Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 94,205 (bp)   Positions: 466
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.36
.001
.03
.0
.229
.123
.0
.0
.003
.0
.0
.002
.002
.034
.031
.114
.01
.0
.0
.002
.111
.001
.003
.463
.101
.014
.015
.066
.007
.025
.14
.249
--
--
--
--
--
--
--
.027
.022
.087
.054
.005
.007
.425
.0
.01
.011
.019
.0
.001
.006
.009
.021
.02
.0
.0
.0
.003
.019
.001
.082
.001
.005
.0
.0
.001
.002
.043
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.001
.017
.0
.0
.0
.976
.0
.0
.001
.005
.015
.011
.003
.001
.0
.0
.001
.002
.0
.001
.002
.001
.002
.051
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.0
.008
.024
.0
.002
.28
.029
.013
.005
.07
.005
.005
.016
.004
.02
.111
.003
.0
.01
.0
.001
.001
.001
.0
.0
.001
.0
.001
.009
.0
.003
.083
--
--
--
--
--
--
--
.011
.003
.003
.009
.007
.009
.005
.014
.01
.004
.021
.028
.017
.011
.012
.014
.01
.002
.006
.003
.007
.013
.001
.002
.002
.011
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.001
--
--
--
.002
.0
.0
.008
.083
.011
.02
.968
.974
.957
.957
.909
.917
.986
.997
.996
.996
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.997
1.0
1.0
1.0
--
.104
.021
.005
.025
.075
.054
.069
.025
.029
.039
.02
.132
.034
--
.029
.002
.002
.017
.0
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
.035
.257
.255
.11
.093
.023
.001
.001
.002
.019
.001
.0
.0
.001
.001
.006
.075
.014
.002
.007
.01
.001
.01
.001
.001
.016
.008
.002
.001
.013
.0
.001
.003
.001
.002
.001
.136
.003
.008
.0
.012
.004
.03
.009
.0
.0
.052
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.003
.005
.001
.007
.003
.883
.001
.002
.0
.003
.021
.024
--
.189
.01
.004
.146
.121
.143
.0
.003
.003
.004
.018
.013
.004
.052
.053
.106
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.048
.0
.001
.255
.983
.001
.012
.122
.001
.006
.023
.011
.066
.045
.011
.001
.001
.041
.021
.152
.0
.0
.213
.008
.0
.001
.0
.002
.094
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.007
.0
.021
.012
.002
.001
.0
.001
.002
.014
.001
.101
.013
.0
.001
.003
.006
.0
.999
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
Tyr
C
A
-
T
A
T
A
A
G
T
T
A
G
G
G
A
C
G
A
T
T
G
A
G
C
A
T
G
T
10
G
G
C
A
T
G
T
10
G
T
T
A
T
A
C
T
T
T
A
T
A
-
C
-
-
-
C
A
A
T
G
T
C
C
C
T
A
G
C
A
T
T
G
C
A
C
A
G
G
C
G
G
A
T
A
A
A
G
A
C
C
G
T
G
T
C
A
A
A
A
G
C
14
C
T
A
T
G
C
T
C
C
A
C
C
A
T
G
G
A
T
G
A
G
A
A
C
A
T
C
C
5
C
C
T
T
A
G
T
G
A
A
T
T
A
G
C
A
C
C
G
G
T
C
C
C
C
G
C
G
A
A
A
2
-
G
A
C
T
C
T
-
G
T
T
-
-
T
G
G
G
2
-
G
G
T
A
A
A
C
-
-
T
G
-
-
G
A
G
-
C
A
T
-
A
G
G
G
T
T
-
A
A
C
G
-
-
A
G
T
C
T
A
G
C
T
C
A
8
-
C
T
C
A
G
G
5
C
2
C
A
T
-
G
3
T
C
A
A
-
G
T
T
-
-
2
G
T
T
-
-
A
T
T
-
T
G
-
-
-
G
C
G
T
C
T
A
-
-
3
6
-
A
C
G
C
T
-
C
A
G
C
A
C
T
C
-
C
-
T
C
C
G
G
G
T
T
-
C
C
-
A
A
A
C
A
2
-
A
A
C
-
-
A
C
G
T
C
T
-
-
T
C
C
-
C
A
A
-
G
-
T
T
A
-
A
2
G
-
T
C
G
G
G
C
T
A
G
T
G
G
G
17
T
G
A
G
T
6
-
T
T
-
G
C
-
A
G
G
G
A
T
G
T
G
T
A
A
C
T
G
C
G
-
A
T
G
T
T
G
C
T
T
A
G
T
T
-
G
-
-
T
T
A
A
A
C
A
A
G
C
T
-
A
G
T
C
A
8
G
A
C
A
A
T
C
G
T
C
T
T
A
C
T
C
T
A
A
A
A
A
-
C
G
G
A
15
G
G
T
T
A
A
G
G
T
  151,012,609
  151,012,658
  151,012,870
  151,013,035
  151,013,467
  151,013,662
  151,013,710
  151,013,812
  151,013,814
  151,014,491
  151,015,139
  151,015,157
  151,015,272
  151,015,421
  151,015,423
  151,015,626
  151,016,268
  151,016,495
  151,016,617
  151,017,027
  151,017,099
  151,017,512
  151,017,752
  151,018,057
  151,018,208
  151,018,233
  151,018,317
  151,018,346
  151,018,418
  151,018,443
  151,018,485
  151,018,647
  151,018,798
