Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 150,523 (bp)   Positions: 237
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.636
1.0
1.0
.069
.175
.021
.006
.0
.0
.034
.116
.0
.065
.0
.905
.661
.004
.0
.0
.011
.022
.04
.0
.045
.001
.001
.653
.616
.006
.232
--
.045
.011
.082
.012
.142
.096
.114
.043
.006
.023
.001
.012
.011
.004
.871
.108
.009
.011
.001
.03
.0
.001
.0
.0
.294
.104
.004
.0
.008
.02
.0
.0
.001
.001
.018
.005
.004
.034
.0
.003
.013
.437
.356
.0
.0
.028
.0
.014
.022
.037
.767
--
.003
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.066
.002
.03
.001
--
.33
.001
.03
.082
.0
1.0
.001
.016
--
.0
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
.005
.006
--
.002
.267
.014
.0
.001
.014
.393
.016
.935
.005
.033
.01
.006
.0
.009
.006
.317
.012
.035
.06
.134
.0
.001
.002
.023
.392
.01
.007
.002
.296
.0
.073
.042
.0
.001
.934
.097
.161
.995
.012
.502
.0
.001
.0
.03
.001
.0
.0
.0
.036
.001
.097
.007
.017
.122
.019
.006
.001
.002
.083
.002
.013
.02
.029
.014
.133
--
--
.065
.016
.032
.014
--
--
.061
.011
.072
.002
.546
.495
.05
.01
.011
.092
.109
.094
.161
.08
.049
.009
.057
.001
.161
.0
.002
.225
.012
.007
.025
.003
.03
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
A
G
T
G
T
A
A
C
A
-
T
C
C
C
C
G
A
A
A
A
C
G
T
C
-
C
G
T
-
-
C
-
120
C
C
G
G
-
T
C
G
G
T
T
T
18
A
C
G
G
-
A
C
G
A
G
-
A
A
-
C
A
-
G
A
T
T
G
-
G
T
T
G
A
T
G
T
G
-
T
5
C
-
3
T
A
-
A
G
-
C
G
T
G
T
-
A
A
-
-
A
T
C
-
G
T
-
18
G
T
C
A
-
T
C
T
-
-
-
C
-
-
-
T
-
-
T
A
C
-
T
A
C
-
C
A
T
C
C
C
A
-
A
G
-
T
T
-
G
-
-
G
T
T
T
T
A
-
-
G
-
A
A
C
C
G
A
A
G
C
A
G
-
3
116
A
A
-
4
C
A
C
C
C
T
G
C
2
-
T
G
T
T
G
9
2
4
A
C
-
T
A
G
2
-
T
G
-
A
G
A
T
A
10
T
T
C
T
C
G
C
A
10
T
T
T
T
T
C
T
G
T
A
C
T
G
A
  10,512,233
  10,512,410
  10,512,411
  10,512,593
  10,520,897
  10,521,409
  10,526,696
  10,527,140
  10,528,012
  10,528,871
  10,529,599
  10,529,871
  10,530,218
  10,531,437
  10,532,234
  10,533,048
  10,535,465
  10,535,593
  10,535,699
  10,535,990
  10,536,180
  10,536,688
  10,536,839
  10,537,150
  10,537,414
  10,537,467
  10,540,408
  10,540,440
  10,540,767
  10,542,657
  10,543,846
  10,544,492
  10,545,003
  10,545,382
  10,545,729
  10,545,814
  10,546,722
  10,546,991
  10,549,480
  10,551,498
  10,551,781
  10,551,845
  10,553,926
  10,553,930
  10,554,748
  10,554,827
  10,555,265
  10,555,564
  10,555,931
  10,555,967
  10,556,009
  10,556,021
  10,556,593
  10,556,803
  10,557,254
  10,558,611
  10,558,900
  10,558,994
  10,560,892
  10,561,406
  10,561,549
  10,561,932
  10,561,966
  10,562,174
  10,562,175
  10,562,623
  10,562,875
  10,563,625
  10,563,888
  10,564,604
  10,566,496
  10,566,855
