Variant Visualizer (Variants)

Submit Data | Help | Video Tutorials | News | Publications | Download | REST API | Citing RGD | Contact

Sequence Annotation

Assembly mRatBN7.2

Genes ( + )

Genes ( - )

mRatBN7.2

FHH/EurMcwi (2019)


--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	LOC120097318		--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	LOC120097081					--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4										Abcc4
G	T	T	C	A	C	T	A	G	A	T	T	C	A	G	G	C	T	G	G	C	A	A	C	G	G	T	C	G	C	T	T	C	G	A	C	G	C	A	A	A	A	T	A	C	T	T	G	T	T	T	T	A	A	T	A	G	A	C	A	5	G	T	2	A	T	G	A	T	C	G	G	-	A	C	T	A	C	G	-	-	8	T	G	26	G	G	C	3	G	A	G	A	A	G	G	C	A	C	T	A	G	T	A	C	G	T	G	-	T	C	C	A	C	T	C	A	T	G	T	G	C	A	T	A	G	G	2	T	C	C	G	C	G	T	T	T	T	C	C	G	T	C	-	G	A	-	T	T	C	G	T	-	C	G	C	G	T	-	A	30	G	A	C	G	-	T	A	T	A	C	C	C	T	A	A	G	C	T	3	G	A	T	T	T	C	G	A	-	-	-	2	C	A	C	T	C	G	A	T	2	6	C	G	G	A	2	A	T	T	G	G	T	C	-	C	A	A	C	T	C	G	C	G	G	A	G	C	A	13	G	G	G	A	A	G	C	2	12	A	C	-	G	T	C	G	A	C	G	A	C	A	G	C	T	-	G	C	G	T	C	C	T	A	C	A	10	2	C	T	-	C	-	C	4	A	A	A	T	A	G	-	G	A	2	10	C	T	C	C	T	A	T	G	C	A	T	T	C	C	C	G	4	4	A	C	G	-	2	T	48	C	2	G	12	-	C	C	T	A	C	T	C	C	T	C	G	A	-	C	A	C	G	T	C	G	-	T	A	A	A	T	C	-	C	A	A	T	G	C	G	T	C	C	-	T	A	C	A	A	G	-	T	-	G	C	G	G	G	-	T	2	C	C	A	A	-	A	7	A	-	A	T	G	A	C	A	T	G	G	A	2	2	-	4	T	-	G	G	4	C	A	A	C	A	T	-	T	A	T	-	A	-	T	G	C	A	G	C	-	T	G	T	T	C	13	T	A	A	G	G	T	A	9	A	A	C	-	C	A	A	G	A	G	C	G	A	G	-	A	T	T	A	A	3	C	G	G	C	C	G	C	A	-	G	T	A	G	A	T	3	4	C	G	C	T	G	A	G	C	T	-	A	T	T	A	A	T	A	A	A	G	4	A	-	A	A	T	G	G	-	C	C	-	-	G	A	T	T	C	C	C	-	A	T	G	C	-	-	T	G	C	T	C	C	T	T	A	28	T	-	4	A	-	14	G	A	A	A	A	A	A	G	C	A	C	T	G	C	-	-	2	G	G	A	G	4	G	C	T	A	8	A	G	T	C	-	G	A	C	T	T	T	G	T	C	G	A	-	T	G	A	T	A	G	C	C	T	-	2	A	A	A	A	C	C	-	T	A	G	T	G	T	9	G	C	A	C	G	T	G	C	8	C	C	C	C	C	C	C	T	T	C	5	A	G
95,541,260	95,541,419	95,541,422	95,541,587	95,541,823	95,541,825	95,541,837	95,542,377	95,542,498	95,542,586	95,544,248	95,544,629	95,544,825	95,545,118	95,545,169	95,545,183	95,545,198	95,545,524	95,545,596	95,545,599	95,545,924	95,545,933	95,546,251	95,546,529	95,546,553	95,546,741	95,547,064	95,547,089	95,547,468	95,547,561	95,548,068	95,548,098	95,548,150	95,549,062	95,549,403	95,549,449	95,549,516	95,549,829	95,550,440	95,550,570	95,550,708	95,550,800	95,550,835	95,551,113	95,551,347	95,551,585	95,551,675	95,551,676	95,551,778	95,551,786	95,552,632	95,554,194	95,554,196	95,554,197	95,554,239	95,554,477	95,554,730	95,555,204	95,555,270	95,555,584	95,555,606	95,555,611	95,555,757	95,556,029	95,556,164	95,556,299	95,556,367	95,556,844	95,556,928	95,556,935	