Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 220,494 (bp)   Positions: 534
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
.003
.0
.518
1.0
.349
.98
.001
--
--
--
--
--
--
.013
.0
.002
.002
.002
.0
.0
.0
.0
.015
.0
.004
.923
--
.001
.0
.03
.004
.0
.001
.0
.224
.001
.0
.002
.0
.0
.975
.102
.0
.007
.031
.007
.003
.001
.02
.03
.0
.108
.209
.003
.0
.001
.0
.004
.001
.998
.682
.91
.994
.993
.005
.006
.039
.0
.005
.0
.0
.0
.034
.001
.0
.001
.016
.08
.989
.002
.012
.002
.013
.012
.001
.0
.006
.081
.995
.001
.0
.003
.006
.007
.015
.066
.085
.13
.001
.0
.001
.001
.002
.012
--
.003
.005
.96
.0
.034
.0
.0
.003
.026
--
--
.005
.008
.002
.0
.006
.002
.011
.007
.0
.272
.002
.003
.003
.0
.002
.001
.037
.62
.094
.056
.06
.0
.764
.375
.67
.002
.007
.102
.0
--
.02
.002
.0
.001
.0
.015
.0
.905
.007
.004
.0
.004
.0
.0
.212
.0
.0
.0
.424
.0
.0
.0
.271
.046
.001
.0
.001
.0
.015
.003
.02
.0
.004
.0
.0
.044
.004
.004
.002
.003
.002
.006
.0
.004
.052
.058
.016
.005
.017
.816
.015
.32
.002
.028
.008
.192
1.0
.003
.015
.005
.0
.001
.214
.003
.021
--
.0
.001
.759
.044
.074
.01
.004
.002
.0
.055
1.0
.009
.0
.0
1.0
.059
.164
.0
.599
.032
.002
.005
.002
.155
.033
.004
.002
.0
.756
.0
.0
.0
.005
.001
.001
.025
.066
.039
.081
.076
.0
.303
.003
.667
.015
.0
.0
.0
.007
.004
.001
.001
.002
.006
.089
.998
.025
.018
.001
.001
.032
.002
.005
--
--
--
--
--
.133
.015
.003
.009
.101
.037
.173
.003
.001
.0
.003
.0
.007
.004
.0
.002
.002
.0
1.0
.003
.0
.0
.006
.021
.455
.021
.02
.0
.002
.013
.188
.0
.0
--
.849
.0
.0
.24
.0
.027
.121
.097
.005
.006
.001
.0
.0
.0
.001
.0
.009
.092
.013
.001
.001
.01
.004
.03
.017
.015
.0
.016
1.0
.0
.001
.0
.002
.003
.0
.001
.0
.001
.001
.022
.004
.0
.021
.019
.004
.062
.087
.099
.007
.014
.101
.497
.003
.004
.021
.0
.004
--
--
--
--
.004
.025
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.049
.013
.022
.013
.6
.015
.557
.009
1.0
.048
.001
.0
.001
.078
.0
.002
.001
.012
.202
.139
.015
.007
.005
.008
.009
.079
.005
.215
.003
.0
.0
.003
.02
.021
.02
.004
.009
.002
.061
.007
.016
.001
.005
.013
.006
.256
.002
.06
.067
.011
.335
.604
.181
.003
.0
--
--
--
.015
.001
.265
.082
.28
.544
.096
.014
.413
.017
.004
.001
.024
.073
.109
.002
.071
.0
.036
.002
.082
.783
.003
.0
.006
.0
.044
.173
.521
.005
.001
.039
.016
.038
.434
.964
.0
.0
.0
.001
.0
.118
.004
.047
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.282
.395
.342
.001
.018
.002
.012
.137
.779
.648
.0
.0
.003
.004
.043
.0
.003
.022
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
A
T
G
G
A
A
C
C
C
T
C
G
A
A
T
G
G
C
A
G
T
T
T
C
C
T
T
C
C
A
C
A
C
C
T
C
T
C
A
G
G
C
G
A
C
G
G
G
G
A
C
A
A
G
A
C
A
T
A
T
C
C
C
C
C
C
G
T
T
A
G
C
A
A
T
T
C
G
C
A
A
T
C
G
G
A
C
A
A
A
C
C
G
T
C
G
A
C
C
A
C
T
G
G
A
T
T
C
C
A
G
A
C
A
C
C
G
C
G
C
A
T
C
C
C
A
C
C
G
A
A
C
T
C
T
C
T
T
C
T
G
A
A
A
A
A
A
C
C
A
C
T
C
T
G
T
A
C
A
A
T
A
T
T
C
G
G
T
G
A
C
C
T
A
C
C
G
C
C
A
A
T
G
A
G
G
T
T
A
G
G
T
G
T
G
A
T
G
C
C
C
T
T
T
A
A
C
A
G
