Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 218,695 (bp)   Positions: 312
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.095
.03
.004
--
.825
.0
.001
.035
.002
.005
.013
.0
.815
.817
.95
.982
.266
.01
.003
--
--
--
--
.0
.036
.073
.032
.001
.002
.0
.036
.049
.006
.002
.002
.01
.004
.0
.006
.001
.0
.034
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.019
.0
.001
.018
.029
.004
.027
.06
.515
.21
.001
.001
.003
.008
.003
.221
.141
.098
.007
.053
.045
.007
.001
.001
.0
.463
.198
.027
.01
.011
.003
.0
.0
.017
.001
.0
.013
.016
.0
.016
.004
.0
.04
.0
.007
.0
.001
.101
.941
.031
.002
.034
.009
--
--
--
.025
--
--
--
--
--
--
--
--
.019
.017
.002
.068
.216
.007
.014
.001
.01
.0
.001
.027
.001
.083
.024
.001
.012
.009
.0
.001
.995
.0
.0
.003
.402
.068
.0
.0
.004
.003
.003
.034
.025
.003
.011
.013
.01
.0
.017
.005
.069
.0
.003
.02
.003
.0
.001
.031
.001
.001
.007
.0
.0
.997
.003
.001
.002
.0
.0
.001
.001
.055
.014
.02
.0
.004
.0
.006
.076
.002
.0
.013
.005
.019
.005
.0
.0
.014
.009
.001
.0
.699
--
--
.014
--
.026
.024
.991
.991
.002
.002
.0
.0
.0
.014
.0
.009
.001
.024
.001
.135
.034
.005
.002
.0
.025
.022
.014
.0
.0
.001
.0
.0
.01
.0
.157
.002
.001
.0
.0
.016
.018
.048
.019
.25
.001
.0
.995
.993
.272
.001
.004
.0
.019
.0
.0
.0
.001
.0
.002
.093
.003
.172
.001
.0
.005
.0
.039
.0
.006
.001
.003
.001
.006
--
--
--
.228
.096
.074
.0
.001
.0
.001
.001
.023
.002
.0
.0
.001
--
.181
.514
.098
.057
.009
.0
.097
.018
.049
.397
.049
.004
.019
.643
.01
.004
.077
.002
.749
.008
.039
.01
.007
.032
.239
.085
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
Vps8
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
A
C
A
A
G
T
G
C
T
A
G
G
A
G
T
C
C
T
C
A
A
A
G
C
A
C
A
G
A
T
A
G
A
A
A
G
C
T
A
T
A
T
C
C
C
G
A
C
T
G
C
A
C
C
A
C
T
T
G
G
G
T
A
G
C
T
T
A
T
A
G
G
C
G
C
T
C
T
G
G
C
T
G
A
A
C
C
T
C
C
G
G
A
T
A
G
G
G
T
T
C
G
C
A
G
C
A
G
A
C
T
A
G
T
A
C
A
G
C
C
T
C
T
A
A
A
A
A
G
C
T
G
G
T
T
T
T
G
T
T
T
G
G
A
G
G
G
A
C
A
G
T
T
A
C
C
A
T
T
A
T
T
C
A
G
T
A
A
C
C
G
T
G
G
C
A
T
A
A
G
T
G
C
G
T
A
T
A
T
T
A
T
T
C
A
C
C
A
A
C
T
G
G
T
A
C
A
T
A
G
G
C
C
T
G
A
C
C
A
A
T
T
C
G
C
A
C
G
G
G
C
A
C
T
G
T
T
C
A
C
C
A
G
G
G
C
A
T
A
C
T
C
G
G
C
T
C
T
T
A
C
C
A
G
C
C
G
A
A
C
C
C
G
A
G
G
G
T
G
G
T
T
G
T
C
T
T
C
C
T
C
A
G
A
T
G
A
C
A
G
T
T
G
G
A
T
C
T
C
T
  83,115,154
  83,123,262
  83,128,585
  83,149,825
  83,151,521
  83,152,021
  83,152,022
  83,153,225
  83,155,726
  83,159,007
  83,160,166
  83,174,677
  83,176,766
  83,176,767
  83,176,774
  83,176,777
  83,181,135
  83,181,174
  83,181,194
  83,186,994
  83,192,606
  83,193,658
  83,193,668
  83,194,139
  83,194,188
  83,202,118
  83,202,234
  83,202,787
  83,203,700
  83,204,290
  83,205,497
  83,205,509
  83,207,422
  83,208,934
  83,209,269
  83,209,877
  83,210,266
  83,210,842
  83,210,887
  83,210,947
  83,211,088
  83,211,119
  83,211,137
  83,211,204
  83,211,302
  83,211,348
  83,211,424
  83,211,660
  83,211,982
  83,212,116
  83,212,143
  83,212,154
  83,212,161
  83,212,249
  83,212,291
  83,212,297
  83,212,317
  83,212,332
  83,212,351
  83,212,638
  83,212,804
  83,213,111
  83,213,129
  83,213,371
  83,213,550
  83,213,564
  83,213,756
  83,213,978
  83,214,222
  83,214,252
  83,214,314
  83,214,546
  83,214,598
  83,214,655
  83,214,685
  83,214,695
  83,214,862
  83,215,079
  83,215,340
  83,215,403
  83,215,440
  83,215,474
  83,215,545
  83,215,554
  83,215,617
  83,215,744
  83,215,933
  83,216,201
  83,216,203
  83,216,512
  83,217,522
  83,218,796
  83,218,925
