Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 136,582 (bp)   Positions: 472
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.07
.001
.0
.011
.002
.006
.012
.004
.396
.016
.0
.01
.476
.649
.001
.0
.007
.024
.04
.0
.006
.0
.099
.107
.025
.019
.031
.026
.016
.037
.341
.003
.002
.011
.008
.344
--
.02
.0
.005
.972
.01
.0
.051
.005
.033
.952
.054
.0
.0
.002
.024
.299
.001
.007
--
--
--
--
--
--
.962
1.0
.336
.004
.043
.018
.002
.145
.0
.01
.0
.0
.0
.0
.007
.022
.0
.054
.048
.079
.154
.034
.122
.107
.089
.064
.038
.028
.016
.009
.013
.018
.004
.002
.0
.001
.003
.004
.015
.011
.011
.003
.014
.02
.058
.104
.384
.418
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.11
.015
.39
.54
.025
.01
.001
.005
.087
.0
.013
.278
.04
.001
.014
--
--
.236
.237
.096
.018
.004
.155
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.072
.114
.005
.001
.146
.984
.001
.001
.004
.014
.005
.001
.108
.013
.002
.0
.006
.0
.0
.0
.003
.007
.0
.004
.001
.022
.114
.087
.046
.028
.284
.011
.61
.002
.0
.0
.0
.0
.002
.011
.004
.01
.002
.061
.004
.003
.0
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.177
--
.011
.075
.042
.14
.032
.0
.003
.195
.123
.136
.131
.36
.037
--
--
.013
.037
.274
.001
.004
.015
.001
.079
.069
.0
.0
--
--
--
--
--
.0
.029
.004
.002
.003
.005
.0
.001
.003
.07
.225
.008
.0
.288
.0
.001
.054
.083
.013
.001
.001
.003
.01
.0
.001
.018
.001
.0
.0
.001
.001
.056
.027
.04
.005
.0
.0
.119
.972
.001
.103
.001
.055
.006
.005
.001
.172
.0
.0
.148
.008
.007
.0
.001
.001
.081
.18
.027
.045
.001
.053
.056
.606
.125
.548
.008
.047
.019
.002
.154
.049
.03
.019
.625
.064
.004
.001
.001
.004
.004
.028
.031
.001
.048
.001
.007
.092
.406
.008
.062
.117
.006
.001
.0
.0
.0
.015
.65
.003
.001
.066
.083
.02
.0
.0
.003
.002
.102
.025
.0
.016
.568
.016
.151
.144
.027
.003
.063
.012
.998
1.0
.479
.643
.651
.0
.0
.2
.0
.001
.008
.322
--
--
--
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
Tshr
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
A
C
T
G
2
C
T
G
C
T
T
T
G
-
A
-
C
G
A
A
G
C
G
-
G
2
6
C
G
C
T
A
G
G
C
2
-
G
A
T
G
C
C
T
C
-
-
T
C
A
C
T
-
-
-
-
A
C
C
G
A
C
A
G
-
C
A
-
G
C
A
C
G
A
T
-
G
G
G
C
-
T
G
-
T
4
-
T
C
G
2
9
A
A
A
A
-
2
3
-
G
T
A
C
G
C
-
T
G
T
A
G
G
G
C
T
C
A
C
A
4
A
3
A
C
G
G
T
C
C
G
C
G
C
T
C
G
G
G
T
G
C
A
G
G
C
T
A
G
C
A
G
G
G
C
G
C
G
G
C
C
G
G
G
C
G
C
T
A
G
C
T
C
T
A
C
G
G
C
C
G
C
A
G
A
G
-
-
G
A
C
2
A
G
A
A
C
C
G
A
C
T
C
A
T
T
C
-
A
C
A
C
G
G
C
C
A
T
A
T
T
C
T
C
A
T
G
A
T
T
T
A
A
G
A
A
C
T
C
A
-
T
C
T
A
C
T
G
G
G
A
T
T
G
-
C
C
C
C
C
G
C
G
C
C
C
C
C
-
2
C
T
C
A
T
G
T
C
A
A
C
G
C
T
G
G
G
T
-
G
A
G
A
A
T
A
A
A
G
A
A
C
C
2
2
C
A
T
T
C
C
A
C
8
10
G
T
G
4
8
A
G
T
-
G
-
-
A
T
T
C
A
T
T
-
A
G
G
