Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 19,226 (bp)   Positions: 391
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
.083
.306
.469
.133
.037
.014
.029
.094
.792
.12
.276
.296
.364
.006
.005
.007
.085
.108
.022
.017
.005
.003
.003
.012
.003
.004
.006
.002
.005
.014
.016
.014
.108
.019
.121
.034
.011
.012
.008
.027
.002
.003
.002
.007
.008
.015
.003
.007
.002
.022
.022
.003
.003
.017
.039
.059
.383
.687
.099
.16
.282
.004
.015
.338
.297
.006
.014
.004
.005
.006
.004
.025
.034
.005
.16
.084
.034
.108
.006
.021
.345
.293
.005
.02
.107
.095
.223
.102
.015
.002
.019
.027
.004
.003
.005
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.023
.017
.012
.007
.021
.006
.003
.011
.005
.002
.003
.046
--
--
--
--
--
--
.0
.022
.006
.001
.002
.002
.012
.009
.0
.0
.001
.003
.011
.006
.004
.001
.002
.003
.0
.0
.001
.0
.001
.041
.002
.001
.031
.006
.0
.0
.005
.004
.001
.04
.005
.001
.012
.013
.001
.011
.002
.002
.002
.005
.001
.002
.001
.0
.012
.012
.008
.02
.05
.565
.501
.573
.067
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
--
--
--
--
.0
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.025
.006
.001
.002
.004
.007
.003
.062
.059
.0
.0
.008
.0
.0
.042
.009
.015
.139
.065
.004
.0
.002
.002
.039
.006
.011
.001
.002
.003
.009
.011
.002
.006
.015
.003
.006
.018
.016
.056
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.009
--
--
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
Ulbp1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
G
T
C
T
A
A
A
G
A
G
G
C
A
C
T
T
T
G
G
G
A
T
A
G
A
A
T
G
G
T
T
G
G
T
A
T
C
A
C
C
G
C
C
A
G
C
G
C
C
G
A
G
G
G
G
C
C
C
T
T
T
G
G
C
A
T
G
C
T
C
T
T
G
T
T
G
G
G
A
C
G
A
T
G
T
T
G
G
T
T
A
A
C
T
T
G
C
C
G
T
C
C
G
G
G
C
A
A
A
G
T
G
A
G
T
T
G
C
T
G
A
G
T
G
G
C
G
C
T
T
A
C
A
C
C
G
T
G
C
C
C
T
G
G
A
A
T
C
T
C
C
C
T
C
C
A
G
C
G
G
A
C
C
T
T
G
C
C
T
T
T
A
A
T
A
G
A
G
A
A
C
G
T
C
T
G
G
G
A
A
C
A
G
G
A
A
C
A
C
C
T
C
A
A
A
T
G
T
C
G
C
T
A
C
T
C
C
A
C
T
C
A
G
C
C
G
T
T
C
C
G
A
G
T
G
A
A
G
C
A
C
G
G
C
C
C
A
C
C
A
G
C
C
A
T
T
T
G
A
A
C
G
T
T
A
A
G
C
C
C
G
T
A
G
C
G
T
G
C
A
A
T
C
G
T
G
T
G
C
C
C
T
G
C
A
C
C
C
A
G
T
G
C
A
A
G
G
T
T
G
G
C
C
A
G
A
C
C
T
A
G
G
C
G
A
C
G
A
C
C
G
C
A
G
G
T
T
G
G
G
C
A
T
T
G
G
T
A
A
G
C
A
A
G
A
G
A
T
G
A
C
A
T
G
C
A
C
C
C
C
G
A
A
C
A
A
A
T
G
G
A
T
A
G
G
G
G
T
G
  1,181,308
  1,181,327
  1,181,352
  1,181,359
  1,181,392
  1,181,431
  1,181,454
  1,181,465
  1,181,472
  1,181,514
  1,181,576
  1,181,600
  1,181,601
  1,181,629
  1,181,660
  1,181,675
  1,181,676
  1,181,720
  1,181,741
  1,181,753
  1,181,760
  1,181,766
  1,181,778
  1,181,780
  1,181,786
  1,181,803
  1,181,808
  1,181,813
  1,181,834
  1,181,839
  1,181,861
  1,181,863
  1,181,902
  1,181,923
  1,181,945
  1,182,079
  1,182,088
  1,182,132
  1,182,188
  1,182,239
  1,182,297
  1,182,304
