Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 252,968 (bp)   Positions: 481
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.013
.0
.0
.005
.027
.0
.009
.02
.089
.307
.0
.619
.546
.017
.012
.0
.039
.039
.011
.061
.007
.0
.0
.048
.077
.267
.001
.001
.0
.002
.002
.001
.004
.0
.001
.0
.003
--
.005
.003
.001
.07
.0
.213
.002
.0
.0
.619
.0
.0
.871
.0
.021
.001
.06
.0
.004
.013
.003
.0
.001
.0
.0
.001
.074
.052
.009
.007
.029
.001
.124
.368
.012
.006
--
.001
.012
.005
.01
.001
.003
.002
.004
.286
.042
.0
.225
.0
.001
.002
.031
.005
.001
.025
.282
.036
.002
.001
.0
.001
.002
.002
.04
.47
.0
.001
.063
.013
.525
.459
.003
.0
.011
.001
.002
.022
.002
.002
.002
.027
.001
.001
.009
.055
.198
.0
.019
.001
.002
.006
.002
--
--
--
.766
--
.003
.172
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.002
.865
.0
.002
.001
.0
.109
.001
.06
.001
.053
.024
.007
.011
.004
.013
.0
.002
.001
.001
.002
.0
.0
.016
.0
.001
.0
.004
.014
.002
.002
.02
.001
.001
.334
--
--
--
--
--
.088
.04
.021
.001
.015
.0
.0
.0
.0
.011
.011
.001
.001
--
--
--
--
--
--
.001
.946
.028
.002
.0
.0
--
.018
.012
.021
.148
.021
.001
.006
.003
.001
.019
.006
.0
.015
.004
.003
.001
.084
.028
.3
.835
.058
.008
.264
.045
.088
.143
.111
.006
.009
.004
.003
.054
.005
.002
.002
.0
.005
.0
.367
.013
.019
.0
.001
.0
.155
.007
.048
--
--
--
.19
.004
.004
.001
.003
.004
.001
.001
.205
.095
.001
.005
.0
.016
--
--
--
--
--
--
--
.003
.018
.002
.001
.007
.001
.001
.001
.007
.047
.005
.0
.012
.135
.001
.003
.036
.031
.002
--
--
--
--
.01
--
.001
.785
.001
.003
.0
.014
.114
.0
--
.001
.004
.004
.0
.0
.0
.013
.01
.994
.0
.0
.0
.003
.0
--
.051
.004
.004
.025
.173
--
--
--
.073
.025
.0
.858
.004
--
.033
.0
.0
.006
.014
.004
.0
.01
.005
.001
.001
.183
.001
.0
.003
.001
.004
1.0
.815
.773
.004
.001
.032
.0
.003
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.001
.002
.003
.003
.008
.002
.0
.016
.034
.006
.001
.002
.0
.015
.007
.003
.01
.006
.011
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.248
.001
.003
.517
.004
.001
.0
.014
.012
.996
.002
.287
.037
.113
.992
.866
.988
.911
--
.0
.291
.018
.0
.873
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108350153
LOC108350153
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
Xrcc4
A
G
A
G
T
T
G
T
A
T
C
T
T
C
G
A
A
G
A
G
A
C
A
T
T
C
T
C
C
G
A
G
T
G
A
C
G
T
A
G
G
C
C
A
G
T
G
C
T
C
A
G
C
T
T
C
T
C
C
G
G
C
T
T
G
C
T
G
T
C
G
A
G
G
G
A
G
T
G
C
C
C
G
T
T
T
C
C
C
T
A
T
C
T
G
T
T
T
A
T
C
G
C
G
A
G
T
C
A
T
T
C
T
G
A
T
C
G
G
C
C
T
C
G
A
C
C
C
T
A
G
C
C
G
G
A
G
A
C
A
G
T
T
A
G
C
T
G
G
G
C
A
G
A
C
C
T
G
C
G
G
G
T
C
G
C
C
G
G
C
G
T
C
G
A
A
G
G
A
T
A
T
A
C
C