T
T
C
G
C
T
T
T
C
-
G
G
A
T
C
C
G
A
G
A
G
A
A
2
G
G
-
-
T
T
T
T
8
C
G
C
C
A
-
A
G
G
C
C
A
T
-
-
G
C
G
G
G
T
A
G
C
C
-
C
G
T
T
G
G
G
G
C
T
A
-
A
T
T
T
T
T
T
A
T
C
C
-
-
A
G
A
A
G
G
A
T
A
G
C
-
G
G
G
C
C
G
A
T
A
A
G
A
G
T
T
G
T
C
A
G
A
T
G
T
T
T
A
C
T
C
T
-
A
-
G
A
  115,170,825
  115,171,281
  115,171,318
  115,171,332
  115,171,679
  115,171,693
  115,171,695
  115,171,818
  115,172,132
  115,173,150
  115,173,326
  115,173,388
  115,174,858
  115,176,085
  115,176,469
  115,178,754
  115,180,866
  115,181,335
  115,182,282
  115,182,311
  115,182,815
  115,182,821
  115,183,615
  115,183,707
  115,184,141
  115,184,420
  115,184,523
  115,184,834
  115,184,837
  115,185,403
  115,185,455
  115,185,731
  115,187,222
  115,187,487
  115,187,735
  115,187,812
  115,188,211
  115,188,358
  115,188,981
  115,189,255
  115,190,897
  115,191,030
  115,191,496
  115,192,057
  115,193,505
  115,193,633
  115,193,828
  115,193,952
  115,196,843
  115,197,767
  115,198,197
  115,198,314
  115,198,524
  115,198,662
  115,198,710
  115,198,723
  115,198,763
  115,198,780
  115,198,824
  115,198,842
  115,198,854
  115,199,099
  115,200,056
  115,200,076
  115,200,193
  115,200,334
  115,200,706
  115,200,980
  115,201,019
  115,201,927
  115,202,087
  115,202,627
  115,202,764
  115,203,112
  115,203,444
  115,203,655
  115,203,836
  115,203,928
  115,204,003
  115,204,597
  115,204,607
  115,204,892
  115,205,067
  115,205,507
  115,205,659
  115,205,665
  115,205,670
  115,205,675
  115,205,680
  115,205,691
  115,205,705
  115,205,712
  115,205,718
  115,205,723
  115,205,733
  115,205,734
  115,205,738
  115,205,739
  115,205,743
  115,205,746
  115,205,753
  115,205,759
  115,205,762
  115,205,773
  115,205,785
  115,205,786
  115,205,789
  115,205,792
  115,205,801
  115,205,817
  115,206,211
  115,206,343
  115,206,373
  115,206,752
  115,207,000
  115,207,882
  115,208,072
  115,208,158
  115,208,242
  115,208,998
  115,209,191
  115,209,248
  115,209,260
  115,209,483
  115,209,534
  115,209,610
  115,209,686
  115,209,796
  115,209,946
  115,209,991
  115,210,334
  115,210,601
  115,210,900
  115,210,924
  115,211,098
  115,211,111
  115,211,113
  115,211,122
  115,211,179
  115,211,252
  115,211,255
  115,211,391
  115,211,400
  115,211,408
  115,211,441
  115,211,452
  115,211,455
  115,211,496
  115,211,519
  115,211,726
  115,211,967
  115,212,065
  115,212,183
  115,212,309
  115,212,328
  115,212,392
  115,212,405
  115,212,413
  115,212,463
  115,212,488
  115,212,557
  115,212,786
  115,212,984
  115,213,048
  115,213,165
  115,213,243
  115,213,253
  115,214,969
  115,214,983
  115,215,211
