Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 98,282 (bp)   Positions: 339
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
1.0
.001
.0
.019
.006
.003
.0
--
--
--
--
--
--
.003
.001
.002
.001
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.33
.007
.002
.002
.001
--
--
--
--
.054
.096
.146
.14
.092
.368
.236
.085
.02
.701
.846
.846
.889
.013
.559
.002
.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.006
.256
.206
.01
.001
.008
.003
.008
.035
.029
.002
.002
.006
.006
.005
.006
.0
.003
.04
.005
.004
.002
.002
.004
.001
.002
.002
.013
.035
.016
.017
.011
.009
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.09
.128
.06
.006
.012
.004
.006
.011
--
--
--
.029
.04
.044
.023
.004
.004
.065
.077
.004
.006
.001
.025
.044
.069
.4
.42
.099
.12
.024
.014
.178
.387
.414
.362
.187
.137
.047
.012
.012
.01
.007
.056
.005
.002
.024
.079
.029
.028
.006
.057
.063
.178
.465
.411
.259
.162
.166
.218
.177
.182
.008
.002
.001
.003
.014
.05
.04
.031
.004
.012
.057
.075
.251
.045
.007
.002
.264
.741
.051
.006
.009
.088
.002
.003
.014
--
--
--
.003
.002
.003
.005
.026
.02
.002
.0
.005
.002
.005
.004
.001
.569
.68
.623
.116
.024
.414
.011
.032
.024
.022
.021
.03
.026
.02
.024
.009
.008
.004
.002
.001
.001
.002
.029
.153
.001
.001
.011
.01
.001
.098
.189
.203
.206
.099
.009
.002
.008
.001
.025
.002
.713
.997
.996
.997
.998
.954
.827
.987
.972
.712
.013
.021
.049
.007
.001
.006
.364
.008
.013
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
Ubap2
-
-
A
-
-
-
A
2
G
G
A
-
-
T
A
A
A
T
G
-
G
T
C
-
2
-
3
-
-
-
T
G
T
5
G
-
G
T
T
C
A
G
T
T
C
T
C
C
A
-
-
G
-
C
A
G
-
C
T
A
T
A
-
-
A
-
C
2
-
-
T
C
-
C
-
-
-
C
T
G
C
-
-
-
G
A
A
-
-
4
-
-
C
C
-
G
A
G
A
-
-
G
C
-
T
G
G
-
2
-
2
T
T
-
C
2
T
A
A
2
G
G
C
G
C
A
-
A
A
2
C
G
-
G
-
-
-
2
-
-
-
-
2
-
G
-
-
G
T
-
C
-
G
-
T
-
-
G
2
-
G
-
-
-
-
-
A
T
A
-
G
-
-
-
-
-
-
A
C
-
A
-
A
T
-
-
T
-
C
2
G
G
-
T
3
-
-
-
-
-
-
T
-
T
-
-
T
T
-
2
-
-
-
2
-
-
A
G
-
-
-
-
G
G
-
-
-
A
G
-
-
-
-
A
T
-
-
C
T
C
G
5
A
C
-
T
-
-
2
T
A
-
C
G
-
A
G
-
-
2
-
A
C
T
-
C
-
-
-
C
G
T
-
-
-
A
-
-
-
C
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
G
A
C
C
2
C
T
C
C
A
T
A
-
-
-
2
G
-
-
A
C
T
T
G
-
C
-
G
A
G
-
2
-
C
G
-
-
T
-
-
-
C
A
-
T
-
T
T
G
  57,538,841
  57,540,420
  57,540,425
  57,540,442
  57,540,447
  57,540,453
  57,540,465
  57,576,404
  57,576,421
  57,576,452
  57,576,458
  57,576,475
  57,579,287
  57,579,608
  57,579,763
  57,579,768
  57,579,786
  57,579,838
  57,592,771
  57,592,815
  57,593,429
  57,593,440
  57,593,697
  57,593,718
  57,595,178
  57,595,905
  57,595,927
  57,595,976
  57,595,981
  57,595,985
  57,596,782
  57,596,802
  57,597,778
  57,598,331
  57,598,435
  57,598,666
  57,599,152
  57,599,154
  57,599,179
  57,599,194
  57,599,196
  57,599,200
  57,599,203
  57,599,204
  57,599,207
  57,599,218
  57,599,222
  57,599,275
  57,599,318
  57,599,348
  57,599,349
  57,603,045
  57,604,918
  57,604,921
  57,604,922
  57,604,927
  57,604,932
  57,604,967
  57,605,006
  57,605,008
  57,605,771
  57,605,808
  57,605,927
  57,605,948
  57,605,967
  57,605,996
  57,606,041
  57,606,210
  57,606,216
  57,606,270
  57,606,286
  57,606,287
  57,606,352
  57,606,469
  57,606,566
  57,606,630
  57,606,633
  57,607,737
  57,607,744
  57,607,745
  57,607,754
  57,607,768
  57,607,804
  57,607,808
  57,607,867
  57,607,881
  57,607,894
  57,607,912
  57,607,919
  57,607,927
  57,607,936
  57,607,937
  57,607,941
  57,607,948
  57,607,962
  57,607,969
  57,608,035
  57,608,046
  57,608,053
  57,608,058
  57,608,062
  57,608,087
  57,608,090
  57,608,096
  57,608,097
  57,608,119
  57,608,130
  57,608,136
  57,608,160
  57,608,168
  57,608,174
  57,608,181
  57,608,183
  57,608,193