C
T
T
G
C
T
C
A
A
T
C
A
T
T
A
T
A
A
G
G
C
G
T
G
A
A
T
G
G
A
G
T
T
C
G
G
C
G
C
A
T
C
A
A
G
T
C
A
T
C
G
T
T
A
G
T
A
T
T
G
T
C
G
C
C
T
G
G
A
A
A
T
T
A
C
C
A
G
A
T
C
T
A
T
A
T
A
G
C
T
G
T
A
A
A
G
T
T
T
A
A
A
G
A
T
T
C
A
A
C
T
G
A
C
C
G
G
A
T
C
T
C
A
C
A
C
A
G
C
T
A
T
C
G
A
C
A
A
C
T
G
T
C
T
T
A
T
T
A
G
C
T
T
G
C
C
A
T
T
T
T
C
A
T
T
A
G
A
T
C
G
T
C
C
C
A
G
A
A
T
A
A
C
A
C
C
G
A
C
T
T
G
T
T
G
T
G
T
T
C
C
C
C
G
G
G
T
G
A
G
T
G
G
A
T
A
A
C
C
T
T
T
A
A
G
A
A
T
T
T
C
T
C
C
A
C
A
A
G
A
C
A
T
C
T
C
A
T
C
A
G
A
C
A
C
T
C
G
C
T
A
G
A
A
G
C
A
G
G
T
C
G
A
T
A
C
T
G
G
T
G
T
T
G
C
G
G
C
T
C
A
G
A
T
G
G
  18,674,635
  18,674,912
  18,675,034
  18,675,165
  18,675,535
  18,675,803
  18,675,939
  18,676,703
  18,677,000
  18,677,131
  18,677,247
  18,677,439
  18,677,706
  18,677,707
  18,677,770
  18,677,861
  18,679,338
  18,679,416
  18,679,724
  18,680,223
  18,680,315
  18,680,402
  18,680,503
  18,680,743
  18,680,964
  18,682,313
  18,682,332
  18,682,718
  18,682,942
  18,683,050
  18,683,125
  18,683,803
  18,683,857
  18,683,887
  18,684,082
  18,684,345
  18,684,390
  18,687,550
  18,689,052
  18,692,722
  18,692,743
  18,693,657
  18,693,742
  18,693,803
  18,694,573
  18,697,378
  18,697,512
  18,697,687
  18,699,369
  18,699,416
  18,699,685
  18,700,345
  18,700,367
  18,700,416
  18,700,885
  18,701,042
  18,701,389
  18,704,429
  18,705,639
  18,706,373
  18,707,138
  18,707,287
  18,707,456
  18,708,016
  18,708,541
  18,708,744
  18,710,310
  18,710,456
  18,710,457
  18,710,649
  18,710,988
  18,711,279
  18,711,301
  18,711,382
  18,711,416
  18,711,565
  18,712,128
  18,712,258
  18,712,283
  18,712,792
  18,712,870
  18,713,078
  18,714,128
  18,715,359
  18,715,382
  18,715,545
  18,716,322
  18,716,626
  18,717,190
  18,717,194
  18,717,468
  18,717,775
  18,718,631
  18,719,087
  18,719,249
  18,720,941
  18,721,297
  18,721,478
  18,721,651
  18,722,308
  18,722,424
  18,722,710
  18,722,766
  18,723,441
  18,723,624
  18,723,901
  18,723,914
  18,724,207
  18,724,430
  18,724,642
  18,724,888
  18,725,009
  18,725,265
  18,725,430
  18,725,461
  18,725,607
  18,725,820
  18,727,208
  18,727,568
  18,727,575
  18,727,925
  18,727,940
  18,728,173
  18,728,681
  18,728,939
  18,728,981
  18,729,186
  18,729,316
  18,729,320
  18,729,343
  18,730,032
  18,730,084
  18,730,234
  18,730,346
  18,730,361
  18,731,113
  18,731,688
  18,732,790
  18,733,511
  18,733,920
  18,734,491
  18,738,849
  18,739,243
  18,739,331
  18,740,128
  18,740,353
  18,740,367
  18,741,100
  18,741,108
  18,741,180
  18,743,584
  18,744,096
  18,744,507
  18,745,041
  18,754,125
