  32,472,216
  32,472,219
  32,472,366
  32,472,448
  32,473,007
  32,473,334
  32,473,338
  32,473,349
  32,473,399
  32,473,411
  32,473,416
  32,473,606
  32,473,878
  32,473,976
  32,474,124
  32,474,225
  32,474,397
  32,474,611
  32,474,704
  32,475,240
  32,475,284
  32,475,311
  32,475,318
  32,475,661
  32,475,697
  32,476,073
  32,476,140
  32,476,199
  32,476,416
  32,476,616
  32,476,684
  32,477,051
  32,477,732
  32,478,038
  32,478,156
  32,478,732
  32,478,736
  32,478,891
  32,478,986
  32,479,232
  32,479,702
  32,479,957
  32,480,365
  32,480,406
  32,480,945
  32,481,245
  32,481,276
  32,481,286
  32,481,558
  32,482,046
  32,482,803
  32,483,026
  32,483,508
  32,483,573
  32,484,098
  32,485,021
  32,485,108
  32,485,507
  32,485,508
  32,485,636
  32,485,882
  32,486,161
  32,486,588
  32,486,782
  32,486,805
  32,486,913
  32,487,001
  32,487,648
  32,488,358
  32,488,512
  32,489,038
  32,489,777
  32,490,326
  32,490,396
  32,490,577
  32,490,602
  32,490,832
  32,491,194
  32,491,248
  32,491,256
  32,491,596
  32,491,672
  32,492,749
  32,492,930
  32,493,059
  32,493,115
  32,493,143
  32,493,308
  32,494,685
  32,494,720
  32,494,794
  32,494,876
  32,494,899
  32,494,953
  32,495,209
  32,495,212
  32,495,218
  32,495,245
  32,495,256
  32,495,703
  32,495,770
  32,495,978
  32,496,428
  32,496,578
  32,496,826
  32,496,862
  32,496,928
  32,497,019
  32,497,418
  32,497,902
  32,497,950
  32,498,091
  32,498,117
  32,498,189
  32,498,198
  32,498,240
  32,498,332
  32,498,413
  32,498,551
  32,498,659
  32,498,681
  32,498,721
  32,498,857
  32,499,013
  32,499,087
  32,499,255
  32,499,261
  32,499,439
  32,499,583
  32,500,445
  32,500,462
  32,500,553
  32,500,898
  32,500,946
  32,501,553
  32,502,047
  32,502,177
  32,502,258
  32,502,359
  32,502,517
  32,502,518
  32,502,552
  32,502,557
  32,502,656
  32,503,123
  32,503,223
  32,503,325
  32,503,346
  32,503,373
  32,503,420
  32,503,445
  32,503,577
  32,503,702
  32,503,809
  32,503,822
  32,504,004
  32,504,005
  32,504,034
  32,504,158
  32,504,286
  32,504,378
  32,504,517
  32,504,776
  32,504,790
  32,504,869
  32,505,019
  32,505,063
  32,505,088
  32,505,240
  32,505,469
  32,505,483
  32,505,652
  32,505,912
  32,506,018
  32,506,209
  32,506,313
  32,506,779
  32,506,906
  32,507,101
  32,507,183
  32,507,405
  32,507,533
  32,507,599
  32,507,682
  32,507,752
  32,507,893
  32,507,924
  32,508,053
  32,508,095
  32,508,249
  32,508,291
  32,508,341
  32,508,507
  32,508,960
  32,509,117
  32,509,288
  32,509,322
  32,509,436
  32,509,633
  32,509,734
  32,509,919
  32,510,138
  32,510,289
  32,510,526
  32,510,575
  32,511,523
  32,511,642
  32,511,708
  32,511,819
  32,511,835
  32,511,881
  32,513,101
  32,513,139
  32,513,252
  32,513,415
  32,513,626
  32,513,628
  32,513,630
  32,520,620
  32,520,642
  32,520,789
  32,520,970
  32,521,124
  32,521,128
  32,521,379
  32,521,528
  32,522,590
  32,522,609
  32,522,886
  32,522,980
  32,523,161
  32,523,593
  32,523,956
  32,524,056
  32,524,136
  32,524,317
  32,524,594
  32,524,826
  32,524,941
  32,525,031
  32,525,204
  32,525,517
  32,526,098
  32,526,118
  32,526,341
  32,526,367
  32,527,059
  32,527,152
  32,527,154
  32,527,159
  32,527,259
  32,527,555
  32,528,797
  32,530,075
  32,530,557
  32,531,504
  32,532,204
  32,533,013
  32,533,376
  32,534,467
  32,536,306
  32,536,633
  32,536,855
  32,537,626
  32,537,890
  32,538,643
  32,539,265
  32,540,691
  32,542,077
  32,542,251
  32,542,653
  32,543,153
  32,543,536
  32,544,110
  32,546,052
  32,546,546
  32,546,975
  32,547,016
  32,547,490
  32,547,914
  32,548,407
  32,549,082
  32,549,349
  32,550,762
  32,550,764
  32,550,768
  32,550,778
  32,551,455
  32,551,745
  32,552,034
  32,552,080
  32,552,344
  32,553,159
  32,553,369
  32,553,601
  32,554,631
  32,554,950
  32,555,742
  32,556,507
  32,556,694
  32,558,144
  32,559,247
  32,559,250
  32,559,695
  32,559,926
  32,560,045
  32,560,565
  32,560,606
  32,561,341
  32,561,365
  32,561,646
  32,561,698
  32,561,987
G
T
A
C
G
G
A
C
T
-
C
G
T
3
T
G
-
T
T
T
T
-
A
C
G
A
T
C
-
T
C
-/T
A
G
T
C
G
A
G
G
C
A
G
A
C
C
A
G
C
C
G
G
C
C
G
C
A
G
T
C
G
C
A
C
T
T
G
C
A
T
T
T
G
C
G
T
A
C
C
C
C
T
A
-
G
T
G
-
A
C
G
C
A
-
C
T
A
A
T
T
T
T
A
A
A
G
C
G
C
A
G
T
A
G
G
C
C
T
-
-
-
-
C
A
A
G
C
T
T
G
G
G
T
T
C
C
A
A
-
C
T
A
A
T
G
G
3/-
60/-
C
T
T
-
C
C
G
130
2
G
A/-
C
T
A
G
T
-
C
6
G/-
A
T
G
A
G
3
G
C
T
G
A
4
-
G
A
T
A
C
C
C
G
C
T
A
C
A
T
G
A
C
T
T
T
T
T
A
G
-
-
T
T
8
G
G
C
G
G
G
T
A
T
C
-
G
C
-
T
T
C
T
A
T
A
T
T
C
C
G
A
A
A
C
A
T
T
G
2
6
A
C
A
G
A
A
T
A
A
A
C
T
-
T
A
A
T
C
A
C
A
A
C
G
A
C
4
C
-
C
C
T
A
C
A
G
C
T
-
A
C
A
T
A
A
G
G
C
A
G
C
T
G
-
-
-
T
G
A
G
C
A
G
G
G
C
C
T
C
A
T
-
4
T/-
C/-
T
A
-
A
G
T
C
-
A
A
C
C
A
4
C
G
G
C
T
-
C
-
C
A
G
C
C
A
G
T
T
G
T
A
G
C
T
A
A
G
C
G
G
T
5
G
A
C
A
C
T
A
C
C
C
T
G
G
G
A
A
G
G
C
G
A
G
G
C
3
A
4
G
C/-
C/-
C/-
C/-
G
A
C
G
C
A
-
C/-
C
C
C
C
T
T
G
A
A/-
-
A
G
T
C
G
-
C
G