Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 233,713 (bp)   Positions: 505
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
WN/N (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC120097081
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
Abcc4
T
A
-
-
G
C
C
G
C
G
C
G
12
C
A
G
G
C
A
G
T
A
G
C
A
A
G
A
A
A
T
C
-
G
A
T
T
T
T
C
T
T
T
T
G
A
5
G
T
2
A
T
A
T
C
G
G
-
A
T
A
C
G
-
-
8
T
G
26
G
G
C
3
A
G
A
A
G
G
C
A
C
T
A
G
T
A
C
G
T
G
-
T
C
C
A
T
A
T
G
T
G
C
A
T
C
G
A
G
G
T
G
C
G
C
C
T
-
A
T
A
5
T
T
A
T
T
A
C
C
T
A
T
C
C
G
G
G
T
T
C
-
G
A
2
T
G
C
G
C
A
2
20
-
A
C
G
3
T
G
-
A
G
C
G
G
T
G
G
C
A
G
C
G
C
-
G
T
C
G
A
C
G
A
C
C
A
G
C
T
C
C
G
T
C
C
C
G
C
T
G
G
C
T
-
G
C
4
G
G
A
A
C
C
G
T
G
G
A
2
C
A
T
G
T
C
2
A
G
2
A
C
G
2
42
12
-
-
C
C
T
C
A
C
T
T
C
C
T
C
G
A
-
C
A
C
G
T
C
C
G
-
T
A
A
A
T
C
-
4
A
A
A
G
A
G
A
T
C
T
A
A
-
A
A
T
-
A
A
C
A
A
G
C
T
G
C
G
4
A
T
-
C
A
-
T
-
T
G
G
A
A
T
G
T
A
A
A
T
A
C
-
-
-
6
-
A
G
T
-
G
T
A
C
-
-
G
A
-
A
G
13
C
80
A
C
G
T
T
C
T
G
T
G
3
3
C
C
A
T
-
A
A
G
T
2
C
A
G
A
10
-
-
G
-
-
T
G
C
T
C
G
G
-
C
-
T
A
-
T
T
A
G
6
G
C
-
A
A
G
G
G
A
G
27
T
-
G
A
G
-
3
C
G
G
C
A
A
A
-
C
T
T
G
C
G
A
6
A
G
C
-
T
A
T
C
A
C
C
-
G
A
C
T
T
T
G
T
A
-
T
A
A
G
C
C
T
G
A
-
G
G
G
2
A
A
C
C
A
C
C
T
G
G
-
G
A
C
G
A
5
T
C
A
G
T
G
C
8
G
G
C
C
T
C
C
G
A
T
G
-
T
G
A
G
  95,541,419
  95,542,377
  95,543,288
  95,544,571
  95,545,141
  95,545,533
  95,545,924
  95,546,553
  95,547,089
  95,547,468
  95,547,561
  95,547,725
  95,548,030
  95,548,150
  95,548,320
  95,548,416
  95,549,062
  95,549,250
  95,549,403
  95,549,516
  95,550,000
  95,550,001
  95,550,167
  95,550,193
  95,550,440
  95,550,570
  95,550,590
  95,550,624
  95,550,708
  95,550,800
  95,550,835
  95,550,836
  95,550,895
  95,550,896
  95,551,113
  95,551,585
  95,551,675
  95,551,778
  95,551,786
  95,551,827
  95,552,347
  95,552,632
  95,553,960
  95,554,203
  95,554,731
  95,555,584
  95,555,606
  95,555,611
  95,555,757
  95,556,029
  95,556,164
  95,556,299
  95,556,844
  95,556,928
  95,556,935
  95,556,973
  95,556,992
  95,557,141
  95,557,479
  95,558,484
  95,558,759
  95,558,837
  95,558,863
  95,558,963
  95,559,002
  95,559,022
  95,559,105
  95,559,322
  95,559,329
  95,559,487
  95,559,521
  95,559,533
  95,559,874
  95,560,046
  95,560,246
  95,560,310
  95,560,351
  95,560,611
  95,560,691
  95,560,767
  95,560,811
  95,560,891
  95,560,935
  95,561,030
  95,561,090
  95,561,153
  95,561,328
  95,561,367
  95,561,388
  95,561,404
  95,561,424
  95,561,551
  95,561,560
  95,561,563
  95,561,623
  95,561,634
  95,561,783
  95,561,825
  95,561,958
  95,562,279
  95,562,620
  95,562,713
  95,563,256
  95,563,331
  95,563,374
  95,563,769
  95,563,922
  95,564,107
  95,564,224
  95,566,128
  95,566,141
  95,566,469
  95,568,295
  95,569,917
  95,569,969
  95,570,508
  95,571,521
  95,573,597
  95,574,365
  95,575,385
  95,576,825
  95,577,334
  95,579,002
  95,580,259
  95,580,362
  95,581,563
  95,582,180
  95,583,539
  95,585,107
  95,585,161
