Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 144,002 (bp)   Positions: 500
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.002
.066
.001
.0
.006
.001
.002
.007
.0
.004
.162
.14
.0
.001
.01
.533
.754
.0
.001
.042
.05
.015
.0
.02
.086
.007
.0
.003
.09
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.045
.101
.994
.982
.597
.943
.027
.0
.0
.001
1.0
1.0
.022
.145
.0
.001
.976
.0
.017
.001
.003
.003
.01
.013
.0
.007
.001
.003
.001
.005
.642
.013
.002
.446
.002
.001
.01
.0
.017
.795
.444
.116
.28
.052
.246
.022
.018
.554
.025
.432
.078
.036
.232
.227
.146
.418
.082
.202
.352
.069
.059
.005
.008
.242
.012
.082
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.012
.008
.22
.016
.237
.066
.113
.245
--
.094
.011
.002
.001
.076
.099
.026
.025
.003
.032
.027
.045
.007
.007
.004
.034
.021
.011
.089
.034
.013
.014
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.001
.021
.0
.006
.0
.248
.235
.097
.142
.013
.007
.005
.006
.003
.004
.018
.014
.016
.027
.034
.02
.006
.008
.003
.467
.226
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.037
.034
.029
.009
.006
.227
.442
.457
.396
.133
.164
.031
.011
.011
.059
.029
.01
.054
.021
.04
.007
.007
.018
.004
.014
.021
.361
.03
.026
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.059
.197
.002
.009
.083
.065
.001
.004
.611
.771
.054
.211
--
--
.089
.001
.092
.003
.011
.0
.005
.775
.414
.001
.005
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.566
.102
--
.077
.0
.004
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.107
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
.002
.003
.001
.002
.001
.198
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.189
.35
.055
.128
.054
--
--
.061
.015
.002
.003
.009
.039
.058
.001
.001
.023
.0
.015
.0
.004
.037
.0
.002
.467
.002
.0
.207
.969
.026
.018
.002
.0
1.0
.551
.505
.002
.019
.003
.0
.014
.153
.006
.006
.15
.042
.0
.001
.001
.0
.003
.016
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.076
.002
.018
.223
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
Vrk2
C
T
C
T
G
A
A
T
4
C
G
T
-
T
C
T
C
A
G
T
G
G
C
A
A
-
G
C
C
-
C
A
A
G
C
A
C
A
T
C
G
G
C
A
C
T
G
C
T
-
G
C
A
C
C
G
T
T
27
C
T
T
G
T
T
C
G
C
C
A
A
G
T
-
C
T
G
C
A
C
C
A
G
G
C
T
C
A
33
22
A
T
-
T
C
A
G
C
G
A
C
A
5
C
T
C
A
G
-
T
-
A
A
A
G
G
A
T
A
T
G
A
G
G
G
A
G
-
G
C
A
T
C
G
T
G
G
G
G
G
11
C
C
C
T
G
6
8
G
T
G
T
C
-
A
T
C
C
G
-
T
C
-
A
G
C
T
A
G
T
G
G
C
G
A
A
C
T
A
T
T
G
T
A
G
C
-
C
G
A
A
-
G
-
-
A
A
A
A
T
-
2
-
-
T
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
C
G
C
C
T
C
G
A
15
3
A
C
A
T
G
C
4
A
T
-
2
-
-
-
3
C
-
2
T
T
2
G
G
C
G
T
-
G
T
G
G
A
G
3
-
C
G
2
G
-
2
G
T
-
2
T
3
G
2
G
C
2
G
-
T
G
G
2
T
T
A
G
A
A
G
T
C
2
C
A
G
-
A
A
G
G
T
C
A
T
-
A
A
A
A
G
G
T
4
T
G
C
G
G
G
G
C
G
C
G
G
C
T
C
C
A
G
G
C
T
T
T
T
A
C
G
A
G
G
-
G
T
T
-
C
T
G
2
-
T
T
3
