Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 220,494 (bp)   Positions: 589
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
.003
.098
1.0
.349
.021
.0
.001
.0
.0
.088
.001
.215
.087
.098
.08
.027
.112
.164
.129
.078
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.617
.013
.002
.0
.034
.0
.0
.0
.0
.015
.009
.004
.923
.006
.012
.001
.0
.002
.022
.122
.147
--
--
.002
.001
.785
.627
.0
.001
.0
.001
.001
.002
.053
.004
.006
.001
.009
.006
.975
.0
.007
.031
.0
.01
.001
.02
.03
.0
.108
.209
.001
.003
.941
.005
.011
.001
.0
.001
.0
.005
.039
.023
.0
.0
.038
.005
.045
.0
.0
.0
.034
.006
.006
.001
.0
.004
.004
.001
.141
.0
.08
.001
.999
.989
.002
.012
.031
.013
.032
.012
.002
.001
.001
.0
.0
.001
.0
.006
.081
.995
.001
.003
.0
.003
.006
.309
.002
.015
.066
.075
--
--
.001
.002
.0
.001
.001
.002
.01
.012
--
.003
.018
.005
.662
.96
.0
.028
.0
.0
.0
.003
.0
.001
--
--
--
.005
.008
.002
.0
.002
.008
.011
.007
.0
.272
.003
.003
.001
.001
.029
.0
.009
.023
.001
.037
.065
.62
.013
.003
.0
.0
.002
.007
.102
.525
.02
.0
--
.026
.002
.0
.001
.0
.015
.0
.007
.004
.006
.007
.0
.001
.0
.212
.0
.0
.0
.005
.424
.013
.0
.0
.013
.0
.271
.023
.046
.0
.0
.001
.0
1.0
.0
.0
.003
.066
.02
.0
.004
.841
.0
.0
.044
.004
.003
.002
.006
.0
.002
.008
.192
1.0
.003
.0
.004
.005
1.0
.021
.437
.001
.669
.679
.003
.005
.003
.083
.081
.078
--
--
--
.001
.021
.033
--
--
--
.002
.015
.002
.0
.07
.819
.001
.044
.01
.763
.0
.055
.107
.003
.099
.0
.012
.0
.0
1.0
.0
.003
.002
.516
.04
.01
.003
.155
.0
.002
.047
.0
.756
.083
.002
.003
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.025
.006
.039
.015
.152
.013
.176
.011
.005
.0
.979
.004
.014
.836
.455
.0
.0
.009
.002
.231
.002
.004
.002
.007
.244
.003
.001
.0
.06
.004
.0
.0
.0
.003
.002
.015
.0
.053
.0
.003
.0
.048
.212
.067
.04
.001
.002
.003
.0
.0
.011
.004
.002
.003
.012
.081
.0
.0
.001
.026
.664
.0
.0
.108
.03
.002
.084
.012
.002
.002
.01
.02
.062
.001
.001
.001
.204
.0
.024
.0
.998
.998
.004
.03
.076
.563
.947
.826
1.0
1.0
.393
.654
.126
.089
.134
.183
.997
.234
.131
.996
.997
.992
.999
.001
.0
.051
.861
.709
.774
.753
.761
.86
1.0
.211
.234
.606
.973
.975
.871
.906
.833
.763
.362
.006
.012
.025
.012
.007
.001
.0
.075
1.0
1.0
.015
.048
.065
.028
.038
.026
.853
.004
.688
.864
.997
1.0
.846
.55
.982
1.0
.95
1.0
1.0
.999
1.0
1.0
.397
.067
.507
1.0
.005
.0
.969
.005
.0
.035
.011
.018
.231
.001
.223
.008
.01
.01
.049
.094
.072
.137
.007
.011
.032
.304
.005
.0
.819
.002
.001
.0
.018
.026
.01
.033
.032
.705
.004
.002
.044
.027
.028
.011
--
.077
.037
.0
.006
.004
.013
.0
.001
.0
.0
.054
.081
--
--
.314
.037
.002
.006