  57,608,194
  57,608,206
  57,608,629
  57,608,637
  57,608,643
  57,608,651
  57,608,663
  57,608,666
  57,608,667
  57,608,669
  57,608,677
  57,608,682
  57,608,707
  57,608,718
  57,608,730
  57,608,749
  57,608,763
  57,608,767
  57,608,795
  57,608,804
  57,608,812
  57,610,524
  57,610,585
  57,610,589
  57,610,624
  57,610,629
  57,610,685
  57,610,689
  57,610,696
  57,610,703
  57,610,736
  57,610,770
  57,610,778
  57,610,832
  57,610,856
  57,610,865
  57,610,883
  57,610,894
  57,610,939
  57,610,959
  57,611,004
  57,611,037
  57,611,049
  57,611,061
  57,611,076
  57,611,100
  57,611,105
  57,611,114
  57,611,126
  57,611,133
  57,611,138
  57,611,140
  57,611,148
  57,611,149
  57,611,153
  57,611,170
  57,611,200
  57,611,202
  57,611,208
  57,611,219
  57,611,234
  57,611,236
  57,611,255
  57,611,273
  57,611,274
  57,611,279
  57,611,291
  57,611,306
  57,611,319
  57,611,327
  57,611,329
  57,611,339
  57,611,345
  57,611,348
  57,611,356
  57,611,363
  57,611,367
  57,611,368
  57,611,371
  57,611,375
  57,611,378
  57,611,384
  57,611,395
  57,611,416
  57,611,443
  57,611,449
  57,611,503
  57,611,551
  57,611,560
  57,611,574
  57,611,596
  57,611,617
  57,611,645
  57,611,665
  57,611,672
  57,611,707
  57,611,740
  57,611,750
  57,611,779
  57,611,796
  57,611,815
  57,611,838
  57,611,853
  57,611,854
  57,611,860
  57,611,864
  57,611,882
  57,611,888
  57,611,916
  57,611,919
  57,611,971
  57,611,985
  57,611,995
  57,612,010
  57,612,016
  57,612,040
  57,612,052
  57,612,097
  57,612,650
  57,612,655
  57,612,712
  57,612,755
  57,612,798
  57,613,965
  57,613,970
  57,613,977
  57,613,987
  57,613,989
  57,614,020
  57,614,021
  57,614,059
  57,614,061
  57,614,070
  57,614,076
  57,614,083
  57,614,096
  57,614,097
  57,614,117
  57,614,133
  57,614,168
  57,614,175
  57,614,186
  57,614,206
  57,614,228
  57,614,289
  57,614,540
  57,614,550
  57,614,555
  57,614,569
  57,614,625
  57,614,636
  57,614,641
  57,614,644
  57,614,671
  57,614,677
  57,614,727
  57,614,741
  57,614,748
  57,614,762
  57,614,763
  57,614,794
  57,614,814
  57,614,833
  57,614,842
  57,614,851
  57,615,384
  57,618,961
  57,618,978
  57,618,992
  57,619,001
  57,619,010
  57,619,039
  57,619,090
  57,619,099
  57,619,116
  57,622,344
  57,622,351
  57,622,367
  57,622,370
  57,622,375
  57,622,383
  57,622,390
  57,622,406
  57,622,423
  57,622,428
  57,622,434
  57,622,444
  57,622,445
  57,622,449
  57,622,456
  57,622,485
  57,622,496
  57,622,526
  57,622,532
  57,622,536
  57,622,553
  57,622,561
  57,622,574
  57,622,584
  57,622,587
  57,622,615
  57,622,632
  57,622,642
  57,622,682
  57,622,686
  57,622,695
  57,622,730
  57,622,765
  57,622,775
  57,622,802
  57,622,818
  57,622,830
  57,622,840
  57,622,857
  57,622,869
  57,622,877
  57,622,880
  57,622,893
  57,622,915
  57,622,937
  57,622,950
  57,622,993
  57,622,994
  57,623,005
  57,627,654
A
2
-
G
2
2
-
-
C
A
-
T
A
C
C
T
C
C
-
G
G/A
T/-
T
7
-
T
-
T
A
C
T/C
G/A
-
-
A
T
G/A
C
T/A
C/A
A/C
G/A
T/C
T/C
C/T
T/C
C/T
C/A
A/G
A
-/T
A
C
A
C
-
3
-
-
T
-
-
G
T
-
A
-
-
3
C
C
T
C
-
T
T
T
A
G
T
A
A
G
A
-
-
-
T
A
-
G
G
-
-
C
A
G
-
-
C
T
-
A
C
C
-
-
A
-
3
-
A
-
A
A
-
-
-
-
-
C
C
A
A
-
-
C
-
-
-
A
-
G
-
A
G
A
-
4
T
T
T
-
C
-
G
T
-
-
A
-
G
-
T
-
T
A
-
-
A
-
A
G
T
G
T
T
A
-
2
T
T
T
C
T
2
A
T
A
G
-
T
-
A
2
G
G
A
-
-
-
A
C
G
-
C
C
T
T
G
A
-
A
-
A
T
G
C
C
-
G
G
T
-
T
T
G
T
2
2
C
A
-
T
T
2
T
-
-
G
C
2
T
-
-
A
A
-
-
-
-
-
C
A
2
C
T
T
-
A
T
C
-
-
A
-
-
C
T
-
A
-
-
G
C
T
C
T
A
-
-
-
T
T
C
-
G
C
G
T
3
C
2
2
T
G
A
T
11
C
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
G
T
T
G
T
-
-
A
G
C
-
-
-
-
A
-
2
T
-
-
T
-
A
-
-
A
T
-
A
G
G
T
C
C
G
T
A
-
A