95,556,973	95,556,992	95,557,141	95,557,479	95,557,615	95,558,484	95,558,759	95,558,837	95,558,863	95,558,963	95,559,002	95,559,022	95,559,105	95,559,322	95,559,329	95,559,487	95,559,521	95,559,533	95,559,874	95,560,027	95,560,046	95,560,246	95,560,310	95,560,351	95,560,611	95,560,691	95,560,767	95,560,811	95,560,891	95,560,935	95,561,030	95,561,090	95,561,153	95,561,328	95,561,367	95,561,388	95,561,404	95,561,424	95,561,551	95,561,560	95,561,563	95,561,623	95,561,634	95,561,775	95,561,783	95,561,810	95,561,825	95,561,958	95,562,279	95,562,620	95,562,713	95,563,256	95,563,331	95,563,374	95,563,489	95,563,922	95,564,224	95,564,730	95,566,141	95,567,227	95,567,801	95,568,215	95,568,295	95,569,533	95,570,339	95,570,342	95,570,345	95,570,348	95,570,377	95,570,708	95,570,772	95,571,058	95,571,220	95,571,392	95,571,408	95,571,416	95,571,451	95,571,523	95,571,527	95,571,633	95,571,789	95,571,848	95,572,376	95,572,403	95,572,442	95,572,476	95,572,845	95,573,235	95,573,597	95,573,624	95,573,751	95,573,819	95,574,365	95,575,102	95,575,318	95,575,536	95,575,633	95,576,825	95,577,176	95,577,601	95,577,843	95,578,800	95,579,125	95,580,259	95,580,362	95,581,231	95,581,290	95,581,426	95,581,563	95,581,616	95,581,728	95,581,758	95,581,919	95,582,118	95,582,180	95,582,278	95,582,307	95,583,539	95,584,168	95,584,202	95,584,361	95,584,452	95,585,107	95,585,124	95,585,161	95,585,215	95,585,414	95,585,653	95,585,837	95,586,220	95,586,594	95,589,460	95,589,512	95,589,526	95,589,700	95,589,757	95,589,945	95,590,063	95,590,067	95,590,207	95,590,349	95,590,649	95,590,823	95,591,037	95,591,057	95,591,118	95,591,132	95,591,159	95,591,419	95,591,421	95,591,479	95,591,496	95,591,637	95,591,690	95,593,009	95,593,152	95,593,195	95,593,293	95,593,411	95,593,418	95,593,561	95,593,770	95,593,830	95,593,873	95,593,968	95,594,258	95,594,359	95,596,049	95,599,935	95,607,001	95,607,485	95,607,762	95,607,847	95,608,288	95,608,312	95,608,338	95,608,389	95,608,432	95,608,627	95,608,724	95,608,873	95,609,083	95,609,321	95,609,600	95,609,662	95,609,777	95,610,335	95,610,373	95,610,394	95,610,402	95,610,418	95,610,973	95,611,474	95,611,738	95,612,067	95,612,702	95,612,893	95,613,056	95,613,077	95,613,089	95,613,127	95,613,225	95,613,304	95,613,443	95,614,318	95,615,636	95,615,682	95,615,985	95,616,041	95,616,068	95,618,158	95,618,183	95,618,434	95,618,964	95,619,127	95,619,248	95,619,394	95,619,861	95,620,222	95,620,318	95,620,953	95,621,186	95,621,282	95,621,508	95,621,998	