.005
.036
.006
.002
.082
.299
.783
.562
.0
.003
.0
.006
.0
.044
.173
.521
.043
.005
.001
.039
.016
.038
.434
.027
.036
.664
.964
.0
.002
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.0
.004
.0
.0
.001
.118
.004
.047
.008
--
.008
.004
.012
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
Zfp827
A
T
-
A
A
-
3
C
C
T
C
A
T
T
2
A
A
T
A
T
G
T
C
G
G
A
C
A
G
A
T
T
T
A
G
3
C
T
T
T
C
2
T
T
4
7
-
-
-
10
6
A
-
-
-
-
T
T
A
-
T
T
C
A
3
A
G
-
G
G
C
A
C
G
G
-
G
A
C
A
A
G
T
A
T
C
11
A
T
4
G
C
T
G
G
T
G
A
C
G
C
A
A
T
C
T
T
G
G
C
G
4
C
G
C
A
A
T
G
G
G
G
G
A
C
C
C
C
C
A
A
A
C
G
C
G
T
9
-
G
A
8
C
4
A
T
C
T
G
G
T
A
-
T
C
C
T
C
A
G
A
G
C
A
C
G
T
C
22
C
G
C
A
C
G
C
C
A
C
G
A
C
-
G
A
A
14
T
C
-
T
15
C
C
C
A
A
A
C
A
A
A
-
C
A
C
T
C
T
T
A
C
A
A
C
T
A
T
T
C
C
G
-
G
T
T
G
A
C
C
T
-
A
T
G
A
C
G
T
C
C
A
A
A
T
G
A
T
T
A
G
C
T
T
T
G
G
T
C
G
-
T
42
G
-
T
T
A
A
A
A
2
T
-
G
A
A
38
T
C
C
40
3
G
-
-
-
A
T
G
C
T
C
T
-
G
-
G
C
C
T
G
A
C
T
C
-
A
C
T
C
T
A
A
A
T
G
T
T
C
G
G
C
G
A
G
C
G
A
C
A
G
C
T
C
A
G
G
C
A
A
18
G
T
G
-
T
C
C
A
A
-
-
-
-
A
C
G
A
-
-
A
-
-
T
G
4
G
C
A
G
G
G
C
G
A
A
G
G
A
T
A
C
C
A
T
A
A
C
2
G
G
4
T
C
A
-
A
G
A
G
C
C
T
-
-
A
-
-
C
-
-
T
-
A
A
-
A
A
C
A
-
-
-
-
G
-
-
-
T
-
C
A
-
G
-
G
A
-
-
C
-
-
A
-
T
G
G
-
-
-
-
-
G
C
A
C
G
A
-
T
-
-
-
G
T
C
-
-
A
2
T
-
T
G
-
C
G
-
C
A
C
-
-
T
T
-
-
T
G
T
T
-
-
A
T
A
A
C
-
G
A
G
A
G
C
A
3
G
C
G
G
C
A
-
4
A
3
G
C
A
A
C
A
G
T
T
A
A
G
T
G
-
C
32
G
-
C
A
C
T
T
-
T
G
G
C
A
T
T
C
T
A
T
T
C
-
A
C
T
T
C
A
C
3
C
G
-
A
-
T
G
G
G
-
T
C
G
G
C
A
C
A
A
C
34
A
T
C
  32,397,004
  32,397,025
  32,398,487
  32,399,802
  32,400,757
  32,402,375
  32,402,442
  32,402,653
  32,405,141
  32,405,245
  32,405,484
  32,405,524
  32,405,715
  32,405,734
  32,405,737
  32,405,747
  32,405,790
  32,405,804
  32,405,812
  32,405,820
  32,405,831
  32,405,898
  32,406,338
  32,406,391
  32,406,412
  32,406,421
  32,406,445
  32,406,490
  32,406,543
  32,406,548
  32,406,954
  32,409,269
  32,409,378
  32,409,511
  32,409,594
  32,410,632
  32,410,785
  32,410,836
  32,411,383
  32,411,497
  32,411,511
  32,411,516
  32,412,302
  32,412,465
  32,412,845
  32,412,852
  32,412,861
  32,412,863
  32,412,865
  32,412,868
  32,412,880
  32,412,887
  32,413,253
  32,413,451
  32,413,933
  32,415,135
  32,416,107
  32,416,322
  32,416,585
  32,416,707
  32,418,254
  32,418,774
  32,418,877
  32,419,572
  32,419,699
  32,420,622
  32,420,881
  32,420,941
  32,422,679
  32,423,396
  32,424,087
  32,425,518
  32,425,535
  32,426,563
  32,427,486
  32,428,022
  32,428,613
  32,428,702
  32,428,703
  32,429,723
  32,430,885
  32,432,041
  32,432,495
  32,432,592
