Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 365,553 (bp)   Positions: 438
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.017
.042
.026
.058
--
--
.001
.003
.012
.006
.009
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.069
.021
--
.74
.081
.096
.417
.228
.106
.237
.012
.093
.056
.005
.349
.215
.056
.014
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.467
.018
.001
.0
.007
.009
.013
--
--
--
--
--
--
--
.015
.019
.005
.194
.038
.353
.23
.002
.0
.01
.001
.037
.079
.39
.06
.13
.007
.021
--
--
--
.224
.031
.001
.001
.188
.036
.332
.009
.001
.204
.008
.9
--
.0
.035
.001
.139
.011
.001
.01
--
--
--
.001
.334
.006
.028
.005
.132
--
--
--
--
--
.007
.592
.008
.999
.995
.732
.0
.813
.0
.001
.093
.0
.001
.0
.003
.014
.113
.004
--
.0
.007
.008
.001
.004
.601
.0
.001
.0
.004
.016
.195
.015
.605
1.0
.116
.883
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.027
.606
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.0
.006
.003
.0
.016
.002
--
.022
.096
.053
.002
.027
.007
.034
.035
.099
.84
.009
.0
.017
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
.0
--
--
--
.0
.0
.919
.994
.004
.065
.004
.005
.0
.001
.001
.0
.001
.138
.003
.086
.005
.003
.001
.003
.016
--
--
--
--
--
--
--
.005
.063
.008
.007
.006
.005
.004
.001
.0
.001
.069
.0
--
--
--
--
.02
.004
.001
.951
.998
.993
.011
.004
.001
.001
.0
.085
.082
.059
.002
.14
.163
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.004
.036
.125
.001
.381
--
--
--
--
.163
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.211
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.372
.093
.018
.01
.156
.001
.011
--
--
--
.015
.008
.027
.023
.225
.095
.058
.045
--
.013
.235
.82
.017
.014
.001
.0
.0
.043
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
.28
.008
.178
.004
.001
.031
.026
.002
.05
.052
.002
.016
.133
.004
--
.001
.922
.001
.026
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.07
--
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
Wdpcp
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
C
G
A
C
C
A
C
C
C
A
C
T
T
C
T
G
C
A
A
T
C
G
G
A
C
A
G
A
A
G
G
G
A
G
C
T
C
C
T
G
T
A
T
A
G
A
G
T
T
G
T
A
T
C
C
G
A
G
G
G
C
C
T
A
G
G
C
T
C
G
T
C
T
A
A
C
T
G
T
C
C
A
T
T
T
T
G
C
A
A
A
A
A
A
C
T
G
T
C
A
G
A
A
C
C
T
T
A
A
C
G
C
T
C
T
G
G
G
G
G
A
C
G
T
T
T
T
G
T
T
T
G
G
A
C
G
G
T
T
C
G
G
C
C
G
C
C
C
C
G
G
T
T
C
C
C
A
T
C
G
A
C
G
T
G
A
C
T
A
T
G
A
G
A
G
A
T
A
A
A
C
A
A
A
A
G
C
C
T
A
A
C
A
G
C
G
A
A
G
A
G
G
G
C
C
A
A
C
C
A
G
C
A
A
G
G
A
G
G
G
T
A
C
C
G
T
G
G
G
C
T
G
C
A
A
A
C
T
G
G
A
T
A
T
G
T
T
G
T
G
A
C
T
C
C
G
A
T
A
A
C
T
G
T
A
C
T
A
A
T
G
C
A
A
A
T
A
A
C
C
C
T
T
T
T
G
T
G
C
C
G
A
T
G
T
T
T
C
T
C
A
G
C
T
T
A
T
T
C
T
T
A
T
C
T
G
C
A
C
A
T
T
C
T
A
T
A
A
A
T
T
G
C
G
A
C
C
C
T
C
T
G
C
T
T
C
C
G
C
C
C
T
G
T
C
C
G
C
C
A
G
T
A
A
G
C
G
A
T
C
C
A
G
T
A
A
G
T
G
T
C
T
G
A
T
G
T
A
T
A
C
T
T
T
G
C
A
C
G
T
C
A
G
A
T
C
C
G
A
G
G
C
G
G
T
A
A
C
A
C
C
G
G
G
G
C
A
T
C
G
T
A
G
T
C
C
  106,394,546
  106,395,524
  106,398,441
  106,399,307
  106,399,830
  106,400,117
  106,400,695
  106,400,875
  106,401,492
  106,401,529
  106,401,581
  106,401,881
  106,402,565
  106,402,973
  106,403,487
  106,403,581
  106,405,189
  106,405,199
  106,405,317
  106,405,423
  106,405,530
  106,405,569
  106,405,713
  106,405,719
  106,406,401
  106,406,402
  106,406,513
  106,406,766
  106,406,795
  106,406,852
  106,407,165
  106,407,329
  106,407,337