  151,018,823
  151,018,907
  151,018,936
  151,019,008
  151,019,033
  151,019,075
  151,019,411
  151,019,500
  151,019,581
  151,019,630
  151,019,759
  151,019,837
  151,020,463
  151,020,597
  151,020,777
  151,020,991
  151,022,574
  151,022,797
  151,022,952
  151,023,273
  151,023,685
  151,023,687
  151,023,688
  151,023,803
  151,023,871
  151,023,889
  151,023,924
  151,024,224
  151,024,232
  151,024,619
  151,024,956
  151,025,077
  151,025,220
  151,025,230
  151,025,231
  151,025,239
  151,025,252
  151,025,387
  151,025,620
  151,025,636
  151,026,050
  151,026,210
  151,026,587
  151,026,623
  151,026,811
  151,026,840
  151,027,446
  151,027,499
  151,027,709
  151,027,894
  151,028,481
  151,028,502
  151,029,165
  151,029,360
  151,029,732
  151,030,018
  151,030,066
  151,030,279
  151,030,347
  151,030,380
  151,030,680
  151,030,930
  151,031,248
  151,031,852
  151,031,864
  151,032,056
  151,032,331
  151,032,382
  151,032,390
  151,032,492
  151,032,577
  151,032,589
  151,032,638
  151,032,680
  151,032,777
  151,032,874
  151,032,912
  151,032,981
  151,033,081
  151,033,195
  151,033,476
  151,033,491
  151,033,492
  151,033,595
  151,033,603
  151,033,812
  151,034,212
  151,034,232
  151,034,329
  151,034,355
  151,034,520
  151,034,614
  151,034,740
  151,035,220
  151,035,351
  151,035,435
  151,035,467
  151,035,564
  151,035,795
  151,035,848
  151,035,850
  151,036,050
  151,036,187
  151,036,307
  151,036,458
  151,036,684
  151,036,753
  151,037,038
  151,037,056
  151,037,466
  151,037,777
  151,037,893
  151,039,431
  151,040,888
  151,041,125
  151,041,422
  151,041,931
  151,042,109
  151,042,278
  151,042,484
  151,043,251
  151,043,282
  151,043,895
  151,043,975
  151,044,626
  151,044,647
  151,044,710
  151,044,727
  151,044,734
  151,045,060
  151,045,125
  151,045,270
  151,045,310
  151,045,336
  151,045,439
  151,045,739
  151,045,757
  151,045,759
  151,045,780
  151,045,799
  151,045,808
  151,045,814
  151,045,842
  151,045,852
  151,045,875
  151,045,887
  151,045,895
  151,045,896
  151,045,907
  151,045,910
  151,046,209
  151,046,576
  151,046,614
  151,046,662
  151,047,599
  151,047,797
  151,048,891
  151,048,980
  151,049,026
  151,049,072
  151,049,108
  151,049,124
  151,049,147
  151,049,189
  151,049,222
  151,049,260
  151,049,265
  151,049,266
  151,049,294
  151,049,296
  151,049,298
  151,049,305
  151,049,312
  151,049,319
  151,049,327
  151,049,337
  151,049,345
  151,049,358
  151,049,376
  151,049,378
  151,049,391
  151,049,396
  151,049,401
  151,049,404
  151,049,417
  151,049,420
  151,049,431
  151,049,457
  151,049,459
  151,049,471
  151,049,482
  151,049,483
  151,049,499
  151,049,507
  151,049,530
  151,049,537
  151,049,552
  151,049,558
  151,049,559
  151,049,567
  151,049,575
  151,049,579
  151,049,583
  151,049,614
  151,049,689
  151,049,830
  151,049,857
  151,051,689
  151,052,799
  151,060,342
  151,060,378
  151,060,385
  151,060,578
  151,060,581
  151,060,601
  151,060,736
  151,061,197
  151,062,458
  151,062,527
  151,063,410
  151,063,416
  151,063,424
  151,063,425
  151,063,438
  151,063,441
  151,063,448
  151,063,456
  151,063,464
  151,063,465
  151,063,476
  151,063,492
  151,063,501
  151,063,507
  151,063,511
  151,063,517
  151,063,521
  151,063,526
  151,063,533
  151,063,535
  151,063,540
  151,063,567
  151,063,571
  151,063,587
  151,063,588
  151,063,593
  151,063,595
  151,063,598
  151,063,602
  151,063,612
  151,063,958