  95,585,215
  95,585,837
  95,586,220
  95,588,840
  95,589,497
  95,592,556
  95,592,865
  95,592,913
  95,594,576
  95,594,591
  95,594,629
  95,594,677
  95,595,444
  95,595,523
  95,596,049
  95,596,305
  95,598,098
  95,598,232
  95,598,364
  95,599,298
  95,599,532
  95,599,949
  95,599,954
  95,600,003
  95,600,222
  95,600,271
  95,600,372
  95,600,375
  95,600,843
  95,601,175
  95,601,432
  95,601,528
  95,601,696
  95,602,298
  95,603,122
  95,603,737
  95,604,441
  95,605,408
  95,605,410
  95,606,979
  95,607,001
  95,607,320
  95,607,485
  95,607,517
  95,607,533
  95,607,762
  95,607,847
  95,608,288
  95,608,312
  95,608,338
  95,608,389
  95,608,432
  95,608,627
  95,608,724
  95,608,873
  95,609,023
  95,609,083
  95,609,321
  95,609,600
  95,609,662
  95,610,323
  95,610,373
  95,610,394
  95,610,402
  95,610,418
  95,610,919
  95,610,973
  95,611,106
  95,611,435
  95,611,474
  95,611,998
  95,612,281
  95,612,797
  95,612,861
  95,613,304
  95,613,856
  95,614,038
  95,614,144
  95,614,189
  95,615,048
  95,615,636
  95,615,682
  95,615,689
  95,616,532
  95,618,158
  95,618,237
  95,618,293
  95,618,294
  95,618,964
  95,619,127
  95,619,394
  95,619,806
  95,619,861
  95,621,281
  95,621,282
  95,622,054
  95,622,217
  95,623,425
  95,624,990
  95,625,279
  95,625,332
  95,626,556
  95,627,754
  95,627,851
  95,627,971
  95,628,206
  95,628,254
  95,629,614
  95,629,785
  95,629,950
  95,630,539
  95,631,259
  95,631,999
  95,632,131
  95,632,312
  95,632,450
  95,632,477
  95,632,833
  95,633,045
  95,633,052
  95,633,075
  95,633,089
  95,633,173
  95,633,201
  95,633,364
  95,633,435
  95,633,760
  95,634,085
  95,634,114
  95,634,221
  95,634,514
  95,634,535
  95,634,746
  95,635,040
  95,635,291
  95,636,152
  95,636,331
  95,636,461
  95,636,648
  95,637,427
  95,637,440
  95,637,543
  95,637,798
  95,638,019
  95,638,616
  95,640,172
  95,641,850
  95,643,332
  95,643,383
  95,644,151
  95,644,840
  95,645,010
  95,645,493
  95,645,514
  95,645,557
  95,645,796
  95,646,142
  95,647,402
  95,647,565
  95,648,676
  95,649,306
  95,650,359
  95,651,280
  95,652,948
  95,652,963
  95,653,180
  95,654,470
  95,654,756
  95,655,397
  95,655,870
  95,657,053
  95,658,209
  95,658,283
  95,658,313
  95,658,368
  95,658,637
  95,659,993
  95,660,260
  95,660,636
  95,660,668
  95,661,524
  95,662,321
  95,663,620
  95,664,113
  95,664,437
  95,664,945
  95,667,339
  95,669,687
  95,670,395
  95,671,086
  95,672,187
  95,672,570
  95,676,276
  95,676,278
  95,680,304
  95,680,976
  95,681,106
  95,681,727
  95,681,973
  95,682,825
  95,684,726
  95,685,007
  95,685,010
  95,686,015
  95,686,948
  95,686,954
  95,687,044
  95,688,109
  95,688,606
  95,688,660
  95,689,219
  95,690,488
  95,690,500
  95,697,375
  95,697,446
  95,698,087
  95,698,838
  95,699,240
  95,699,545
  95,700,046
  95,701,532
  95,701,636
  95,702,763
  95,703,037
  95,704,583
  95,704,588
  95,706,487
  95,707,314