G
T
A
A
C
C
A
A
C
T
C
A
C
T
C
G
C
A
C
T
G
T
C
G
A
C
C
A
C
A
T
C
A
C
C
T
C
G
G
C
T
T
A
T
C
G
A
T
G
G
A
A
A
T
A
T
G
G
A
G
G
T
T
C
A
G
A
A
C
G
C
C
G
C
A
A
T
A
A
A
T
T
C
C
G
A
G
A
A
T
G
G
G
T
T
T
A
C
A
T
G
A
A
A
T
A
A
G
G
G
G
T
C
C
G
T
A
C
T
G
C
G
G
C
G
A
C
A
A
G
A
G
G
A
G
T
G
T
C
A
T
G
C
C
A
C
C
A
T
T
C
C
G
G
G
G
T
A
C
A
A
A
C
T
G
C
C
C
G
C
A
G
T
T
T
C
A
G
A
T
A
T
A
G
C
C
C
T
T
G
C
G
T
A
G
C
T
A
A
G
A
T
T
A
A
G
G
A
A
T
G
G
A
G
C
G
G
G
C
G
G
A
T
G
G
C
G
T
G
C
C
C
G
A
C
G
C
T
T
T
A
A
T
A
G
T
G
C
T
C
C
T
C
G
C
C
G
A
C
A
A
C
G
A
C
C
T
T
G
C
T
C
T
A
T
T
C
A
C
T
T
C
A
G
T
G
G
C
C
A
C
A
A
C
T
C
T
C
T
A
A
G
A
A
A
G
T
A
A
G
C
G
T
T
G
G
T
A
C
A
A
A
G
C
C
  32,397,004
  32,397,025
  32,398,462
  32,398,994
  32,399,802
  32,400,757
  32,401,779
  32,402,653
  32,406,338
  32,406,393
  32,406,394
  32,406,412
  32,406,421
  32,406,490
  32,406,954
  32,408,531
  32,408,931
  32,409,218
  32,409,511
  32,409,912
  32,410,836
  32,411,383
  32,411,499
  32,411,511
  32,412,274
  32,412,302
  32,412,465
  32,413,509
  32,413,581
  32,416,585
  32,416,720
  32,416,831
  32,417,906
  32,418,235
  32,418,254
  32,418,601
  32,418,774
  32,419,556
  32,419,572
  32,420,332
  32,421,838
  32,424,087
  32,424,462
  32,425,518
  32,425,535
  32,426,563
  32,426,658
  32,428,454
  32,428,613
  32,428,702
  32,428,703
  32,429,723
  32,430,885
  32,432,041
  32,432,592
  32,433,509
  32,433,977
  32,434,062
  32,434,798
  32,434,812
  32,434,896
  32,434,922
  32,435,026
  32,435,082
  32,435,123
  32,435,357
  32,435,404
  32,435,929
  32,437,799
  32,438,407
  32,438,824
  32,439,233
  32,439,360
  32,439,528
  32,441,488
  32,441,550
  32,442,344
  32,444,591
  32,445,356
  32,446,285
  32,446,554
  32,447,438
  32,447,585
  32,447,854
  32,448,439
  32,448,531
  32,450,325
  32,450,443
  32,450,468
  32,451,059
  32,451,542
  32,451,820
  32,452,368
  32,452,618
  32,453,081
  32,454,742
  32,454,833
  32,455,438
  32,455,458
  32,456,374
  32,456,729
  32,456,821
  32,456,822
  32,456,836
  32,457,902
  32,458,234
  32,458,498
  32,459,843
  32,461,840
  32,462,221
  32,462,556
  32,463,035
  32,463,435
  32,463,495
  32,463,736
  32,467,018
  32,468,514
  32,469,027
  32,469,466
  32,470,082
  32,470,204
  32,471,176
  32,471,563
  32,471,578
  32,471,926
  32,472,647
  32,472,997
  32,473,494
  32,473,693
  32,473,695
  32,474,326
  32,476,206
  32,476,591
  32,477,244
  32,477,443
  32,477,559
  32,477,566
  32,477,574
  32,479,606
  32,480,243
  32,480,253
  32,480,277
  32,480,981
  32,481,534
  32,482,326
  32,483,424
  32,485,644
  32,485,868
  32,486,547
  32,487,126
  32,487,179
  32,487,830
  32,488,355
  32,488,427
  32,488,699
  32,488,950
  32,489,221
  32,489,415
  32,490,514
  32,490,598
  32,490,671
  32,490,997
  32,491,222
  32,491,284
  32,491,560
  32,492,397
  32,492,557
  32,492,979
  32,493,750
  32,494,131
  32,494,580
  32,495,241
  32,495,375
  32,495,790
