Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 288,078 (bp)   Positions: 412
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.001
.0
.02
.006
.009
.394
.257
.009
.071
.002
.11
.007
.594
.074
.0
.022
.022
.055
.007
.006
--
.008
.512
.003
.002
.0
.0
.124
.019
.004
.297
.005
.022
.043
.003
.028
.013
.007
.006
.409
.006
.0
.044
.001
.087
.007
.025
.046
.002
.005
.001
.008
.006
.001
.009
.0
.0
.082
.004
.002
.022
.273
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.318
.001
.126
.013
.025
.502
.065
.005
.019
.002
.006
.0
.002
.001
.019
.002
.003
.02
.225
.001
.006
.156
.012
.031
.007
--
.006
.005
.018
.0
.019
.175
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.996
--
.029
.033
.049
.068
.011
.005
.001
.008
.021
.068
.003
.058
.025
.001
.001
.034
.044
--
--
--
.0
.051
.001
.0
.0
.004
.0
.0
.0
.003
.001
.562
.006
.001
.007
.03
.001
.029
.096
.007
.001
.0
.0
.001
.079
.617
.576
.008
.491
.003
.014
.016
.0
.0
.006
.001
.003
.0
.218
.007
.001
.006
.001
.01
.178
.002
.01
.037
.006
.001
.007
.055
.001
.001
.903
.091
.002
.001
.008
.002
.255
.061
.001
.016
.015
.001
.0
.001
.0
.004
.0
.0
.0
.017
.011
.021
.025
.03
.002
--
.016
.051
.041
.069
.003
.004
.164
--
--
--
--
--
--
.443
.0
.106
.001
.0
.022
.115
.005
.004
.001
.014
.341
.016
.018
.004
.011
.006
.0
.006
.0
.882
.002
.001
--
.226
.002
.011
.35
.039
.192
.022
.03
.009
.06
.047
.188
.004
.152
--
.033
.086
.019
.005
.013
.407
.142
.001
.0
.001
.041
.019
.096
.0
.113
.225
.0
.005
.314
.039
.012
.001
.11
.001
.101
.552
.076
.231
.001
.001
.034
.06
.002
.024
--
.0
.001
.001
.098
.119
.033
.002
.01
.166
.001
.129
.0
.054
.008
.001
.006
.002
.001
--
.003
.139
--
.009
.055
.099
.257
.214
.178
.001
.155
.021
.17
.169
.001
.046
.0
.34
.049
.062
.008
.017
.002
.131
.004
.041
.154
.012
.88
.134
--
.006
.0
.009
.003
.109
.074
.0
.003
.087
.038
.048
.022
.006
.001
.0
.001
.001
.162
.01
.001
.002
.0
.407
.271
.0
.187
.0
.015
.08
--
.528
.854
.0
.029
.0
.004
.233
.004
.0
.333
.025
.0
.0
.0
.17
.0
.134
.0
.002
.0
.01
.001
.003
.001
.001
.002
.022
.001
.0
.944
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
Ulk4
G
T
C
C
C
G
G
T
C
A
G
T
A
G
C
C
G
C
C
C
C
C
T
A
C
G
C
T
G
G
A
T
G
T
C
A
C
C
G
G
G
C
A
A
T
T
T
G
T
C
C
C
A
G
G
T
C
A
G
C
G
T
C
T
T
C
T
A
C
T
C
C
G
T
G
C
G
T
C
T
C
C
A
G
T
C
C
A
G
A
A
G
G
G
T
A
A
G
G
C
C
G
T
A
T
G
G
T
T
A
T
T
T
C
G
C
C
C
G
A
A
C
C
A
G
A
G
A
G
C
A
C
C
G
C
T
C
C
G
G
C
G
C
A
T
T
C
T
A
C
G
G
T
G
T
A
G
G
G
C
C
C
C
T
A
C
T
T
T
G
C
A
G
C
T
C
G
T
C
G
G
C
A
G
C
T
A
G
T
G
A
A
G
T
A
G
C
T
C
G
C
C
T
A
C
A
T
T
A
G
G
C
T
G
G
T
C
C
A
G
G
C
A
A
C
T
G
G
A
C
A
G
A
A
C
T
A
C
C
A
C
A
G
C
C
T
A
G
G
T
T
G
G
C
T
G
A
T
C
A
A
A
A
C
G
T
A
T
A
T
C
G
C
T
G
A
A
T
G
G
C
A
C
G
C
A
T
G
C
C
T
G
A
A
C
A
C
T
T
T
A
T
G
A
A
A
C
T
T
C
G
C
A
A
G
A
A
G
T
C
G
T
A
T
T
G
G
G
C
G
T
G
A
A
C
A
A
T
A
G
T
C
T
A
T
C
C
C
C
C
C
C
G
C
A
G
C
C
T
A
A
A
T
C
G
A
C
C
G
T
A
A
G
T
T
T
C
T
A
G
G
G
A
G
G
T
G
A
G
A
T
G
A
A
T
T
A
T
C
G
G
C
G
A
A
T
T
C
T
G
C
G
  129,631,731
  129,632,243
  129,633,934
  129,634,717
  129,634,745
  129,635,119
  129,635,992
  129,636,901
  129,637,245
  129,644,426
  129,644,613
  129,645,464
  129,646,965
  129,647,649
  129,648,253
  129,648,367
  129,648,384