  10,567,404
  10,567,435
  10,568,113
  10,568,281
  10,568,548
  10,569,272
  10,571,610
  10,572,024
  10,572,418
  10,573,535
  10,573,632
  10,575,501
  10,575,949
  10,576,466
  10,577,694
  10,577,736
  10,578,021
  10,578,633
  10,578,809
  10,580,301
  10,580,905
  10,581,092
  10,581,879
  10,581,948
  10,583,080
  10,585,776
  10,586,423
  10,587,738
  10,589,346
  10,589,657
  10,589,836
  10,589,990
  10,590,366
  10,591,328
  10,591,590
  10,592,558
  10,593,682
  10,595,120
  10,596,247
  10,597,068
  10,597,602
  10,597,619
  10,597,647
  10,597,650
  10,597,869
  10,597,929
  10,598,021
  10,598,133
  10,598,262
  10,598,285
  10,598,346
  10,598,404
  10,598,553
  10,599,187
  10,599,197
  10,599,238
  10,599,241
  10,599,259
  10,601,078
  10,601,438
  10,601,598
  10,603,520
  10,604,966
  10,606,532
  10,606,594
  10,607,445
  10,607,710
  10,608,066
  10,608,952
  10,610,971
  10,611,718
  10,612,027
  10,612,136
  10,612,371
  10,612,373
  10,612,465
  10,613,150
  10,613,711
  10,613,744
  10,614,005
  10,615,131
  10,615,568
  10,616,425
  10,618,273
  10,618,549
  10,619,489
  10,619,628
  10,619,765
  10,619,861
  10,619,866
  10,620,387
  10,620,935
  10,622,002
  10,622,794
  10,622,870
  10,624,674
  10,625,448
  10,627,626
  10,627,846
  10,629,939
  10,629,969
  10,630,752
  10,631,688
  10,633,213
  10,633,215
  10,633,217
  10,633,227
  10,634,188
  10,634,363
  10,634,379
  10,634,537
  10,634,821
  10,634,841
  10,634,976
  10,635,023
  10,635,039
  10,635,770
  10,636,015
  10,636,665
  10,637,196
  10,638,529
  10,638,681
  10,638,691
  10,639,051
  10,639,054
  10,639,060
  10,639,162
  10,639,513
  10,640,393
  10,640,401
  10,640,566
  10,640,921
  10,640,924
  10,641,547
  10,641,761
  10,641,791
  10,642,622
  10,642,836
  10,642,967
  10,644,086
  10,644,181
  10,644,239
  10,644,697
  10,644,989
  10,645,118
  10,645,553
  10,646,041
  10,646,998
  10,649,058
  10,649,125
  10,649,362
  10,649,565
  10,649,778
  10,649,814
  10,653,822
  10,654,785
  10,655,102
  10,655,153
  10,657,174
  10,658,000
  10,658,046
  10,658,632
  10,659,072
  10,659,408
  10,659,465
G
A
C
A
C
-
-
T
G
T
A
A
T
A
T
A
-
G
G
G
G
A
A
T
C
G
-
-
9
3
T
G
120/-
G
T
A
A
A
G
A
A
T
G
G
A
18/-
-
G
-
T
A
-
T
A
G
-
3
C
-
12
T
G
T
A
T
G
C
A
T
T
C
C
A
G
G
A
C
A
A
C
-
-
C
-
G
-
-/T
G
A
4
T
-
G
A
C
2
C
-
C
C
G
C
T
10
T
G
2
-
A
C
T
G
T
A
T
C
G
T
T
A
T
T
T
G
T
G
-
-
-
C
A
G
T
A
T
G
A
A
T
T
-
G
G
T
2
-
A
2
A
3
T
A
C
C
G
C
G
A
A
T
G
G
G
T
T
A
G
G
T
T
G
T
3
-
-
-
C
2
-
T
C
T
-
G
G
A
A
-
2
-
T
C
C
A
-
-
-
T
G
2
C
G
A
-
2
C
-
A
G
T
G
C
G
-
C
C
T
G
T
A
G
G
-
C
G
G
-
A
A
-
A
C
C
T
G
A
G