95,622,000	95,622,061	95,622,182	95,622,242	95,622,246	95,622,705	95,622,805	95,623,145	95,623,199	95,623,969	95,624,753	95,624,990	95,625,147	95,625,279	95,625,319	95,625,343	95,626,556	95,627,851	95,628,068	95,628,206	95,629,614	95,629,785	95,629,950	95,630,539	95,631,999	95,632,131	95,632,312	95,632,477	95,632,833	95,633,045	95,633,052	95,633,075	95,633,089	95,633,173	95,633,201	95,633,364	95,633,435	95,633,760	95,634,085	95,634,221	95,634,514	95,634,535	95,634,746	95,635,040	95,635,291	95,636,152	95,636,331	95,636,461	95,636,648	95,637,532	95,637,543	95,638,616	95,643,332	95,643,707	95,644,037	95,644,134	95,644,151	95,644,197	95,644,277	95,644,489	95,644,687	95,644,840	95,645,427	95,645,514	95,645,557	95,645,654	95,646,022	95,646,031	95,646,121	95,646,125	95,646,132	95,646,133	95,646,135	95,646,139	95,646,502	95,646,657	95,646,661	95,646,728	95,646,836	95,646,935	95,647,101	95,647,164	95,647,402	95,647,577	95,648,122	95,648,370	95,648,639	95,648,668	95,648,847	95,649,175	95,649,285	95,649,306	95,649,672	95,649,735	95,649,784	95,650,371	95,650,973	95,651,361	95,651,428	95,651,568	95,651,677	95,652,185	95,653,180	95,653,184	95,655,397	95,655,444	95,655,638	95,655,870	95,655,936	95,656,929	95,657,053	95,657,079	95,657,340	95,657,546	95,657,867	95,658,209	95,658,313	95,658,368	95,658,637	95,658,841	95,658,976	95,659,353	95,659,585	95,659,719	95,659,993	95,660,606	95,660,636	95,660,846	95,661,063	95,661,100	95,661,104	95,661,544	95,661,704	95,661,720	95,661,943	95,661,953	95,662,073	95,662,321	95,662,581	95,662,663	95,662,735	95,664,470	95,664,558	95,664,693	95,664,945	95,665,393	95,665,441	95,665,493	95,665,951	95,666,434	95,666,700	95,667,339	95,668,055	95,669,395	95,669,687	95,670,395	95,670,823	95,670,872	95,671,086	95,671,427	95,671,452	95,672,012	95,672,554	95,673,249	95,673,323	95,673,421	95,674,095	95,676,235	95,676,258	95,676,574	95,676,619	95,676,818	95,677,061	95,677,549	95,677,687	95,677,760	95,677,804	95,678,123	95,678,733	95,678,751	95,679,771	95,680,826	95,681,106	95,681,727	95,681,738	95,681,973	95,682,825	95,683,834	95,684,850	95,685,007	95,685,010	95,685,405	95,685,504	95,686,955	95,686,957	95,686,959	95,687,044	95,687,232	95,688,109	95,688,606	95,688,660	95,688,690	95,688,845	95,689,127	95,689,379	95,689,500	95,690,309	95,690,500	95,696,085	95,696,237	95,697,372	95,697,446	95,699,240	95,701,532	95,702,699	95,706,487	95,707,209	95,707,211	95,711,096	95,711,336	95,712,659	95,713,415	95,715,669	95,717,200	95,718,262	95,719,106	