  1,182,311
  1,182,326
  1,182,335
  1,182,341
  1,182,345
  1,182,350
  1,182,354
  1,182,363
  1,182,376
  1,182,378
  1,182,429
  1,182,479
  1,182,571
  1,182,590
  1,182,594
  1,182,621
  1,182,696
  1,182,757
  1,182,761
  1,182,790
  1,182,866
  1,182,871
  1,182,968
  1,182,984
  1,183,098
  1,183,109
  1,183,124
  1,183,136
  1,183,146
  1,183,159
  1,183,169
  1,183,262
  1,183,286
  1,183,342
  1,183,352
  1,183,418
  1,183,451
  1,183,469
  1,183,553
  1,183,581
  1,183,594
  1,183,757
  1,183,779
  1,183,818
  1,183,975
  1,184,143
  1,184,237
  1,184,386
  1,184,403
  1,184,450
  1,184,522
  1,184,546
  1,184,557
  1,184,561
  1,184,601
  1,184,639
  1,184,678
  1,184,683
  1,184,692
  1,184,710
  1,184,717
  1,184,881
  1,184,929
  1,184,945
  1,185,014
  1,185,033
  1,185,035
  1,185,051
  1,185,091
  1,185,126
  1,185,166
  1,185,181
  1,185,251
  1,185,271
  1,185,276
  1,185,300
  1,185,367
  1,185,369
  1,185,379
  1,185,386
  1,185,420
  1,185,425
  1,185,432
  1,185,462
  1,185,513
  1,185,523
  1,185,528
  1,185,563
  1,185,620
  1,185,654
  1,185,664
  1,185,674
  1,185,677
  1,185,756
  1,185,799
  1,185,824
  1,185,850
  1,185,876
  1,185,880
  1,185,889
  1,185,944
  1,185,957
  1,185,973
  1,185,979
  1,186,000
  1,186,010
  1,186,031
  1,186,034
  1,186,279
  1,186,329
  1,186,338
  1,186,359
  1,186,387
  1,186,407
  1,186,501
  1,186,528
  1,186,533
  1,186,564
  1,186,633
  1,186,645
  1,186,655
  1,186,740
  1,186,745
  1,186,747
  1,186,767
  1,186,776
  1,186,834
  1,186,835
  1,186,852
  1,186,861
  1,186,875
  1,186,878
  1,186,915
  1,186,930
  1,186,942
  1,186,943
  1,186,954
  1,187,035
  1,187,146
  1,187,219
  1,187,225
  1,187,233
  1,187,251
  1,187,266
  1,187,471
  1,187,542
  1,187,576
  1,187,581
  1,187,616
  1,187,712
  1,187,721
  1,187,725
  1,189,016
  1,189,051
  1,189,089
  1,189,188
  1,189,197
  1,189,201
  1,189,325
  1,189,367
  1,189,402
  1,189,435
  1,189,445
  1,189,470
  1,189,484
  1,189,520
  1,189,521
  1,189,526
  1,189,539
  1,189,570
  1,189,603
  1,189,624
  1,189,648
  1,189,649
  1,189,661
  1,189,670
  1,189,705
  1,189,710
  1,189,748
  1,189,755
  1,189,793
  1,189,794
  1,189,806
  1,189,808
  1,189,817
  1,189,825
  1,189,832
  1,189,842
  1,189,866
  1,189,867
  1,189,885
  1,189,904
  1,189,920
  1,189,954
  1,189,960
  1,189,962
  1,189,978
  1,189,980
  1,189,988
  1,190,069
  1,190,088
  1,190,104
  1,190,120
  1,190,145
  1,190,196
  1,190,209
  1,190,242
  1,190,249
  1,190,332
  1,190,355
  1,190,368
  1,190,424
  1,190,591
  1,190,595
  1,190,603
  1,190,614
  1,190,651
  1,190,795
  1,190,805
  1,190,808
  1,190,815
  1,190,850
  1,190,870
  1,190,876
  1,190,896
  1,190,897
  1,190,957
  1,190,964
  1,190,985
  1,190,998
  1,191,003