  106,411,806
  106,411,839
  106,411,849
  106,411,885
  106,411,933
  106,419,644
  106,419,889
  106,420,011
  106,420,139
  106,420,796
  106,421,382
  106,421,410
  106,421,469
  106,421,900
  106,422,009
  106,422,078
  106,422,358
  106,422,397
  106,422,415
  106,422,787
  106,422,902
  106,423,231
  106,423,554
  106,423,972
  106,424,044
  106,424,520
  106,425,170
  106,425,524
  106,425,706
  106,425,889
  106,428,646
  106,428,702
  106,428,796
  106,428,876
  106,429,486
  106,429,866
  106,429,992
  106,431,237
  106,431,515
  106,432,413
  106,433,179
  106,433,707
  106,433,819
  106,434,147
  106,434,938
  106,435,328
  106,436,991
  106,438,164
  106,438,303
  106,438,313
  106,438,318
  106,438,339
  106,438,397
  106,439,056
  106,439,132
  106,441,146
  106,441,788
  106,442,403
  106,442,632
  106,442,663
  106,443,187
  106,443,937
  106,447,370
  106,447,381
  106,447,438
  106,447,515
  106,447,684
  106,447,717
  106,448,028
  106,448,053
  106,448,069
  106,448,328
  106,448,536
  106,448,987
  106,449,055
  106,449,071
  106,449,315
  106,449,621
  106,450,514
  106,450,529
  106,451,454
  106,452,292
  106,452,386
  106,452,563
  106,452,729
  106,453,501
  106,454,618
  106,454,653
  106,455,255
  106,456,078
  106,456,291
  106,456,549
  106,456,959
  106,457,199
  106,458,329
  106,458,699
  106,466,773
  106,466,827
  106,468,902
  106,470,344
  106,470,595
  106,470,837
  106,471,382
  106,471,729
  106,473,164
  106,473,815
  106,473,816
  106,473,847
  106,473,877
  106,473,959
  106,474,039
  106,474,097
  106,474,864
  106,475,812
  106,476,651
  106,478,407
  106,478,466
  106,478,509
  106,478,594
  106,479,956
  106,480,732
  106,481,171
  106,481,711
  106,482,377
  106,482,638
  106,482,668
  106,484,332
  106,484,357
  106,484,442
  106,485,834
  106,486,357
  106,487,482
  106,489,397
  106,491,596
  106,492,850
  106,493,655
  106,493,942
  106,494,276
  106,495,071
  106,497,947
  106,498,095
  106,498,537
  106,499,484
  106,499,946
  106,500,013
  106,500,222
  106,501,022
  106,501,023
  106,501,308
  106,501,365
  106,501,397
  106,501,507
  106,501,583
  106,501,968
  106,501,978
  106,501,979
  106,501,997
  106,502,011
  106,502,378
  106,502,392
  106,502,472
  106,502,874
  106,503,009
  106,503,402
  106,508,643
  106,509,080
  106,509,112
  106,509,132
  106,509,136
  106,509,139
  106,509,152
  106,509,518
  106,509,716
  106,509,821
  106,510,216
  106,511,299
  106,511,933
  106,512,326
  106,512,762
  106,513,925
  106,516,735
  106,525,061
  106,526,623
  106,526,776
  106,526,850
  106,528,161
  106,528,295
  106,529,073
  106,529,747
  106,529,863
  106,529,968
  106,530,121
  106,530,268
  106,530,599
  106,531,336
  106,531,649
  106,531,890
  106,532,699
  106,533,078
  106,535,011
  106,535,014
  106,535,018
  106,535,979
  106,536,741
  106,542,140
  106,542,289
  106,542,340
  106,547,519
  106,547,588
  106,547,674
  106,547,737
  106,547,884
  106,547,888
  106,547,891
  106,548,640
  106,548,867
  106,549,216
  106,549,218
  106,550,650
  106,550,652
  106,550,762
  106,550,987
  106,552,115
  106,558,383
  106,558,614
  106,558,911
  106,559,491
  106,560,766
  106,561,179
  106,561,862
  106,561,876
  106,562,468
  106,563,513
  106,564,501
  106,565,135
  106,566,427
  106,566,452
  106,566,992
  106,567,097
  106,567,485