95,719,111	95,719,143	95,719,145	95,720,719	95,721,981	95,722,324	95,727,325	95,727,561	95,733,280	95,733,736	95,733,829	95,733,970	95,740,503	95,743,649	95,746,678	95,747,062	95,747,064	95,747,066	95,747,068	95,747,070	95,748,373	95,748,604	95,749,044	95,750,680	95,751,072	95,751,331	95,751,345	95,751,647	95,751,817	95,752,557	95,752,620	95,752,677	95,753,547	95,754,052	95,754,132	95,754,353	95,754,371	95,754,434	95,754,467	95,754,627	95,755,402	95,755,692	95,755,823	95,756,377	95,756,899	95,756,940	95,757,235	95,757,289	95,757,615	95,757,686	95,757,712	95,757,718	95,758,030	95,758,033	95,758,077	95,758,095	95,758,416	95,758,426	95,758,455	95,758,456	95,758,523	95,758,538	95,758,559	95,758,599	95,758,623	95,758,830	95,759,290	95,759,431	95,765,700	95,765,766	95,765,767	95,765,806	95,765,937	95,766,429	95,766,435	95,766,448	95,766,555	95,766,665	95,766,803	95,766,942	95,767,248	95,767,385	95,767,524	95,767,965	95,767,979	95,767,980	95,768,284	95,769,881	95,769,882	95,769,968	95,770,086	95,770,293	95,771,939	95,771,941	95,771,943	95,771,945	95,771,955	95,771,957	95,771,959	95,772,582	95,773,020	95,773,261	95,773,784	95,773,805	95,774,787
C	C	C	T	G	A	A	G	A	G	C	C	T	G	A	A	T	C	T	T	A/-	C/-	G	T	A	A	C	T	T	T	A	C	T	A	G	A	T	T	G	G	G	G	C	G	T	C	C	A	C	C	C	C	-	G	C	G	A	C	T	G	-	A	A	-	G	C	A	G	C	G	A	A	12	G	T	C	C	T	T	2	2	-	G	A	-	A	A	T	-	A	G	A	T	G	A	A	T	G	T	C	G	A	C	C	T	A	C	T	G	G	T	G	G	A	G	T	G	C	A	A/C	T	G	G	C	G	A	A	-	A	T	G	A	T	C	C	C	C	C	A	T	A	C	G	4	A	T	4	A/-	A	T	A	C	4	T	T	T	C	C	G	G	-	A	G	T	A	T	C	G	G	-	T	T	T	A/-	G	T	A	A	C	-	A	G	C	C	C	T	A	C	6	2	4	2/-	A	G	T	C	T	T	G	A	-	-	T	A	A	G	-	G	C	C	A	A	C	-	2	G	-	C	T	G	T	C	T	A	A	G	A	T	-	-	A	A	A	T	T	T	T	-	-	G	T	A	A	C	T	A	G	A	A	T	T	G	A	T	C	T	T	T	A	C	G	G	A	G	A/-	G	-	-	A	C	8	T	12	G	-	G	G	G	C	G	-	2	T	T	-	-	T	C	A	T	C	-	C	A	T	T	C	C	T/-	T	T	T	-	-	-	T	A	2	-	C	-	T	-	A/-	-	C	T	T	C	G	T	G	T	A	C	T	A	C	4	T	G	T	A	C	T	T	2	A	C	G	C	A	T	A	T	G	G	C	A	G	A	A	T	T	A	C	G	T	-	T	A	A	G	4	A/-	-/T	A/-	-/A	A	A	C	-	A	T	G	G	4	G	-	C	2	-	G	A	T	T	G	C	A	C	C	2/-	-	2	-	G	4	T	A	-	T	-	G	T	G	C	55	C	G	C	2	G	G	C	A	A	T	A	T	2	C	A	C	G	?	-	C	G	G	C	A	C	C	-	G	-	T	4	T	G	G	A	G	A	G	A	G	-	G	G	C	C	G	G	-	T	A	T	T	A	A	T	G	4	A	C	C	A	T	C	-	-	T	A	T	C	A	C	C	A	C	2	G	A	G	G	G	C	-/G	G	G	C	-	-/G	2	G	T	C	A	A	2	T	A/-	4	4	T	G/-	C	A/-	T	G/-	A	T	G	C	C	T	2	2	C	C	T	C	T	T	C	A	C	-	-/A	4	-	G	8	-	A	-/T	T/-	T/-	T	A/T	G	C	T	G	T	C	T	-	8	C	-	A	C	G	A	-	A	T	C	G	-	G	A	C	A	A	C	G	T	C	C	C	A	G	T	A	G	G	C	A	G	C	G	A	T	T	C	G	-	-	G	C/T	T	T	T	6	-	G	A	G	A	C	-	A	A	G	G	-/T	-/G	A	T	-	-/T	T/-	T/-	T/-	T/-	-/T	C/T	C	C	G	-	C	A