Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 325,061 (bp)   Positions: 573
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.002
.001
.079
--
.021
.068
.171
.462
.004
.056
.12
.002
.001
.001
.002
.356
.003
.001
.0
.004
.0
.012
.948
.99
.02
.777
.773
.77
.754
.704
.0
.006
.001
.0
.021
.0
.0
.018
.998
.0
.001
.003
.009
.0
.002
.001
.0
.0
.002
.002
.002
.003
.0
.004
.012
.0
.0
.001
.001
.002
.0
.003
.0
.016
.051
.01
.025
.001
.005
.003
.001
.003
.0
.007
.01
.003
.058
.0
.0
.0
.0
.002
.004
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.901
.065
.061
.001
.003
.001
.013
.008
.009
.002
.001
.005
.001
.008
.011
.0
.0
.004
.07
.0
.002
.001
.329
.001
.007
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.002
.006
.003
.0
.113
.009
.281
.0
.01
.38
.002
.309
.515
.0
.001
.007
.379
.0
.001
.001
.007
.003
.054
.374
.0
.065
.919
.004
.0
.0
.008
.033
.0
.0
.0
.01
.0
.005
.002
.0
.016
.001
.009
.002
.932
.0
.0
.034
.05
.03
.003
.001
.003
.067
.118
.007
.003
.001
.326
.004
.312
.253
.068
.002
.0
.036
.002
.026
.292
.027
.192
.006
.313
.323
.009
.002
.21
.17
.097
.031
.015
.015
.032
.003
.001
.082
.001
.048
--
--
.042
.002
.119
.003
.03
.0
.001
.032
.088
.221
.01
.105
.006
.004
.051
.0
.033
.001
.332
.001
.006
.124
.022
.025
.032
.01
.004
.038
.039
.003
.0
.104
.002
.001
.002
.017
.002
.003
.076
.128
.05
.004
.002
.001
.002
.006
.005
.011
.008
.003
.252
.002
.005
.03
.005
.002
.144
.014
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.001
.0
.0
.001
.001
.116
.795
.011
.0
.0
.008
.0
.0
.0
.005
.0
.009
.028
.0
.001
.001
.0
.0
.001
.002
.002
--
.169
.025
.126
.006
.015
.004
.105
.057
.36
.904
.943
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.008
.025
.0
.001
.003
.001
.001
.0
.001
.146
.022
.001
.0
.002
.0
.009
.001
.17
.003
.141
.617
.003
.008
.0
.021
.016
.002
.0
.022
.0
.118
.0
.087
.062
.0
.001
.001
.001
.166
.005
.002
.001
.001
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.254
.0
.015
.0
.022
.0
.844
.149
.006
.0
.004
.204
.067
.045
.236
.032
.0
.0
.042
.088
.136
.004
.0
1.0
.995
.001
.0
.003
.996
.0
.013
.004
.0
.021
.004
.031
.066
.054
.014
.051
.005
.004
.0
.998
.0
.002
.006
.007
.0
.011
.005
.202
.027
.003
.027
.003
.001
.01
.001
.0
.019
.019
.003
.008
.01
.021
.15
--
.0
.0
.011
.005
.0
.0
.009
.001
.001
.0
.056
.047
.034
.004
.799
.724
.003
.008
.001
.042
.027
.0
.001
.0
.0
.014
.001
.05
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.051
.0
.003
.025
.0
.024
.011
.017
.001
.019
.024
.82
.767
.049
.144
.0
.001
.676
.002
.015
.0
.001
.015
.0
.006
.001
.0
.0
.016
.021
.2
.004
.001
.128
.0
.003
.0
.0
.077
.005
.48
.095
.0
.994
.046
.0
.019
.0
.024
.951
.621
.107
.086