C
G
A
T
G
T
G
T
T
G
T
4
T
A
T
A
C
A
C
G
A
T
G
T
A
A
T
A
A
T
T
T
A
T
C
12
-
T
C
A
G
T
C
C
T
T
C
-
T
C
C
C
T
G
G
A
T
T
T
G
C
C
A
A
T
A
C
C
T
A
C
G
C
T
G
T
G
2
82
-
T
T
T
G
T
A
C
C
C
G
G
C
2
-
A
G
A
A
G
C
C
T
A
A
C
G
G
G
-
T
T
C
G
C
A
C
A
A
A
G
C
C
G
-
A
-
2
2
G
T
G
T
C
C
G
G
G
-
T
A
A
-
  110,741,669
  110,742,153
  110,742,323
  110,743,297
  110,743,636
  110,743,781
  110,743,838
  110,744,106
  110,744,458
  110,745,478
  110,745,991
  110,747,846
  110,747,852
  110,748,481
  110,748,495
  110,748,790
  110,748,950
  110,748,953
  110,749,232
  110,749,400
  110,749,771
  110,749,775
  110,750,937
  110,751,052
  110,753,235
  110,753,789
  110,753,790
  110,754,095
  110,754,928
  110,754,942
  110,755,228
  110,755,233
  110,755,419
  110,755,492
  110,756,447
  110,756,586
  110,756,929
  110,757,128
  110,757,968
  110,757,983
  110,758,058
  110,758,158
  110,758,499
  110,758,626
  110,758,639
  110,758,840
  110,759,290
  110,759,346
  110,759,590
  110,759,665
  110,760,183
  110,760,973
  110,761,038
  110,761,667
  110,761,716
  110,762,088
  110,762,164
  110,762,221
  110,762,223
  110,763,772
  110,765,383
  110,765,810
  110,766,973
  110,767,167
  110,768,913
  110,769,052
  110,769,067
  110,770,722
  110,770,827
  110,770,914
  110,772,150
  110,772,290
  110,772,364
  110,772,536
  110,772,780
  110,773,307
  110,773,959
  110,774,073
  110,774,116
  110,774,507
  110,774,756
  110,774,796
  110,774,822
  110,774,941
  110,775,178
  110,775,514
  110,775,562
  110,775,576
  110,775,753
  110,775,788
  110,775,814
  110,775,850
  110,776,097
  110,776,440
  110,776,584
  110,776,611
  110,776,918
  110,776,993
  110,776,997
  110,777,195
  110,777,573
  110,777,832
  110,777,903
  110,778,781
  110,779,236
  110,779,798
  110,779,852
  110,780,095
  110,780,259
  110,780,576
  110,780,673
  110,781,075
  110,781,177
  110,781,245
  110,781,381
  110,781,496
  110,781,580
  110,781,623
  110,781,871
  110,782,218
  110,783,129
  110,783,424
  110,783,428
  110,783,566
  110,783,756
  110,783,778
  110,784,011
  110,784,457
  110,785,271
  110,785,332
  110,785,569
  110,785,654
  110,785,967
  110,786,007
  110,786,020
  110,786,027
  110,786,977
  110,787,224
  110,787,303
  110,787,567
  110,787,625
  110,787,831
  110,787,846
  110,787,847
  110,787,929
  110,788,275
  110,788,735
  110,788,756
  110,789,142
  110,789,883
  110,789,939
  110,789,941
  110,789,951
  110,789,954
  110,789,956
  110,789,970
  110,789,983
  110,789,992
  110,790,005
  110,790,292
  110,790,320
  110,791,438
  110,791,467
  110,791,789
  110,792,265
  110,792,269
  110,792,597
  110,792,670
  110,792,679
  110,792,756
  110,792,850
  110,792,856
  110,792,861
  110,792,873
  110,792,875
  110,792,876
  110,792,887
  110,792,889