  106,567,632
  106,567,789
  106,568,008
  106,568,244
  106,568,296
  106,568,303
  106,569,979
  106,570,775
  106,570,809
  106,571,154
  106,571,169
  106,571,173
  106,571,177
  106,572,432
  106,573,030
  106,576,343
  106,576,361
  106,576,977
  106,578,833
  106,578,982
  106,579,478
  106,579,530
  106,579,599
  106,582,188
  106,595,242
  106,596,324
  106,596,335
  106,596,444
  106,598,650
  106,599,411
  106,601,511
  106,601,815
  106,604,107
  106,604,540
  106,605,478
  106,605,891
  106,606,786
  106,610,643
  106,612,915
  106,613,595
  106,615,603
  106,615,606
  106,615,703
  106,617,363
  106,617,632
  106,617,761
  106,617,805
  106,618,647
  106,619,015
  106,619,023
  106,619,035
  106,619,069
  106,620,572
  106,620,657
  106,625,435
  106,626,733
  106,626,806
  106,627,584
  106,628,017
  106,628,224
  106,628,465
  106,629,508
  106,630,942
  106,631,018
  106,631,495
  106,631,648
  106,631,768
  106,631,957
  106,631,959
  106,632,922
  106,632,949
  106,636,787
  106,636,793
  106,636,837
  106,636,840
  106,636,841
  106,636,873
  106,637,909
  106,639,910
  106,641,550
  106,644,160
  106,647,322
  106,658,505
  106,659,027
  106,660,673
  106,662,117
  106,662,164
  106,665,519
  106,665,895
  106,668,047
  106,668,967
  106,670,360
  106,670,434
  106,671,032
  106,671,400
  106,673,278
  106,673,788
  106,673,811
  106,677,619
  106,678,117
  106,678,120
  106,678,154
  106,680,516
  106,681,426
  106,681,648
  106,682,030
  106,682,213
  106,682,503
  106,682,572
  106,682,623
  106,682,866
  106,684,160
  106,684,613
  106,684,923
  106,686,133
  106,687,727
  106,688,838
  106,689,408
  106,690,084
  106,691,734
  106,691,968
  106,694,741
  106,695,169
  106,695,210
  106,695,321
  106,697,985
  106,698,040
  106,698,656
  106,701,017
  106,711,189
  106,711,954
  106,712,356
  106,713,136
  106,713,240
  106,713,430
  106,713,613
  106,713,817
  106,715,510
  106,716,470
  106,718,933
  106,720,419
  106,722,645
  106,722,698
  106,724,567
  106,726,120
  106,726,944
  106,728,528
  106,729,274
  106,729,700
  106,730,659
  106,730,679
  106,730,739
  106,730,742
  106,738,624
  106,739,416
  106,740,780
  106,742,105
  106,742,171
  106,742,198
  106,742,226
  106,742,410
  106,743,315
  106,745,841
  106,751,875
  106,754,230
A
A
T
A
T
T
T
T
T
A
T
T
T
A
C
G
C
T
G
G
C
G
T
T
T
T
T
G
T
G
G
C
T
G/C
A/G
G/T
C/G
T/A
A
T
C
A
A
G
T/G
G
A
C
A
C
C
T
G
T
T/G
A
T
A
G
A
A
T
C/A
T
C
C
T
A
C/A
C
A
A
C
T
C
G
G
T
A
T
G
C/A
C/T
A/G
T/A
G
G
C
C
T
G
G
G
C
G
C
A
C
T
C
T
G
T
G
T
T
T
G
T/C
C
T
C/G
A
T
C
A
A
A
T
A
C
G/A
G
A
A
A
C
C
A
T
C
C
C
C
A
G
T
T
A
C
C
T
T
C
T
C/T
T
G
T
T
T
C
A
C
G
T
T
T
C
C
T
C
T
T
A
C
A
G
T
C
G
C
A
C
A
C
A
G
C
T
C
A/C
C/T
A/G
A/T
A/C
G
A
T
C/T
T/A
A/C
A/G
C/T
G
T
T
G/C
A/T
A/C
G/T
A/T
G/A
G/A
G/A
C/T
T
G
G
T
A
G
A
A
A/T
C
C
A
G
C
A
A
C
C
T
A
C
T/G
A
A
A
T
T/G
G/T
C/A
G
G
G
G
C
G/A
G/A
A/T
T/A
A/G
T/C
G/T
C
C
G/A
T/C
A
G
T
C
T
T
A
G
C
G
G
A
C
A
C
G
T
C
G
G
C
A
T
A/T
A/T
A/T
T/C
A/T
C
A
T
T
C
C
C
C
A
T/C
T
T
G
T
A/T
T/A
G/A
A
A
T/C
C/T
T/C
T
G
A
T
C
C
G
C
C
T
G
G
G
C
T
C
A
C/G
A/G
T
A/T
T/C
T/G
C/T
G
C
C
G
G
C
T/G
A
A
T
A
G
A
T
A
A
A
T/C
G/T
C/T
T/G
T/C
C/G
C/G
G/A
T
T
G
C
A
C
T
T
C
T
A
C
T
T/A
G
C
T
T
A
C
C
T
C/T
A/T
G/A
C
C
G
A
C
A
C
A
G
T
T
C
A
C
C
C
G
T
G
C
G
T
G
G
T
A
C
T
G
A
G
C
T
T
G/A
T
C
A
T
A
A
C
G
G
A
G
T
T
A
T
A
G/T
C/T
A/T
T/A
C/T
G/T
C
A/T
G/A
G
C/T
T