.002
.009
.007
.003
.001
.462
.0
.0
.013
.044
.001
.012
.001
.001
.208
.003
.0
.058
.115
.015
.002
.0
.017
.017
.004
.008
.0
.001
.0
.042
.004
.0
1.0
.0
.097
.013
.002
.202
.008
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
Xylt1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
G
T
-
T
T
A
T
G
T
G
A
G
C
A
G
T
A
C
G
G
T
G
A
A
A
-
C
G
T
C
4
A
C
C
C
C
T
G
T
-
G
T
-
2
T
C
C
2
G
-
A
C
G
-
C
T
C
-
C
4
C
-
-
-
T
C
G
C
T
T
A
G
G
T
T
C
C
T
G
C
A
A
T
C
G
G
A
C
C
G
C
T
G
T
T
G
G
A
G
A
A
A
G
T
-
C
A
T
G
-
A
G
T
A
G
A
T
T
A
-
-
-
G
C
-
A
G
A
A
-
A
C
9
C
T
A
G
A
C
T
C
T
A
-
A
A
C
C
G
A
G
G
9
-
G
C
C
G
T
A
A
A
T
A
A
A
A
T
-
C
G
T
A
T
C
T
-
G
G
G
G
C
G
A
-
A
A
-
G
C
T
C
C
T
T
A
T
A
6
A
20
G
C
2
2
G
2
4
G
5
-
2
T
15
C
C
49
G
-
A
A
T
A
C
T
T
A
-
C
T
T
A
A
C
G
G
G
A
A
-
G
T
T
-
A
C
C
C
T
G
T
C
T
G
T
T
C
C
3
G
C
A
G
C
C
-
2
A
-
T
C
A
T
G
G
T
G
C
3
A
A
T
T
A
G
C
T
G
A
C
C
G
C
C
C
A
C
G
G
T
A
C
A
-
C
G
T
A
C
C
G
4
C
C
C
A
G
T
G
G
C
A
T
T
G
A
T
T
T
T
T
C
G
A
A
A
A
T
G
T
T
A
C
A
A
A
T
T
T
A
A
C
G
A
G
A
C
A
T
G
A
T
-
A
T
G
C
6
-
T
A
2
T
C
C
G
A
A
A
C
-
G
C
T
-
A
-
C
G
A
A
A
-
G
T
T
-
T
C
G
A
T
A
G
A
A
C
A
-
T
T
C
T
T
G
A
A
A
A
T
C
A
A
A
-
G
G
G
G
G
G
A
G
A
T
-
C
4
-
T
C
-
4
A
G
4
C
C
T
C
C
-
C
A
G
G
G
G
C
G
T
A
-
C
A
G
-
A
G
C
A
G
G
G
G
G
G
T
A
G
T
G
G
A
C
G
14
C
A
A
G
A
C
A
C
2
T
-
A
T
C
C
T
C
G
G
G
C
-
A
12
C
C
T
A
T
G
A
G
A
C
-
A
-
G
C
C
C
T
T
G
-
C
A
A
G
C
G
C
T
A
T
G
A
C
A
C
G
G
A
G
G
A
G
C
6
G
T
A
C
A
-
T
G
G
T
A
G
-
G
G
  186,940,321
  186,940,351
  186,940,435
  186,940,712
  186,940,903
  186,941,022
  186,941,299
  186,941,595
  186,941,631
  186,941,769
  186,941,807
  186,941,876
  186,942,178
  186,942,243
  186,942,377
  186,942,485
  186,944,007
  186,944,413
  186,945,047
  186,945,291
  186,945,930
  186,946,474
  186,946,696
  186,946,818
  186,947,052
  186,947,954
  186,948,112
  186,948,115
  186,948,116
  186,948,119
  186,948,638
  186,949,267
  186,949,429
  186,950,252
  186,950,291
  186,950,855
  186,950,994
  186,951,146
  186,952,045
  186,953,269
  186,953,733
  186,953,735
  186,953,737
  186,953,754
  186,953,761
  186,953,795
  186,953,804
  186,953,806
  186,953,808
  186,953,813
  186,953,816
  186,953,821
  186,953,824
  186,953,834
  186,953,839
  186,953,848
  186,953,855
  186,953,863
  186,953,896
  186,953,900
  186,953,902
  186,953,906
  186,953,912
  186,953,917
  186,953,929
  186,953,935
  186,954,078
  186,954,141
  186,954,380
  186,954,384
  186,954,419
  186,954,428
  186,954,477
  186,954,761
  186,955,486
  186,956,086
  186,956,768
  186,956,857
  186,957,442
  186,959,093
  186,959,206
  186,959,700
  186,959,870
  186,959,879
  186,960,120
  186,960,410
  186,960,415