  151,064,939
  151,065,224
  151,065,242
  151,065,245
  151,065,250
  151,065,287
  151,065,299
  151,067,926
  151,068,043
  151,068,047
  151,068,060
  151,068,208
  151,068,769
  151,068,893
  151,069,071
  151,070,454
  151,071,027
  151,071,046
  151,071,391
  151,072,603
  151,072,787
  151,072,847
  151,073,644
  151,073,653
  151,073,661
  151,073,708
  151,073,723
  151,073,726
  151,073,750
  151,073,775
  151,073,810
  151,073,811
  151,073,852
  151,073,900
  151,073,930
  151,073,950
  151,073,967
  151,073,972
  151,073,979
  151,073,998
  151,074,038
  151,074,054
  151,074,141
  151,074,145
  151,074,210
  151,074,231
  151,074,266
  151,074,277
  151,074,280
  151,074,293
  151,074,358
  151,074,672
  151,074,707
  151,074,764
  151,074,768
  151,075,482
  151,075,483
  151,075,486
  151,076,015
  151,076,802
  151,076,859
  151,076,885
  151,077,016
  151,077,123
  151,077,131
  151,077,189
  151,083,158
  151,083,203
  151,083,265
  151,083,359
  151,083,369
  151,083,481
  151,083,504
  151,083,645
  151,083,764
  151,084,012
  151,084,064
  151,084,094
  151,084,307
  151,084,601
  151,084,836
  151,085,045
  151,085,118
  151,085,898
  151,086,044
  151,086,170
  151,086,249
  151,086,974
  151,087,175
  151,087,266
  151,087,412
  151,087,416
  151,087,422
  151,087,818
  151,087,870
  151,088,168
  151,088,320
  151,088,797
  151,088,944
  151,089,145
  151,089,262
  151,089,571
  151,089,700
  151,089,833
  151,089,889
  151,089,923
  151,090,116
  151,090,357
  151,090,418
  151,090,469
  151,090,472
  151,090,767
  151,096,489
  151,096,541
  151,096,659
  151,096,684
  151,096,727
  151,096,759
  151,096,767
  151,096,783
  151,096,836
  151,096,847
  151,096,891
  151,096,947
  151,096,979
  151,096,993
  151,097,013
  151,097,050
  151,097,239
  151,097,306
  151,097,419
  151,097,424
  151,097,538
  151,097,709
  151,097,831
  151,097,840
  151,098,194
  151,098,289
  151,098,639
  151,098,878
  151,099,190
  151,099,196
  151,099,234
  151,099,537
  151,099,807
  151,099,874
  151,099,927
  151,099,967
  151,100,250
  151,100,251
  151,100,529
  151,100,625
  151,100,812
  151,100,906
  151,100,973
  151,101,139
  151,101,324
  151,101,636
  151,101,843
  151,101,960
  151,102,076
  151,102,158
  151,102,235
  151,102,260
  151,102,476
  151,102,569
  151,102,876
  151,103,228
  151,103,266
  151,103,350
  151,103,470
  151,104,239
  151,104,404
  151,104,669
  151,104,925
  151,104,975
  151,105,329
  151,105,520
  151,105,610
  151,105,732
  151,105,898
  151,106,439
  151,106,748
T
-
3
C
G
-
G
G
A
C
C
G
A
A
A
G
T
A
G
C
C
A
T
-
T
T
A
A
C
-
A
-
T
T
A
A
C
-
A
C
C
G
T/-
G
T
C
C
-
-
C
G
T
A
2
6
3
T
G
G
G
A
A
T
G
T
A
G
A
A
G
C
C
A
T
G
T
C
T
C
-
A
C
G
C
G
C
T
A
T
T
T
A
C
A
C
T
G
T
-
G
T
G
-
G
C
G
C
A
A
C
G
T
T
A
T
G
A
C
A
C
A
C
T
A
C
C
T
T
A
A
T
-
T
A
C
C
C
C
C
A
G
G
C
C
T
A
T
G
G
T
T
A
A
T
T
T
T
A
T
C
G
G
G
-
7
A
C
G
-
T
G
T
T
C
G
6
T
G
C
T
T
-
2
A
C
G
G
-
G
T
3
C
-
-
G
C
C
-
-
G
T
T
A
T
-
-
-
-
-
C
2
C
-
-
-
A
T
C
A
-
-
-
-
-
T
-
G
-
-
A
T
G
-
-
T
-
-
T
-
A
G
C
A
-
-
A
A
T
T
2
A
C
-
T
3
-
T
G
G
G
C
T
-
-
G
-
-
G
G
C
C
T
-
-
-
A
G
G
T
-
-
2
G
T
-
-
-
T
-
-
A
A
-
-
-
T
T
T
G
A
A
T
C
A
A
C
-
T
-
-
A
C
C
T
A
-
-
A
-
C
-
A
C
C
-
-
-
-
-
A
A
-
-
-
2
-
-
-
2
A
6
A
-
C
A
G
-
-
T
-
A
A
A
A
T
-
C
A
C
A
T
A
-
C
C
G
A
-
-
8
A
-
T
T
T
9
T
A
-
C
G
C
T
G
T
C
G
G
A
A
A
T
T
12
T
C
-
A
-
A
T
C
C
G
A
G
A
G
A
G
A
G
A
G
-
G
A
G
G
T
T
C
A
C
A
C
T
T
-
T
G
A
G
-
C
T
T
C
T
-
G
G
A
A
T
G
T
G
G
G
G
10
T
A
A
G
-
A
A
C
C
G
-
C
A
C