  32,496,700
  32,497,190
  32,497,616
  32,497,872
  32,499,127
  32,499,289
  32,500,011
  32,500,178
  32,500,224
  32,500,892
  32,501,458
  32,502,562
  32,502,894
  32,502,896
  32,503,376
  32,503,523
  32,504,334
  32,504,745
  32,504,775
  32,504,783
  32,504,792
  32,504,815
  32,504,824
  32,504,836
  32,504,865
  32,506,031
  32,507,292
  32,508,949
  32,510,237
  32,510,575
  32,512,075
  32,513,636
  32,514,298
  32,514,681
  32,515,448
  32,515,989
  32,519,019
  32,521,785
  32,522,565
  32,523,564
  32,524,237
  32,526,079
  32,526,306
  32,526,335
  32,526,382
  32,527,040
  32,527,108
  32,527,117
  32,527,259
  32,527,556
  32,527,761
  32,529,793
  32,530,673
  32,531,087
  32,531,131
  32,531,465
  32,531,608
  32,531,939
  32,532,338
  32,532,684
  32,533,803
  32,534,036
  32,534,791
  32,535,370
  32,535,381
  32,535,458
  32,535,551
  32,536,217
  32,536,267
  32,537,439
  32,537,703
  32,538,000
  32,538,111
  32,538,304
  32,538,408
  32,538,454
  32,538,458
  32,538,463
  32,540,141
  32,541,115
  32,542,963
  32,544,273
  32,544,711
  32,545,278
  32,546,014
  32,546,922
  32,548,564
  32,549,989
  32,550,019
  32,550,388
  32,550,997
  32,551,844
  32,558,879
  32,560,946
  32,561,197
  32,561,795
  32,566,439
  32,566,648
  32,567,688
  32,568,471
  32,568,855
  32,568,895
  32,571,383
  32,571,546
  32,571,567
  32,571,636
  32,571,832
  32,572,254
  32,572,346
  32,572,361
  32,572,367
  32,572,383
  32,572,423
  32,572,443
  32,572,640
  32,572,726
  32,572,736
  32,572,770
  32,572,916
  32,572,922
  32,572,991
  32,573,313
  32,573,317
  32,573,346
  32,573,454
  32,573,628
  32,573,647
  32,573,685
  32,573,697
  32,573,738
  32,573,750
  32,573,809
  32,573,870
  32,573,951
  32,573,970
  32,574,194
  32,574,323
  32,574,358
  32,574,386
  32,575,075
  32,575,525
  32,577,179
  32,577,864
  32,577,870
  32,578,562
  32,578,682
  32,579,130
  32,579,184
  32,579,190
  32,579,330
  32,579,683
  32,580,402
  32,580,445
  32,580,482
  32,580,665
  32,580,910
  32,581,142
  32,581,202
  32,581,438
  32,581,471
  32,581,484
  32,581,501
  32,581,536
  32,581,692
  32,581,707
  32,581,780
  32,581,977
  32,582,130
  32,582,362
  32,582,629
  32,583,109
  32,583,113
  32,583,353
  32,583,468
  32,583,816
  32,583,873
  32,583,932
  32,583,965
  32,584,212
  32,584,399
  32,584,822
  32,585,118
  32,585,306
  32,585,340
  32,585,459
  32,585,648
  32,585,745
  32,585,768
  32,586,118
  32,586,373
  32,586,380
  32,586,456
  32,586,481
  32,586,750
  32,586,751
  32,586,853
  32,587,135
  32,587,382
  32,587,695
  32,587,758
  32,587,770
  32,587,797
  32,588,403
  32,588,709
  32,589,025
  32,589,144
  32,589,219
  32,589,308
  32,589,508
  32,589,691
  32,589,695
  32,589,858
  32,590,207
  32,590,225
  32,590,336
  32,590,463
  32,590,968
  32,591,114
  32,591,277
  32,591,294
  32,591,482
  32,591,484
  32,591,565
  32,591,674