  32,432,860
  32,433,183
  32,433,500
  32,433,977
  32,434,062
  32,434,105
  32,435,289
  32,435,357
  32,435,929
  32,436,337
  32,436,952
  32,437,799
  32,437,862
  32,438,407
  32,438,505
  32,438,824
  32,439,233
  32,439,360
  32,439,528
  32,440,812
  32,441,098
  32,441,488
  32,441,550
  32,442,747
  32,443,040
  32,443,216
  32,443,361
  32,444,104
  32,445,356
  32,445,483
  32,446,260
  32,446,285
  32,446,554
  32,447,438
  32,447,799
  32,447,854
  32,448,405
  32,448,439
  32,448,501
  32,448,531
  32,448,849
  32,448,925
  32,449,083
  32,449,918
  32,450,325
  32,450,443
  32,450,468
  32,451,059
  32,451,542
  32,451,801
  32,451,820
  32,452,368
  32,452,618
  32,453,151
  32,453,681
  32,454,742
  32,454,833
  32,455,571
  32,455,602
  32,455,691
  32,456,374
  32,456,638
  32,456,729
  32,456,821
  32,456,822
  32,456,836
  32,456,945
  32,457,902
  32,458,205
  32,458,498
  32,459,703
  32,459,843
  32,461,621
  32,461,840
  32,462,221
  32,462,489
  32,463,035
  32,463,390
  32,463,435
  32,463,495
  32,464,438
  32,464,622
  32,466,906
  32,467,018
  32,468,333
  32,469,027
  32,469,466
  32,470,082
  32,470,204
  32,471,563
  32,471,566
  32,471,578
  32,471,926
  32,472,647
  32,472,997
  32,473,693
  32,473,695
  32,473,697
  32,473,708
  32,474,194
  32,474,906
  32,475,814
  32,476,133
  32,476,591
  32,477,244
  32,477,253
  32,477,443
  32,477,542
  32,478,155
  32,479,304
  32,479,606
  32,480,981
  32,481,534
  32,482,326
  32,483,239
  32,483,354
  32,483,424
  32,485,644
  32,486,104
  32,486,547
  32,487,126
  32,487,179
  32,487,830
  32,488,355
  32,488,427
  32,488,950
  32,489,221
  32,490,197
  32,490,526
  32,490,530
  32,490,590
  32,490,671
  32,490,997
  32,491,222
  32,491,284
  32,491,560
  32,492,114
  32,492,397
  32,492,440
  32,492,557
  32,492,979
  32,493,516
  32,493,750
  32,494,131
  32,494,352
  32,494,580
  32,495,375
  32,495,426
  32,495,790
  32,496,047
  32,496,364
  32,496,599
  32,496,700
  32,496,791
  32,497,630
  32,497,872
  32,499,127
  32,499,289
  32,499,312
  32,500,011
  32,500,178
  32,500,224
  32,500,892
  32,502,894
  32,502,896
  32,503,376
  32,503,523
  32,506,031
  32,508,949
  32,510,237
  32,510,575
  32,511,284
  32,512,552
  32,513,943
  32,514,298
  32,514,390
  32,515,906
  32,515,998
  32,518,087
  32,518,324
  32,518,327
  32,519,019
  32,519,057
  32,519,615
  32,519,787
  32,519,789
  32,519,791
  32,519,938
  32,520,001
  32,520,122
  32,520,296
  32,521,785
  32,522,477
  32,522,560
  32,522,606
  32,522,650
  32,523,646
  32,524,086
  32,524,275