  115,215,269
  115,215,324
  115,215,726
  115,215,752
  115,215,805
  115,215,848
  115,215,858
  115,216,144
  115,216,169
  115,216,172
  115,216,195
  115,216,233
  115,216,429
  115,216,635
  115,216,823
  115,217,066
  115,217,082
  115,217,118
  115,217,205
  115,217,390
  115,217,450
  115,217,542
  115,217,811
  115,218,235
  115,218,364
  115,218,769
  115,218,973
  115,219,233
  115,219,410
  115,219,745
  115,220,012
  115,220,125
  115,220,361
  115,220,521
  115,220,674
  115,221,170
  115,221,905
  115,222,167
  115,222,280
  115,222,515
  115,222,991
  115,223,210
  115,223,238
  115,223,651
  115,223,666
  115,223,691
  115,223,746
  115,223,815
  115,223,817
  115,223,965
  115,224,004
  115,224,054
  115,225,654
  115,225,766
  115,226,040
  115,226,281
  115,226,533
  115,227,071
  115,228,197
  115,228,439
  115,228,679
  115,228,798
  115,228,804
  115,228,812
  115,228,926
  115,228,976
  115,229,095
  115,229,114
  115,229,124
  115,229,359
  115,230,143
  115,230,741
  115,230,977
  115,231,174
  115,231,730
  115,232,608
  115,232,705
  115,233,037
  115,233,158
  115,234,362
  115,234,817
  115,235,203
  115,235,502
  115,235,826
  115,235,879
  115,237,473
  115,238,041
  115,238,053
  115,238,055
  115,238,059
  115,238,064
  115,238,074
  115,238,103
  115,238,104
  115,238,109
  115,238,114
  115,238,118
  115,238,139
  115,238,201
  115,238,207
  115,238,209
  115,238,213
  115,238,284
  115,238,287
  115,238,291
  115,238,791
  115,240,711
  115,240,866
  115,240,952
  115,241,185
  115,241,332
  115,241,347
  115,241,356
  115,241,767
  115,241,970
  115,242,152
  115,242,816
  115,243,075
  115,243,170
  115,243,649
  115,243,661
  115,243,945
  115,243,979
  115,244,377
  115,244,379
  115,244,421
  115,244,428
  115,244,484
  115,244,571
  115,244,713
  115,244,717
  115,244,841
  115,244,856
  115,244,875
  115,245,049
  115,245,284
  115,245,408
  115,245,498
  115,245,515
  115,245,591
  115,245,627
  115,246,433
  115,247,759
  115,248,059
  115,248,652
  115,248,788
  115,248,802
  115,249,081
  115,249,248
  115,249,339
  115,250,154
  115,250,316
  115,250,898
  115,251,750
  115,251,757
  115,252,944
  115,252,948
  115,252,954
  115,254,069
  115,254,884
  115,255,497
  115,256,381
  115,258,107
  115,259,622
  115,259,642
  115,259,734
  115,259,989
  115,260,050
  115,262,854
  115,263,980
  115,264,664
  115,264,695
  115,264,699
  115,264,785
  115,265,256
  115,265,610
  115,265,932
  115,266,225
  115,266,256
  115,266,365
  115,266,390
  115,266,551
  115,266,875
  115,267,073
  115,267,527
  115,268,016
  115,269,035
  115,269,069
  115,270,354