  110,792,915
  110,792,998
  110,792,999
  110,793,012
  110,793,521
  110,793,645
  110,793,719
  110,793,865
  110,793,884
  110,793,934
  110,793,935
  110,793,956
  110,793,957
  110,793,965
  110,794,004
  110,794,068
  110,794,073
  110,794,077
  110,794,096
  110,794,111
  110,794,133
  110,794,177
  110,794,190
  110,794,222
  110,794,292
  110,794,294
  110,794,313
  110,794,319
  110,794,322
  110,794,332
  110,794,337
  110,794,364
  110,794,370
  110,794,398
  110,794,438
  110,794,507
  110,794,526
  110,794,713
  110,794,774
  110,794,943
  110,795,014
  110,795,131
  110,795,412
  110,795,415
  110,795,980
  110,795,998
  110,796,015
  110,796,035
  110,796,230
  110,796,306
  110,796,447
  110,796,462
  110,796,466
  110,796,858
  110,796,962
  110,796,967
  110,796,976
  110,796,979
  110,796,983
  110,796,988
  110,796,993
  110,797,003
  110,797,008
  110,797,034
  110,797,038
  110,797,040
  110,797,064
  110,797,071
  110,797,079
  110,797,082
  110,797,111
  110,797,118
  110,797,120
  110,797,141
  110,797,153
  110,797,169
  110,797,175
  110,797,177
  110,797,180
  110,797,199
  110,797,203
  110,797,209
  110,797,215
  110,797,217
  110,797,234
  110,797,265
  110,797,278
  110,797,288
  110,797,301
  110,797,313
  110,797,315
  110,797,338
  110,797,355
  110,797,361
  110,797,690
  110,797,695
  110,797,698
  110,797,702
  110,797,717
  110,797,720
  110,797,734
  110,797,736
  110,797,861
  110,798,369
  110,798,491
  110,798,581
  110,798,678
  110,798,702
  110,799,135
  110,799,146
  110,799,293
  110,799,468
  110,799,928
  110,800,008
  110,800,021
  110,800,037
  110,800,081
  110,800,145
  110,800,903
  110,800,953
  110,801,003
  110,801,069
  110,801,219
  110,801,394
  110,801,680
  110,801,798
  110,801,855
  110,802,008
  110,802,338
  110,802,416
  110,802,761
  110,802,893
  110,804,014
  110,804,474
  110,804,918
  110,805,084
  110,805,613
  110,805,659
  110,805,679
  110,805,862
  110,806,340
  110,807,165
  110,807,466
  110,808,328
  110,808,892
  110,809,070
  110,810,774
  110,810,980
  110,811,270
  110,812,924
  110,814,164
  110,814,232
  110,816,670
  110,816,830
  110,816,994
  110,818,197
  110,818,458
  110,818,719
  110,819,734
  110,820,074
  110,820,352
  110,821,221
  110,821,336
  110,821,379
  110,821,819
  110,822,157
  110,822,403
  110,825,270
  110,826,223
  110,827,309
  110,828,725
  110,828,973
  110,829,587
  110,829,621
  110,829,680
  110,829,745
  110,829,750
  110,829,761
  110,829,770
  110,829,773
  110,829,785
  110,829,787
  110,829,793
  110,829,809
  110,829,836
  110,829,838
  110,829,895
  110,829,898
  110,830,607
  110,831,161
  110,831,240
  110,831,278
  110,831,326
  110,831,330
  110,831,381
  110,831,391
  110,831,413
  110,831,432