  186,960,481
  186,960,534
  186,960,540
  186,960,548
  186,960,553
  186,960,789
  186,960,795
  186,960,797
  186,960,799
  186,960,809
  186,960,859
  186,960,870
  186,961,320
  186,961,986
  186,962,828
  186,962,881
  186,963,488
  186,963,489
  186,963,507
  186,963,706
  186,963,887
  186,964,159
  186,964,901
  186,965,461
  186,977,614
  187,011,933
  187,011,943
  187,014,130
  187,014,140
  187,014,155
  187,014,191
  187,014,215
  187,014,311
  187,014,352
  187,014,361
  187,014,466
  187,014,477
  187,014,509
  187,014,558
  187,014,564
  187,014,569
  187,014,683
  187,014,685
  187,014,809
  187,014,833
  187,016,109
  187,016,353
  187,016,627
  187,016,936
  187,017,075
  187,018,184
  187,018,216
  187,018,499
  187,018,665
  187,020,362
  187,020,699
  187,021,266
  187,021,773
  187,022,598
  187,023,161
  187,025,008
  187,025,369
  187,025,770
  187,025,983
  187,025,990
  187,026,841
  187,026,945
  187,027,010
  187,027,499
  187,027,792
  187,030,313
  187,030,962
  187,030,965
  187,031,873
  187,031,888
  187,032,262
  187,032,656
  187,033,288
  187,033,841
  187,033,921
  187,034,039
  187,034,965
  187,035,100
  187,035,288
  187,035,308
  187,036,940
  187,036,979
  187,037,493
  187,037,719
  187,037,874
  187,038,450
  187,039,232
  187,039,256
  187,039,659
  187,040,181
  187,040,194
  187,040,240
  187,040,499
  187,041,560
  187,041,782
  187,041,852
  187,042,383
  187,042,599
  187,043,128
  187,043,389
  187,043,990
  187,044,192
  187,044,200
  187,044,240
  187,044,526
  187,044,555
  187,044,669
  187,045,760
  187,046,349
  187,046,469
  187,047,409
  187,047,433
  187,048,087
  187,048,517
  187,048,575
  187,048,589
  187,048,604
  187,048,636
  187,048,656
  187,048,661
  187,048,701
  187,048,705
  187,048,826
  187,048,918
  187,050,054
  187,050,123
  187,051,023
  187,051,219
  187,052,157
  187,052,570
  187,053,664
  187,054,169
  187,054,857
  187,055,227
  187,055,920
  187,056,072
  187,056,122
  187,057,325
  187,057,483
  187,057,642
  187,057,790
  187,057,818
  187,058,770
  187,059,032
  187,059,201
  187,059,923
  187,060,511
  187,060,758
  187,060,788
  187,061,061
  187,061,229
  187,061,253
  187,062,526
  187,063,448
  187,063,539
  187,063,616
  187,063,622
  187,063,771
  187,064,008
  187,064,339
  187,064,561
  187,064,659
  187,064,774
  187,064,804
  187,064,824
  187,064,827
  187,064,856
  187,064,866
  187,064,879
  187,064,889
  187,064,892
  187,064,894
  187,064,898
  187,064,902
  187,064,920
  187,064,933
  187,064,935
  187,065,404
  187,065,652
  187,066,662
  187,067,131
  187,067,214
  187,067,267
  187,067,415