  18,754,396
  18,754,615
  18,754,659
  18,754,735
  18,754,802
  18,755,051
  18,755,173
  18,756,230
  18,756,834
  18,757,525
  18,758,351
  18,758,356
  18,758,402
  18,758,580
  18,758,737
  18,758,945
  18,759,252
  18,759,545
  18,760,594
  18,760,630
  18,761,295
  18,761,479
  18,761,709
  18,762,159
  18,762,810
  18,763,050
  18,763,417
  18,763,613
  18,764,569
  18,764,594
  18,765,297
  18,765,655
  18,765,820
  18,766,407
  18,766,429
  18,766,473
  18,767,356
  18,767,368
  18,767,383
  18,768,287
  18,768,361
  18,768,473
  18,768,513
  18,769,008
  18,769,460
  18,769,527
  18,769,658
  18,769,774
  18,769,801
  18,769,871
  18,769,988
  18,770,181
  18,770,883
  18,771,025
  18,771,120
  18,771,179
  18,771,506
  18,771,535
  18,771,601
  18,772,077
  18,772,376
  18,772,414
  18,772,996
  18,773,045
  18,773,670
  18,773,698
  18,774,601
  18,774,674
  18,775,331
  18,775,462
  18,775,501
  18,775,684
  18,775,916
  18,776,302
  18,776,581
  18,777,064
  18,777,613
  18,777,807
  18,777,815
  18,777,902
  18,778,178
  18,778,374
  18,778,530
  18,778,820
  18,778,878
  18,778,898
  18,778,940
  18,778,994
  18,779,066
  18,779,235
  18,779,383
  18,779,588
  18,779,592
  18,779,611
  18,779,632
  18,779,645
  18,779,722
  18,779,774
  18,779,784
  18,780,051
  18,780,248
  18,780,329
  18,780,661
  18,781,219
  18,781,940
  18,782,274
  18,784,146
  18,784,417
  18,784,437
  18,786,563
  18,786,758
  18,786,922
  18,787,081
  18,788,963
  18,789,284
  18,791,224
  18,791,458
  18,792,690
  18,792,809
  18,794,103
  18,794,215
  18,795,012
  18,795,243
  18,797,984
  18,798,037
  18,798,432
  18,800,015
  18,800,176
  18,800,942
  18,801,349
  18,804,013
  18,804,415
  18,804,500
  18,805,175
  18,805,467
  18,805,493
  18,806,009
  18,806,285
  18,808,572
  18,808,983
  18,809,149
  18,809,256
  18,809,436
  18,810,017
  18,814,546
  18,814,555
  18,814,713
  18,814,722
  18,815,865
  18,816,659
  18,816,854
  18,816,914
  18,817,013
  18,817,631
  18,818,418
  18,824,969
  18,825,345
  18,825,808
  18,830,624
  18,830,665
  18,832,002
  18,832,761
  18,832,881
  18,835,495
  18,835,639
  18,835,775
  18,836,752
  18,837,032
  18,837,156
  18,837,243
  18,838,122
  18,838,478
  18,838,722
  18,838,834
  18,839,847
  18,840,019
  18,840,232
  18,840,256
  18,840,696
  18,841,642
  18,841,881
  18,841,910
  18,842,349
  18,842,490
  18,842,567
  18,842,788
  18,842,877
  18,842,969
  18,843,679
  18,844,501
  18,844,804
  18,845,628
  18,847,475
  18,867,787
  18,868,958
  18,869,495
  18,869,766
  18,870,213
  18,870,242
  18,871,643