  110,831,678
  110,831,690
  110,831,697
  110,831,806
  110,831,893
  110,832,265
  110,832,450
  110,832,504
  110,832,802
  110,832,854
  110,833,171
  110,833,373
  110,833,637
  110,833,709
  110,834,038
  110,834,042
  110,834,089
  110,834,135
  110,834,184
  110,836,219
  110,836,641
  110,853,210
  110,853,898
  110,854,944
  110,854,967
  110,855,029
  110,855,299
  110,855,615
  110,855,646
  110,855,922
  110,855,984
  110,856,097
  110,856,517
  110,856,618
  110,856,655
  110,856,708
  110,857,105
  110,857,108
  110,857,307
  110,857,310
  110,857,468
  110,857,922
  110,857,941
  110,858,272
  110,858,310
  110,858,457
  110,858,601
  110,858,678
  110,858,910
  110,860,430
  110,860,645
  110,860,664
  110,862,281
  110,863,363
  110,863,907
  110,864,260
  110,864,555
  110,865,107
  110,865,316
  110,865,544
  110,865,554
  110,866,039
  110,866,453
  110,866,454
  110,866,942
  110,866,948
  110,867,073
  110,867,087
  110,867,123
  110,868,116
  110,868,287
  110,868,318
  110,868,498
  110,869,974
  110,870,897
  110,871,136
  110,871,141
  110,871,297
  110,871,362
  110,871,878
  110,871,966
  110,872,051
  110,872,409
  110,872,761
  110,873,285
  110,874,568
  110,875,181
  110,875,282
  110,876,786
  110,877,320
  110,877,339
  110,878,656
  110,878,669
  110,878,993
  110,879,036
  110,879,162
  110,879,531
  110,879,880
  110,881,152
  110,881,197
  110,881,411
  110,881,459
  110,881,467
  110,881,526
  110,881,579
  110,881,592
  110,881,602
  110,881,610
  110,881,611
  110,881,615
  110,881,622
  110,881,626
  110,881,627
  110,881,637
  110,881,854
  110,882,086
  110,882,315
  110,882,316
  110,882,416
  110,882,499
  110,882,660
  110,882,727
  110,882,897
  110,883,628
T
C
T
C
A
G
C
G
-
T
T
G
T
C
T
C
A
C
A
C
A
A
G
G
C
3
C
T
T
2
T
G
G
A
A
G
T
G
C
T
A
A
A
G
A
-
A
T
A
A
A
T
-
T
A
A
C
-
-
T
C
A
A
C
G
T
A
T
T
C
C
A
A
3
T
A
A
T
C
T
T
G
C
T
T
C
A
G
-
-
C
C
A
G
G
C
A
T
A
G
T
C
-
T
C
G
-
A
A
C
3
G
C
G
A
T
G
-
G
C
A
G
A
C
A
-
T
7
A
A
C
C
T
T
C
C
T
A
A
A
-
T
A
G
C
A
-
-
T
C
T
-
T
G
C
A
A
T
T
2
C
G
2
G
-
A
C
G
A
G
T
C
T
C
T
T
T
C
C
C
C
A
G
-
A
-
G
G
C
-
G
T
A
C
G
-
T
T
-
G
A
-
T
G
G
-
G
A
C
A
A
T
2
C
C
T
T
T
A
T
C
T
T
T
-
-
G
T
G
C
A
G
-
T
C
A
-
G
T
T
-
-
G
-
C
-
-
T
A
T
C
-
T
T
-
-
A
-
-
-
2
-
-
-
-
T
-
A
C
T
-
-
-
-
-
-
-
-
T
3
A
A
C
-
C
A
G
A
G
G
A
-
G
-
A
G
-
T
-
G
T
C
C
T
G
C
A
C
G
G
G
A
T
C
-
A
A
A
C
A
A
A
A
A
T
A
A
T
C
A
T
G
T
-
T
C
C
C
C
G
T
A
G
A
T
4
T
C
C
2
G
C
T
-
2
C
C
-
T
C
T
C
C
G
A
A
C
G/A
T/G
-
C
G
C
C
A
C
C/A
G/C
A/C
T/A
A
C
C
G
G
C
C
T/C
G
-
G
C
T
-
G
T/G
A
C
T
T/C
C/T
C/T
T/C
G
G
2
G
G
C/T
C/T
T/C
G/A
C
T
C
C
C
G/C
C/T
T
A/T
A/G
G
T
C/T
A
-
G
T
A
A
C
A
C
A
-
-
A
A
A
C
A
C
T
T
G
A
A
T
A
-
G
G
A
G
-
A
T
T
C
-
C
T
T
A
G/C
-/2
C
C
T
T
T
G
A
C
G
G
A
T
T
T
3
C
4
-
-
A
C
A
C
T
T
C
A
A
C
C
G
G
8