  187,067,843
  187,068,429
  187,068,570
  187,068,639
  187,068,680
  187,068,929
  187,068,987
  187,068,988
  187,069,305
  187,069,316
  187,069,321
  187,069,371
  187,069,492
  187,069,508
  187,069,602
  187,069,652
  187,069,953
  187,070,025
  187,070,253
  187,070,733
  187,070,803
  187,070,886
  187,071,086
  187,071,178
  187,071,326
  187,071,659
  187,072,322
  187,072,690
  187,072,888
  187,073,069
  187,073,548
  187,073,634
  187,073,704
  187,073,736
  187,073,919
  187,074,140
  187,078,563
  187,078,822
  187,078,955
  187,079,028
  187,079,347
  187,079,353
  187,079,380
  187,079,408
  187,079,471
  187,079,473
  187,079,591
  187,079,592
  187,079,652
  187,079,866
  187,080,148
  187,080,232
  187,080,234
  187,080,237
  187,080,418
  187,080,460
  187,080,819
  187,080,839
  187,081,545
  187,082,075
  187,082,446
  187,082,585
  187,084,245
  187,085,628
  187,085,693
  187,085,977
  187,086,545
  187,086,622
  187,088,004
  187,088,479
  187,089,737
  187,090,052
  187,090,099
  187,090,751
  187,092,125
  187,092,848
  187,093,546
  187,094,111
  187,094,334
  187,094,419
  187,094,993
  187,095,231
  187,099,565
  187,099,953
  187,100,070
  187,100,349
  187,100,887
  187,101,584
  187,102,226
  187,102,236
  187,102,381
  187,102,382
  187,103,187
  187,103,329
  187,103,409
  187,103,422
  187,103,524
  187,103,708
  187,103,943
  187,104,060
  187,104,919
  187,104,949
  187,106,754
  187,109,508
  187,116,388
  187,119,249
  187,120,401
  187,120,420
  187,121,187
  187,121,677
  187,122,123
  187,122,505
  187,123,884
  187,127,495
  187,131,931
  187,132,106
  187,132,348
  187,132,388
  187,132,518
  187,133,421
  187,133,458
  187,133,961
  187,133,981
  187,134,840
  187,135,401
  187,135,823
  187,136,740
  187,136,809
  187,136,910
  187,137,143
  187,140,007
  187,141,959
  187,142,248
  187,142,703
  187,142,915
  187,145,462
  187,145,480
  187,146,689
  187,147,507
  187,147,632
  187,148,819
  187,148,854
  187,150,224
  187,150,530
  187,151,242
  187,151,843
  187,151,985
  187,152,337
  187,153,713
  187,154,002
  187,154,005
  187,154,344
  187,154,948
  187,155,019
  187,155,062
  187,155,087
  187,155,754
  187,155,914
  187,157,244
  187,157,648
  187,157,817
  187,159,369
  187,161,099
  187,162,440
  187,164,693
  187,164,906
  187,169,514
  187,169,520
  187,173,086
  187,185,322
  187,189,387
  187,190,056
  187,199,345
  187,199,385
  187,199,982
  187,200,347
  187,200,568
  187,201,302
  187,201,746
  187,202,251
  187,203,059
  187,203,283
  187,203,286
  187,203,289
  187,204,532
  187,204,869
  187,204,900
  187,205,863
  187,206,074
  187,206,221