  18,872,104
  18,874,130
  18,874,150
  18,876,296
  18,876,418
  18,876,700
  18,876,933
  18,876,949
  18,877,268
  18,878,003
  18,880,361
  18,881,231
  18,881,871
  18,882,388
  18,882,914
  18,883,772
  18,884,236
  18,884,697
  18,884,906
  18,885,469
  18,885,526
  18,885,675
  18,885,895
  18,886,642
  18,886,679
  18,886,801
  18,886,903
  18,887,060
  18,887,336
  18,887,768
  18,888,069
  18,888,084
  18,888,126
  18,888,221
  18,888,285
  18,888,349
  18,888,521
  18,888,573
  18,888,759
  18,888,771
  18,888,826
  18,888,872
  18,888,902
  18,889,136
  18,889,247
  18,889,269
  18,889,332
  18,889,430
  18,889,504
  18,890,226
  18,890,667
  18,892,086
  18,892,523
  18,894,004
  18,894,777
  18,894,966
  18,895,335
  18,895,433
  18,895,729
  18,895,914
  18,896,048
  18,896,269
  18,896,300
  18,896,392
  18,897,225
  18,897,284
  18,897,308
  18,897,414
  18,897,494
  18,898,604
  18,898,867
  18,899,124
  18,899,211
  18,899,667
  18,899,851
  18,900,255
  18,900,350
  18,902,047
  18,902,270
  18,902,378
  18,902,781
  18,902,945
  18,902,964
  18,903,662
  18,904,035
  18,904,126
  18,904,705
  18,905,590
  18,905,752
  18,905,980
  18,906,021
  18,906,216
  18,907,918
  18,908,005
  18,908,205
  18,908,293
  18,909,236
  18,909,675
  18,909,900
  18,909,976
  18,910,771
  18,911,909
  18,912,355
  18,912,378
  18,912,544
  18,913,180
  18,913,421
  18,913,477
  18,913,640
  18,913,680
  18,914,285
  18,914,569
  18,915,177
  18,915,461
  18,915,657
  18,915,764
  18,915,878
  18,916,056
  18,916,197
  18,916,689
  18,918,720
  18,922,289
  18,923,285
  18,924,858
  18,925,095
  18,927,420
G
A
G
A
C
G
T
A
C
C
T
C
C
G
A
G
C
T
C
A
T
G
G
C
C
T
C
T
T
T
C
A
C
T
G
T
A
A
C
C
A
G
T
C
A
C
T
T
C
T
C
A
T
C
A
T
G
T
T
A
A
T
C
C
T
T
C
A
A
T
A
G
A
A
C
G
A
G
T
T
T
T
A
C
C
C
T
A
A
G
G
C
T
C
T
C
C
C
G
C
A
A
T
A
G
A
C
T
G
C
C
A
C
A
G
C
G
A
T
T
A
G
T
A
C
G
T
T
G
G
A
T
T
A
A
G
A
G
T
C
A
G
C
G
C
A
A
A
A
T
G
G
C
C
T
A
A
A
G
C
A
A
C
G
A
T
T
A
A
T
C
C
T
T
G
G
A
T
G
C
G
A
G
T
T
A
C
A
T
T
A
T
T
T
A
T
G
C
C
G
C
G
C
A
A
T
T
C
T
G
G
C
T
C
C
A
G
C
A
A
A
T
T
T
C
C
T
G
G
A
C
T
G
C
A
A
C
C
G
A
C
G
C
C
T
C
G
C
G
G
G
A
C
C
C
G
C
A
G
A
T
T
T
T
G
T
C
G
C
G
C
T
C
T
C
T
G
G
C
C
A
C
C
A
T
G
G
T
G
C
C
A
T
G
T
G
C
C
A
A
A
A
G
C
A
C
T
G
T
C
T
G
A
A
C
G
C
T
T
T
T
G
G
T
G
A
G
G
G
A
G
A
C
G
A
G
G
C
A
T
T
G
G
C
A
C
T
G
C
C
G
A
G
A
T
A
C
A
T
A
G
A
G
T
C
G
G
A
T
T
G
T
C
T
C
C
C
G
C
C
C
A
C
G
T
T
T
T
T
A
T
C
T
C
T
C
A
T
T
G
T
C
T
A
G
C
A
C
G
A
G
G
C
C
A
T
G
A
G
G
T
G
G
A
G
T
T
C
T
G
T
G
C
T
G
C
T
G
G
A
C
T
A
T
G
G
C
C
G
A
T
C
T
A
C
G
A
C
C
T
T
C
T
A
C
A
C
G
C
T
A
A
A
C
T
G
A
T
G
A
T