Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 150,523 (bp)   Positions: 294
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
1.0
1.0
.092
1.0
.006
.003
.024
.028
.026
.363
.003
.0
1.0
.02
.116
.0
.034
.03
.001
.177
.0
.661
--
.001
.004
.0
.004
.022
.04
.022
.0
.001
.01
.641
.616
.006
.003
.053
.002
.049
.045
.011
.012
.142
.096
.024
.0
.055
--
--
.0
.023
.001
.001
.001
.012
.011
.108
.001
.03
.0
.007
.004
.007
.001
.003
.002
.104
.004
.63
.0
.003
.01
.008
.006
.003
.0
.0
.0
.18
.018
.005
.001
.017
.123
.003
.013
.437
.0
.0
.028
.008
.09
.014
.022
.0
.02
.027
.767
.242
.133
.054
.081
.003
.001
.001
.003
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.009
.066
.038
.0
.001
.001
.03
.0
.0
.027
--
.001
.0
.33
.001
.0
.0
1.0
.001
.022
.0
.0
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
.005
.006
.034
.148
.091
.083
.015
.0
.002
.208
.229
.14
.618
.647
.817
.802
.048
.012
.007
.004
.014
.001
.014
.393
.66
.016
.054
.935
.005
.001
.033
.274
.01
.006
.0
.009
.006
.012
.023
.035
.06
.134
.99
.0
.001
.002
.392
.01
.007
.296
.341
.0
.073
.042
.011
.0
.001
.006
.097
.995
.012
.056
.502
.016
.0
.001
.0
.03
.024
.001
.0
.0
.0
.036
.001
.097
.007
.019
.006
.001
.083
.013
.02
.029
.133
--
--
.065
.016
.032
.014
--
--
.061
.011
.072
.002
.546
.05
.01
.092
.109
.094
--
.022
.08
.009
.11
.692
.0
.001
.137
.426
.255
.048
.042
.011
.014
.161
.0
.155
1.0
.002
.225
.0
.024
.087
.105
.012
.007
.025
.03
.001
.0
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
Usp9x
G
T
2
C
A
C
-
-
3
T
T
A
C
A
T
C
-
-
G
A
T
G
C
G
A
A
G
C
G
-
T
C
T
G
T
-
G
G
T
A
-
120
C
G
G
C
C
G
A
C
-
G
G
T
G
T
T
A
G
-
A
A
C
-
C
C
A
-
A
T
A
C
A
-
A
T
A
-
2
T
T
T
T
G
5
T
T
G
T
G
T
-
C
-
T
A
G
G
C
C
T
C
2
3
T
C
C
A
A
A
-
T
A
G
G
A
C
T
-
T
G
-
A
A
-
A
4
A
C
A
T
C
-
-
T
-
A
T
C
G
T
-
C
G
T
C
A
-
T
C
T
-
-
-
C
-
-
-
G
A
C
A
A
C
-
C
-
-
-
-
9
C
T
-
-
G
T
A
-
T
C
C
A
T
-
T
A
G
-
-
-
T
T
-
G
-
G
C
T
T
T
T
T
A
-
G
-
A
C
119
C
G
A
T
A
G
G
A
-
3
T
116
C
A
A
-
4
A
C
A
C
C
C
T
G
C
T
G
T
G
2
4
A
-
T
A
G
2
-
T
G
-
A
G
A
T
A
T
T
T
C
G
A
T
A
T
G
G
G
A
C
A
C
G
T
-
10
T
T
C
A
C
T
G
C
G
-
-
T
A
T
G
A
A
  10,512,410
  10,512,411
  10,512,611
  10,512,813
  10,526,696
  10,526,737
  10,527,073
  10,527,079
  10,527,089
  10,527,578
  10,527,857
  10,528,012
  10,529,172
  10,529,362
  10,529,599
  10,529,871
  10,530,343
  10,531,409
  10,531,742
  10,532,039
  10,532,533
  10,533,048
  10,533,766
  10,534,584
  10,535,465
  10,535,593
  10,536,112
  10,536,180
  10,536,688
  10,536,747
  10,536,839
  10,537,467
  10,540,366
  10,540,437
  10,540,440
  10,540,767
  10,542,164
  10,542,263
  10,542,408
  10,542,836
  10,544,492
  10,545,003
  10,545,729
  10,545,814
  10,546,722
  10,548,206
  10,548,235
  10,548,786
  10,548,864
  10,548,885
  10,550,503
  10,551,781
  10,551,845
  10,553,815
  10,553,875
  10,553,926
  10,553,930
  10,555,265
  10,555,967
  10,556,009
  10,556,021
  10,556,062
  10,556,093
  10,556,488
  10,556,593
  10,556,693
  10,557,194
  10,558,900
  10,558,994
  10,560,886
  10,560,892
  10,561,149
  10,561,260
  10,561,406
  10,561,589
  10,561,647
  10,561,932
  10,561,966
  10,562,161
  10,562,366
  10,562,623
  10,562,875
  10,565,428
  10,565,962
  10,566,319
  10,566,496
  10,566,855
  10,567,404
  10,568,113