  32,591,814
  32,592,001
  32,592,026
  32,592,044
  32,592,074
  32,594,579
  32,594,842
  32,594,852
  32,595,197
  32,595,315
  32,595,728
  32,595,881
  32,595,930
  32,595,978
  32,596,294
  32,596,317
  32,596,431
  32,596,679
  32,596,866
  32,596,900
  32,597,003
  32,597,083
  32,597,123
  32,597,182
  32,597,193
  32,597,204
  32,597,249
  32,597,277
  32,597,370
  32,597,593
  32,597,619
  32,597,632
  32,597,672
  32,597,877
  32,597,897
  32,597,975
  32,597,981
  32,598,033
  32,598,037
  32,598,053
  32,598,121
  32,598,287
  32,598,328
  32,598,346
  32,598,443
  32,598,632
  32,598,669
  32,598,859
  32,598,957
  32,598,961
  32,598,974
  32,598,998
  32,599,021
  32,599,132
  32,599,159
  32,599,179
  32,599,371
  32,599,396
  32,599,604
  32,599,985
  32,600,184
  32,600,866
  32,600,900
  32,601,250
  32,601,340
  32,602,250
  32,602,361
  32,602,454
  32,603,839
  32,604,674
  32,605,232
  32,605,489
  32,606,376
  32,608,025
  32,608,180
  32,608,235
  32,608,696
  32,608,727
  32,609,050
  32,609,066
  32,609,318
  32,609,436
  32,609,468
  32,609,480
  32,609,524
  32,609,666
  32,609,677
  32,609,686
  32,609,853
  32,609,864
  32,609,994
  32,610,019
  32,610,068
  32,610,241
  32,610,592
  32,611,716
  32,611,735
  32,611,772
  32,611,807
  32,611,811
  32,612,280
  32,612,304
  32,612,371
  32,612,458
  32,612,586
  32,612,627
  32,612,707
  32,612,920
  32,612,971
  32,612,997
  32,613,105
  32,613,145
  32,613,300
  32,613,416
  32,613,419
  32,613,513
  32,613,531
  32,613,579
  32,613,711
  32,613,720
  32,613,736
  32,613,762
  32,613,976
  32,614,084
  32,614,231
  32,615,028
  32,615,322
  32,615,558
  32,615,769
  32,615,814
  32,616,043
  32,616,171
  32,616,191
  32,616,283
  32,616,395
  32,616,404
G
C
A
A
G
G
T
T
T
A
A
A
C
A/T
C
A
A
T
G
A
C
C
A
A
T
G
C
C/T
A
G
T
G
A
G
A
T
C
T
G
T
A
T
A
G
T
A
A
A
A
G
T
G
G
T
G
T
G
G
C
C
C/T
C/T
C/T
C/T
C/G
T
A
C
C
G
A
T
G
G
A
C
G
A
T
G
C
C
T
A
A
G
T
T
G
G
T
T
C
C
T
A
G
C/T
C/T
G
T
C
A
A
G
T/G
C
G
T
C
A
G
A
G
T
T
A
T
A
T
G
C
T
T
A
T
T
G
G/A
A/G
G
T
C
T
G
C/T
T/C
T/C
T
G
A
G
G
G
G
T
G
G
T
G
T
C
G
C
A
C
G
C/G
G
G
C
G
A
C
T
A
A
G
A
G
T
T
C
T
T
T
A
T
T
G
G
C
A
G
A
A
C
C
G
C
C
T/C
G/A
T/C
G/T
A/G
T/C
G/A
C/T
A
C/G
C
C
C
T
C
G
G
A
A
C
G
G
T
T
G
T
T
C
T
G
T
C
T
A
G
G
T
A
A
A
T
A
G
T
T
G
T
G
C
T
G
A
T
C
T
A
C
G
C
G
G
C
T
A
T
C
A
A
G
G
C
C
G
A
A
G/C
G
A
C
A
C
T
T
A
G
C
T
A
A
T
C
A
G
G
C
C
C
G
C
C
T
T
A
G
T
C
G
C
A
A
A
C
C
C
G
T
G
C
C
G
C
G
C
G
G
C
T
A
C
C
G
G
A
C
G
T
C
T
T
C
A
T
A
G
T
G
G
A
G
A
A
G
A
C
A
C
T
G
C
C
T
T
G
T
T
G
C
C
T
T
T
C
C
C
C
T
T
G
G
G
A
C
A
G
G
T
A
A
T
T
C
G
T/G
C/T
G
G/A
A/G
G
G
G
G
G/A
C/T
C/T
C/T
T/A
C
A
A
A
C
G
A
G
C
C
G
A
G
G
C
G
T
A
T
C
T
C
C
A
G
A
G
C
C
A
T
A
A
G
C
C
C
T
A
C
A
T
T
A
A
G
T
A
T
C
C
C
T
G
C
G
T
C
C
C/T
A
G
G
C
G
A
T
T
A
G
T
C
G
T
A
G
A
T
C
C
A
T
C
T
C
G
C
C
G
G
T
G
C
G
C
A
C
T
C
G
T
G
A
C
G
C/T
A
T
C
T
C
C
T
G/A
G
G
G
C
G
A/G
A/G
A
G
A
A
C
A
A
C
G
G
G
C
G
A
A
T