  115,270,870
  115,271,027
  115,271,420
  115,271,548
  115,271,803
  115,271,854
  115,271,960
  115,272,157
  115,272,756
  115,272,965
  115,273,471
  115,273,531
  115,273,592
  115,274,207
  115,274,401
  115,274,491
  115,275,018
  115,275,798
  115,277,050
  115,277,152
  115,277,871
  115,278,497
  115,278,847
  115,278,916
  115,279,627
  115,279,877
  115,280,465
  115,280,523
  115,281,122
  115,281,510
  115,281,511
  115,281,826
  115,281,964
  115,282,250
  115,282,877
  115,283,451
  115,283,470
  115,283,571
  115,283,722
  115,284,227
  115,284,239
  115,284,305
  115,284,386
  115,284,506
  115,284,618
  115,284,656
  115,284,659
  115,284,729
  115,284,763
  115,284,778
  115,284,817
  115,285,032
  115,285,103
  115,285,256
  115,285,278
  115,285,283
  115,285,285
  115,285,288
  115,285,289
  115,285,858
  115,286,362
  115,287,171
  115,287,287
  115,287,315
  115,288,368
  115,288,691
  115,288,815
  115,288,978
  115,289,031
  115,289,079
  115,289,182
  115,289,558
  115,290,209
  115,290,226
  115,290,284
  115,290,350
  115,290,461
  115,290,857
  115,290,924
  115,291,488
  115,291,526
  115,292,025
  115,292,078
  115,293,143
  115,293,161
  115,293,334
  115,293,468
  115,293,711
  115,294,678
  115,296,147
  115,296,432
  115,297,305
  115,298,054
  115,299,251
  115,301,004
  115,301,091
  115,301,507
  115,301,890
  115,303,213
  115,303,233
  115,303,405
  115,303,426
  115,303,615
  115,303,832
  115,304,959
  115,304,980
  115,305,301
  115,305,506
  115,306,007
  115,306,543
  115,306,735
  115,306,838
  115,306,867
T
A
G
T
C
-
-
A
C
A
T
C
C
C
A
A
G
3
T
A
G
G
A
T
T
A
C
-
-
T
T
T
C
G
A
T
T
2/-
T
A
T
-
A
T
T
C
T
2
2
C
A
G
T
-
T
A
CA/T
C
C/C
T
T
C
G
T
G
A
32
T
C
A
T
-
G
T
A
T
-
2
A
A
A
G
T
C
T
G
-
-
T
-
-
A
-
-
G
C
G
G
G
-
-
T
-
-
-
T
-
-
A
-
A
-
T
A
T
C
T
C
T
T
A
G
4/-
G
-
-
T
C
A
C
G
T
T
A
G/A
C/T
T/G
C/A
G/T
G/A
G/C
T/G
G/C
C/T
A/G
G/A
G/A
C/T
T/C
A/T
G/T
C/T
A/G
G/A
G/C
G/A
C/A
G/A
C/T
G/C
G/A
A
C/A
G/T
G/C
G/A
C/T
A
A
T/C
A/G
G/A
C/G
T/C
C/G
T/A
A/G
C/G
G/C
G/T
C/A
C/A
G/A
C/G
T
A
G
-
T
A
A
-
T
-
C
T
G
G
T
G
A
G
T
C
T
G
C
C
T
T
T
A
G
T
A
T
T
A
G
C
G
C
C
T
C
T
G
G
A
G
A
T/A
T/A
A/T
C
C
A/G
A/T
C/T
A
T
G
A
C
G
C
C
-
A
A
A
A
G
C
C
T
T
A
A
A
G
A
C
T
C
A
G
G
A
G
2
-
-
-
-
T
C
A
C
A
G
G
G
A
T
C
-
C
A
-
2
T
G
A
T
G
C
G
T
G
T
G
G
A
A
-
-
G
T
G
C
A
A
C
A
-
10/-
C
C
A
-
-
G
T
-
2
-
C
6
T
A
C
T
-
A
C
22
C
A
A
C
C
-
A
T
C
C
C
T
A
C
A
T
C
T
T
A
G
A
G
A
G
G
2/-
A
A
12
A/G
G
A
C
-
-
A
A
T
T
G
4
T
A
A
T
T
G
C
2
2
A
G
A
A
A
G
G
A
T
G
C
T
A
C
C
A
-
A
A
T
C
T
A
G
C
A
G
C
C
A
G
G
A
T
A
A
G
A
G
T
A
A
G
A
G
A
T
A
A
A
A
A
T
A
G
C
G
G
T
G
T
T/-
-
T
C
T
T
A
G
C
A
C
C
C
G
T
-
T
C
A
G
2
A
T