  10,568,281
  10,568,548
  10,568,681
  10,570,144
  10,571,610
  10,572,024
  10,572,283
  10,572,320
  10,573,508
  10,573,535
  10,573,773
  10,574,293
  10,574,518
  10,574,787
  10,575,501
  10,575,949
  10,576,380
  10,576,625
  10,576,778
  10,577,459
  10,577,613
  10,577,694
  10,577,717
  10,577,736
  10,577,757
  10,578,021
  10,578,171
  10,578,456
  10,578,468
  10,578,633
  10,580,057
  10,580,301
  10,581,556
  10,581,796
  10,581,939
  10,581,948
  10,582,113
  10,582,465
  10,582,955
  10,583,473
  10,585,776
  10,585,939
  10,586,213
  10,586,349
  10,587,738
  10,588,711
  10,589,280
  10,589,346
  10,589,657
  10,590,276
  10,590,366
  10,591,328
  10,591,590
  10,594,461
  10,594,750
  10,595,120
  10,596,247
  10,597,068
  10,597,602
  10,597,619
  10,597,647
  10,597,650
  10,597,869
  10,597,929
  10,598,021
  10,598,133
  10,598,262
  10,598,285
  10,598,553
  10,600,103
  10,601,438
  10,601,598
  10,601,825
  10,603,256
  10,603,263
  10,603,270
  10,603,277
  10,603,282
  10,603,290
  10,603,320
  10,603,323
  10,603,366
  10,603,393
  10,603,394
  10,603,406
  10,603,411
  10,603,428
  10,603,432
  10,603,439
  10,603,453
  10,606,594
  10,607,710
  10,608,066
  10,608,952
  10,609,785
  10,610,971
  10,611,036
  10,611,718
  10,612,027
  10,612,063
  10,612,136
  10,612,340
  10,612,371
  10,612,373
  10,612,465
  10,613,150
  10,613,711
  10,614,005
  10,615,040
  10,615,131
  10,615,568
  10,616,425
  10,617,415
  10,618,273
  10,618,549
  10,619,489
  10,619,765
  10,619,861
  10,619,866
  10,620,935
  10,621,403
  10,622,002
  10,622,794
  10,622,870
  10,624,237
  10,624,674
  10,625,448
  10,626,928
  10,627,846
  10,629,969
  10,630,752
  10,631,042
  10,631,688
  10,632,046
  10,633,213
  10,633,215
  10,633,217
  10,633,227
  10,634,012
  10,634,188
  10,634,363
  10,634,379
  10,634,537
  10,634,821
  10,634,841
  10,634,976
  10,635,023
  10,636,015
  10,636,665
  10,637,196
  10,638,681
  10,639,051
  10,639,054
  10,639,060
  10,639,513
  10,640,393
  10,640,401
  10,640,566
  10,640,921
  10,640,924
  10,641,547
  10,641,761
  10,641,791
  10,642,622
  10,642,836
  10,642,967
  10,644,086
  10,644,181
  10,644,697
  10,644,989
  10,645,553
  10,646,041
  10,646,998
  10,647,192
  10,648,715
  10,649,125
  10,649,565
  10,649,839
  10,650,668
  10,651,947
  10,652,166
  10,652,668
  10,653,075
  10,653,191
  10,653,605
  10,653,725
  10,653,793
  10,653,797
  10,653,822
  10,654,785
  10,654,916
  10,654,965
  10,655,102
  10,655,153
  10,655,551
  10,655,798
  10,656,512
  10,656,568
  10,657,174
  10,658,000
  10,658,046
  10,659,072
  10,659,408
  10,659,465
  10,659,740
A
C
-
T
-
T
T
2
-
G
-
G
T
-
A
A
A
A
A
C
A
A
T
C
-
G
A
G
A
G
A
G
C
A
-
9
A
A
C
G
G
-
T
A
A
A
T
A
G
G
G
A
T
C
T
G
G
-
T
A
-
C
A
4
T
T
-
3
C
C
-
T
G
12
G
C
G
T
-
G
G
C
C
A
-
C
C
A
G
A
C
3
T
A
C
G
C
A
-
T
G
G
-
-
G
T
G
G
-
G
T
C
G
A
A
G
T
-
4
G
-
G
G
G
2
C
-
G
T
-
C
A
2
C
C
T
G
C
A
T
G
2
A
A
C
T
G
T
A
T
C
G
T
T
A
T
T
T
A
G
T
G
-
T
G
-
T
G
C
G
-
T
C
T
T
-
-
-
G
A
T
T
-
C
G
C
G
T
A
2
2
-
A
2
A
3
A
T
C
C
G
G
C
G
A
T
G
G
T
-
T
A
G
G
G
T
C
G
3
-
G
-
G
-
C
2
-
T
T
C
T
-
G
G
A
A
-
T
C
A
-
-
T
2
C
G
A
-
2
C
-
A
G
T
G
C
G
C
C
G
T
A
C
-
G
C
A
A
T
G
T
G
T
-
C
T
-
-
A
G
G
A
-
A
A
A
2
7
C
C
G
A
G
C