  95,708,863
  95,710,126
  95,710,439
  95,710,792
  95,711,096
  95,711,286
  95,711,415
  95,712,710
  95,712,714
  95,713,213
  95,714,317
  95,714,412
  95,715,376
  95,715,669
  95,716,009
  95,716,652
  95,717,200
  95,717,357
  95,718,262
  95,719,106
  95,719,111
  95,719,143
  95,719,145
  95,719,291
  95,719,697
  95,719,707
  95,720,499
  95,720,726
  95,721,364
  95,721,580
  95,721,712
  95,721,981
  95,722,324
  95,722,451
  95,722,699
  95,722,971
  95,727,791
  95,731,299
  95,733,736
  95,733,970
  95,734,838
  95,735,115
  95,735,460
  95,735,562
  95,736,025
  95,739,463
  95,739,473
  95,739,707
  95,740,503
  95,740,845
  95,742,046
  95,742,156
  95,743,415
  95,743,732
  95,743,852
  95,745,711
  95,746,632
  95,746,804
  95,747,062
  95,747,064
  95,747,066
  95,747,870
  95,748,204
  95,748,207
  95,748,368
  95,748,604
  95,749,044
  95,750,548
  95,750,680
  95,751,015
  95,751,289
  95,751,453
  95,751,660
  95,752,557
  95,754,467
  95,754,627
  95,755,363
  95,755,413
  95,755,548
  95,755,893
  95,756,899
  95,756,940
  95,757,235
  95,757,289
  95,757,615
  95,757,686
  95,757,712
  95,757,718
  95,758,030
  95,758,033
  95,758,416
  95,758,426
  95,758,455
  95,758,523
  95,758,559
  95,758,599
  95,758,601
  95,758,623
  95,759,290
  95,759,332
  95,759,372
  95,759,431
  95,764,900
  95,765,510
  95,765,575
  95,765,700
  95,765,766
  95,765,937
  95,766,025
  95,766,238
  95,766,317
  95,766,429
  95,766,435
  95,766,555
  95,766,744
  95,766,803
  95,766,939
  95,767,441
  95,767,495
  95,767,713
  95,767,965
  95,767,980
  95,768,009
  95,768,016
  95,768,284
  95,768,956
  95,769,881
  95,769,882
  95,769,991
  95,770,086
  95,770,293
  95,770,657
  95,771,201
  95,771,216
  95,771,460
  95,771,581
  95,771,939
  95,772,094
  95,772,096
  95,772,277
  95,773,020
  95,773,345
  95,773,366
  95,773,465
  95,773,732
  95,773,805
  95,774,787
C
G
2
T
A
T
-/A
A
T
T
T
A
-
T
T
A
A
T
G
T
A
T
C
T
G
G
A
G
G
G
C
T
2
A/5
G
C
C
C
C
T
C
C
C
A
T
G
-
A
A
-
G
C
G
C
G
A
A
12
G
C
C
T
T
2
2
-
G
A
-
A
A
T
-
G
A
T
G
A
A
T
G
T
C
G
A
C
C
T
A
C
T
G
G
T
G
G
G
G
C
A
C/A
T
G
G
C
T
A
G
A
A
A
T
T
A
T
T
-/A
G
G
C
G
-
C
-/A
G
C
C
C
A
T
C
G
A
T
T
-
A
A
G
C
T
12
A
-
-
G
A
A
A
T
G
-
-
A
C
T
-
-
C
A
T
G
A
T
A
A
C
-/T
T
T
G
A
T
A
T
A
A
C
T
A
G
A
A
T
T
T
G
A
T
C
T
T
A
C
G
G
G
A
G
A
A
T
T
C
12
T
T
-
-/A
C
G
G
T
T
-
C
-
A
T
-
T
G
C
A
C
G
-
C
A
-
G
T
C
-
-
-
4
C
T
T
C
T
G
T
G
G
T
A
C
T
A
C
4
T
G
T
A
C
T
T
T
2
A
C
G
C
A
T
A
-
G
G
G
A
G
A
G
C
A
A
G
G
A
-
T
C
2
G
G
T
G
-/C
A
T
-/G
T
A
T
-
G
C
2
A
G
G
C
2
A
A
A
G
C
G
A
T/C
G
G
G
C
G
T
2
2
18
-
2
C
C
C
2
A
G
G
T
8
4
C
G/-
2
G
A
-
-/A
-
-/G
T
A
C
C
A
-/A
A
C
C
-
-
G/-
T
C
A
3
G
G
A
C
-
-
C
A
G
-
2
6
C
2
2
C
C
T
C
T
T
C
6
T
2
C
C
2
C
A
G
A
-
A
T
4
G
G
A
T
A
T
C
-
C
8
A
G
A
2
-
T
A
A
T
-/T
-/T
-/T
2
T
C
A
C
T
A
G
-
G
A
T
C
C
G
A/-
T
G
T
A
A
C
G
T
C
C
C
A
G
G
G
C
G
G
A
T
T
C
G/A
A/G
-/G
A
A
-
-
-
T
T
T
G
T
T
-
A
A
T
T
C
T
A
G
-
-
G
T
-/T
-/G
A
T
-
A
A
T
G
C
T/-
T
T
G
C
A
C
C
A
C
A