  32,525,027
  32,525,898
  32,526,073
  32,526,122
  32,526,306
  32,526,382
  32,526,535
  32,527,117
  32,527,259
  32,527,342
  32,527,900
  32,529,065
  32,529,783
  32,529,980
  32,530,456
  32,530,503
  32,531,087
  32,531,608
  32,531,718
  32,532,684
  32,532,816
  32,533,587
  32,534,132
  32,534,425
  32,534,791
  32,535,234
  32,535,458
  32,535,799
  32,536,051
  32,536,217
  32,536,732
  32,537,169
  32,537,232
  32,537,283
  32,537,703
  32,537,705
  32,537,966
  32,538,111
  32,538,304
  32,538,408
  32,538,709
  32,539,535
  32,539,790
  32,539,928
  32,540,003
  32,540,156
  32,540,324
  32,540,437
  32,540,544
  32,540,969
  32,541,021
  32,541,048
  32,541,099
  32,541,156
  32,541,358
  32,541,692
  32,541,896
  32,541,917
  32,542,095
  32,542,130
  32,542,132
  32,542,140
  32,542,144
  32,542,197
  32,542,239
  32,542,245
  32,542,271
  32,542,746
  32,542,775
  32,542,811
  32,542,812
  32,542,817
  32,544,273
  32,545,038
  32,545,278
  32,546,922
  32,548,601
  32,548,614
  32,548,670
  32,548,697
  32,548,730
  32,548,746
  32,548,754
  32,548,787
  32,548,808
  32,548,812
  32,548,825
  32,548,831
  32,548,836
  32,549,578
  32,551,507
  32,551,844
  32,552,227
  32,552,287
  32,552,289
  32,552,366
  32,552,455
  32,552,957
  32,553,070
  32,553,188
  32,554,182
  32,554,316
  32,554,329
  32,554,473
  32,555,239
  32,555,282
  32,555,438
  32,555,454
  32,555,476
  32,555,508
  32,555,539
  32,555,547
  32,556,205
  32,557,232
  32,557,504
  32,558,081
  32,558,679
  32,558,882
  32,558,947
  32,559,758
  32,559,768
  32,559,960
  32,560,714
  32,560,720
  32,560,724
  32,560,735
  32,560,742
  32,560,816
  32,560,851
  32,560,917
  32,560,927
  32,560,930
  32,560,946
  32,560,954
  32,560,955
  32,560,971
  32,560,985
  32,560,991
  32,561,032
  32,561,038
  32,561,051
  32,561,119
  32,561,526
  32,561,531
  32,561,534
  32,561,558
  32,561,566
  32,561,575
  32,561,580
  32,561,591
  32,561,594
  32,561,635
  32,561,698
  32,561,704
  32,561,712
  32,561,720
  32,561,726
  32,561,733
  32,561,746
  32,561,755
  32,561,756
  32,561,762
  32,561,787
  32,561,788
  32,561,795
  32,561,807
  32,561,818
  32,561,821
  32,561,823
  32,561,826
  32,561,842
  32,561,851
  32,561,893
  32,561,903
  32,561,905
  32,561,908
  32,561,911
  32,561,917
  32,561,925
  32,561,952
  32,561,962
  32,561,986
  32,562,006
  32,562,029
  32,562,039
  32,562,041
  32,562,055
  32,562,072
  32,562,699
  32,562,897
  32,562,901
  32,562,902
  32,562,908
  32,562,914
  32,563,242
  32,563,266
  32,563,284
  32,563,928
  32,564,516