  1,191,007
  1,191,049
  1,191,060
  1,191,234
  1,191,259
  1,191,274
  1,191,328
  1,191,347
  1,191,531
  1,191,604
  1,191,641
  1,191,673
  1,191,674
  1,191,717
  1,191,841
  1,191,845
  1,191,846
  1,191,867
  1,191,876
  1,191,932
  1,191,977
  1,191,990
  1,191,999
  1,192,011
  1,192,029
  1,192,065
  1,192,068
  1,192,080
  1,192,088
  1,192,132
  1,192,147
  1,192,177
  1,192,200
  1,192,250
  1,192,303
  1,192,335
  1,192,343
  1,192,347
  1,192,349
  1,192,369
  1,192,403
  1,192,444
  1,192,448
  1,192,459
  1,192,498
  1,192,561
  1,192,571
  1,192,592
  1,192,614
  1,192,659
  1,192,732
  1,192,864
  1,192,895
  1,192,903
  1,192,913
  1,192,938
  1,192,939
  1,192,950
  1,192,960
  1,193,012
  1,193,040
  1,193,071
  1,193,105
  1,193,139
  1,193,141
  1,193,155
  1,193,158
  1,193,174
  1,193,175
  1,193,198
  1,193,199
  1,193,233
  1,193,241
  1,193,242
  1,193,257
  1,193,262
  1,193,281
  1,193,294
  1,193,310
  1,193,316
  1,193,333
  1,193,348
  1,193,369
  1,193,382
  1,193,441
  1,193,444
  1,193,565
  1,193,569
  1,193,585
  1,193,608
  1,193,609
  1,193,636
  1,193,677
  1,193,702
  1,193,789
  1,193,843
  1,193,858
  1,193,862
  1,193,872
  1,194,085
  1,194,305
  1,194,944
  1,195,093
  1,195,567
  1,195,577
  1,195,652
  1,195,654
  1,195,847
  1,195,854
  1,198,222
  1,198,224
  1,198,247
  1,198,959
  1,199,045
  1,199,047
  1,199,143
  1,200,442
  1,200,500
G/T
T/C
G/T
T/A
C/T
T/A
G
A/G
G
G/A
A/G
G/C
G/A
C/T
G
C/A
T/G
T/C
T/C
G/A
A
G/C
C
A
A/G
C
A/T
A/T
A
G/A
G/A
T/C
T/C
G/A
G/T
C
A/C
C
T
T
C/G
C/T
A
C/T
C/G
A/G
G/A
T
C
C/T
C/A
G/T
A/C
T
T
G/A
G/A
C/T
C/G
C/T
G
T/C
T/C
G/C
G/T
T
T
T/C
G/A
C/T
T/A
C/A
T/G
T/G
G/A
T/A
T/G
G/A
G/T
G/A
G
C/G
G/A
A/G
T/G
G/C
C
T/C
T
G/C
T/A
T/A
A/C
A/G
C/G
T/C
T/A
G/T
C/T
C/T
G/A
T/G
C/T
C/A
G/A
G/A
G/A
C/T
A/T
A/G
A/T
G/C
T/G
G/A
A/T
G/C
T/C
T/C
T
C/A
T/G
G/C
A/T
G/C
T/C
G/A
G/A
C/G
G/T
C/T
T/C
T/C
A/G
C/T
A/G
C/G
C/G
G/A
T/C
G/C
C/T
C/A
C/A
T/A
G/A
G/T
A/C
A/C
T/A
C/A
T/A
C/A
C/A
C/G
T/A
C/T
C/G
A/G
G/A
C/G
G/T
G/A
A/C
C/T
C/A
T/A
T/C
G/A
C/T
C/A
T/C
T/C
T/A
A/T
A/G
T/C
A/T
G/T
A/G
G/A
A/G
A/T
C/T
G/A
T/C
C/A
G
T
A
T
G
C
T
T
T
A
G
C
T
T
C/G
T
C
C/G
C
T
G
C
G/A
G
T
T
A
G
G
T
G
G
A
T
T
G
G
G
A
T
A
A
T/G
G
G
G
A
G
A
C
T
C
T
G/A
G
T
C/G
A
A
T
C/T
C/T
A/C
C/G
C/T
A/G
G/A
C/T
C/T
A/T
C
T/C
T/C
G/T
A/G
A/T
C/T
G/A
T/A
T/G
A/C
A/C
G/T
C/G
C/A
C/T
G/T
T/C
A/C
G/C
T
G/T
T/G
C
G
A/T
A/C
T/C
C/T
G/A
T/C
G/C
T/C
G/A
C/A
C/A
C/A
T/C
G/C
C/G
A/G
C/T
C/G
C/T
C
A
C
G/A
C/T
T
T
T
A
C
A
G/A
T
C/T
C/A
A/G
A
G
C/G
C/T
T/A
G
G/A
G/A
C/T
G/T
A/T
C/T
G/C
A/C
C/T
C/G
G/C
C/T
A/G
G/C
G/A
T/A
T/C
G/C
G/C
G/A
C/T
A/G
T/A
T/C
G/A
G/C
T/C
A/T
A/G
G/T
C/T
A/G
A/T
G/A
A/G
G/A
A/G
T/C
G/A
A/C
C/T
A/G
T/C
G/T
C/T
G
C/T
C/T
C/T
C/G
G/A
A/G
A/G
C/T
G
A/G
A/C
T/C
G/A
G/A
C
C
G
A
A
A
A
C
G/A