  129,648,389
  129,648,415
  129,648,426
  129,648,485
  129,648,493
  129,648,845
  129,651,106
  129,653,639
  129,654,171
  129,654,710
  129,655,466
  129,656,456
  129,656,480
  129,657,669
  129,661,091
  129,661,498
  129,663,487
  129,664,336
  129,664,923
  129,665,585
  129,666,244
  129,666,512
  129,666,936
  129,668,098
  129,668,918
  129,668,937
  129,669,190
  129,669,214
  129,671,213
  129,674,043
  129,674,072
  129,674,482
  129,676,146
  129,676,502
  129,678,262
  129,678,352
  129,678,420
  129,678,425
  129,678,919
  129,680,154
  129,680,576
  129,680,896
  129,681,650
  129,681,878
  129,682,697
  129,683,917
  129,684,228
  129,684,906
  129,684,993
  129,685,292
  129,685,339
  129,687,406
  129,688,565
  129,688,805
  129,689,031
  129,689,592
  129,689,905
  129,689,992
  129,692,493
  129,692,578
  129,693,447
  129,694,211
  129,694,950
  129,695,671
  129,696,360
  129,697,796
  129,698,180
  129,698,578
  129,698,639
  129,698,759
  129,699,146
  129,699,474
  129,699,794
  129,702,108
  129,703,655
  129,703,679
  129,703,793
  129,706,391
  129,706,505
  129,706,992
  129,707,423
  129,707,427
  129,707,557
  129,708,743
  129,708,984
  129,709,054
  129,709,184
  129,711,134
  129,711,601
  129,711,679
  129,711,719
  129,711,720
  129,711,836
  129,715,334
  129,715,344
  129,715,369
  129,715,882
  129,717,239
  129,717,803
  129,719,052
  129,719,393
  129,719,505
  129,720,354
  129,720,819
  129,722,477
  129,725,581
  129,726,102
  129,726,156
  129,726,919
  129,728,025
  129,728,108
  129,728,840
  129,730,454
  129,731,751
  129,733,541
  129,736,335
  129,736,340
  129,736,479
  129,738,082
  129,738,401
  129,738,408
  129,738,476
  129,738,534
  129,738,555
  129,739,108
  129,740,340
  129,741,244
  129,741,698
  129,741,751
  129,743,335
  129,743,615
  129,744,132
  129,745,741
  129,745,784
  129,746,561
  129,746,685
  129,746,754
  129,746,808
  129,747,354
  129,748,536
  129,748,575
  129,749,219
  129,749,270
  129,749,299
  129,749,303
  129,749,678
  129,751,077
  129,751,114
  129,751,155
  129,751,636
  129,751,719
  129,751,885
  129,752,267
  129,752,368
  129,752,480
  129,753,818
  129,753,988
  129,754,412
  129,755,093
  129,755,114
  129,755,751
  129,756,488
  129,758,416
  129,761,046
  129,762,106
  129,762,157
  129,762,193
  129,762,571
  129,762,731
  129,763,631
  129,764,295
  129,764,296
  129,764,874
  129,767,769
  129,767,983
  129,768,719
  129,769,216
  129,769,730
  129,769,960
  129,770,008
  129,770,066
  129,770,079
  129,770,584
  129,771,745
  129,772,059
  129,772,694
  129,772,707
  129,772,801
  129,773,102
  129,773,570
  129,775,297
  129,775,457
  129,775,844
  129,776,833
  129,776,949
  129,777,425
  129,777,639
  129,783,114
  129,784,519
  129,786,131
  129,786,463
  129,788,886
  129,789,990
  129,790,066
  129,790,251
  129,792,756
  129,792,800
  129,792,864
  129,793,040
  129,793,760
  129,794,586
  129,795,276
  129,795,476
  129,796,436
  129,798,342
  129,799,474
  129,800,011
  129,800,124
  129,800,496
  129,801,137
  129,801,372
  129,801,718
  129,802,223
  129,802,449
  129,802,468
  129,802,832
  129,803,409