  32,564,804
  32,565,294
  32,565,674
  32,565,762
  32,565,771
  32,566,415
  32,566,439
  32,566,455
  32,566,648
  32,566,840
  32,566,938
  32,566,939
  32,566,940
  32,567,070
  32,567,083
  32,567,355
  32,567,961
  32,568,306
  32,568,318
  32,568,471
  32,568,667
  32,568,895
  32,568,946
  32,569,083
  32,569,235
  32,569,345
  32,569,365
  32,569,909
  32,569,988
  32,570,014
  32,570,137
  32,570,147
  32,570,186
  32,570,455
  32,570,468
  32,570,694
  32,570,775
  32,570,792
  32,571,305
  32,571,566
  32,572,218
  32,572,423
  32,572,985
  32,573,738
  32,573,765
  32,574,323
  32,574,386
  32,574,627
  32,575,075
  32,575,236
  32,575,252
  32,575,357
  32,575,538
  32,591,535
  32,598,387
  32,607,779
  32,608,180
  32,608,181
  32,608,390
  32,608,727
  32,608,930
  32,609,050
  32,609,066
  32,609,287
  32,609,318
  32,609,355
  32,609,357
  32,609,436
  32,609,468
  32,609,480
  32,609,524
  32,609,666
  32,609,677
  32,609,686
  32,609,802
  32,609,853
  32,609,864
  32,609,994
  32,610,019
  32,610,068
  32,610,241
  32,610,369
  32,610,481
  32,610,586
  32,610,592
  32,611,693
  32,611,702
  32,611,705
  32,611,716
  32,611,731
  32,611,735
  32,611,746
  32,611,751
  32,611,755
  32,611,758
  32,611,772
  32,611,799
  32,611,807
  32,612,280
  32,612,304
  32,612,371
  32,612,458
  32,613,322
  32,613,679
  32,614,136
  32,614,231
  32,614,399
G
C
2
G
G
2
-
T
T
C
G
G
C
C
-
G
G
-
C
C
C
C
T
A
A
C
T
T
C
C
C
C
C
G
A
-
T
C
C
-
-
2/-
G
C
-
-
G
T
G
-
-
T
8
2
A
A
C
A
G
48
A
C
T
G
-
T
A
G
A
A
T
G
T
A
A
2
A
G
T
G
G
T
C
G
C
T
-
G
G
-
A
T
C
A
-
C
A
G
T
A
T
G
G
C
T
A
C
A
C
T
T
-
T
A
A
G
C
C
C
A
A
A
A
G
G
T
T
T
T
T
G
G
T
A
T
C
C
-
A
A
G
-
T
-
G
-
T
C
A
A
-
G
T
C
T
G
C
T
C
A
G
A
A
G
T
T
C
T
-
T
A
T
G
T
A
T
A
T
T
A
G
T
3
-
-
-
-
C
T
T
G
-
-
T
T
G
G
G
T
T
T
G
4
T
G
T
C
G
C
C
G
T
G
G
A
C
G
A
C
T
T
A/A
A
A
G
G
A
G
-
T
C
2
T
C
A
-
T
A
G
T
T
G
G
G
C
A
G
C
C
G
C
A
C
C
C
T
C
C
G
A
A
-
-
C
4
C
C
G
T
T
A/T
-
A
2
A
G
G
-
C
T
A
-
-
A
A
A
G
T
C
-
T
C
T
A
A
A
5
A
A
T
A
C
G
T
C
T
4
G
T
C
T
C
G
G
G
C
A
C
G
T
A
C
G
A
G
A
G
A
T
A
C
A
A
C
A
G
A
C
G
G
G
-
-
C
-
A
-
T
T
G
-
C
A
A
C
T
T
A
G
6
A
-
A
C
-
-
-
-
-
-
-
-
A
T
A
T
C
A
A
T
C
G
G
T
T/G
-
T
G
T
-
A
A
-
C
G
G
4
G
A
G
C
T
A
-
C
G
G
A
C
-
2
G
-
G
-
G
C
C
-
-
-
G
G
C
C
-
2
G
T
-
G
-
-
T
-
C
T
-
G
2
-
C
C
C
C
C
T
C
C
C
C
C
C
-
-
-
G
C
G
C
-
C
C
C
-
-
-
C
C
-
-
A
2
G
C
C
-
-
G
-
G
T
12
A
C
C
12
A
A
-
C
-
C
2
G
C
C
G
T
4
A
T
A
G
A
T
C
-
A
T
T
A
T
G
5
-
G
-
C
T
T
G
T
C
A
C
C
G
G
T
C
A
A
-
-
A
T
A
-
G
C
C
2
C
A
A
T
-
-
C
T
C
G
C
C
G
2
G
T
G
C
G
C
G
-
T
A
81
-
G
C
-
T
-
G
C
-
C
-
G
G
A
C
G
T
-
-
C
T