  83,220,178
  83,220,208
  83,220,538
  83,220,873
  83,221,849
  83,222,141
  83,222,561
  83,223,246
  83,224,450
  83,224,521
  83,224,945
  83,226,157
  83,232,494
  83,232,591
  83,233,122
  83,233,276
  83,233,784
  83,233,785
  83,234,291
  83,234,399
  83,234,634
  83,234,966
  83,237,455
  83,239,079
  83,241,126
  83,241,700
  83,244,505
  83,246,341
  83,247,163
  83,248,454
  83,251,845
  83,252,036
  83,253,863
  83,256,023
  83,258,847
  83,259,103
  83,259,951
  83,260,469
  83,260,667
  83,265,541
  83,266,067
  83,266,955
  83,267,093
  83,267,119
  83,267,165
  83,267,207
  83,267,586
  83,267,824
  83,267,825
  83,267,833
  83,268,009
  83,268,092
  83,268,174
  83,269,065
  83,270,799
  83,270,806
  83,271,170
  83,271,221
  83,271,308
  83,271,419
  83,272,115
  83,272,126
  83,272,238
  83,272,269
  83,272,496
  83,272,513
  83,272,529
  83,272,658
  83,272,771
  83,272,846
  83,272,950
  83,273,055
  83,273,058
  83,273,109
  83,273,445
  83,273,704
  83,273,737
  83,273,901
  83,274,720
  83,275,177
  83,275,189
  83,275,342
  83,275,348
  83,275,359
  83,275,699
  83,275,769
  83,275,858
  83,275,977
  83,275,994
  83,276,387
  83,277,058
  83,277,128
  83,277,238
  83,278,376
  83,279,056
  83,279,733
  83,279,767
  83,279,803
  83,279,867
  83,280,049
  83,280,095
  83,280,572
  83,282,530
  83,282,555
  83,283,500
  83,283,572
  83,283,987
  83,283,988
  83,286,175
  83,286,177
  83,287,043
  83,287,135
  83,287,170
  83,287,348
  83,287,389
  83,287,419
  83,287,501
  83,287,847
  83,287,857
  83,287,863
  83,288,147
  83,288,457
  83,289,299
  83,289,562
  83,289,900
  83,290,755
  83,292,006
  83,292,007
  83,294,311
  83,294,428
  83,294,683
  83,294,745
  83,294,782
  83,295,122
  83,295,135
  83,295,402
  83,296,563
  83,296,635
  83,296,639
  83,296,772
  83,297,856
  83,297,895
  83,298,683
  83,298,684
  83,298,772
  83,299,446
  83,299,828
  83,300,024
  83,300,218
  83,300,220
  83,300,280
  83,300,935
  83,300,936
  83,301,781
  83,301,927
  83,302,343
  83,302,754
  83,303,036
  83,303,529
  83,303,635
  83,303,687
  83,304,244
  83,304,711
  83,306,052
  83,306,072
  83,306,288
  83,306,377
  83,306,573
  83,306,680
  83,307,275
  83,307,520
  83,307,751
  83,307,775
  83,307,932
  83,308,836
  83,309,330
  83,310,519
  83,310,579
  83,310,938
  83,311,268
  83,311,274
  83,312,034
  83,312,915
  83,313,158
  83,313,169
  83,313,772
  83,313,806
  83,313,844
  83,314,085
  83,314,261
  83,314,305
  83,315,371
  83,315,640
  83,315,725
  83,315,869
  83,316,754
  83,316,800
  83,316,817
  83,316,844
  83,317,042
  83,317,168
  83,317,429
  83,317,769
  83,317,806
  83,318,017
  83,318,578
  83,319,616
  83,319,712
  83,319,734
  83,319,849
  83,320,394
  83,320,734
  83,321,046
  83,321,362
  83,321,686
  83,321,956
  83,322,377
  83,322,380
  83,323,117
G
A
C
G
T
T
C
C
A
G
C
G
G/A
G/C
A/G
G/A
C
T
T
C
T
G
G
G
C
A
G
G
G
A
G
C
G
A
G
C
G
C
T
G
G
C
G
A
T
T
T
A
C
T
C
A
T
G
G
T
G
A
C
C
A
A
G/A
C
G
A
T
C
C
G
G
G
A
A
A
A
A
G
A
C
A
T
T
C
A
G
C
T
G
C
G
T
A
A
C
C
G
T
A
A
G
C
T
A
G
G
C
G
G
A
G
T
C
C
T
C
G
T
G
T
T
G
C
A
A
G
T
G
C
G
C
G
C
A
A
C
A
A
C
A
T/C
T/C
T/C
T
T
G
A
A
A
G
T
G
A
C
C
C
T
T
C
C
C
G
C
C
T
G
A
C
G
G
T
T
A
A
A
C
T
G
C
G
G
A
C
T
T
A
C
G
C
G
C
C
G
C
C
T
C
T
T
G
T
A
A
A
A
C
G
T
G
C
G
C
A
T
T
C
A
G
T
T
C
G
C
C
A
A
G
G
T
C
A
A
T
C
T
A
T
C
C
A
G
T
T
G
A
A
A
T
G
G
G
T
C
T
A
A
T
C
T
C
C
C
A
T
C
T
T
T
C
G
G
T
T
T
A
G
A
A
A
C
T
A
C
A
A
C
T
C
C
A
A
G
T
G
A
G
C
A
G
T
G
C
C
G
A
A
C
C
A
C
T
C