  129,803,411
  129,804,802
  129,806,040
  129,806,524
  129,807,208
  129,807,456
  129,807,629
  129,807,905
  129,808,227
  129,808,327
  129,808,516
  129,808,722
  129,809,088
  129,809,104
  129,809,339
  129,809,879
  129,809,904
  129,810,890
  129,811,214
  129,811,247
  129,811,349
  129,811,508
  129,815,359
  129,815,749
  129,815,787
  129,816,057
  129,816,092
  129,816,923
  129,817,122
  129,817,431
  129,817,593
  129,817,814
  129,818,321
  129,818,555
  129,819,065
  129,819,237
  129,819,773
  129,820,529
  129,823,704
  129,825,383
  129,825,702
  129,826,546
  129,826,811
  129,827,514
  129,828,045
  129,828,102
  129,828,384
  129,828,723
  129,829,317
  129,829,683
  129,829,769
  129,829,902
  129,829,927
  129,830,197
  129,830,200
  129,830,551
  129,830,855
  129,831,073
  129,831,288
  129,831,500
  129,831,513
  129,832,423
  129,832,431
  129,834,381
  129,837,512
  129,838,251
  129,838,340
  129,840,189
  129,841,248
  129,842,666
  129,843,459
  129,843,671
  129,845,822
  129,846,185
  129,846,566
  129,848,128
  129,849,428
  129,850,190
  129,851,572
  129,852,918
  129,854,789
  129,855,027
  129,859,103
  129,859,625
  129,859,626
  129,859,629
  129,860,108
  129,861,051
  129,862,185
  129,862,690
  129,864,330
  129,864,848
  129,865,655
  129,865,742
  129,866,165
  129,866,448
  129,867,612
  129,873,613
  129,875,527
  129,876,282
  129,876,569
  129,876,834
  129,876,868
  129,876,910
  129,876,928
  129,877,138
  129,878,651
  129,878,937
  129,879,254
  129,880,344
  129,880,396
  129,881,344
  129,881,531
  129,882,445
  129,882,650
  129,883,867
  129,884,556
  129,885,191
  129,885,558
  129,886,003
  129,886,549
  129,887,718
  129,888,314
  129,892,177
  129,892,182
  129,892,249
  129,892,802
  129,893,136
  129,894,795
  129,894,899
  129,894,910
  129,895,710
  129,896,150
  129,896,809
  129,897,590
  129,897,883
  129,897,897
  129,899,134
  129,901,483
  129,901,787
  129,903,021
  129,904,123
  129,904,228
  129,904,309
  129,905,066
  129,905,120
  129,905,925
  129,908,162
  129,908,571
  129,909,656
  129,909,787
  129,909,858
  129,910,141
  129,910,452
  129,910,667
  129,910,887
  129,911,018
  129,911,290
  129,912,229
  129,913,643
  129,913,988
  129,914,084
  129,916,259
  129,916,266
  129,916,400
  129,918,619
  129,918,693
  129,918,981
A
G
T
A
T
A
A
C
T
G
A
G
G
A
T
T
C
T
G
G
T
T
A
G
A
A
T
C
C
A
G
G
T
C
T
G
T
T
T
A
T
T
T
G
C
C
A
A
C
T
T
A
G
A
A
C
T
G
C
T
C
A
G
G
C
T
C
G
T
C
T
T
A
C
A
T
A
C
T
C
T
G
G
A
G
T
T
G
T
G
G
A
A
A
C
G
G
A
T
T
A
A
C
T
A
A
A
C
C
G
A
C
C
T
A
A
T
T
A
C
G
T
T
G
A
G
A
G
C
T
G
T
T
A
A
C
T
T
A
A
G
A
T
G
C
G
T
G
G
T
A
A
C
A
C
G
A
A
A
A
T
T
T
C
G
T
C
C
C
A
A
G
A
T
C
T
A
C
A
A
A
T
G
A
T
C
G
A
C
A
G
G
A
C
G
A
T
C
T
A
T
T
C
T
T
G
C
C
G
A
A
T
C
A
A
C
A
T
G
T
T
T
T
G
T
C
A
A
G
T
G
A
G
G
T
C
T
G
T
G
T
G
A
A
G
G
G
A
A
G
C
A
C
T
C
A
C
A
T
T
G
G
G
G
C
C
T
A
G
A
A
A
A
C
A
C
G
A
A
C
T
G
T
T
T
G
C
A
T
T
G
A
C
G
T
G
T
G
C
C
C
C
A
G
C
G
A
A
A
T
C
A
G
C
A
T
G
C
C
A
A
C
G
G
G
A
C
C
G
C
C
A
T
C
A
G
G
C
T
A
C
A
C
G
C
T
A
T
T
T
T
T
A
T
G
A
A
T
C
G
G
T
C
T
A
G
A
T
A
C
C
G
A
A
A
C
T
C
G
A
A
A
G
A
T
C
T
G
A
G
C
A
G
G
A
C
G
G
T
A
T
T
A
G
G
C
C
T
C
A
T
A