  187,206,846
  187,207,056
  187,207,570
  187,207,581
  187,208,483
  187,209,244
  187,210,645
  187,211,252
  187,211,810
  187,212,365
  187,212,454
  187,212,619
  187,212,780
  187,212,902
  187,213,101
  187,213,908
  187,213,948
  187,214,179
  187,214,899
  187,215,493
  187,216,678
  187,218,228
  187,218,940
  187,219,848
  187,220,290
  187,220,291
  187,220,588
  187,220,705
  187,220,729
  187,225,747
  187,225,769
  187,225,779
  187,225,799
  187,225,893
  187,225,929
  187,226,438
  187,228,463
  187,228,845
  187,228,988
  187,229,227
  187,229,346
  187,229,359
  187,229,449
  187,229,787
  187,229,802
  187,230,253
  187,230,530
  187,231,853
  187,232,047
  187,232,140
  187,232,235
  187,232,789
  187,232,871
  187,233,400
  187,233,595
  187,233,941
  187,234,365
  187,234,620
  187,234,687
  187,235,205
  187,235,693
  187,235,776
  187,235,847
  187,235,916
  187,236,025
  187,236,061
  187,236,293
  187,236,507
  187,236,659
  187,236,808
  187,236,851
  187,236,966
  187,237,066
  187,237,131
  187,237,216
  187,237,295
  187,238,019
  187,238,103
  187,238,177
  187,239,370
  187,239,416
  187,239,459
  187,240,177
  187,240,855
  187,241,123
  187,241,515
  187,242,056
  187,243,929
  187,244,440
  187,245,202
  187,248,906
  187,248,910
  187,248,917
  187,248,921
  187,252,494
  187,254,487
  187,256,333
  187,256,936
  187,259,024
  187,259,735
  187,261,545
  187,261,776
  187,262,025
  187,262,893
  187,262,904
  187,264,076
  187,264,686
G
T
A
A
A
A
C
G
C
A
G
A
T
A
A
C
A
C
G
T
T
A
C
A
G
T
-
A
T
T
G
T
-
G
T
G
T
T
G
A
G
A
T
-
T
-
C
T
T
-
T
C
-
-
-
2
-
-
-
G
-
-
-
A
C
6
A
A
A
T
C
C
G
T
A
C
C
T
T
G
T
G
G
T
C
T
A
A
C
A
T
A
T
G
A
C
C
A
A
G
A
G
G
C
A
G
T
A
G
-
-
T
T
T
-
-
-
-
-
-
-
A
T
C
-
-
T
-
A
-
-
23
T
T
-
A
G
G
A
G
G
C
G
C
G
T
G
G
T
T
T
G
A
A
-
A
T
G
T
A
C
G
G
-
C
G
G
G
T
G
2
A
A
C
G
C
T
C
C
A
T
-
-
T
A
G
2
G
G
7
-
G
C
T
G
-
A
G
C
G
-
G
-
A
T
-
-
-
-
-
-
5/-
G
-
C
-
A
T
-
A
2
C
T
C
G
T
C
C
G
A
G
C
C
G
G
T
A
A
A
T
G
2
A
A
C
7
C
T
T
T
C
A
C
T
C
A
-
-
A
-
-
T
T
T
T
T
T
TT/G
-
C
2
C
A
G
C
A
A
C
A
G
-
G
G
C
C
T
C
T
A
A
C
T
A
T
A
T
G
G
T
A
C
-
G
T
G
G
T
C
C
G
T
T
A
-
T
T
T
G
A
-
T
A
G
G
A
C
C
G
C
G
G
G
C
G
A
C
T
G
G
C
A
C
C
G
A
G
G
G
C
C
G
G
G
A
A
G
A
G
T
G
C
T
G
C
T
G
C
A
T
-
11
C
G
-
C
T
A
A
G
G
G
G
2
A
T
G
2
T
T
T
A
T
C
-
5
A
C
G
A
C
A
T
C
C
C
A
G
G
T
G
C
-
G
G
C
C
T
G
G
G
G
C
A
G
T
G
T
A
T
A
A
A
A
T
T
G
-
14
T
-
T
A
T
C
-
G
A
-
T
A
A
T
T
3
T
-
T
A
A
A
T
A
C
T
A
T
G
A
2
G
T
A
G
C
A
A
A
A
A
C
G
A
C
A
A
T
A
T
-
T
G
G
T
G
T
-
-
-
-
T
G
C
T
T
C
T
A
A
A
T
T
G
-
T
T
C
G
C
T
G
A
-
T
T
G
6
A
T
T
T
C
C
A
C
T
G
G
C
A
A
T
C
G
C
A
C
G
G
A
A
A
-
T
-
G
A
A
-
-
A
G
G
T
2
G
A
A
C
C
A
C
A
C